MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008381	CTT	2	6	254937	254942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254694
4002	NC_008381	GGC	2	6	254959	254964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254694
4003	NC_008381	ATCG	2	8	255054	255061	25 %	25 %	25 %	25 %	116254694
4004	NC_008381	GCG	2	6	255067	255072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254694
4005	NC_008381	GCG	2	6	255080	255085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254694
4006	NC_008381	CGG	2	6	255146	255151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254694
4007	NC_008381	TCT	2	6	255155	255160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254694
4008	NC_008381	GGT	3	9	255183	255191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254694
4009	NC_008381	GCG	2	6	255280	255285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254694
4010	NC_008381	TTG	2	6	255326	255331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254694
4011	NC_008381	CGT	2	6	255333	255338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254694
4012	NC_008381	ACG	2	6	255421	255426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4013	NC_008381	CGA	2	6	255526	255531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4014	NC_008381	TGC	2	6	255712	255717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4015	NC_008381	CGG	2	6	255767	255772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254695
4016	NC_008381	CAG	3	9	255774	255782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4017	NC_008381	CCG	2	6	255816	255821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254695
4018	NC_008381	AAG	2	6	255858	255863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254695
4019	NC_008381	CCA	2	6	255899	255904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254695
4020	NC_008381	AGG	3	9	255943	255951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254695
4021	NC_008381	ATTTC	2	10	256075	256084	20 %	60 %	0 %	20 %	116254695
4022	NC_008381	CTG	2	6	256092	256097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4023	NC_008381	TCC	2	6	256101	256106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254695
4024	NC_008381	CCA	2	6	256117	256122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254695
4025	NC_008381	GGC	2	6	256131	256136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254695
4026	NC_008381	GCA	2	6	256239	256244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254695
4027	NC_008381	CAA	2	6	256289	256294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254695
4028	NC_008381	AGGCG	2	10	256322	256331	20 %	0 %	60 %	20 %	116254695
4029	NC_008381	GGC	2	6	256524	256529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
4030	NC_008381	GTG	2	6	256567	256572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254696
4031	NC_008381	CCGCG	2	10	256608	256617	0 %	0 %	40 %	60 %	116254696
4032	NC_008381	GAA	2	6	256641	256646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254696
4033	NC_008381	CCG	2	6	256649	256654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254696
4034	NC_008381	GC	3	6	256659	256664	0 %	0 %	50 %	50 %	116254696
4035	NC_008381	TGA	2	6	256691	256696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254696
4036	NC_008381	CGA	2	6	256707	256712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4037	NC_008381	GAT	2	6	256719	256724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254696
4038	NC_008381	GA	3	6	256766	256771	50 %	0 %	50 %	0 %	116254696
4039	NC_008381	GAG	2	6	256807	256812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254696
4040	NC_008381	GGC	2	6	256896	256901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
4041	NC_008381	GAT	2	6	256929	256934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254696
4042	NC_008381	GCC	2	6	256960	256965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254696
4043	NC_008381	CGT	2	6	256974	256979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4044	NC_008381	GC	3	6	257037	257042	0 %	0 %	50 %	50 %	116254696
4045	NC_008381	GCC	2	6	257049	257054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254696
4046	NC_008381	CGA	2	6	257186	257191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4047	NC_008381	GGC	2	6	257215	257220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
4048	NC_008381	CGA	2	6	257241	257246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4049	NC_008381	GC	3	6	257273	257278	0 %	0 %	50 %	50 %	116254696
4050	NC_008381	CAA	2	6	257295	257300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254696
4051	NC_008381	GCC	2	6	257362	257367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254696
4052	NC_008381	CGC	2	6	257373	257378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254696
4053	NC_008381	CGT	2	6	257421	257426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4054	NC_008381	CGA	2	6	257442	257447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4055	NC_008381	GGC	2	6	257515	257520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
4056	NC_008381	CGG	2	6	257535	257540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
4057	NC_008381	TTC	2	6	257545	257550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254696
4058	NC_008381	CGA	2	6	257555	257560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4059	NC_008381	TGC	2	6	257574	257579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254696
4060	NC_008381	CG	4	8	257592	257599	0 %	0 %	50 %	50 %	116254696
4061	NC_008381	CGA	2	6	257640	257645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254696
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4063	NC_008381	GTCTC	2	10	257774	257783	0 %	40 %	20 %	40 %	116254696
4064	NC_008381	CGG	2	6	257802	257807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254696
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4067	NC_008381	ATCG	2	8	258292	258299	25 %	25 %	25 %	25 %	116254697
4068	NC_008381	GC	3	6	258427	258432	0 %	0 %	50 %	50 %	116254697
4069	NC_008381	CGG	2	6	258451	258456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254697
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4072	NC_008381	CGA	2	6	258541	258546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254697
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4080	NC_008381	TCT	2	6	259517	259522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254698
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4084	NC_008381	CGA	2	6	259942	259947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254699
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4104	NC_008381	GATC	2	8	260563	260570	25 %	25 %	25 %	25 %	116254699
4105	NC_008381	TGA	2	6	260575	260580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254699
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4107	NC_008381	CGA	2	6	260669	260674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254700
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4121	NC_008381	TGG	2	6	261092	261097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254700
4122	NC_008381	ACG	2	6	261100	261105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254700
4123	NC_008381	CGG	2	6	261108	261113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254700
4124	NC_008381	CAT	2	6	261114	261119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254700
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4145	NC_008381	CTG	2	6	262163	262168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254701
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4153	NC_008381	GTC	2	6	262571	262576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254702
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4162	NC_008381	CCA	2	6	262926	262931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254702
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4228	NC_008381	AACGA	2	10	266224	266233	60 %	0 %	20 %	20 %	116254704
4229	NC_008381	TGCGC	2	10	266324	266333	0 %	20 %	40 %	40 %	116254704
4230	NC_008381	CTTC	2	8	266447	266454	0 %	50 %	0 %	50 %	116254704
4231	NC_008381	GAT	2	6	266507	266512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254704
4232	NC_008381	CGT	2	6	266545	266550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254704
4233	NC_008381	GAT	2	6	266561	266566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254704
4234	NC_008381	TTG	2	6	266593	266598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254704
4235	NC_008381	CGC	2	6	266599	266604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254704
4236	NC_008381	TCG	2	6	266650	266655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254704
4237	NC_008381	CGGT	2	8	266656	266663	0 %	25 %	50 %	25 %	116254704
4238	NC_008381	CTT	2	6	266742	266747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254704
4239	NC_008381	CGT	2	6	266810	266815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254704
4240	NC_008381	CTC	2	6	266867	266872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254704
4241	NC_008381	CGA	2	6	266875	266880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254704
4242	NC_008381	AGGA	2	8	266940	266947	50 %	0 %	50 %	0 %	116254704
4243	NC_008381	CG	3	6	266953	266958	0 %	0 %	50 %	50 %	116254704
4244	NC_008381	CTG	2	6	266966	266971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254704
4245	NC_008381	GCGTGC	2	12	267019	267030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254704
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4247	NC_008381	ATA	2	6	267251	267256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254704
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4249	NC_008381	TGG	2	6	267446	267451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254705
4250	NC_008381	GCG	2	6	267455	267460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254705
4251	NC_008381	CGA	2	6	267476	267481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254705
4252	NC_008381	CGC	2	6	267557	267562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254705
4253	NC_008381	TCG	2	6	267571	267576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254705
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4255	NC_008381	GGGCC	2	10	267604	267613	0 %	0 %	60 %	40 %	116254705
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4259	NC_008381	GGCG	2	8	267800	267807	0 %	0 %	75 %	25 %	116254705
4260	NC_008381	AAG	2	6	267826	267831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254705
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4263	NC_008381	TCGAGG	2	12	267907	267918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254705
4264	NC_008381	ATG	2	6	267934	267939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254705
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4267	NC_008381	GCTT	2	8	268121	268128	0 %	50 %	25 %	25 %	116254705
4268	NC_008381	CGAG	2	8	268138	268145	25 %	0 %	50 %	25 %	116254705
4269	NC_008381	TCT	2	6	268168	268173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254705
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4271	NC_008381	CCGG	2	8	268212	268219	0 %	0 %	50 %	50 %	116254705
4272	NC_008381	CGTC	2	8	268284	268291	0 %	25 %	25 %	50 %	116254705
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4278	NC_008381	GCAGA	2	10	268667	268676	40 %	0 %	40 %	20 %	116254706
4279	NC_008381	GCG	2	6	268694	268699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254706
4280	NC_008381	ATCT	2	8	268742	268749	25 %	50 %	0 %	25 %	116254706
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4304	NC_008381	GCCTT	2	10	269898	269907	0 %	40 %	20 %	40 %	116254707
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4344	NC_008381	GCT	2	6	271095	271100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254708
4345	NC_008381	GAT	3	9	271122	271130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254708
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4347	NC_008381	TCCTGA	2	12	271160	271171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254708
4348	NC_008381	ATG	2	6	271249	271254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254708
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4350	NC_008381	CGA	2	6	271322	271327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254708
4351	NC_008381	TGC	2	6	271343	271348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254708
4352	NC_008381	CGC	2	6	271416	271421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254708
4353	NC_008381	TCG	2	6	271480	271485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254708
4354	NC_008381	CAT	2	6	271497	271502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254708
4355	NC_008381	GC	3	6	271511	271516	0 %	0 %	50 %	50 %	116254708
4356	NC_008381	CGGC	2	8	271598	271605	0 %	0 %	50 %	50 %	116254708
4357	NC_008381	TGC	2	6	271676	271681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254709
4358	NC_008381	GCA	2	6	271784	271789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254709
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4360	NC_008381	GCCG	2	8	271838	271845	0 %	0 %	50 %	50 %	116254709
4361	NC_008381	GCA	2	6	271886	271891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254709
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4468	NC_008381	ACAT	2	8	276701	276708	50 %	25 %	0 %	25 %	116254713
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4472	NC_008381	CAT	2	6	276862	276867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254713
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4479	NC_008381	TCG	2	6	277082	277087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
4480	NC_008381	GCG	2	6	277150	277155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
4481	NC_008381	CGG	2	6	277247	277252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
4482	NC_008381	GGC	2	6	277258	277263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
4483	NC_008381	CG	3	6	277278	277283	0 %	0 %	50 %	50 %	116254713
4484	NC_008381	CAT	2	6	277302	277307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254713
4485	NC_008381	GCC	2	6	277333	277338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
4486	NC_008381	GA	3	6	277376	277381	50 %	0 %	50 %	0 %	116254713
4487	NC_008381	GCC	2	6	277399	277404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
4488	NC_008381	CGC	2	6	277434	277439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
4489	NC_008381	TCG	2	6	277542	277547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
4490	NC_008381	GCT	2	6	277561	277566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
4491	NC_008381	GGC	2	6	277631	277636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
4492	NC_008381	CGG	3	9	277709	277717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
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4497	NC_008381	CCGA	2	8	278075	278082	25 %	0 %	25 %	50 %	116254714
4498	NC_008381	CGAG	2	8	278118	278125	25 %	0 %	50 %	25 %	116254714
4499	NC_008381	GC	3	6	278136	278141	0 %	0 %	50 %	50 %	116254714
4500	NC_008381	TCTGG	2	10	278227	278236	0 %	40 %	40 %	20 %	116254714

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