MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 1628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	CAT	2	6	163	168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254911
2	NC_008382	CCG	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254911
3	NC_008382	CGT	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254911
4	NC_008382	TGA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254911
5	NC_008382	ACG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254911
6	NC_008382	AGC	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254911
7	NC_008382	ACG	2	6	815	820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254911
8	NC_008382	TCG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254911
9	NC_008382	CCG	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254911
10	NC_008382	CTG	2	6	961	966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254911
11	NC_008382	ACG	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254911
12	NC_008382	GCT	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254912
13	NC_008382	CAG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254912
14	NC_008382	CGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254912
15	NC_008382	AGC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254912
16	NC_008382	TGG	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254912
17	NC_008382	GCC	2	6	1815	1820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254912
18	NC_008382	ATC	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254912
19	NC_008382	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254912
20	NC_008382	CCT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254912
21	NC_008382	CTG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254912
22	NC_008382	AAC	2	6	2242	2247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254912
23	NC_008382	GAA	2	6	2288	2293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254912
24	NC_008382	GAC	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254913
25	NC_008382	GCG	2	6	2491	2496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254913
26	NC_008382	GAC	2	6	2520	2525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254913
27	NC_008382	CGG	2	6	2592	2597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254913
28	NC_008382	TTG	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254913
29	NC_008382	GCA	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254913
30	NC_008382	TCG	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254913
31	NC_008382	GGA	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254913
32	NC_008382	GAA	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254913
33	NC_008382	AGG	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254913
34	NC_008382	TGC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254913
35	NC_008382	AGC	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254913
36	NC_008382	GGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254913
37	NC_008382	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254913
38	NC_008382	AGG	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254913
39	NC_008382	GCG	2	6	3506	3511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254913
40	NC_008382	CGG	2	6	3584	3589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254913
41	NC_008382	GAT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254913
42	NC_008382	TTG	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254913
43	NC_008382	CAT	2	6	3922	3927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254914
44	NC_008382	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254914
45	NC_008382	TCA	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254914
46	NC_008382	GCA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254914
47	NC_008382	CTG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254914
48	NC_008382	GTT	2	6	4472	4477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254914
49	NC_008382	CGC	3	9	4562	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254914
50	NC_008382	CCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254914
51	NC_008382	AGA	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254914
52	NC_008382	TCG	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254914
53	NC_008382	ATC	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254914
54	NC_008382	GAG	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254914
55	NC_008382	TGA	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254915
56	NC_008382	CGC	2	6	4932	4937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254915
57	NC_008382	GAT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254915
58	NC_008382	GCC	2	6	5222	5227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254915
59	NC_008382	TGC	2	6	5268	5273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254915
60	NC_008382	TGG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254915
61	NC_008382	CGG	2	6	5346	5351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254915
62	NC_008382	GCC	2	6	5401	5406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254915
63	NC_008382	TTC	2	6	5470	5475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254915
64	NC_008382	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254915
65	NC_008382	CGG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254915
66	NC_008382	TTC	2	6	5835	5840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254916
67	NC_008382	CGA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254916
68	NC_008382	AGC	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254916
69	NC_008382	CCT	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254916
70	NC_008382	TGG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254916
71	NC_008382	GCT	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254916
72	NC_008382	CAA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254917
73	NC_008382	CCG	2	6	7106	7111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
74	NC_008382	GAG	3	9	7246	7254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254917
75	NC_008382	CGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
76	NC_008382	TTC	2	6	7267	7272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254917
77	NC_008382	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
78	NC_008382	CCG	2	6	7500	7505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
79	NC_008382	GCT	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254917
80	NC_008382	AGC	2	6	7613	7618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254917
81	NC_008382	AGG	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254917
82	NC_008382	GCC	2	6	8089	8094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
83	NC_008382	GAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254917
84	NC_008382	AGC	2	6	8543	8548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254917
85	NC_008382	TGG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254917
86	NC_008382	CCG	2	6	8597	8602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
87	NC_008382	GGC	2	6	8670	8675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254917
88	NC_008382	GAT	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254917
89	NC_008382	CGA	2	6	8880	8885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254917
90	NC_008382	CGC	3	9	8946	8954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254917
91	NC_008382	ACC	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254918
92	NC_008382	GCC	2	6	9262	9267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254918
93	NC_008382	GAG	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254918
94	NC_008382	AGG	2	6	9506	9511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254918
95	NC_008382	GTG	2	6	9512	9517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254918
96	NC_008382	ACT	2	6	9799	9804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254919
97	NC_008382	CAA	2	6	9813	9818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254919
98	NC_008382	TCG	2	6	9880	9885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
99	NC_008382	CGA	2	6	9903	9908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
100	NC_008382	TGC	2	6	9990	9995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
101	NC_008382	GCG	2	6	10153	10158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254919
102	NC_008382	GCA	2	6	10167	10172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
103	NC_008382	TCG	2	6	10291	10296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
104	NC_008382	CGA	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
105	NC_008382	TCG	2	6	10385	10390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
106	NC_008382	ACC	2	6	10408	10413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254919
107	NC_008382	CGA	2	6	10452	10457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
108	NC_008382	CCT	2	6	10565	10570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254919
109	NC_008382	TGC	2	6	10653	10658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
110	NC_008382	AGC	2	6	10677	10682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
111	NC_008382	TCG	2	6	10708	10713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
112	NC_008382	GCG	2	6	10741	10746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254919
113	NC_008382	TCG	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254919
114	NC_008382	GAC	3	9	10771	10779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254919
115	NC_008382	GGA	2	6	10851	10856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254919
116	NC_008382	GAA	2	6	10959	10964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254919
117	NC_008382	CCT	2	6	10979	10984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254919
118	NC_008382	AGC	2	6	11135	11140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254920
119	NC_008382	GCC	2	6	11288	11293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254920
120	NC_008382	GAT	2	6	11301	11306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254920
121	NC_008382	ATC	2	6	11475	11480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254921
122	NC_008382	CGC	2	6	11566	11571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254921
123	NC_008382	CGG	2	6	11633	11638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254921
124	NC_008382	AGG	2	6	11668	11673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254921
125	NC_008382	TCC	2	6	11707	11712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254921
126	NC_008382	GAG	2	6	11814	11819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254921
127	NC_008382	GCA	2	6	11831	11836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
128	NC_008382	CAT	2	6	11885	11890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254921
129	NC_008382	GTG	2	6	11901	11906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254921
130	NC_008382	GCT	2	6	12002	12007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254921
131	NC_008382	GCA	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
132	NC_008382	CGA	2	6	12059	12064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
133	NC_008382	GTG	2	6	12093	12098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254921
134	NC_008382	TGA	2	6	12100	12105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254921
135	NC_008382	GCC	2	6	12153	12158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254921
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137	NC_008382	ACG	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
138	NC_008382	CGG	2	6	12379	12384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254921
139	NC_008382	CGG	2	6	12478	12483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254921
140	NC_008382	CAG	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
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142	NC_008382	GCA	2	6	12597	12602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254921
143	NC_008382	ATC	2	6	12633	12638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254921
144	NC_008382	CCG	2	6	12795	12800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254921
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150	NC_008382	GCC	2	6	13075	13080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254921
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154	NC_008382	CAC	2	6	13229	13234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254921
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159	NC_008382	GGC	2	6	13391	13396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254921
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162	NC_008382	GAG	2	6	13698	13703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254921
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247	NC_008382	GAC	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254927
248	NC_008382	ATC	2	6	20120	20125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254927
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250	NC_008382	CTT	2	6	20269	20274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254928
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252	NC_008382	CGA	2	6	20421	20426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254928
253	NC_008382	CAA	2	6	20579	20584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254929
254	NC_008382	TGG	2	6	20641	20646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254929
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256	NC_008382	CGT	2	6	20882	20887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254929
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262	NC_008382	TAG	2	6	21485	21490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254930
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377	NC_008382	GAT	2	6	33008	33013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254943
378	NC_008382	CGC	2	6	33024	33029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
379	NC_008382	GGC	2	6	33050	33055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254943
380	NC_008382	GTC	2	6	33066	33071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254943
381	NC_008382	CGC	2	6	33095	33100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
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385	NC_008382	GCC	2	6	33342	33347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
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389	NC_008382	TTG	2	6	33895	33900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254944
390	NC_008382	CTT	2	6	33927	33932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254944
391	NC_008382	GAT	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254944
392	NC_008382	GCA	2	6	33970	33975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254944
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497	NC_008382	GGC	3	9	43251	43259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254956
498	NC_008382	AAG	2	6	43471	43476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254956
499	NC_008382	CGA	2	6	43494	43499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254956
500	NC_008382	GAG	2	6	43858	43863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254956

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