MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 1761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008386	CAT	2	6	59423	59428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345580
1002	NC_008386	ATG	2	6	59446	59451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345580
1003	NC_008386	CGG	2	6	59486	59491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1004	NC_008386	TGA	2	6	59498	59503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345580
1005	NC_008386	CGG	2	6	59540	59545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1006	NC_008386	CGG	2	6	59567	59572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1007	NC_008386	GAT	2	6	59580	59585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345580
1008	NC_008386	CGA	2	6	59660	59665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345580
1009	NC_008386	GTT	2	6	59669	59674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345580
1010	NC_008386	GAC	2	6	59715	59720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345580
1011	NC_008386	GCG	4	12	59728	59739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1012	NC_008386	ACG	2	6	59794	59799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345580
1013	NC_008386	GGC	2	6	59811	59816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1014	NC_008386	ATAGA	2	10	59827	59836	60 %	20 %	20 %	0 %	115345580
1015	NC_008386	GCA	3	9	59840	59848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345580
1016	NC_008386	ATG	2	6	59851	59856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345580
1017	NC_008386	CTTG	2	8	59909	59916	0 %	50 %	25 %	25 %	115345580
1018	NC_008386	TGG	2	6	59918	59923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345580
1019	NC_008386	CGG	2	6	59972	59977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345580
1020	NC_008386	TTC	2	6	59992	59997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345580
1021	NC_008386	CAA	2	6	60029	60034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345580
1022	NC_008386	CAG	2	6	60037	60042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345580
1023	NC_008386	TC	3	6	60117	60122	0 %	50 %	0 %	50 %	115345580
1024	NC_008386	TGGT	2	8	60146	60153	0 %	50 %	50 %	0 %	115345580
1025	NC_008386	GACG	2	8	60264	60271	25 %	0 %	50 %	25 %	115345581
1026	NC_008386	CCGT	2	8	60293	60300	0 %	25 %	25 %	50 %	115345581
1027	NC_008386	ACG	2	6	60305	60310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345581
1028	NC_008386	GAG	2	6	60359	60364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345581
1029	NC_008386	GTT	2	6	60637	60642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345582
1030	NC_008386	AAG	2	6	60765	60770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345582
1031	NC_008386	TAAT	2	8	60841	60848	50 %	50 %	0 %	0 %	115345582
1032	NC_008386	AGC	2	6	61027	61032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345583
1033	NC_008386	TCCG	2	8	61038	61045	0 %	25 %	25 %	50 %	115345583
1034	NC_008386	CA	3	6	61127	61132	50 %	0 %	0 %	50 %	115345583
1035	NC_008386	AGA	2	6	61336	61341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345584
1036	NC_008386	CTT	2	6	61375	61380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345584
1037	NC_008386	GCG	2	6	61385	61390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345584
1038	NC_008386	GTT	2	6	61408	61413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345584
1039	NC_008386	GCTT	2	8	61550	61557	0 %	50 %	25 %	25 %	115345584
1040	NC_008386	TGC	2	6	61570	61575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345584
1041	NC_008386	GC	3	6	61588	61593	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
1042	NC_008386	CG	3	6	61633	61638	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
1043	NC_008386	CAA	2	6	61804	61809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345584
1044	NC_008386	GAT	2	6	61887	61892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345584
1045	NC_008386	ATG	2	6	61913	61918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345584
1046	NC_008386	TCC	2	6	61920	61925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345585
1047	NC_008386	CAA	2	6	61994	61999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345585
1048	NC_008386	ACGC	2	8	62021	62028	25 %	0 %	25 %	50 %	115345585
1049	NC_008386	CAG	2	6	62183	62188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345585
1050	NC_008386	TGA	2	6	62226	62231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345585
1051	NC_008386	GCG	2	6	62244	62249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345585
1052	NC_008386	CTGG	2	8	62260	62267	0 %	25 %	50 %	25 %	115345585
1053	NC_008386	GACG	2	8	62363	62370	25 %	0 %	50 %	25 %	115345585
1054	NC_008386	CTG	2	6	62408	62413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345585
1055	NC_008386	CGC	2	6	63048	63053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345586
1056	NC_008386	TCG	2	6	63198	63203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345586
1057	NC_008386	GGC	3	9	63242	63250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345586
1058	NC_008386	GC	3	6	63274	63279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
1059	NC_008386	GC	3	6	63328	63333	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
1060	NC_008386	ACA	2	6	63430	63435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345586
1061	NC_008386	C	7	7	63446	63452	0 %	0 %	0 %	100 %	115345586
1062	NC_008386	TTG	2	6	63568	63573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345587
1063	NC_008386	TTC	2	6	63579	63584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345587
1064	NC_008386	CT	3	6	63623	63628	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
1065	NC_008386	GTGC	2	8	63629	63636	0 %	25 %	50 %	25 %	115345587
1066	NC_008386	GCGGCA	2	12	63637	63648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115345587
1067	NC_008386	CG	3	6	63654	63659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
1068	NC_008386	TTC	2	6	63667	63672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345587
1069	NC_008386	CAGC	2	8	63681	63688	25 %	0 %	25 %	50 %	115345587
1070	NC_008386	GGC	2	6	63699	63704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345587
1071	NC_008386	CTC	2	6	63765	63770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345587
1072	NC_008386	GC	3	6	63771	63776	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
1073	NC_008386	TCA	2	6	63784	63789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345587
1074	NC_008386	GGC	2	6	63821	63826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345587
1075	NC_008386	GT	3	6	63843	63848	0 %	50 %	50 %	0 %	115345587
1076	NC_008386	CT	3	6	63895	63900	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
1077	NC_008386	ATA	2	6	63936	63941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345587
1078	NC_008386	GCC	2	6	63951	63956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345587
1079	NC_008386	CCG	2	6	64013	64018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345587
1080	NC_008386	ATCA	2	8	64020	64027	50 %	25 %	0 %	25 %	115345587
1081	NC_008386	AGC	2	6	64046	64051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345587
1082	NC_008386	CAGA	2	8	64147	64154	50 %	0 %	25 %	25 %	115345587
1083	NC_008386	CGG	2	6	64334	64339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345588
1084	NC_008386	TAT	2	6	64345	64350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345588
1085	NC_008386	CGC	2	6	64371	64376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345588
1086	NC_008386	CCA	2	6	64485	64490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345588
1087	NC_008386	AAT	2	6	64572	64577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345588
1088	NC_008386	TCTG	2	8	64583	64590	0 %	50 %	25 %	25 %	115345588
1089	NC_008386	AGT	2	6	64598	64603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345588
1090	NC_008386	TAT	2	6	64608	64613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345588
1091	NC_008386	TCG	2	6	64662	64667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345588
1092	NC_008386	CCA	2	6	64670	64675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345588
1093	NC_008386	TGA	2	6	64685	64690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345588
1094	NC_008386	CCG	2	6	64737	64742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345588
1095	NC_008386	CCA	2	6	64762	64767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345588
1096	NC_008386	TATT	2	8	64784	64791	25 %	75 %	0 %	0 %	115345588
1097	NC_008386	TTG	2	6	64862	64867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345588
1098	NC_008386	TTG	3	9	64932	64940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345588
1099	NC_008386	GCCA	2	8	65018	65025	25 %	0 %	25 %	50 %	115345588
1100	NC_008386	ATC	2	6	65332	65337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345588
1101	NC_008386	CCA	2	6	65344	65349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345588
1102	NC_008386	T	6	6	65386	65391	0 %	100 %	0 %	0 %	115345588
1103	NC_008386	TTA	2	6	65498	65503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345588
1104	NC_008386	GTCGG	2	10	65528	65537	0 %	20 %	60 %	20 %	115345588
1105	NC_008386	GCG	2	6	65605	65610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345588
1106	NC_008386	CTTC	2	8	65652	65659	0 %	50 %	0 %	50 %	115345588
1107	NC_008386	GCC	2	6	65666	65671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345588
1108	NC_008386	GTC	3	9	65704	65712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345588
1109	NC_008386	ATT	2	6	65734	65739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345588
1110	NC_008386	GTT	2	6	65770	65775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345588
1111	NC_008386	TGA	2	6	65789	65794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345588
1112	NC_008386	TGCCA	2	10	65815	65824	20 %	20 %	20 %	40 %	115345588
1113	NC_008386	GC	4	8	65843	65850	0 %	0 %	50 %	50 %	115345588
1114	NC_008386	CGC	2	6	65857	65862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345588
1115	NC_008386	GCA	2	6	65978	65983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345588
1116	NC_008386	TGG	2	6	66042	66047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345588
1117	NC_008386	C	6	6	66086	66091	0 %	0 %	0 %	100 %	115345588
1118	NC_008386	CAA	2	6	66120	66125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345588
1119	NC_008386	GTT	2	6	66139	66144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345588
1120	NC_008386	GTC	2	6	66175	66180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345588
1121	NC_008386	TCG	2	6	66200	66205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345588
1122	NC_008386	CGG	2	6	66551	66556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345589
1123	NC_008386	CAG	2	6	66689	66694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345589
1124	NC_008386	GCA	2	6	66721	66726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345589
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1126	NC_008386	TCA	2	6	66746	66751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345589
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1500	NC_008386	GAT	2	6	90971	90976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345620

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