MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008381	CCG	2	6	231733	231738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254669
3502	NC_008381	CGGCGC	2	12	231746	231757	0 %	0 %	50 %	50 %	116254669
3503	NC_008381	GAT	2	6	231764	231769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254669
3504	NC_008381	ATC	2	6	231903	231908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254669
3505	NC_008381	GGC	2	6	231915	231920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254669
3506	NC_008381	CCT	2	6	231967	231972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254669
3507	NC_008381	TCA	2	6	231973	231978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254669
3508	NC_008381	CGT	2	6	231992	231997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3509	NC_008381	CGG	2	6	232288	232293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254669
3510	NC_008381	GCGA	2	8	232323	232330	25 %	0 %	50 %	25 %	116254669
3511	NC_008381	TGC	2	6	232345	232350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3512	NC_008381	TCG	2	6	232375	232380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3513	NC_008381	CTC	2	6	232396	232401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254669
3514	NC_008381	ACG	2	6	232426	232431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3515	NC_008381	CGC	2	6	232445	232450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254669
3516	NC_008381	TGA	2	6	232487	232492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254669
3517	NC_008381	TGA	2	6	232500	232505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254669
3518	NC_008381	CG	3	6	232548	232553	0 %	0 %	50 %	50 %	116254670
3519	NC_008381	ATT	2	6	232605	232610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254670
3520	NC_008381	TGC	2	6	232624	232629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254670
3521	NC_008381	TCC	2	6	232648	232653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254670
3522	NC_008381	GCC	2	6	232666	232671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254670
3523	NC_008381	GTG	2	6	232698	232703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254670
3524	NC_008381	CGG	3	9	232714	232722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254670
3525	NC_008381	TGG	2	6	232815	232820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254670
3526	NC_008381	GCC	2	6	232835	232840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254670
3527	NC_008381	GAC	2	6	232867	232872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254670
3528	NC_008381	CT	3	6	232926	232931	0 %	50 %	0 %	50 %	116254670
3529	NC_008381	GCA	2	6	233131	233136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3530	NC_008381	ATT	2	6	233155	233160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254671
3531	NC_008381	GCC	2	6	233194	233199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3532	NC_008381	GGCA	2	8	233201	233208	25 %	0 %	50 %	25 %	116254671
3533	NC_008381	GCC	2	6	233217	233222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3534	NC_008381	GTC	2	6	233223	233228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3535	NC_008381	CCG	2	6	233233	233238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3536	NC_008381	GCTGGG	2	12	233266	233277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	116254671
3537	NC_008381	TCG	2	6	233314	233319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3538	NC_008381	GCT	2	6	233333	233338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3539	NC_008381	GCC	2	6	233352	233357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3540	NC_008381	ATCC	2	8	233366	233373	25 %	25 %	0 %	50 %	116254671
3541	NC_008381	CGC	2	6	233410	233415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3542	NC_008381	TGC	2	6	233449	233454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3543	NC_008381	TGC	3	9	233473	233481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3544	NC_008381	GCC	3	9	233589	233597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3545	NC_008381	CTT	2	6	233627	233632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254671
3546	NC_008381	GCG	2	6	233647	233652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
3547	NC_008381	TC	3	6	233657	233662	0 %	50 %	0 %	50 %	116254671
3548	NC_008381	GGC	2	6	233684	233689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
3549	NC_008381	CGC	2	6	233690	233695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3550	NC_008381	GCCGC	2	10	233705	233714	0 %	0 %	40 %	60 %	116254671
3551	NC_008381	TGC	2	6	233734	233739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3552	NC_008381	CCG	2	6	233861	233866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3553	NC_008381	GCT	2	6	233885	233890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3554	NC_008381	ATC	2	6	233916	233921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254671
3555	NC_008381	CGC	2	6	233992	233997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3556	NC_008381	T	6	6	234012	234017	0 %	100 %	0 %	0 %	116254671
3557	NC_008381	CCG	2	6	234026	234031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3558	NC_008381	CGAC	2	8	234055	234062	25 %	0 %	25 %	50 %	116254671
3559	NC_008381	GCG	2	6	234090	234095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
3560	NC_008381	GGC	2	6	234111	234116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
3561	NC_008381	CCG	2	6	234190	234195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3562	NC_008381	GC	3	6	234248	234253	0 %	0 %	50 %	50 %	116254671
3563	NC_008381	TCG	2	6	234307	234312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3564	NC_008381	ACA	2	6	234316	234321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254671
3565	NC_008381	CGC	2	6	234369	234374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254671
3566	NC_008381	GCT	2	6	234503	234508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3567	NC_008381	CGG	2	6	234560	234565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
3568	NC_008381	CAG	3	9	234567	234575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3569	NC_008381	TGC	2	6	234616	234621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3570	NC_008381	CGA	2	6	234626	234631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3571	NC_008381	TCG	2	6	234658	234663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3572	NC_008381	TCA	2	6	234679	234684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254671
3573	NC_008381	ACG	2	6	234705	234710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3574	NC_008381	TCGTCA	2	12	234712	234723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254671
3575	NC_008381	GTC	2	6	234762	234767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
3576	NC_008381	GCA	2	6	235042	235047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3577	NC_008381	AGC	2	6	235068	235073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3578	NC_008381	TCG	2	6	235134	235139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3579	NC_008381	GAA	2	6	235364	235369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254672
3580	NC_008381	AGC	2	6	235455	235460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3581	NC_008381	ACCA	2	8	235502	235509	50 %	0 %	0 %	50 %	116254672
3582	NC_008381	CTG	2	6	235520	235525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3583	NC_008381	CGC	2	6	235546	235551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254672
3584	NC_008381	GAC	3	9	235583	235591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3585	NC_008381	GCAGA	2	10	235620	235629	40 %	0 %	40 %	20 %	116254672
3586	NC_008381	AACGC	2	10	235646	235655	40 %	0 %	20 %	40 %	116254672
3587	NC_008381	CGG	2	6	235665	235670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254672
3588	NC_008381	GCG	2	6	235707	235712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254672
3589	NC_008381	GCT	2	6	235766	235771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3590	NC_008381	GTC	2	6	235784	235789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254672
3591	NC_008381	CCG	2	6	235877	235882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254672
3592	NC_008381	CTG	2	6	236001	236006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254673
3593	NC_008381	GCC	2	6	236010	236015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254673
3594	NC_008381	AGC	2	6	236077	236082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254673
3595	NC_008381	CGC	2	6	236096	236101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254673
3596	NC_008381	GCG	2	6	236112	236117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254673
3597	NC_008381	CGG	2	6	236183	236188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254673
3598	NC_008381	CGC	2	6	236191	236196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254673
3599	NC_008381	CTATGC	2	12	236246	236257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254673
3600	NC_008381	GCCTC	2	10	236323	236332	0 %	20 %	20 %	60 %	116254673
3601	NC_008381	ATG	2	6	236341	236346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254673
3602	NC_008381	AGC	2	6	236374	236379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254673
3603	NC_008381	CTAC	2	8	236401	236408	25 %	25 %	0 %	50 %	116254673
3604	NC_008381	TTC	2	6	236427	236432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254673
3605	NC_008381	ATC	2	6	236493	236498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254673
3606	NC_008381	ACCA	2	8	236511	236518	50 %	0 %	0 %	50 %	116254673
3607	NC_008381	GCC	2	6	236556	236561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254673
3608	NC_008381	ACG	3	9	236590	236598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254673
3609	NC_008381	GGC	2	6	236600	236605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254673
3610	NC_008381	CCT	2	6	236609	236614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254673
3611	NC_008381	CCGG	2	8	236626	236633	0 %	0 %	50 %	50 %	116254673
3612	NC_008381	CG	3	6	236680	236685	0 %	0 %	50 %	50 %	116254673
3613	NC_008381	CAC	2	6	236750	236755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254673
3614	NC_008381	CCA	2	6	236794	236799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254673
3615	NC_008381	CCCG	2	8	236885	236892	0 %	0 %	25 %	75 %	116254673
3616	NC_008381	ATC	2	6	236909	236914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254673
3617	NC_008381	CGA	2	6	236979	236984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254674
3618	NC_008381	AGC	2	6	237017	237022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254674
3619	NC_008381	GGC	3	9	237111	237119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254674
3620	NC_008381	CG	3	6	237224	237229	0 %	0 %	50 %	50 %	116254674
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3741	NC_008381	TCG	2	6	242960	242965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254682
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3857	NC_008381	GCA	2	6	248954	248959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254688
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3859	NC_008381	GGC	2	6	249089	249094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254688
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3978	NC_008381	TGC	2	6	254188	254193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254693
3979	NC_008381	TCA	2	6	254197	254202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254693
3980	NC_008381	AAG	2	6	254226	254231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254693
3981	NC_008381	GGC	2	6	254252	254257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254693
3982	NC_008381	GCG	2	6	254266	254271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254693
3983	NC_008381	CTG	2	6	254301	254306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254693
3984	NC_008381	GGC	2	6	254327	254332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254693
3985	NC_008381	CGG	2	6	254390	254395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254693
3986	NC_008381	ATG	2	6	254406	254411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254693
3987	NC_008381	TGC	2	6	254468	254473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254693
3988	NC_008381	GTG	2	6	254490	254495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254693
3989	NC_008381	CTG	2	6	254499	254504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254693
3990	NC_008381	TGG	2	6	254587	254592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254694
3991	NC_008381	CTG	2	6	254602	254607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254694
3992	NC_008381	CTG	3	9	254635	254643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254694
3993	NC_008381	CTC	2	6	254676	254681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254694
3994	NC_008381	CCG	2	6	254698	254703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254694
3995	NC_008381	GCTG	2	8	254750	254757	0 %	25 %	50 %	25 %	116254694
3996	NC_008381	TGC	2	6	254810	254815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254694
3997	NC_008381	CCT	2	6	254828	254833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254694
3998	NC_008381	GTTC	2	8	254849	254856	0 %	50 %	25 %	25 %	116254694
3999	NC_008381	GAT	2	6	254895	254900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254694
4000	NC_008381	CGT	2	6	254907	254912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254694

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