MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 2549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008383	TTGA	2	8	28199	28206	25 %	50 %	25 %	0 %	116255092
502	NC_008383	GCT	2	6	28233	28238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255092
503	NC_008383	GCT	2	6	28279	28284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255092
504	NC_008383	CTTC	2	8	28308	28315	0 %	50 %	0 %	50 %	116255092
505	NC_008383	TTC	3	9	28400	28408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255092
506	NC_008383	CTA	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255092
507	NC_008383	CTT	3	9	28486	28494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255092
508	NC_008383	GCA	2	6	28575	28580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255092
509	NC_008383	TGG	2	6	28632	28637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255092
510	NC_008383	CG	3	6	28691	28696	0 %	0 %	50 %	50 %	116255092
511	NC_008383	CGG	2	6	28801	28806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255092
512	NC_008383	ATC	2	6	28817	28822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255092
513	NC_008383	CGT	2	6	28876	28881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255092
514	NC_008383	AAC	2	6	29056	29061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255093
515	NC_008383	TTC	2	6	29162	29167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255093
516	NC_008383	TGA	2	6	29276	29281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255093
517	NC_008383	CAC	2	6	29294	29299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255093
518	NC_008383	GCC	2	6	29320	29325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255093
519	NC_008383	GC	3	6	29333	29338	0 %	0 %	50 %	50 %	116255093
520	NC_008383	TCT	2	6	29384	29389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255093
521	NC_008383	CGA	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255093
522	NC_008383	TCG	2	6	29450	29455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255093
523	NC_008383	GCG	2	6	29456	29461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255093
524	NC_008383	ATC	2	6	29476	29481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255093
525	NC_008383	GCTGTT	2	12	29520	29531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116255093
526	NC_008383	TGA	2	6	29534	29539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255093
527	NC_008383	ATC	2	6	29560	29565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255093
528	NC_008383	GGC	2	6	29628	29633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255093
529	NC_008383	TA	3	6	29729	29734	50 %	50 %	0 %	0 %	116255093
530	NC_008383	CGG	2	6	29805	29810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255093
531	NC_008383	TGG	2	6	29821	29826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255093
532	NC_008383	CAG	2	6	29856	29861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255093
533	NC_008383	CTG	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255093
534	NC_008383	CTG	2	6	29914	29919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255093
535	NC_008383	TCG	2	6	30014	30019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255093
536	NC_008383	CGG	2	6	30076	30081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255094
537	NC_008383	AAC	2	6	30163	30168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255094
538	NC_008383	A	6	6	30376	30381	100 %	0 %	0 %	0 %	116255094
539	NC_008383	AGCG	2	8	30403	30410	25 %	0 %	50 %	25 %	116255094
540	NC_008383	GC	3	6	30447	30452	0 %	0 %	50 %	50 %	116255094
541	NC_008383	CAG	2	6	30453	30458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255094
542	NC_008383	CGA	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255094
543	NC_008383	GGCC	2	8	30547	30554	0 %	0 %	50 %	50 %	116255094
544	NC_008383	AGG	2	6	30564	30569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255094
545	NC_008383	TTC	2	6	30604	30609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255094
546	NC_008383	TGG	2	6	30627	30632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255094
547	NC_008383	CCG	2	6	30714	30719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255094
548	NC_008383	GTG	2	6	30771	30776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255095
549	NC_008383	TCC	2	6	30856	30861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255095
550	NC_008383	TGA	2	6	30892	30897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255095
551	NC_008383	TCG	2	6	30994	30999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255095
552	NC_008383	GCG	2	6	31028	31033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255095
553	NC_008383	GAG	2	6	31056	31061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255095
554	NC_008383	CTC	2	6	31068	31073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255095
555	NC_008383	GGC	2	6	31088	31093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255095
556	NC_008383	CGC	2	6	31106	31111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255095
557	NC_008383	GAC	2	6	31156	31161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255095
558	NC_008383	CAG	3	9	31191	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255095
559	NC_008383	TCC	2	6	31240	31245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255095
560	NC_008383	CTG	2	6	31599	31604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255096
561	NC_008383	ACG	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
562	NC_008383	GGC	2	6	31655	31660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255096
563	NC_008383	AGCG	2	8	31677	31684	25 %	0 %	50 %	25 %	116255096
564	NC_008383	GAC	2	6	31730	31735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
565	NC_008383	TCA	2	6	31867	31872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255096
566	NC_008383	GACA	2	8	31913	31920	50 %	0 %	25 %	25 %	116255096
567	NC_008383	GAACG	2	10	31922	31931	40 %	0 %	40 %	20 %	116255096
568	NC_008383	TCA	2	6	31936	31941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255096
569	NC_008383	CAT	2	6	31946	31951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255096
570	NC_008383	CGG	2	6	31967	31972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255096
571	NC_008383	GAT	2	6	32013	32018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255096
572	NC_008383	CGA	2	6	32102	32107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
573	NC_008383	GGT	2	6	32186	32191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255096
574	NC_008383	ACG	3	9	32248	32256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
575	NC_008383	ATG	2	6	32301	32306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255096
576	NC_008383	CAG	2	6	32376	32381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
577	NC_008383	AAG	2	6	32422	32427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255096
578	NC_008383	GTC	2	6	32451	32456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255096
579	NC_008383	AAC	2	6	32458	32463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255096
580	NC_008383	GCT	2	6	32509	32514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255096
581	NC_008383	ATG	2	6	32533	32538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255096
582	NC_008383	GC	3	6	32543	32548	0 %	0 %	50 %	50 %	116255096
583	NC_008383	CGCA	2	8	32597	32604	25 %	0 %	25 %	50 %	116255096
584	NC_008383	CGG	2	6	32620	32625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255096
585	NC_008383	AGCA	2	8	32677	32684	50 %	0 %	25 %	25 %	116255096
586	NC_008383	GAG	2	6	32694	32699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255096
587	NC_008383	GGA	2	6	32714	32719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255096
588	NC_008383	ACG	3	9	32724	32732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
589	NC_008383	GC	3	6	32750	32755	0 %	0 %	50 %	50 %	116255096
590	NC_008383	CAG	2	6	32860	32865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255096
591	NC_008383	GCGG	2	8	32948	32955	0 %	0 %	75 %	25 %	116255096
592	NC_008383	AGG	2	6	32989	32994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255096
593	NC_008383	ATCA	2	8	33036	33043	50 %	25 %	0 %	25 %	116255096
594	NC_008383	ACGTCC	2	12	33061	33072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255096
595	NC_008383	TGGT	2	8	33088	33095	0 %	50 %	50 %	0 %	116255096
596	NC_008383	TC	3	6	33186	33191	0 %	50 %	0 %	50 %	116255096
597	NC_008383	CGT	2	6	33221	33226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255096
598	NC_008383	GCG	2	6	33249	33254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255096
599	NC_008383	GCC	2	6	33276	33281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255096
600	NC_008383	TGG	2	6	33338	33343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255096
601	NC_008383	CCAG	2	8	33476	33483	25 %	0 %	25 %	50 %	116255097
602	NC_008383	AG	3	6	33591	33596	50 %	0 %	50 %	0 %	116255097
603	NC_008383	GCG	2	6	33637	33642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255097
604	NC_008383	CGA	2	6	33686	33691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255097
605	NC_008383	TGC	2	6	33693	33698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255097
606	NC_008383	TCG	2	6	33707	33712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255097
607	NC_008383	CAG	2	6	33818	33823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255097
608	NC_008383	AGC	2	6	33838	33843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255097
609	NC_008383	CGA	2	6	33875	33880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255097
610	NC_008383	TCG	2	6	33928	33933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255097
611	NC_008383	GAC	2	6	33936	33941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255097
612	NC_008383	CTG	2	6	33963	33968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255097
613	NC_008383	G	6	6	34080	34085	0 %	0 %	100 %	0 %	116255097
614	NC_008383	TGA	2	6	34599	34604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255098
615	NC_008383	GCC	2	6	34606	34611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255098
616	NC_008383	CAG	2	6	34645	34650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255098
617	NC_008383	GAA	2	6	34761	34766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255098
618	NC_008383	CGC	2	6	34795	34800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255098
619	NC_008383	GC	3	6	34799	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	116255098
620	NC_008383	GCC	2	6	35054	35059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255098
621	NC_008383	CCG	2	6	35079	35084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255098
622	NC_008383	GCG	2	6	35089	35094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255098
623	NC_008383	GCAA	2	8	35120	35127	50 %	0 %	25 %	25 %	116255098
624	NC_008383	CCA	2	6	35135	35140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255098
625	NC_008383	GCC	2	6	35156	35161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255098
626	NC_008383	GCAA	2	8	35171	35178	50 %	0 %	25 %	25 %	116255098
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