MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008384	TCG	2	6	44663	44668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1002	NC_008384	GGCC	2	8	44736	44743	0 %	0 %	50 %	50 %	116255235
1003	NC_008384	GGC	2	6	44773	44778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255235
1004	NC_008384	T	6	6	45148	45153	0 %	100 %	0 %	0 %	116255236
1005	NC_008384	GCG	3	9	45168	45176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1006	NC_008384	CGG	2	6	45184	45189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1007	NC_008384	TCG	2	6	45205	45210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1008	NC_008384	ATG	2	6	45228	45233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1009	NC_008384	TGA	2	6	45247	45252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1010	NC_008384	GC	4	8	45260	45267	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1011	NC_008384	CTC	2	6	45335	45340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255236
1012	NC_008384	TC	3	6	45368	45373	0 %	50 %	0 %	50 %	116255236
1013	NC_008384	TCGG	2	8	45378	45385	0 %	25 %	50 %	25 %	116255236
1014	NC_008384	ACG	2	6	45391	45396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1015	NC_008384	GCA	2	6	45415	45420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1016	NC_008384	GCC	2	6	45423	45428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1017	NC_008384	CGC	2	6	45434	45439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1018	NC_008384	GCCG	2	8	45443	45450	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1019	NC_008384	CGC	2	6	45530	45535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1020	NC_008384	GC	3	6	45534	45539	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1021	NC_008384	CGG	2	6	45692	45697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1022	NC_008384	TCG	2	6	45730	45735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1023	NC_008384	CG	3	6	45734	45739	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1024	NC_008384	TGC	2	6	45751	45756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1025	NC_008384	CGT	2	6	45773	45778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1026	NC_008384	GCT	2	6	45785	45790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1027	NC_008384	CCG	2	6	45874	45879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1028	NC_008384	CCG	2	6	45892	45897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1029	NC_008384	TGA	2	6	45988	45993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1030	NC_008384	CGCT	2	8	46014	46021	0 %	25 %	25 %	50 %	116255236
1031	NC_008384	TGC	2	6	46156	46161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1032	NC_008384	CGGG	2	8	46170	46177	0 %	0 %	75 %	25 %	116255236
1033	NC_008384	CCG	2	6	46178	46183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1034	NC_008384	TTC	2	6	46200	46205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255236
1035	NC_008384	GCCG	2	8	46208	46215	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1036	NC_008384	CAT	2	6	46250	46255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255236
1037	NC_008384	CCG	2	6	46312	46317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1038	NC_008384	GC	3	6	46362	46367	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1039	NC_008384	AGCG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	50 %	25 %	116255236
1040	NC_008384	GAG	2	6	46643	46648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255237
1041	NC_008384	CTAT	2	8	46689	46696	25 %	50 %	0 %	25 %	116255237
1042	NC_008384	GCG	2	6	46734	46739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1043	NC_008384	CCGCG	2	10	46813	46822	0 %	0 %	40 %	60 %	116255237
1044	NC_008384	GC	5	10	46832	46841	0 %	0 %	50 %	50 %	116255237
1045	NC_008384	CGG	3	9	46848	46856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1046	NC_008384	ATC	2	6	46925	46930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255237
1047	NC_008384	GATCC	2	10	46931	46940	20 %	20 %	20 %	40 %	116255237
1048	NC_008384	GTC	2	6	46941	46946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1049	NC_008384	AGC	2	6	47002	47007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1050	NC_008384	CCG	2	6	47041	47046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255237
1051	NC_008384	CAG	2	6	47104	47109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1052	NC_008384	GC	3	6	47411	47416	0 %	0 %	50 %	50 %	116255237
1053	NC_008384	AGA	2	6	47436	47441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255237
1054	NC_008384	CGG	2	6	47464	47469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1055	NC_008384	CAA	2	6	47485	47490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255237
1056	NC_008384	CTG	2	6	47492	47497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1057	NC_008384	GAA	2	6	47527	47532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255237
1058	NC_008384	TC	3	6	47548	47553	0 %	50 %	0 %	50 %	116255237
1059	NC_008384	CCG	2	6	47632	47637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255237
1060	NC_008384	ATG	2	6	47687	47692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255237
1061	NC_008384	CGA	2	6	47757	47762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1062	NC_008384	TCG	2	6	47805	47810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1063	NC_008384	CGG	2	6	47836	47841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1064	NC_008384	GAA	2	6	47864	47869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255237
1065	NC_008384	GCC	2	6	47896	47901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255237
1066	NC_008384	CGA	2	6	47929	47934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1067	NC_008384	TTC	2	6	47981	47986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255237
1068	NC_008384	ACC	2	6	47987	47992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255237
1069	NC_008384	CGGCCT	2	12	48013	48024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116255237
1070	NC_008384	TGA	3	9	48066	48074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255237
1071	NC_008384	AGC	2	6	48077	48082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1072	NC_008384	GAC	2	6	48136	48141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1073	NC_008384	AGG	2	6	48168	48173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255237
1074	NC_008384	TCG	2	6	48198	48203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1075	NC_008384	TGGTC	2	10	48217	48226	0 %	40 %	40 %	20 %	116255237
1076	NC_008384	TGA	2	6	48228	48233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255237
1077	NC_008384	ACG	2	6	48236	48241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1078	NC_008384	GGA	2	6	48250	48255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255237
1079	NC_008384	CCATG	2	10	48343	48352	20 %	20 %	20 %	40 %	116255237
1080	NC_008384	GC	3	6	48366	48371	0 %	0 %	50 %	50 %	116255237
1081	NC_008384	ATC	2	6	48413	48418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255237
1082	NC_008384	TCG	2	6	48459	48464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1083	NC_008384	CCG	2	6	48545	48550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1084	NC_008384	CGC	2	6	48571	48576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
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1086	NC_008384	CGC	2	6	48608	48613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1087	NC_008384	GTT	2	6	48647	48652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255238
1088	NC_008384	GAT	2	6	48662	48667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255238
1089	NC_008384	GCC	2	6	48674	48679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1090	NC_008384	GGCATC	2	12	48707	48718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255238
1091	NC_008384	CGC	2	6	48764	48769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1092	NC_008384	CG	3	6	48775	48780	0 %	0 %	50 %	50 %	116255238
1093	NC_008384	CGT	2	6	48802	48807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255238
1094	NC_008384	GCA	2	6	48814	48819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255238
1095	NC_008384	CGC	2	6	48888	48893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1096	NC_008384	GTCG	2	8	48911	48918	0 %	25 %	50 %	25 %	116255238
1097	NC_008384	GCG	2	6	48967	48972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255238
1098	NC_008384	CCG	2	6	49058	49063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1099	NC_008384	CGA	2	6	49153	49158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255238
1100	NC_008384	AGC	2	6	49221	49226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255238
1101	NC_008384	CAGA	2	8	49229	49236	50 %	0 %	25 %	25 %	116255238
1102	NC_008384	CG	3	6	49247	49252	0 %	0 %	50 %	50 %	116255238
1103	NC_008384	GCC	2	6	49309	49314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255238
1104	NC_008384	TTC	2	6	49340	49345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255239
1105	NC_008384	ATC	2	6	49346	49351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255239
1106	NC_008384	CAT	2	6	49366	49371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255239
1107	NC_008384	GAT	2	6	49383	49388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255239
1108	NC_008384	CGA	2	6	49422	49427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255239
1109	NC_008384	TGA	2	6	49428	49433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255239
1110	NC_008384	CCAC	2	8	49459	49466	25 %	0 %	0 %	75 %	116255239
1111	NC_008384	GAA	2	6	49492	49497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255239
1112	NC_008384	GAC	2	6	49507	49512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255239
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1114	NC_008384	CCAG	2	8	49584	49591	25 %	0 %	25 %	50 %	116255239
1115	NC_008384	GGCC	2	8	49656	49663	0 %	0 %	50 %	50 %	116255239
1116	NC_008384	GTG	2	6	49684	49689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255239
1117	NC_008384	ATC	2	6	49727	49732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255239
1118	NC_008384	CAG	2	6	49743	49748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255240
1119	NC_008384	GAC	2	6	49776	49781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255240
1120	NC_008384	GGC	3	9	49817	49825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255240
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1122	NC_008384	CGA	2	6	49916	49921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255240
1123	NC_008384	GAA	2	6	49926	49931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255240
1124	NC_008384	GGA	2	6	49932	49937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255240
1125	NC_008384	TTGCG	2	10	50063	50072	0 %	40 %	40 %	20 %	116255240
1126	NC_008384	GCA	2	6	50081	50086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255240
1127	NC_008384	GAG	2	6	50107	50112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255240
1128	NC_008384	AGC	2	6	50116	50121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255240
1129	NC_008384	CGG	2	6	50162	50167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255240
1130	NC_008384	TCA	2	6	50243	50248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255240
1131	NC_008384	GAT	2	6	50285	50290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255240
1132	NC_008384	TCA	2	6	50351	50356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255240
1133	NC_008384	GCAA	2	8	50367	50374	50 %	0 %	25 %	25 %	116255241
1134	NC_008384	CGG	2	6	50410	50415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255241
1135	NC_008384	ACC	2	6	50460	50465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255241
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1138	NC_008384	CCA	2	6	50495	50500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255241
1139	NC_008384	GCCGGT	2	12	50555	50566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255241
1140	NC_008384	TTC	2	6	50568	50573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255241
1141	NC_008384	TTC	2	6	50622	50627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255241
1142	NC_008384	CAC	2	6	50654	50659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255241
1143	NC_008384	CGG	3	9	50684	50692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255241
1144	NC_008384	CGC	2	6	50734	50739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255241
1145	NC_008384	GTC	2	6	50741	50746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255241
1146	NC_008384	GAC	2	6	50774	50779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255241
1147	NC_008384	GGC	2	6	50795	50800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255241
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1149	NC_008384	GAT	2	6	50837	50842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
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1154	NC_008384	GAT	2	6	51053	51058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
1155	NC_008384	GCA	2	6	51097	51102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255241
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1157	NC_008384	GCC	2	6	51143	51148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255241
1158	NC_008384	GAT	2	6	51263	51268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
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1162	NC_008384	GTG	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255241
1163	NC_008384	CGA	2	6	51421	51426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255241
1164	NC_008384	GCA	2	6	51451	51456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255241
1165	NC_008384	CCAGAT	2	12	51482	51493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255241
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1209	NC_008384	TGA	2	6	52975	52980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255242
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1232	NC_008384	TCT	2	6	54199	54204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255243
1233	NC_008384	GCCC	2	8	54219	54226	0 %	0 %	25 %	75 %	116255243
1234	NC_008384	CGT	2	6	54236	54241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255243
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1239	NC_008384	GAT	2	6	54482	54487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255243
1240	NC_008384	GC	3	6	54499	54504	0 %	0 %	50 %	50 %	116255243
1241	NC_008384	TCG	2	6	54544	54549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255243
1242	NC_008384	CTT	2	6	54596	54601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255243
1243	NC_008384	CGT	2	6	54620	54625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255243
1244	NC_008384	CTG	2	6	54675	54680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255243
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1246	NC_008384	TGC	2	6	54718	54723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255243
1247	NC_008384	TGG	2	6	54853	54858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255243
1248	NC_008384	CGGT	2	8	54877	54884	0 %	25 %	50 %	25 %	116255243
1249	NC_008384	ATC	2	6	54894	54899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255243
1250	NC_008384	CGGC	2	8	54926	54933	0 %	0 %	50 %	50 %	116255243
1251	NC_008384	GC	3	6	54932	54937	0 %	0 %	50 %	50 %	116255243
1252	NC_008384	TCA	2	6	54958	54963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255243
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1254	NC_008384	CGC	2	6	55168	55173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255243
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1257	NC_008384	CTA	2	6	55220	55225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255243
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1259	NC_008384	GCA	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255243
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1273	NC_008384	CTT	2	6	56160	56165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255245
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1280	NC_008384	GCG	2	6	56368	56373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255246
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1282	NC_008384	GGCGA	2	10	56475	56484	20 %	0 %	60 %	20 %	116255246
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1284	NC_008384	CGG	2	6	56494	56499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255246
1285	NC_008384	GA	3	6	56505	56510	50 %	0 %	50 %	0 %	116255246
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1349	NC_008384	GAC	2	6	59420	59425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255247
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1352	NC_008384	T	6	6	59482	59487	0 %	100 %	0 %	0 %	116255247
1353	NC_008384	ATG	2	6	59705	59710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255248
1354	NC_008384	GTCGAG	2	12	59731	59742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255248
1355	NC_008384	GCG	2	6	59765	59770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255248
1356	NC_008384	GC	3	6	59861	59866	0 %	0 %	50 %	50 %	116255248
1357	NC_008384	CGC	2	6	59883	59888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255248
1358	NC_008384	CGA	2	6	59892	59897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255248
1359	NC_008384	GCCT	2	8	59953	59960	0 %	25 %	25 %	50 %	116255248
1360	NC_008384	TGC	2	6	60052	60057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255248
1361	NC_008384	CAG	2	6	60091	60096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255248
1362	NC_008384	GCA	2	6	60114	60119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255248
1363	NC_008384	GCC	2	6	60125	60130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255248
1364	NC_008384	CGC	2	6	60136	60141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255248
1365	NC_008384	GCA	2	6	60152	60157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255248
1366	NC_008384	CGC	3	9	60165	60173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255248
1367	NC_008384	CCG	2	6	60174	60179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255248
1368	NC_008384	GAT	2	6	60184	60189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255248
1369	NC_008384	TCGG	2	8	60200	60207	0 %	25 %	50 %	25 %	116255248
1370	NC_008384	CCGGCG	2	12	60210	60221	0 %	0 %	50 %	50 %	116255248
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1373	NC_008384	CGGC	2	8	60368	60375	0 %	0 %	50 %	50 %	116255248
1374	NC_008384	GCCG	2	8	60483	60490	0 %	0 %	50 %	50 %	116255248
1375	NC_008384	GAT	2	6	60505	60510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255248
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1393	NC_008384	GCTG	2	8	61067	61074	0 %	25 %	50 %	25 %	116255249
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1404	NC_008384	TCG	2	6	61384	61389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255249
1405	NC_008384	CCGGT	2	10	61399	61408	0 %	20 %	40 %	40 %	116255249
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1477	NC_008384	CGA	2	6	64337	64342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255251
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1491	NC_008384	CGA	2	6	64789	64794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255252
1492	NC_008384	GCG	2	6	64840	64845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255252
1493	NC_008384	GCGG	2	8	64859	64866	0 %	0 %	75 %	25 %	116255252
1494	NC_008384	GAC	2	6	64868	64873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255252
1495	NC_008384	TCG	2	6	64890	64895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255252
1496	NC_008384	GC	3	6	64905	64910	0 %	0 %	50 %	50 %	116255252
1497	NC_008384	GCC	2	6	64912	64917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255252
1498	NC_008384	GCCG	2	8	64925	64932	0 %	0 %	50 %	50 %	116255252
1499	NC_008384	GCCG	2	8	64934	64941	0 %	0 %	50 %	50 %	116255252
1500	NC_008384	CGA	2	6	64945	64950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255252

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