MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008384	CACG	2	8	281409	281416	25 %	0 %	25 %	50 %	116255459
5502	NC_008384	TCCG	2	8	281463	281470	0 %	25 %	25 %	50 %	116255459
5503	NC_008384	AAT	2	6	281490	281495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255459
5504	NC_008384	GTC	2	6	281630	281635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255460
5505	NC_008384	CAT	2	6	281671	281676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255460
5506	NC_008384	GC	3	6	281770	281775	0 %	0 %	50 %	50 %	116255460
5507	NC_008384	CGA	2	6	281875	281880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255460
5508	NC_008384	CG	3	6	281944	281949	0 %	0 %	50 %	50 %	116255460
5509	NC_008384	CTG	2	6	281987	281992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255460
5510	NC_008384	AGG	2	6	282002	282007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255460
5511	NC_008384	TCG	2	6	282032	282037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255460
5512	NC_008384	GC	3	6	282094	282099	0 %	0 %	50 %	50 %	116255460
5513	NC_008384	GAA	2	6	282110	282115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255460
5514	NC_008384	TTC	2	6	282142	282147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255460
5515	NC_008384	CGA	2	6	282164	282169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255460
5516	NC_008384	CGGT	2	8	282189	282196	0 %	25 %	50 %	25 %	116255460
5517	NC_008384	GCC	3	9	282247	282255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255460
5518	NC_008384	GCG	2	6	282291	282296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255460
5519	NC_008384	CTC	2	6	282338	282343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255460
5520	NC_008384	AGA	2	6	282368	282373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255460
5521	NC_008384	GGC	2	6	282480	282485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255461
5522	NC_008384	GCC	2	6	282516	282521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255461
5523	NC_008384	CGA	2	6	282548	282553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5524	NC_008384	ACC	2	6	282560	282565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255461
5525	NC_008384	GCC	2	6	282594	282599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255461
5526	NC_008384	TGCGC	2	10	282614	282623	0 %	20 %	40 %	40 %	116255461
5527	NC_008384	GGC	2	6	282662	282667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255461
5528	NC_008384	CA	3	6	282726	282731	50 %	0 %	0 %	50 %	116255461
5529	NC_008384	GAC	2	6	282737	282742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5530	NC_008384	CG	3	6	282814	282819	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5531	NC_008384	CTT	2	6	282855	282860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255461
5532	NC_008384	CTC	2	6	282867	282872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255461
5533	NC_008384	GTC	2	6	282945	282950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5534	NC_008384	GC	3	6	282970	282975	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5535	NC_008384	GGT	2	6	283145	283150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255461
5536	NC_008384	GCA	2	6	283159	283164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5537	NC_008384	TCA	2	6	283180	283185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255461
5538	NC_008384	AGG	2	6	283231	283236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255461
5539	NC_008384	CTGG	2	8	283250	283257	0 %	25 %	50 %	25 %	116255461
5540	NC_008384	TGCC	2	8	283333	283340	0 %	25 %	25 %	50 %	116255461
5541	NC_008384	GC	3	6	283344	283349	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5542	NC_008384	CAA	2	6	283358	283363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255461
5543	NC_008384	GCT	2	6	283409	283414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5544	NC_008384	GGC	2	6	283523	283528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255461
5545	NC_008384	ACG	2	6	283563	283568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5546	NC_008384	CGC	2	6	283573	283578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255461
5547	NC_008384	GCAA	2	8	283613	283620	50 %	0 %	25 %	25 %	116255461
5548	NC_008384	CTC	2	6	283634	283639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255461
5549	NC_008384	CGA	2	6	283648	283653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5550	NC_008384	CAC	2	6	283661	283666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255461
5551	NC_008384	GCA	2	6	283682	283687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5552	NC_008384	GTC	2	6	283785	283790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5553	NC_008384	ATCGAC	2	12	283941	283952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255461
5554	NC_008384	CG	3	6	284015	284020	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5555	NC_008384	GC	3	6	284085	284090	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5556	NC_008384	AC	3	6	284119	284124	50 %	0 %	0 %	50 %	116255461
5557	NC_008384	CGTC	2	8	284182	284189	0 %	25 %	25 %	50 %	116255461
5558	NC_008384	CAT	2	6	284222	284227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255461
5559	NC_008384	GGCAG	2	10	284240	284249	20 %	0 %	60 %	20 %	116255461
5560	NC_008384	CCT	2	6	284324	284329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255461
5561	NC_008384	TGG	2	6	284335	284340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255461
5562	NC_008384	CGGC	2	8	284383	284390	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5563	NC_008384	TCG	2	6	284428	284433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5564	NC_008384	TCG	3	9	284449	284457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255461
5565	NC_008384	ATG	3	9	284473	284481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255461
5566	NC_008384	GCG	2	6	284506	284511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255461
5567	NC_008384	ACCGA	2	10	284556	284565	40 %	0 %	20 %	40 %	116255461
5568	NC_008384	GAGTG	2	10	284570	284579	20 %	20 %	60 %	0 %	116255461
5569	NC_008384	CCG	2	6	284616	284621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255461
5570	NC_008384	CG	3	6	284644	284649	0 %	0 %	50 %	50 %	116255461
5571	NC_008384	CGG	2	6	284696	284701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255461
5572	NC_008384	CGAC	2	8	285259	285266	25 %	0 %	25 %	50 %	116255462
5573	NC_008384	CGC	2	6	285362	285367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5574	NC_008384	TC	3	6	285397	285402	0 %	50 %	0 %	50 %	116255462
5575	NC_008384	GAG	3	9	285408	285416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255462
5576	NC_008384	GCC	2	6	285420	285425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5577	NC_008384	CGA	2	6	285566	285571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5578	NC_008384	GCC	2	6	285600	285605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5579	NC_008384	CTTC	2	8	285619	285626	0 %	50 %	0 %	50 %	116255462
5580	NC_008384	CGC	2	6	285650	285655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5581	NC_008384	CCG	3	9	285667	285675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5582	NC_008384	TCG	2	6	285769	285774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5583	NC_008384	GCG	2	6	285775	285780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255462
5584	NC_008384	ATCGG	2	10	285813	285822	20 %	20 %	40 %	20 %	116255462
5585	NC_008384	GCT	2	6	285881	285886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5586	NC_008384	GC	3	6	285988	285993	0 %	0 %	50 %	50 %	116255462
5587	NC_008384	CGC	2	6	286018	286023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255462
5588	NC_008384	T	6	6	286072	286077	0 %	100 %	0 %	0 %	116255462
5589	NC_008384	GCT	2	6	286099	286104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5590	NC_008384	GC	3	6	286156	286161	0 %	0 %	50 %	50 %	116255462
5591	NC_008384	GCGG	2	8	286261	286268	0 %	0 %	75 %	25 %	116255462
5592	NC_008384	CAT	2	6	286286	286291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255462
5593	NC_008384	GC	3	6	286346	286351	0 %	0 %	50 %	50 %	116255462
5594	NC_008384	GCT	2	6	286361	286366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5595	NC_008384	CG	3	6	286389	286394	0 %	0 %	50 %	50 %	116255462
5596	NC_008384	ACGG	2	8	286397	286404	25 %	0 %	50 %	25 %	116255462
5597	NC_008384	TGC	2	6	286459	286464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5598	NC_008384	GGC	2	6	286511	286516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255462
5599	NC_008384	ACA	2	6	286594	286599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255462
5600	NC_008384	GGCC	2	8	286610	286617	0 %	0 %	50 %	50 %	116255462
5601	NC_008384	CAG	2	6	286629	286634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255462
5602	NC_008384	CCG	2	6	286661	286666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255463
5603	NC_008384	CTTGG	2	10	286690	286699	0 %	40 %	40 %	20 %	116255463
5604	NC_008384	TGTC	2	8	286700	286707	0 %	50 %	25 %	25 %	116255463
5605	NC_008384	AGC	2	6	286747	286752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255463
5606	NC_008384	ACG	2	6	286846	286851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255463
5607	NC_008384	CGG	2	6	286902	286907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255463
5608	NC_008384	GAAG	2	8	286935	286942	50 %	0 %	50 %	0 %	116255463
5609	NC_008384	GCG	2	6	286982	286987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255463
5610	NC_008384	AGGC	2	8	287093	287100	25 %	0 %	50 %	25 %	116255463
5611	NC_008384	TCT	2	6	287147	287152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255463
5612	NC_008384	CCG	2	6	287162	287167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255463
5613	NC_008384	TCG	2	6	287186	287191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255463
5614	NC_008384	AC	3	6	287208	287213	50 %	0 %	0 %	50 %	116255463
5615	NC_008384	TC	3	6	287293	287298	0 %	50 %	0 %	50 %	116255463
5616	NC_008384	CCG	2	6	287351	287356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255463
5617	NC_008384	GA	3	6	287376	287381	50 %	0 %	50 %	0 %	116255463
5618	NC_008384	GGAA	2	8	287427	287434	50 %	0 %	50 %	0 %	116255463
5619	NC_008384	GA	3	6	287450	287455	50 %	0 %	50 %	0 %	116255464
5620	NC_008384	CGG	2	6	287516	287521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255464
5621	NC_008384	CGG	2	6	287563	287568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255464
5622	NC_008384	CGT	2	6	287576	287581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255464
5623	NC_008384	TGC	2	6	287587	287592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255464
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5861	NC_008384	GATC	2	8	299957	299964	25 %	25 %	25 %	25 %	116255476
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5984	NC_008384	GAA	2	6	306180	306185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255480
5985	NC_008384	ATT	2	6	306376	306381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255481
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5987	NC_008384	TCG	2	6	306463	306468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255481
5988	NC_008384	TCG	2	6	306529	306534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255481
5989	NC_008384	TCG	2	6	306591	306596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255481
5990	NC_008384	GAT	2	6	306620	306625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255481
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