MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008384	CCA	2	6	172339	172344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255360
3502	NC_008384	ATG	2	6	172410	172415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255360
3503	NC_008384	GT	4	8	172428	172435	0 %	50 %	50 %	0 %	116255360
3504	NC_008384	CGA	2	6	172620	172625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255360
3505	NC_008384	AGA	2	6	172626	172631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255360
3506	NC_008384	CGA	2	6	172660	172665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255360
3507	NC_008384	GCC	2	6	172676	172681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255360
3508	NC_008384	GC	3	6	172967	172972	0 %	0 %	50 %	50 %	116255360
3509	NC_008384	CG	3	6	172973	172978	0 %	0 %	50 %	50 %	116255360
3510	NC_008384	CGG	2	6	173002	173007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255360
3511	NC_008384	GATC	2	8	173029	173036	25 %	25 %	25 %	25 %	116255360
3512	NC_008384	TTCCG	2	10	173161	173170	0 %	40 %	20 %	40 %	116255361
3513	NC_008384	CGC	2	6	173199	173204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255361
3514	NC_008384	C	6	6	173219	173224	0 %	0 %	0 %	100 %	116255361
3515	NC_008384	GC	3	6	173285	173290	0 %	0 %	50 %	50 %	116255361
3516	NC_008384	GCC	2	6	173488	173493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255361
3517	NC_008384	GGC	2	6	173545	173550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255361
3518	NC_008384	GCTT	2	8	173616	173623	0 %	50 %	25 %	25 %	116255361
3519	NC_008384	TCG	2	6	173747	173752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255361
3520	NC_008384	CGA	2	6	173769	173774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255361
3521	NC_008384	TCG	2	6	173918	173923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255361
3522	NC_008384	ACG	2	6	173936	173941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255361
3523	NC_008384	CGG	2	6	174015	174020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255361
3524	NC_008384	GAT	2	6	174028	174033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255361
3525	NC_008384	AGC	2	6	174036	174041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255361
3526	NC_008384	CGG	2	6	174042	174047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255361
3527	NC_008384	GGGA	2	8	174069	174076	25 %	0 %	75 %	0 %	116255361
3528	NC_008384	GGC	2	6	174183	174188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255361
3529	NC_008384	TTC	2	6	174193	174198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255361
3530	NC_008384	GC	3	6	174323	174328	0 %	0 %	50 %	50 %	116255361
3531	NC_008384	CG	3	6	174381	174386	0 %	0 %	50 %	50 %	116255361
3532	NC_008384	ATCA	2	8	174508	174515	50 %	25 %	0 %	25 %	116255361
3533	NC_008384	GTCA	2	8	174550	174557	25 %	25 %	25 %	25 %	116255361
3534	NC_008384	GT	3	6	174633	174638	0 %	50 %	50 %	0 %	116255362
3535	NC_008384	CCG	2	6	174709	174714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255362
3536	NC_008384	GCC	2	6	174745	174750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255362
3537	NC_008384	GGGA	2	8	174756	174763	25 %	0 %	75 %	0 %	116255362
3538	NC_008384	CGA	2	6	174824	174829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255362
3539	NC_008384	CGA	2	6	174845	174850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255362
3540	NC_008384	AGGACG	2	12	174952	174963	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116255362
3541	NC_008384	CGT	2	6	174992	174997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255362
3542	NC_008384	GAGGCA	2	12	175057	175068	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116255362
3543	NC_008384	GCCGAT	2	12	175107	175118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255362
3544	NC_008384	CGC	2	6	175169	175174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255362
3545	NC_008384	ATG	2	6	175216	175221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255362
3546	NC_008384	CGT	2	6	175247	175252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255362
3547	NC_008384	CAACG	2	10	175268	175277	40 %	0 %	20 %	40 %	116255362
3548	NC_008384	CGC	2	6	175286	175291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255362
3549	NC_008384	TCA	2	6	175406	175411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255362
3550	NC_008384	CCG	2	6	175421	175426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255362
3551	NC_008384	ATCT	2	8	175427	175434	25 %	50 %	0 %	25 %	116255362
3552	NC_008384	GCG	2	6	175523	175528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255362
3553	NC_008384	GGAT	2	8	175538	175545	25 %	25 %	50 %	0 %	116255362
3554	NC_008384	CGG	2	6	175748	175753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255363
3555	NC_008384	GGC	2	6	175908	175913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255363
3556	NC_008384	TCGC	2	8	176057	176064	0 %	25 %	25 %	50 %	116255363
3557	NC_008384	CGT	2	6	176104	176109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255363
3558	NC_008384	CGA	2	6	176130	176135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255363
3559	NC_008384	CCA	2	6	176197	176202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255363
3560	NC_008384	GGC	2	6	176412	176417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255363
3561	NC_008384	CAT	2	6	176418	176423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255363
3562	NC_008384	GCC	2	6	176519	176524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255364
3563	NC_008384	TAA	2	6	176548	176553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255364
3564	NC_008384	TGA	2	6	176646	176651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255364
3565	NC_008384	GAC	2	6	176696	176701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255364
3566	NC_008384	TGT	2	6	176731	176736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255364
3567	NC_008384	GTACG	2	10	176798	176807	20 %	20 %	40 %	20 %	116255364
3568	NC_008384	TCCC	2	8	176810	176817	0 %	25 %	0 %	75 %	116255364
3569	NC_008384	TCT	2	6	176866	176871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255364
3570	NC_008384	TGCT	2	8	176880	176887	0 %	50 %	25 %	25 %	116255364
3571	NC_008384	GGC	2	6	176909	176914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255364
3572	NC_008384	CCT	3	9	176932	176940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255364
3573	NC_008384	TTC	2	6	176945	176950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255364
3574	NC_008384	CTC	2	6	176960	176965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255364
3575	NC_008384	TTG	2	6	176973	176978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255364
3576	NC_008384	GTT	2	6	176993	176998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255364
3577	NC_008384	GCC	2	6	177014	177019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255364
3578	NC_008384	CGT	2	6	177022	177027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255364
3579	NC_008384	TCA	2	6	177120	177125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255364
3580	NC_008384	TCCT	2	8	177167	177174	0 %	50 %	0 %	50 %	116255364
3581	NC_008384	TCC	2	6	177261	177266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255364
3582	NC_008384	TGA	2	6	177458	177463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
3583	NC_008384	CG	3	6	177466	177471	0 %	0 %	50 %	50 %	116255365
3584	NC_008384	GCG	2	6	177543	177548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3585	NC_008384	GCC	2	6	177585	177590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3586	NC_008384	TCG	2	6	177628	177633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
3587	NC_008384	GGC	2	6	177646	177651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3588	NC_008384	ACA	2	6	177761	177766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255365
3589	NC_008384	GCCG	2	8	177785	177792	0 %	0 %	50 %	50 %	116255365
3590	NC_008384	CGC	2	6	177842	177847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3591	NC_008384	GCG	2	6	177939	177944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3592	NC_008384	GCA	2	6	177945	177950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255365
3593	NC_008384	GAT	2	6	178112	178117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
3594	NC_008384	CTT	2	6	178169	178174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255365
3595	NC_008384	CGG	2	6	178187	178192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3596	NC_008384	CGGG	2	8	178226	178233	0 %	0 %	75 %	25 %	116255365
3597	NC_008384	GCC	2	6	178302	178307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3598	NC_008384	CAA	2	6	178325	178330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255365
3599	NC_008384	TGA	2	6	178403	178408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
3600	NC_008384	GCG	2	6	178409	178414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3601	NC_008384	CG	3	6	178413	178418	0 %	0 %	50 %	50 %	116255365
3602	NC_008384	CGT	2	6	178472	178477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
3603	NC_008384	GCG	2	6	178512	178517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3604	NC_008384	CTGT	2	8	178536	178543	0 %	50 %	25 %	25 %	116255365
3605	NC_008384	AGA	2	6	178549	178554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255365
3606	NC_008384	GCC	2	6	178598	178603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3607	NC_008384	CGG	2	6	178631	178636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3608	NC_008384	CGT	2	6	178656	178661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
3609	NC_008384	GGA	2	6	178694	178699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255365
3610	NC_008384	TG	3	6	178704	178709	0 %	50 %	50 %	0 %	116255365
3611	NC_008384	GAT	2	6	178803	178808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
3612	NC_008384	CTG	2	6	178866	178871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255366
3613	NC_008384	CCG	2	6	178877	178882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255366
3614	NC_008384	CCCG	2	8	178912	178919	0 %	0 %	25 %	75 %	116255366
3615	NC_008384	CAAAGC	2	12	178928	178939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116255366
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3617	NC_008384	GAT	2	6	179053	179058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255366
3618	NC_008384	TGC	2	6	179107	179112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255366
3619	NC_008384	CTC	2	6	179302	179307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255366
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3621	NC_008384	TTG	2	6	179393	179398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255366
3622	NC_008384	GGA	2	6	179445	179450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255366
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3736	NC_008384	TTGA	2	8	185942	185949	25 %	50 %	25 %	0 %	116255371
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3863	NC_008384	GTC	2	6	194188	194193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255379
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3980	NC_008384	CGG	2	6	201768	201773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255387
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3982	NC_008384	CAGCT	2	10	201982	201991	20 %	20 %	20 %	40 %	116255387
3983	NC_008384	TTC	2	6	201997	202002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255387
3984	NC_008384	TGG	2	6	202008	202013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255387
3985	NC_008384	GCC	2	6	202019	202024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255387
3986	NC_008384	TCG	2	6	202091	202096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255387
3987	NC_008384	CTC	2	6	202111	202116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255387
3988	NC_008384	GGTC	2	8	202146	202153	0 %	25 %	50 %	25 %	116255387
3989	NC_008384	ATCG	2	8	202220	202227	25 %	25 %	25 %	25 %	116255387
3990	NC_008384	GCT	2	6	202309	202314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255387
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3999	NC_008384	GTC	2	6	202784	202789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255387
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