MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 1761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008386	ATC	2	6	30271	30276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345562
502	NC_008386	CGG	2	6	30286	30291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
503	NC_008386	GC	3	6	30446	30451	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
504	NC_008386	TGA	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
505	NC_008386	GTT	2	6	30564	30569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345562
506	NC_008386	CGA	2	6	30582	30587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
507	NC_008386	AAG	2	6	30746	30751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
508	NC_008386	GAC	2	6	30769	30774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
509	NC_008386	GCAC	2	8	30834	30841	25 %	0 %	25 %	50 %	115345562
510	NC_008386	GCG	2	6	30923	30928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
511	NC_008386	ATGGT	2	10	31300	31309	20 %	40 %	40 %	0 %	115345562
512	NC_008386	GCC	2	6	31320	31325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345562
513	NC_008386	TGACA	2	10	31326	31335	40 %	20 %	20 %	20 %	115345562
514	NC_008386	CTG	2	6	31336	31341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345562
515	NC_008386	CGC	2	6	31342	31347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345562
516	NC_008386	TGG	2	6	31397	31402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345562
517	NC_008386	GGC	2	6	31404	31409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
518	NC_008386	GAA	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
519	NC_008386	GA	3	6	31514	31519	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
520	NC_008386	CG	3	6	31543	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
521	NC_008386	ATCAG	2	10	31633	31642	40 %	20 %	20 %	20 %	115345562
522	NC_008386	TCT	2	6	31657	31662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345562
523	NC_008386	GAA	2	6	31690	31695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
524	NC_008386	AGA	2	6	31698	31703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
525	NC_008386	TGG	2	6	31775	31780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345562
526	NC_008386	AGC	2	6	31811	31816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
527	NC_008386	GCA	2	6	31824	31829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
528	NC_008386	ATG	2	6	31886	31891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
529	NC_008386	CTTG	2	8	31896	31903	0 %	50 %	25 %	25 %	115345562
530	NC_008386	ATG	2	6	31910	31915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
531	NC_008386	AGGGG	2	10	31965	31974	20 %	0 %	80 %	0 %	115345562
532	NC_008386	GCGG	2	8	32026	32033	0 %	0 %	75 %	25 %	115345563
533	NC_008386	GTC	2	6	32036	32041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345563
534	NC_008386	GAA	2	6	32090	32095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
535	NC_008386	CTT	2	6	32176	32181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345563
536	NC_008386	GGTT	2	8	32196	32203	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
537	NC_008386	TGG	2	6	32220	32225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
538	NC_008386	GC	3	6	32303	32308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345563
539	NC_008386	TGG	2	6	32335	32340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
540	NC_008386	GAA	2	6	32447	32452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
541	NC_008386	GCT	2	6	32534	32539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345563
542	NC_008386	GAT	2	6	32612	32617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
543	NC_008386	ATC	2	6	32631	32636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345563
544	NC_008386	TG	3	6	32656	32661	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
545	NC_008386	TGA	2	6	32695	32700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
546	NC_008386	CGC	2	6	32849	32854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345563
547	NC_008386	TTG	2	6	32919	32924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345563
548	NC_008386	TGTT	2	8	32973	32980	0 %	75 %	25 %	0 %	115345563
549	NC_008386	CGC	2	6	33096	33101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345563
550	NC_008386	AGA	2	6	33196	33201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
551	NC_008386	GAC	2	6	33209	33214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345563
552	NC_008386	GGA	2	6	33226	33231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345563
553	NC_008386	TGG	2	6	33250	33255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
554	NC_008386	GAT	2	6	33260	33265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
555	NC_008386	AGC	2	6	33292	33297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
556	NC_008386	CAG	2	6	33340	33345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
557	NC_008386	GC	4	8	33373	33380	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
558	NC_008386	TCG	2	6	33416	33421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345564
559	NC_008386	TC	3	6	33470	33475	0 %	50 %	0 %	50 %	115345564
560	NC_008386	GGC	2	6	33499	33504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345564
561	NC_008386	GGCGG	2	10	33555	33564	0 %	0 %	80 %	20 %	115345564
562	NC_008386	GTG	2	6	33598	33603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345564
563	NC_008386	CG	4	8	33638	33645	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
564	NC_008386	CG	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
565	NC_008386	GTA	2	6	33751	33756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345564
566	NC_008386	TGA	2	6	33759	33764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345564
567	NC_008386	CTG	2	6	33811	33816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345564
568	NC_008386	CCG	2	6	33849	33854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345564
569	NC_008386	GAC	2	6	34003	34008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
570	NC_008386	TTG	2	6	34205	34210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345564
571	NC_008386	CAG	2	6	34227	34232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
572	NC_008386	ACC	2	6	34240	34245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345564
573	NC_008386	TG	3	6	34297	34302	0 %	50 %	50 %	0 %	115345564
574	NC_008386	AG	3	6	34366	34371	50 %	0 %	50 %	0 %	115345564
575	NC_008386	AGC	2	6	34426	34431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
576	NC_008386	GAT	2	6	34473	34478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345564
577	NC_008386	ACC	2	6	34506	34511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345564
578	NC_008386	CCA	2	6	34545	34550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345564
579	NC_008386	CGG	2	6	34575	34580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345564
580	NC_008386	TGC	2	6	34661	34666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345564
581	NC_008386	TTG	3	9	34720	34728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345564
582	NC_008386	GAG	2	6	34789	34794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345564
583	NC_008386	ACA	2	6	34841	34846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345564
584	NC_008386	GAT	2	6	34860	34865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345564
585	NC_008386	CGT	2	6	34882	34887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345564
586	NC_008386	GCC	2	6	34953	34958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345564
587	NC_008386	GGT	2	6	34966	34971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345564
588	NC_008386	CG	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
589	NC_008386	GAG	2	6	35074	35079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345564
590	NC_008386	GAA	2	6	35137	35142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345564
591	NC_008386	ATC	2	6	35149	35154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345564
592	NC_008386	GAC	3	9	35178	35186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
593	NC_008386	CTAGCG	2	12	35188	35199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115345564
594	NC_008386	GGGTTT	2	12	35206	35217	0 %	50 %	50 %	0 %	115345564
595	NC_008386	ATG	2	6	35231	35236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345564
596	NC_008386	CTTC	2	8	35238	35245	0 %	50 %	0 %	50 %	115345564
597	NC_008386	TTG	2	6	35380	35385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345564
598	NC_008386	AGC	2	6	35427	35432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
599	NC_008386	ACGTT	2	10	35458	35467	20 %	40 %	20 %	20 %	115345564
600	NC_008386	CCG	2	6	35615	35620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345565
601	NC_008386	A	6	6	35635	35640	100 %	0 %	0 %	0 %	115345565
602	NC_008386	AAC	2	6	35645	35650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345565
603	NC_008386	CAACCA	2	12	35710	35721	50 %	0 %	0 %	50 %	115345565
604	NC_008386	GCATT	2	10	35765	35774	20 %	40 %	20 %	20 %	115345565
605	NC_008386	GAG	3	9	35820	35828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345565
606	NC_008386	TCC	2	6	35915	35920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345565
607	NC_008386	TCG	2	6	35928	35933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345565
608	NC_008386	AAAG	2	8	35936	35943	75 %	0 %	25 %	0 %	115345565
609	NC_008386	GCT	2	6	35948	35953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345565
610	NC_008386	GCA	3	9	35985	35993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345565
611	NC_008386	ACA	3	9	36036	36044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345565
612	NC_008386	CCA	2	6	36053	36058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345565
613	NC_008386	A	6	6	36187	36192	100 %	0 %	0 %	0 %	115345566
614	NC_008386	CTT	2	6	36248	36253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345566
615	NC_008386	CGA	2	6	36306	36311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345566
616	NC_008386	GATG	2	8	36352	36359	25 %	25 %	50 %	0 %	115345566
617	NC_008386	CAC	2	6	36476	36481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345566
618	NC_008386	TCA	2	6	36513	36518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345566
619	NC_008386	TCG	2	6	36603	36608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345566
620	NC_008386	CCT	2	6	36631	36636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345566
621	NC_008386	TCA	3	9	36672	36680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345566
622	NC_008386	CCA	2	6	36723	36728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345566
623	NC_008386	GAC	2	6	36731	36736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345566
624	NC_008386	AAC	2	6	36869	36874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345566
625	NC_008386	GCG	2	6	36910	36915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345566
626	NC_008386	CAT	3	9	36919	36927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345566
627	NC_008386	ACG	2	6	36951	36956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345566
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