MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 2318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008382	GCA	2	6	29210	29215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254940
502	NC_008382	CAGC	2	8	29262	29269	25 %	0 %	25 %	50 %	116254940
503	NC_008382	CGA	2	6	29343	29348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254940
504	NC_008382	TTCA	2	8	29358	29365	25 %	50 %	0 %	25 %	116254940
505	NC_008382	GCC	2	6	29381	29386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254940
506	NC_008382	GGTCC	2	10	29454	29463	0 %	20 %	40 %	40 %	116254940
507	NC_008382	ATC	2	6	29515	29520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254940
508	NC_008382	CTC	2	6	29535	29540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254940
509	NC_008382	CGA	2	6	29594	29599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254940
510	NC_008382	ATC	2	6	29622	29627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254940
511	NC_008382	GAC	2	6	29628	29633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254940
512	NC_008382	CCA	2	6	29705	29710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254940
513	NC_008382	TCGC	2	8	29741	29748	0 %	25 %	25 %	50 %	116254940
514	NC_008382	CCG	2	6	29755	29760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254940
515	NC_008382	TCC	2	6	29782	29787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254940
516	NC_008382	AGC	2	6	29839	29844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254940
517	NC_008382	GCG	2	6	29868	29873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254940
518	NC_008382	TCGC	2	8	29898	29905	0 %	25 %	25 %	50 %	116254940
519	NC_008382	CGCC	2	8	29976	29983	0 %	0 %	25 %	75 %	116254940
520	NC_008382	CTCAT	2	10	29989	29998	20 %	40 %	0 %	40 %	116254940
521	NC_008382	TCA	2	6	30005	30010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254940
522	NC_008382	CAC	2	6	30045	30050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254940
523	NC_008382	GCA	2	6	30075	30080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254941
524	NC_008382	GCATC	2	10	30088	30097	20 %	20 %	20 %	40 %	116254941
525	NC_008382	GCC	2	6	30170	30175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254941
526	NC_008382	TGCC	2	8	30247	30254	0 %	25 %	25 %	50 %	116254941
527	NC_008382	GAT	2	6	30275	30280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254941
528	NC_008382	CGG	2	6	30890	30895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254942
529	NC_008382	CTT	2	6	30896	30901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254942
530	NC_008382	ATG	2	6	30918	30923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254942
531	NC_008382	TCA	2	6	31020	31025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254942
532	NC_008382	TCG	2	6	31089	31094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254942
533	NC_008382	CGG	2	6	31110	31115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254942
534	NC_008382	GGC	2	6	31134	31139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254942
535	NC_008382	GCCC	2	8	31241	31248	0 %	0 %	25 %	75 %	116254942
536	NC_008382	A	7	7	31289	31295	100 %	0 %	0 %	0 %	116254942
537	NC_008382	AGGC	2	8	31323	31330	25 %	0 %	50 %	25 %	116254942
538	NC_008382	GAA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254942
539	NC_008382	TGG	2	6	31357	31362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254942
540	NC_008382	CGA	2	6	31365	31370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254942
541	NC_008382	CTG	2	6	32880	32885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254943
542	NC_008382	GAT	2	6	33008	33013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254943
543	NC_008382	CGC	2	6	33024	33029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
544	NC_008382	GGC	2	6	33050	33055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254943
545	NC_008382	GTC	2	6	33066	33071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254943
546	NC_008382	CGC	2	6	33095	33100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
547	NC_008382	CAA	2	6	33113	33118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254943
548	NC_008382	CTCGGC	2	12	33216	33227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116254943
549	NC_008382	CCG	3	9	33268	33276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
550	NC_008382	GAT	2	6	33290	33295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254943
551	NC_008382	GC	3	6	33300	33305	0 %	0 %	50 %	50 %	116254943
552	NC_008382	GCC	2	6	33342	33347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254943
553	NC_008382	CTC	2	6	33354	33359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254943
554	NC_008382	ATC	2	6	33360	33365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254943
555	NC_008382	TCT	2	6	33521	33526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254943
556	NC_008382	CACC	2	8	33536	33543	25 %	0 %	0 %	75 %	116254943
557	NC_008382	TTG	2	6	33895	33900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254944
558	NC_008382	CTT	2	6	33927	33932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254944
559	NC_008382	GAT	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254944
560	NC_008382	GCA	2	6	33970	33975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254944
561	NC_008382	GAC	2	6	33996	34001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254944
562	NC_008382	GACG	2	8	34019	34026	25 %	0 %	50 %	25 %	116254944
563	NC_008382	CGC	2	6	34066	34071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254944
564	NC_008382	GAC	2	6	34111	34116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254944
565	NC_008382	TGA	2	6	34405	34410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254945
566	NC_008382	GA	3	6	34409	34414	50 %	0 %	50 %	0 %	116254945
567	NC_008382	CAAACC	2	12	34435	34446	50 %	0 %	0 %	50 %	116254945
568	NC_008382	AGA	2	6	34546	34551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254945
569	NC_008382	CG	3	6	34580	34585	0 %	0 %	50 %	50 %	116254945
570	NC_008382	TGA	2	6	34588	34593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254945
571	NC_008382	TTGG	2	8	34626	34633	0 %	50 %	50 %	0 %	116254945
572	NC_008382	GGC	2	6	34669	34674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254945
573	NC_008382	TTGC	2	8	34710	34717	0 %	50 %	25 %	25 %	116254945
574	NC_008382	GAC	2	6	34823	34828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254945
575	NC_008382	TGC	2	6	34967	34972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254945
576	NC_008382	CCG	2	6	34991	34996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254945
577	NC_008382	TC	3	6	35000	35005	0 %	50 %	0 %	50 %	116254945
578	NC_008382	ACG	2	6	35082	35087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254945
579	NC_008382	CTGGCG	2	12	35104	35115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254945
580	NC_008382	CGA	2	6	35153	35158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254945
581	NC_008382	CCTTA	2	10	35213	35222	20 %	40 %	0 %	40 %	116254945
582	NC_008382	GAT	2	6	35246	35251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254945
583	NC_008382	TCG	2	6	35283	35288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254945
584	NC_008382	TGA	2	6	35305	35310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254945
585	NC_008382	CCT	2	6	35318	35323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254945
586	NC_008382	TCGT	2	8	35329	35336	0 %	50 %	25 %	25 %	116254945
587	NC_008382	C	6	6	35404	35409	0 %	0 %	0 %	100 %	116254945
588	NC_008382	GCG	3	9	35619	35627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254946
589	NC_008382	GCA	2	6	35813	35818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254946
590	NC_008382	TTG	2	6	35822	35827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254946
591	NC_008382	GCT	2	6	36015	36020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254946
592	NC_008382	CG	3	6	36021	36026	0 %	0 %	50 %	50 %	116254946
593	NC_008382	GAA	2	6	36031	36036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254946
594	NC_008382	TCG	2	6	36111	36116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254946
595	NC_008382	CCG	2	6	36137	36142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254946
596	NC_008382	GAG	2	6	36148	36153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254946
597	NC_008382	CGA	2	6	36252	36257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254946
598	NC_008382	TTG	2	6	36289	36294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254946
599	NC_008382	ATCC	2	8	36372	36379	25 %	25 %	0 %	50 %	116254946
600	NC_008382	CCGAA	2	10	36421	36430	40 %	0 %	20 %	40 %	116254946
601	NC_008382	CGG	2	6	36516	36521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254946
602	NC_008382	GCT	2	6	36553	36558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254946
603	NC_008382	GTTC	2	8	36565	36572	0 %	50 %	25 %	25 %	116254946
604	NC_008382	AGG	2	6	36602	36607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254946
605	NC_008382	GCGG	2	8	36663	36670	0 %	0 %	75 %	25 %	116254946
606	NC_008382	CG	3	6	36711	36716	0 %	0 %	50 %	50 %	116254946
607	NC_008382	TTG	2	6	36833	36838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254947
608	NC_008382	CAA	2	6	36847	36852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254947
609	NC_008382	AAG	2	6	37138	37143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254948
610	NC_008382	CG	3	6	37175	37180	0 %	0 %	50 %	50 %	116254948
611	NC_008382	TTC	2	6	37192	37197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254948
612	NC_008382	GCA	2	6	37199	37204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254948
613	NC_008382	AAG	2	6	37221	37226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254948
614	NC_008382	GTGA	2	8	37296	37303	25 %	25 %	50 %	0 %	116254948
615	NC_008382	ATC	2	6	37409	37414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254948
616	NC_008382	TG	3	6	37425	37430	0 %	50 %	50 %	0 %	116254948
617	NC_008382	GGC	2	6	37433	37438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254948
618	NC_008382	CGC	2	6	37646	37651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254949
619	NC_008382	CGA	2	6	37660	37665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254949
620	NC_008382	GCG	2	6	37698	37703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254949
621	NC_008382	AGG	2	6	37871	37876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254949
622	NC_008382	GCA	2	6	37892	37897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254949
623	NC_008382	TGC	2	6	37960	37965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254949
624	NC_008382	AGC	2	6	38187	38192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254950
625	NC_008382	CGG	2	6	38214	38219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254950
626	NC_008382	AGAT	2	8	38266	38273	50 %	25 %	25 %	0 %	116254950
627	NC_008382	GC	3	6	38318	38323	0 %	0 %	50 %	50 %	116254950
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749	NC_008382	CAA	2	6	46384	46389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254959
750	NC_008382	TGGCT	6	30	46408	46437	0 %	40 %	40 %	20 %	116254959
751	NC_008382	AT	3	6	46445	46450	50 %	50 %	0 %	0 %	116254959
752	NC_008382	CTTT	2	8	46462	46469	0 %	75 %	0 %	25 %	116254959
753	NC_008382	TTTC	2	8	46471	46478	0 %	75 %	0 %	25 %	116254959
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757	NC_008382	GAT	2	6	46820	46825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254960
758	NC_008382	AGGC	2	8	46831	46838	25 %	0 %	50 %	25 %	116254960
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760	NC_008382	GAT	2	6	46984	46989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254960
761	NC_008382	CCG	2	6	47011	47016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254960
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763	NC_008382	TTG	2	6	47192	47197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254960
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780	NC_008382	TTGT	2	8	48390	48397	0 %	75 %	25 %	0 %	116254962
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784	NC_008382	TTG	2	6	48598	48603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254963
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788	NC_008382	TGCC	2	8	49049	49056	0 %	25 %	25 %	50 %	116254965
789	NC_008382	CTG	2	6	49136	49141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254965
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881	NC_008382	G	6	6	58409	58414	0 %	0 %	100 %	0 %	116254972
882	NC_008382	GCGG	2	8	58431	58438	0 %	0 %	75 %	25 %	116254972
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