MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 2549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008383	GC	3	6	61714	61719	0 %	0 %	50 %	50 %	116255119
1002	NC_008383	TGC	2	6	61743	61748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1003	NC_008383	GTC	2	6	61763	61768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1004	NC_008383	CGC	2	6	61818	61823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255119
1005	NC_008383	GC	4	8	61822	61829	0 %	0 %	50 %	50 %	116255119
1006	NC_008383	CGG	2	6	61862	61867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255119
1007	NC_008383	CGAT	2	8	61899	61906	25 %	25 %	25 %	25 %	116255119
1008	NC_008383	CCG	2	6	61917	61922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255119
1009	NC_008383	CAA	2	6	61978	61983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255119
1010	NC_008383	GTCG	2	8	61988	61995	0 %	25 %	50 %	25 %	116255119
1011	NC_008383	GAG	2	6	62015	62020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255119
1012	NC_008383	TCG	2	6	62061	62066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1013	NC_008383	CAGG	2	8	62083	62090	25 %	0 %	50 %	25 %	116255119
1014	NC_008383	GGA	2	6	62227	62232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255119
1015	NC_008383	GTC	2	6	62242	62247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1016	NC_008383	GAG	2	6	62258	62263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255119
1017	NC_008383	CTG	2	6	62379	62384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1018	NC_008383	GCT	2	6	62434	62439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255119
1019	NC_008383	CCG	2	6	62486	62491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255119
1020	NC_008383	GTG	2	6	62563	62568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255119
1021	NC_008383	GCG	2	6	62569	62574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255119
1022	NC_008383	ATT	2	6	62601	62606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255119
1023	NC_008383	GCT	2	6	63569	63574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1024	NC_008383	GTA	2	6	63619	63624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255120
1025	NC_008383	ACGG	2	8	63637	63644	25 %	0 %	50 %	25 %	116255120
1026	NC_008383	CGT	2	6	63645	63650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1027	NC_008383	GCA	2	6	63674	63679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1028	NC_008383	TGG	2	6	63702	63707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255120
1029	NC_008383	TTC	2	6	63719	63724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255120
1030	NC_008383	GAT	2	6	63730	63735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255120
1031	NC_008383	TTC	2	6	63748	63753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255120
1032	NC_008383	CATAA	2	10	63820	63829	60 %	20 %	0 %	20 %	116255120
1033	NC_008383	TCT	2	6	63837	63842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255120
1034	NC_008383	GAA	2	6	63936	63941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255120
1035	NC_008383	CGT	2	6	63969	63974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1036	NC_008383	CAAC	2	8	63982	63989	50 %	0 %	0 %	50 %	116255120
1037	NC_008383	CGA	2	6	63990	63995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1038	NC_008383	GC	3	6	64074	64079	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
1039	NC_008383	CGAC	2	8	64131	64138	25 %	0 %	25 %	50 %	116255120
1040	NC_008383	CGA	2	6	64149	64154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1041	NC_008383	CAA	2	6	64156	64161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255120
1042	NC_008383	CGT	2	6	64164	64169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1043	NC_008383	CTG	2	6	64256	64261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1044	NC_008383	ATC	2	6	64279	64284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255120
1045	NC_008383	GC	3	6	64303	64308	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
1046	NC_008383	ACC	2	6	64388	64393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255120
1047	NC_008383	CGA	2	6	64428	64433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255120
1048	NC_008383	CAA	2	6	64488	64493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255120
1049	NC_008383	GGC	2	6	64498	64503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255120
1050	NC_008383	GC	3	6	64530	64535	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
1051	NC_008383	CCA	2	6	64539	64544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255120
1052	NC_008383	CGAT	2	8	64605	64612	25 %	25 %	25 %	25 %	116255120
1053	NC_008383	GCG	2	6	64625	64630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255120
1054	NC_008383	TGA	2	6	64889	64894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255121
1055	NC_008383	T	6	6	64902	64907	0 %	100 %	0 %	0 %	116255121
1056	NC_008383	CCG	2	6	64910	64915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255121
1057	NC_008383	CAT	2	6	64989	64994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255121
1058	NC_008383	ACG	2	6	65065	65070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255121
1059	NC_008383	GTC	2	6	65115	65120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255121
1060	NC_008383	GTG	2	6	65239	65244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255121
1061	NC_008383	GCC	2	6	65251	65256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255121
1062	NC_008383	T	6	6	65316	65321	0 %	100 %	0 %	0 %	116255121
1063	NC_008383	GGA	2	6	65354	65359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255121
1064	NC_008383	CTTC	2	8	65390	65397	0 %	50 %	0 %	50 %	116255121
1065	NC_008383	TGA	2	6	65492	65497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255121
1066	NC_008383	CGC	2	6	65502	65507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255121
1067	NC_008383	CGA	2	6	65555	65560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255121
1068	NC_008383	GAC	2	6	65608	65613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255121
1069	NC_008383	CTCCG	2	10	65637	65646	0 %	20 %	20 %	60 %	116255121
1070	NC_008383	CGA	2	6	65672	65677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255121
1071	NC_008383	ATG	2	6	65701	65706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255121
1072	NC_008383	CCT	2	6	65903	65908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255122
1073	NC_008383	CAGA	2	8	65956	65963	50 %	0 %	25 %	25 %	116255122
1074	NC_008383	GAC	2	6	66024	66029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255122
1075	NC_008383	CGA	2	6	66151	66156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255122
1076	NC_008383	GAA	2	6	66302	66307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255122
1077	NC_008383	TGGA	2	8	66401	66408	25 %	25 %	50 %	0 %	116255122
1078	NC_008383	CGC	2	6	66457	66462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255122
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1080	NC_008383	GAA	2	6	66639	66644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255122
1081	NC_008383	TCC	2	6	66662	66667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255122
1082	NC_008383	TG	3	6	66737	66742	0 %	50 %	50 %	0 %	116255122
1083	NC_008383	GAA	2	6	66938	66943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255123
1084	NC_008383	CG	3	6	66959	66964	0 %	0 %	50 %	50 %	116255123
1085	NC_008383	GCC	2	6	66966	66971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255123
1086	NC_008383	ACCC	2	8	67059	67066	25 %	0 %	0 %	75 %	116255123
1087	NC_008383	GGCT	2	8	67104	67111	0 %	25 %	50 %	25 %	116255123
1088	NC_008383	AGC	2	6	67147	67152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255123
1089	NC_008383	GCC	2	6	67210	67215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255123
1090	NC_008383	AGG	2	6	67247	67252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255123
1091	NC_008383	TGA	2	6	67262	67267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255123
1092	NC_008383	ATG	2	6	67325	67330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255123
1093	NC_008383	GCT	2	6	67332	67337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255123
1094	NC_008383	AGA	2	6	67342	67347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255123
1095	NC_008383	CG	3	6	67439	67444	0 %	0 %	50 %	50 %	116255124
1096	NC_008383	ATC	2	6	67483	67488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255124
1097	NC_008383	TC	3	6	67487	67492	0 %	50 %	0 %	50 %	116255124
1098	NC_008383	CGA	2	6	67508	67513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255124
1099	NC_008383	CCG	2	6	67519	67524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255124
1100	NC_008383	CG	3	6	67601	67606	0 %	0 %	50 %	50 %	116255124
1101	NC_008383	TCA	2	6	67616	67621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255124
1102	NC_008383	GCC	2	6	67734	67739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255124
1103	NC_008383	CTG	2	6	67899	67904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255124
1104	NC_008383	CGG	2	6	67947	67952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255124
1105	NC_008383	TTG	2	6	67966	67971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255124
1106	NC_008383	CGA	2	6	68003	68008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255124
1107	NC_008383	TGAT	2	8	68038	68045	25 %	50 %	25 %	0 %	116255124
1108	NC_008383	GAT	2	6	68085	68090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255124
1109	NC_008383	TCG	2	6	68183	68188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255124
1110	NC_008383	TG	3	6	68215	68220	0 %	50 %	50 %	0 %	116255124
1111	NC_008383	CCT	2	6	68242	68247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255125
1112	NC_008383	CCGA	2	8	68249	68256	25 %	0 %	25 %	50 %	116255125
1113	NC_008383	GATGC	2	10	68300	68309	20 %	20 %	40 %	20 %	116255125
1114	NC_008383	TCG	2	6	68310	68315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255125
1115	NC_008383	ACA	2	6	68388	68393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255125
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1117	NC_008383	GAT	2	6	68465	68470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255125
1118	NC_008383	AG	3	6	68478	68483	50 %	0 %	50 %	0 %	116255125
1119	NC_008383	GTC	2	6	68484	68489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255125
1120	NC_008383	CGG	2	6	68519	68524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255125
1121	NC_008383	ATT	2	6	68529	68534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255125
1122	NC_008383	TCC	2	6	68557	68562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255125
1123	NC_008383	TTG	2	6	68616	68621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255125
1124	NC_008383	AT	3	6	68655	68660	50 %	50 %	0 %	0 %	116255125
1125	NC_008383	CGA	2	6	68683	68688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255125
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1249	NC_008383	GAA	2	6	76602	76607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255134
1250	NC_008383	GC	3	6	76619	76624	0 %	0 %	50 %	50 %	116255134
1251	NC_008383	CTG	2	6	76663	76668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255134
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1254	NC_008383	GC	3	6	76762	76767	0 %	0 %	50 %	50 %	116255134
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1373	NC_008383	GCC	2	6	83355	83360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255141
1374	NC_008383	GCT	2	6	83413	83418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255141
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1378	NC_008383	GTGCC	2	10	83700	83709	0 %	20 %	40 %	40 %	116255141
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1382	NC_008383	A	7	7	83850	83856	100 %	0 %	0 %	0 %	116255141
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1452	NC_008383	GCA	2	6	87412	87417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255144
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1482	NC_008383	GA	3	6	89606	89611	50 %	0 %	50 %	0 %	116255146
1483	NC_008383	GATG	2	8	89675	89682	25 %	25 %	50 %	0 %	116255146
1484	NC_008383	TCA	2	6	89725	89730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255146
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1486	NC_008383	CGG	2	6	89919	89924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255147
1487	NC_008383	TTG	2	6	89981	89986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255147
1488	NC_008383	ATT	2	6	90022	90027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255147
1489	NC_008383	GGT	2	6	90052	90057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255147
1490	NC_008383	CCA	2	6	90107	90112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255147
1491	NC_008383	TATC	2	8	90129	90136	25 %	50 %	0 %	25 %	116255147
1492	NC_008383	TC	3	6	90141	90146	0 %	50 %	0 %	50 %	116255147
1493	NC_008383	GCG	2	6	90241	90246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255147
1494	NC_008383	CT	3	6	90301	90306	0 %	50 %	0 %	50 %	116255147
1495	NC_008383	GCC	2	6	90346	90351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255147
1496	NC_008383	TCA	2	6	90365	90370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255147
1497	NC_008383	CTG	2	6	90415	90420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255147
1498	NC_008383	GTC	2	6	90424	90429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255147
1499	NC_008383	CGG	2	6	90525	90530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255147
1500	NC_008383	CGG	2	6	90568	90573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255147

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