MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 2549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008383	GGATC	2	10	117139	117148	20 %	20 %	40 %	20 %	116255167
2002	NC_008383	TCA	2	6	117185	117190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255167
2003	NC_008383	TGC	2	6	117272	117277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255167
2004	NC_008383	CGA	2	6	117311	117316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255167
2005	NC_008383	GCC	2	6	117342	117347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255167
2006	NC_008383	GAC	2	6	117355	117360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255167
2007	NC_008383	G	6	6	117392	117397	0 %	0 %	100 %	0 %	116255167
2008	NC_008383	GAG	2	6	117549	117554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255167
2009	NC_008383	GTC	2	6	117911	117916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255168
2010	NC_008383	CCG	2	6	118005	118010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255168
2011	NC_008383	TCA	2	6	118050	118055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255168
2012	NC_008383	TCG	2	6	118122	118127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255168
2013	NC_008383	GGC	2	6	118207	118212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255168
2014	NC_008383	CGA	2	6	118225	118230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255168
2015	NC_008383	GCC	2	6	118262	118267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255168
2016	NC_008383	CGC	2	6	118285	118290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255168
2017	NC_008383	CGC	2	6	118342	118347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255168
2018	NC_008383	TCG	2	6	118359	118364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255168
2019	NC_008383	GGC	2	6	118426	118431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255168
2020	NC_008383	AAG	2	6	118754	118759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255169
2021	NC_008383	GCG	2	6	118856	118861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255169
2022	NC_008383	CCCG	2	8	118881	118888	0 %	0 %	25 %	75 %	116255169
2023	NC_008383	TCG	2	6	118967	118972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255169
2024	NC_008383	GCC	2	6	119009	119014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255169
2025	NC_008383	CGA	2	6	119037	119042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255169
2026	NC_008383	CGGA	2	8	119076	119083	25 %	0 %	50 %	25 %	116255169
2027	NC_008383	GGT	2	6	119087	119092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255169
2028	NC_008383	TAT	2	6	119171	119176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255169
2029	NC_008383	CCGG	2	8	119179	119186	0 %	0 %	50 %	50 %	116255169
2030	NC_008383	TTC	2	6	119231	119236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255169
2031	NC_008383	TGG	2	6	119263	119268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255169
2032	NC_008383	GCC	2	6	119311	119316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255169
2033	NC_008383	GCG	2	6	119336	119341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255169
2034	NC_008383	GCC	2	6	119384	119389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255169
2035	NC_008383	GTT	2	6	119475	119480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255169
2036	NC_008383	CGT	2	6	119535	119540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255169
2037	NC_008383	CGA	2	6	119569	119574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255169
2038	NC_008383	GGC	2	6	119593	119598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255169
2039	NC_008383	GC	3	6	119611	119616	0 %	0 %	50 %	50 %	116255169
2040	NC_008383	CTTC	2	8	119623	119630	0 %	50 %	0 %	50 %	116255169
2041	NC_008383	GGC	2	6	119647	119652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255169
2042	NC_008383	GCT	2	6	119666	119671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255169
2043	NC_008383	CGGT	2	8	119701	119708	0 %	25 %	50 %	25 %	116255170
2044	NC_008383	CGC	2	6	119709	119714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255170
2045	NC_008383	GGT	2	6	119719	119724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255170
2046	NC_008383	CGA	2	6	119841	119846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255170
2047	NC_008383	TCC	2	6	119875	119880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255170
2048	NC_008383	GAT	2	6	119885	119890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255170
2049	NC_008383	CTA	2	6	120361	120366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255171
2050	NC_008383	GCC	2	6	120513	120518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255171
2051	NC_008383	GACC	2	8	120539	120546	25 %	0 %	25 %	50 %	116255171
2052	NC_008383	GCT	2	6	120781	120786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255172
2053	NC_008383	GCC	2	6	120855	120860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255172
2054	NC_008383	GTC	3	9	120951	120959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255172
2055	NC_008383	GAA	2	6	121011	121016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255172
2056	NC_008383	CGA	2	6	121049	121054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255172
2057	NC_008383	GC	4	8	121086	121093	0 %	0 %	50 %	50 %	116255172
2058	NC_008383	TCA	2	6	121105	121110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255172
2059	NC_008383	TGGC	2	8	121124	121131	0 %	25 %	50 %	25 %	116255172
2060	NC_008383	C	6	6	121143	121148	0 %	0 %	0 %	100 %	116255172
2061	NC_008383	CCG	2	6	121239	121244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255172
2062	NC_008383	TCTCT	2	10	121286	121295	0 %	60 %	0 %	40 %	116255172
2063	NC_008383	CT	4	8	121292	121299	0 %	50 %	0 %	50 %	116255172
2064	NC_008383	TCG	2	6	121523	121528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255173
2065	NC_008383	TCG	2	6	121538	121543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255173
2066	NC_008383	GGC	2	6	121617	121622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255173
2067	NC_008383	CAT	2	6	121641	121646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255173
2068	NC_008383	CGA	2	6	121674	121679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255173
2069	NC_008383	GCC	2	6	121681	121686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255173
2070	NC_008383	TTG	2	6	121735	121740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255173
2071	NC_008383	GAC	2	6	121741	121746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255173
2072	NC_008383	CGG	2	6	121811	121816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255173
2073	NC_008383	GCG	2	6	121823	121828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255173
2074	NC_008383	GGA	2	6	121863	121868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255173
2075	NC_008383	GCTCG	2	10	121872	121881	0 %	20 %	40 %	40 %	116255173
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2080	NC_008383	GCA	2	6	122416	122421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255175
2081	NC_008383	ATC	2	6	122476	122481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255175
2082	NC_008383	CGC	2	6	122502	122507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255175
2083	NC_008383	GCC	3	9	122513	122521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255175
2084	NC_008383	GTC	2	6	122539	122544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255175
2085	NC_008383	CTT	2	6	122598	122603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255175
2086	NC_008383	TTG	2	6	122875	122880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255176
2087	NC_008383	CGA	2	6	122981	122986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255176
2088	NC_008383	GCG	2	6	123091	123096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255176
2089	NC_008383	GC	3	6	123210	123215	0 %	0 %	50 %	50 %	116255177
2090	NC_008383	GTG	2	6	123269	123274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255177
2091	NC_008383	TGC	2	6	123292	123297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255177
2092	NC_008383	TCGA	2	8	123348	123355	25 %	25 %	25 %	25 %	116255177
2093	NC_008383	TAG	2	6	123363	123368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255177
2094	NC_008383	CG	3	6	123441	123446	0 %	0 %	50 %	50 %	116255177
2095	NC_008383	CGAA	2	8	123571	123578	50 %	0 %	25 %	25 %	116255177
2096	NC_008383	TCT	2	6	123613	123618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255177
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2098	NC_008383	CTC	2	6	123684	123689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255177
2099	NC_008383	CAG	2	6	123713	123718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255177
2100	NC_008383	GTTCG	2	10	123858	123867	0 %	40 %	40 %	20 %	116255178
2101	NC_008383	CGG	2	6	123943	123948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255178
2102	NC_008383	CG	3	6	123957	123962	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2103	NC_008383	GAC	2	6	124081	124086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255178
2104	NC_008383	CG	3	6	124088	124093	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2105	NC_008383	GTC	2	6	124129	124134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255178
2106	NC_008383	CCG	2	6	124237	124242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255178
2107	NC_008383	ATC	2	6	124276	124281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255178
2108	NC_008383	CCGG	2	8	124302	124309	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2109	NC_008383	CG	3	6	124313	124318	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2110	NC_008383	GAG	2	6	124362	124367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255178
2111	NC_008383	AGGA	2	8	124417	124424	50 %	0 %	50 %	0 %	116255178
2112	NC_008383	GAT	2	6	124428	124433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255178
2113	NC_008383	CG	3	6	124436	124441	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2114	NC_008383	TGA	2	6	124481	124486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255178
2115	NC_008383	GCG	2	6	124636	124641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255178
2116	NC_008383	GC	4	8	124692	124699	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2117	NC_008383	GA	3	6	124720	124725	50 %	0 %	50 %	0 %	116255178
2118	NC_008383	AGC	2	6	124804	124809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255178
2119	NC_008383	CG	3	6	124821	124826	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2120	NC_008383	GAA	2	6	124827	124832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255178
2121	NC_008383	CG	3	6	124851	124856	0 %	0 %	50 %	50 %	116255178
2122	NC_008383	ACG	2	6	124877	124882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255178
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2126	NC_008383	ACG	2	6	125047	125052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255178
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2239	NC_008383	CGG	2	6	130410	130415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255182
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2241	NC_008383	CGG	2	6	130449	130454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255182
2242	NC_008383	CGAT	2	8	130484	130491	25 %	25 %	25 %	25 %	116255182
2243	NC_008383	GGC	2	6	130538	130543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255182
2244	NC_008383	AGG	2	6	130560	130565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255182
2245	NC_008383	CCGG	2	8	130573	130580	0 %	0 %	50 %	50 %	116255182
2246	NC_008383	TCC	2	6	130589	130594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255182
2247	NC_008383	GCT	2	6	130724	130729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255183
2248	NC_008383	AT	3	6	130741	130746	50 %	50 %	0 %	0 %	116255183
2249	NC_008383	GTC	2	6	130818	130823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255183
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2251	NC_008383	GGC	2	6	130858	130863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255183
2252	NC_008383	CG	3	6	130866	130871	0 %	0 %	50 %	50 %	116255183
2253	NC_008383	TCG	2	6	130935	130940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255183
2254	NC_008383	TTCGTT	2	12	130952	130963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116255183
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2262	NC_008383	GGC	2	6	131415	131420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255183
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2271	NC_008383	ATC	2	6	131771	131776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255183
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2275	NC_008383	CGA	2	6	131950	131955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255184
2276	NC_008383	CTCG	2	8	132009	132016	0 %	25 %	25 %	50 %	116255184
2277	NC_008383	CGA	2	6	132019	132024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255184
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2279	NC_008383	CGA	2	6	132106	132111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255184
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2283	NC_008383	TGG	2	6	132246	132251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255184
2284	NC_008383	ACGAT	2	10	132252	132261	40 %	20 %	20 %	20 %	116255184
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2287	NC_008383	GATC	2	8	132451	132458	25 %	25 %	25 %	25 %	116255184
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2309	NC_008383	TCG	2	6	134367	134372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255186
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2311	NC_008383	TTTG	2	8	134440	134447	0 %	75 %	25 %	0 %	116255187
2312	NC_008383	AAC	2	6	134499	134504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255187
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2319	NC_008383	AGACAA	2	12	134656	134667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116255187
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2324	NC_008383	AAC	2	6	135183	135188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255187
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2329	NC_008383	ATC	2	6	135248	135253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255187
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2331	NC_008383	GTT	2	6	135269	135274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255187
2332	NC_008383	CCTT	2	8	135297	135304	0 %	50 %	0 %	50 %	116255187
2333	NC_008383	AAGG	2	8	135365	135372	50 %	0 %	50 %	0 %	116255187
2334	NC_008383	CG	3	6	135419	135424	0 %	0 %	50 %	50 %	116255187
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2343	NC_008383	CGC	2	6	135965	135970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255187
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2348	NC_008383	TCTGG	2	10	136586	136595	0 %	40 %	40 %	20 %	116255188
2349	NC_008383	CGC	2	6	136613	136618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255188
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2352	NC_008383	CGATC	2	10	136764	136773	20 %	20 %	20 %	40 %	116255188
2353	NC_008383	CT	3	6	136855	136860	0 %	50 %	0 %	50 %	116255188
2354	NC_008383	GAAG	2	8	136863	136870	50 %	0 %	50 %	0 %	116255188
2355	NC_008383	ATA	2	6	136940	136945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255188
2356	NC_008383	ACG	2	6	136971	136976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255188
2357	NC_008383	CAA	2	6	136992	136997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255188
2358	NC_008383	GCAT	2	8	137099	137106	25 %	25 %	25 %	25 %	116255189
2359	NC_008383	TCG	2	6	137112	137117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255189
2360	NC_008383	TCG	2	6	137156	137161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255189
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2362	NC_008383	TC	3	6	137326	137331	0 %	50 %	0 %	50 %	116255189
2363	NC_008383	ATG	2	6	137567	137572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255190
2364	NC_008383	TTC	2	6	137639	137644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255190
2365	NC_008383	GC	3	6	137692	137697	0 %	0 %	50 %	50 %	116255190
2366	NC_008383	CCG	2	6	137867	137872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255190
2367	NC_008383	GAT	2	6	137899	137904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255190
2368	NC_008383	GAC	2	6	137914	137919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255190
2369	NC_008383	CTG	2	6	138124	138129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255190
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2466	NC_008383	GCTC	2	8	142837	142844	0 %	25 %	25 %	50 %	116255195
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2473	NC_008383	GA	3	6	143145	143150	50 %	0 %	50 %	0 %	116255196
2474	NC_008383	TCA	2	6	143567	143572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255196
2475	NC_008383	GCT	2	6	143573	143578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
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2477	NC_008383	ATTGC	2	10	143764	143773	20 %	40 %	20 %	20 %	116255196
2478	NC_008383	CGC	2	6	143906	143911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255196
2479	NC_008383	CCG	2	6	143929	143934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255196
2480	NC_008383	AGCGTC	2	12	143941	143952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2481	NC_008383	GGC	2	6	144012	144017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255196
2482	NC_008383	GAG	2	6	144027	144032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255196
2483	NC_008383	TCG	2	6	144082	144087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2484	NC_008383	GGA	2	6	144151	144156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255196
2485	NC_008383	TGA	2	6	144233	144238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255196
2486	NC_008383	CGA	2	6	144346	144351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2487	NC_008383	CCGCCT	2	12	144353	144364	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116255196
2488	NC_008383	TCG	2	6	144388	144393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2489	NC_008383	CCA	2	6	144428	144433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255196
2490	NC_008383	CGAC	2	8	144497	144504	25 %	0 %	25 %	50 %	116255196
2491	NC_008383	CTG	2	6	144549	144554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2492	NC_008383	CTT	2	6	144558	144563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255196
2493	NC_008383	GCT	2	6	144581	144586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2494	NC_008383	TCC	2	6	144592	144597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255196
2495	NC_008383	CGA	2	6	144618	144623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2496	NC_008383	ATCG	2	8	144693	144700	25 %	25 %	25 %	25 %	116255196
2497	NC_008383	CCG	2	6	144755	144760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255196
2498	NC_008383	TCG	2	6	144850	144855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255196
2499	NC_008383	GA	3	6	144916	144921	50 %	0 %	50 %	0 %	116255196
2500	NC_008383	GCG	2	6	144957	144962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255196

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