MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 2318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008382	CGG	2	6	93863	93868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255008
1502	NC_008382	GATGC	2	10	93942	93951	20 %	20 %	40 %	20 %	116255008
1503	NC_008382	TGC	2	6	93959	93964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255008
1504	NC_008382	GTG	2	6	93989	93994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255008
1505	NC_008382	TGA	2	6	94029	94034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255009
1506	NC_008382	CAT	2	6	94037	94042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255009
1507	NC_008382	CGG	2	6	94055	94060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255009
1508	NC_008382	CGC	2	6	94166	94171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255009
1509	NC_008382	TGC	2	6	94194	94199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255009
1510	NC_008382	CGG	2	6	94202	94207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255009
1511	NC_008382	GAG	2	6	94253	94258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255009
1512	NC_008382	GCG	2	6	94278	94283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255009
1513	NC_008382	AGCG	2	8	94290	94297	25 %	0 %	50 %	25 %	116255009
1514	NC_008382	TGG	2	6	94329	94334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255009
1515	NC_008382	CGT	2	6	94405	94410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255009
1516	NC_008382	GAT	2	6	94412	94417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255009
1517	NC_008382	TCG	2	6	94440	94445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255009
1518	NC_008382	GAG	2	6	94499	94504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255009
1519	NC_008382	GAT	2	6	94519	94524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255009
1520	NC_008382	CGGAC	2	10	94575	94584	20 %	0 %	40 %	40 %	116255009
1521	NC_008382	GGC	2	6	94653	94658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255009
1522	NC_008382	TGAA	2	8	94674	94681	50 %	25 %	25 %	0 %	116255009
1523	NC_008382	TCG	2	6	94691	94696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255009
1524	NC_008382	TGGC	2	8	94768	94775	0 %	25 %	50 %	25 %	116255009
1525	NC_008382	TGC	2	6	94824	94829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255009
1526	NC_008382	CCGCA	2	10	94845	94854	20 %	0 %	20 %	60 %	116255009
1527	NC_008382	CGC	2	6	94858	94863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255009
1528	NC_008382	CAA	2	6	94872	94877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255009
1529	NC_008382	CATG	2	8	95563	95570	25 %	25 %	25 %	25 %	116255010
1530	NC_008382	TCG	2	6	95581	95586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255010
1531	NC_008382	GTC	2	6	95604	95609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255010
1532	NC_008382	GCG	2	6	95614	95619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255010
1533	NC_008382	GAG	2	6	95633	95638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255010
1534	NC_008382	GC	3	6	95642	95647	0 %	0 %	50 %	50 %	116255010
1535	NC_008382	GC	3	6	95661	95666	0 %	0 %	50 %	50 %	116255010
1536	NC_008382	GCCC	2	8	95783	95790	0 %	0 %	25 %	75 %	116255011
1537	NC_008382	CGC	2	6	95795	95800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255011
1538	NC_008382	GTA	2	6	95877	95882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255011
1539	NC_008382	AGCG	2	8	95888	95895	25 %	0 %	50 %	25 %	116255011
1540	NC_008382	CT	3	6	95906	95911	0 %	50 %	0 %	50 %	116255011
1541	NC_008382	CCG	2	6	97933	97938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255012
1542	NC_008382	TGC	2	6	98032	98037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1543	NC_008382	GAT	2	6	98094	98099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1544	NC_008382	ACG	2	6	98115	98120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1545	NC_008382	CG	3	6	98178	98183	0 %	0 %	50 %	50 %	116255012
1546	NC_008382	GAT	2	6	98232	98237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1547	NC_008382	ACG	2	6	98253	98258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1548	NC_008382	CG	3	6	98316	98321	0 %	0 %	50 %	50 %	116255012
1549	NC_008382	GAT	2	6	98370	98375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1550	NC_008382	ACG	2	6	98391	98396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1551	NC_008382	CGCT	2	8	98487	98494	0 %	25 %	25 %	50 %	116255012
1552	NC_008382	GAT	2	6	98508	98513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1553	NC_008382	GCG	3	9	98526	98534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255012
1554	NC_008382	GT	3	6	98550	98555	0 %	50 %	50 %	0 %	116255012
1555	NC_008382	CCG	2	6	98563	98568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255012
1556	NC_008382	CGA	2	6	98593	98598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1557	NC_008382	TCT	2	6	98685	98690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255012
1558	NC_008382	TCG	2	6	98701	98706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1559	NC_008382	CCG	3	9	98806	98814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255012
1560	NC_008382	G	6	6	98848	98853	0 %	0 %	100 %	0 %	116255012
1561	NC_008382	GAT	2	6	98857	98862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1562	NC_008382	CTGC	2	8	98928	98935	0 %	25 %	25 %	50 %	116255012
1563	NC_008382	ATG	2	6	98968	98973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255012
1564	NC_008382	CAA	2	6	99029	99034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255012
1565	NC_008382	TGC	2	6	99036	99041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255012
1566	NC_008382	GC	3	6	99040	99045	0 %	0 %	50 %	50 %	116255012
1567	NC_008382	TTG	2	6	99049	99054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255012
1568	NC_008382	ACA	3	9	99118	99126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255012
1569	NC_008382	CCGAA	2	10	99194	99203	40 %	0 %	20 %	40 %	116255012
1570	NC_008382	GCCCG	2	10	99220	99229	0 %	0 %	40 %	60 %	116255012
1571	NC_008382	GTT	2	6	99240	99245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255012
1572	NC_008382	CTGG	2	8	99311	99318	0 %	25 %	50 %	25 %	116255012
1573	NC_008382	TAA	2	6	99580	99585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255013
1574	NC_008382	GCC	2	6	99600	99605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255013
1575	NC_008382	GCG	2	6	99647	99652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255013
1576	NC_008382	CTG	2	6	99667	99672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255013
1577	NC_008382	TGC	2	6	99762	99767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255013
1578	NC_008382	CAACCG	2	12	99907	99918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116255013
1579	NC_008382	GCG	2	6	99956	99961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255013
1580	NC_008382	TCT	2	6	99967	99972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255013
1581	NC_008382	AGT	2	6	100005	100010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255013
1582	NC_008382	TGC	2	6	100283	100288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255014
1583	NC_008382	AAG	2	6	100352	100357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255014
1584	NC_008382	AGG	2	6	100358	100363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255014
1585	NC_008382	GTT	2	6	100369	100374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255014
1586	NC_008382	GAAA	2	8	100408	100415	75 %	0 %	25 %	0 %	116255014
1587	NC_008382	ATC	2	6	100440	100445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255014
1588	NC_008382	TCG	2	6	100458	100463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255014
1589	NC_008382	GGA	2	6	100483	100488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255014
1590	NC_008382	TGAAC	2	10	100555	100564	40 %	20 %	20 %	20 %	116255014
1591	NC_008382	TTG	2	6	100572	100577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255014
1592	NC_008382	CTG	2	6	100592	100597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255014
1593	NC_008382	TCG	2	6	100656	100661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255014
1594	NC_008382	GCT	2	6	100663	100668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255014
1595	NC_008382	TTC	2	6	100701	100706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255014
1596	NC_008382	TC	3	6	100737	100742	0 %	50 %	0 %	50 %	116255014
1597	NC_008382	AAC	2	6	100895	100900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255014
1598	NC_008382	CGC	2	6	100901	100906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255014
1599	NC_008382	AGG	2	6	100996	101001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255015
1600	NC_008382	CGA	2	6	101014	101019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255015
1601	NC_008382	AG	3	6	101042	101047	50 %	0 %	50 %	0 %	116255015
1602	NC_008382	CCT	2	6	101056	101061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255015
1603	NC_008382	TTC	2	6	101158	101163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255015
1604	NC_008382	ACG	2	6	101179	101184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255015
1605	NC_008382	GCG	2	6	101214	101219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255015
1606	NC_008382	CCCG	2	8	101223	101230	0 %	0 %	25 %	75 %	116255015
1607	NC_008382	GCG	2	6	101300	101305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255015
1608	NC_008382	GAC	2	6	101313	101318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255015
1609	NC_008382	GAG	2	6	101376	101381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255015
1610	NC_008382	CTAT	2	8	101385	101392	25 %	50 %	0 %	25 %	116255015
1611	NC_008382	ATG	2	6	101409	101414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255015
1612	NC_008382	AAC	2	6	101523	101528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255015
1613	NC_008382	AAAG	2	8	101531	101538	75 %	0 %	25 %	0 %	116255015
1614	NC_008382	TGA	2	6	101556	101561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255015
1615	NC_008382	GGC	2	6	102398	102403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255016
1616	NC_008382	TGC	2	6	102454	102459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255016
1617	NC_008382	TCA	2	6	102461	102466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255016
1618	NC_008382	GTG	2	6	102533	102538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255016
1619	NC_008382	ATG	2	6	102542	102547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255016
1620	NC_008382	CCT	2	6	102585	102590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255016
1621	NC_008382	CGC	2	6	102599	102604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255016
1622	NC_008382	GTC	2	6	102656	102661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255016
1623	NC_008382	CCG	2	6	102672	102677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255016
1624	NC_008382	GTC	2	6	102682	102687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255016
1625	NC_008382	AGG	2	6	102741	102746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255016
1626	NC_008382	GCA	2	6	102765	102770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255016
1627	NC_008382	CGT	2	6	102793	102798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255016
1628	NC_008382	CGA	2	6	102846	102851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255016
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1633	NC_008382	CG	3	6	103185	103190	0 %	0 %	50 %	50 %	116255016
1634	NC_008382	TCT	2	6	103221	103226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255016
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1639	NC_008382	GAT	2	6	103618	103623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255017
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1643	NC_008382	CCG	2	6	103809	103814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255017
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1645	NC_008382	TTG	2	6	103990	103995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255017
1646	NC_008382	GACG	2	8	104013	104020	25 %	0 %	50 %	25 %	116255017
1647	NC_008382	TGA	2	6	104058	104063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255017
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1651	NC_008382	CG	3	6	104576	104581	0 %	0 %	50 %	50 %	116255018
1652	NC_008382	CGC	2	6	104598	104603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255018
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1655	NC_008382	GTG	2	6	104740	104745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255018
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1657	NC_008382	GC	4	8	104772	104779	0 %	0 %	50 %	50 %	116255018
1658	NC_008382	GTT	2	6	104894	104899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255019
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1661	NC_008382	TCC	2	6	104952	104957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255019
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1715	NC_008382	CGAT	2	8	110412	110419	25 %	25 %	25 %	25 %	116255024
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1723	NC_008382	GAC	2	6	110748	110753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255024
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1728	NC_008382	GCTG	2	8	110984	110991	0 %	25 %	50 %	25 %	116255025
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1731	NC_008382	GAT	2	6	111156	111161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255025
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1739	NC_008382	TCG	2	6	111635	111640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255025
1740	NC_008382	GCC	2	6	111749	111754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255025
1741	NC_008382	CGG	2	6	111777	111782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255025
1742	NC_008382	GTCC	2	8	111820	111827	0 %	25 %	25 %	50 %	116255025
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1744	NC_008382	GC	3	6	111982	111987	0 %	0 %	50 %	50 %	116255025
1745	NC_008382	ACG	2	6	111997	112002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255025
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1747	NC_008382	CGCT	2	8	112110	112117	0 %	25 %	25 %	50 %	116255025
1748	NC_008382	CG	3	6	112129	112134	0 %	0 %	50 %	50 %	116255025
1749	NC_008382	GC	3	6	112140	112145	0 %	0 %	50 %	50 %	116255025
1750	NC_008382	TGA	2	6	112153	112158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255025
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1753	NC_008382	GAAG	2	8	112385	112392	50 %	0 %	50 %	0 %	116255025
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1844	NC_008382	GAT	2	6	119125	119130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255033
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1847	NC_008382	CCATC	2	10	119256	119265	20 %	20 %	0 %	60 %	116255034
1848	NC_008382	GCTT	2	8	119288	119295	0 %	50 %	25 %	25 %	116255034
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1850	NC_008382	GTG	2	6	119382	119387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255034
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1852	NC_008382	CAT	2	6	119458	119463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255034
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1854	NC_008382	GAT	2	6	119667	119672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255035
1855	NC_008382	AGC	2	6	119714	119719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255035
1856	NC_008382	CAT	2	6	119857	119862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255035
1857	NC_008382	AGC	2	6	119878	119883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255035
1858	NC_008382	CGA	2	6	119920	119925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255035
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1860	NC_008382	GTC	2	6	120174	120179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255035
1861	NC_008382	GGC	3	9	120182	120190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255035
1862	NC_008382	CA	3	6	120196	120201	50 %	0 %	0 %	50 %	116255035
1863	NC_008382	ACGC	2	8	120298	120305	25 %	0 %	25 %	50 %	116255035
1864	NC_008382	ATGG	2	8	120341	120348	25 %	25 %	50 %	0 %	116255035
1865	NC_008382	AAG	2	6	120402	120407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255035
1866	NC_008382	CGA	2	6	120425	120430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255035
1867	NC_008382	GT	3	6	120572	120577	0 %	50 %	50 %	0 %	116255035
1868	NC_008382	GAG	2	6	120789	120794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255035
1869	NC_008382	CT	3	6	120874	120879	0 %	50 %	0 %	50 %	116255035
1870	NC_008382	CGAG	2	8	121010	121017	25 %	0 %	50 %	25 %	116255035
1871	NC_008382	A	6	6	121043	121048	100 %	0 %	0 %	0 %	116255035
1872	NC_008382	GGC	2	6	121074	121079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255035
1873	NC_008382	ATGG	2	8	121177	121184	25 %	25 %	50 %	0 %	116255035
1874	NC_008382	CGC	2	6	121223	121228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255035
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1882	NC_008382	CTTC	2	8	122263	122270	0 %	50 %	0 %	50 %	116255036
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1984	NC_008382	GA	3	6	127636	127641	50 %	0 %	50 %	0 %	116255041
1985	NC_008382	CAT	2	6	127689	127694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255041
1986	NC_008382	AGT	2	6	127768	127773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255041
1987	NC_008382	GGACAA	2	12	127776	127787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116255041
1988	NC_008382	TTC	2	6	127789	127794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255041
1989	NC_008382	TCT	2	6	127802	127807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255041
1990	NC_008382	CTG	2	6	127828	127833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255041
1991	NC_008382	TGCG	2	8	127869	127876	0 %	25 %	50 %	25 %	116255041
1992	NC_008382	CGG	2	6	127884	127889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255041
1993	NC_008382	CGC	2	6	127956	127961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255041
1994	NC_008382	GAT	2	6	127992	127997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255041
1995	NC_008382	GCAGC	2	10	128024	128033	20 %	0 %	40 %	40 %	116255041
1996	NC_008382	G	6	6	128052	128057	0 %	0 %	100 %	0 %	116255041
1997	NC_008382	GCT	2	6	128062	128067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255041
1998	NC_008382	CGG	2	6	128150	128155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255041
1999	NC_008382	CGG	2	6	128163	128168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255041
2000	NC_008382	GCCG	2	8	128194	128201	0 %	0 %	50 %	50 %	116255041

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