MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008381	CGC	2	6	203330	203335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254643
3002	NC_008381	TCGGC	2	10	203348	203357	0 %	20 %	40 %	40 %	116254643
3003	NC_008381	GGC	2	6	203371	203376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254643
3004	NC_008381	TGA	2	6	203480	203485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254643
3005	NC_008381	GGC	2	6	203530	203535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254643
3006	NC_008381	GAA	2	6	203616	203621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254644
3007	NC_008381	GCC	4	12	203658	203669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254644
3008	NC_008381	ATC	2	6	203734	203739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254644
3009	NC_008381	GAC	2	6	203757	203762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254644
3010	NC_008381	TGC	2	6	203804	203809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
3011	NC_008381	GGC	2	6	203937	203942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254644
3012	NC_008381	TC	3	6	203967	203972	0 %	50 %	0 %	50 %	116254644
3013	NC_008381	GCC	2	6	203980	203985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254644
3014	NC_008381	CAC	2	6	204033	204038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254644
3015	NC_008381	CGCC	2	8	204098	204105	0 %	0 %	25 %	75 %	116254644
3016	NC_008381	GCG	2	6	204185	204190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254644
3017	NC_008381	TCG	2	6	204191	204196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
3018	NC_008381	AAC	2	6	204202	204207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254644
3019	NC_008381	TGC	2	6	204349	204354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
3020	NC_008381	AGG	2	6	204420	204425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254644
3021	NC_008381	TCG	2	6	204788	204793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254645
3022	NC_008381	CCG	2	6	204803	204808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254645
3023	NC_008381	ACA	2	6	204837	204842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254645
3024	NC_008381	GCC	2	6	204863	204868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254645
3025	NC_008381	GGC	2	6	204881	204886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254645
3026	NC_008381	TCT	2	6	204928	204933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254645
3027	NC_008381	CCGC	2	8	204976	204983	0 %	0 %	25 %	75 %	116254645
3028	NC_008381	CG	3	6	204987	204992	0 %	0 %	50 %	50 %	116254645
3029	NC_008381	CGG	2	6	205035	205040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254645
3030	NC_008381	GAAA	2	8	205043	205050	75 %	0 %	25 %	0 %	116254645
3031	NC_008381	TCGCGG	2	12	206288	206299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254646
3032	NC_008381	GCT	2	6	206310	206315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3033	NC_008381	ATC	2	6	206336	206341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254646
3034	NC_008381	GCT	2	6	206389	206394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3035	NC_008381	CGG	2	6	206434	206439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254646
3036	NC_008381	AT	3	6	206447	206452	50 %	50 %	0 %	0 %	116254646
3037	NC_008381	CGA	2	6	206463	206468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3038	NC_008381	CA	3	6	206608	206613	50 %	0 %	0 %	50 %	116254646
3039	NC_008381	CGG	2	6	206615	206620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254646
3040	NC_008381	CGG	2	6	206634	206639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254646
3041	NC_008381	CGT	2	6	206657	206662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3042	NC_008381	GTG	2	6	206668	206673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254646
3043	NC_008381	CG	4	8	206686	206693	0 %	0 %	50 %	50 %	116254646
3044	NC_008381	CGG	2	6	206700	206705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254646
3045	NC_008381	GCCTG	2	10	206708	206717	0 %	20 %	40 %	40 %	116254646
3046	NC_008381	TGC	2	6	206948	206953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3047	NC_008381	CAA	2	6	206961	206966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254646
3048	NC_008381	TCT	2	6	207011	207016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254646
3049	NC_008381	TGG	2	6	207043	207048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254646
3050	NC_008381	CTT	2	6	207069	207074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254646
3051	NC_008381	CCG	2	6	207080	207085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254646
3052	NC_008381	ATG	2	6	207097	207102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254646
3053	NC_008381	TAC	2	6	207103	207108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254646
3054	NC_008381	GGCC	2	8	207195	207202	0 %	0 %	50 %	50 %	116254646
3055	NC_008381	TCT	2	6	207257	207262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254646
3056	NC_008381	CCT	2	6	207281	207286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254646
3057	NC_008381	GGC	2	6	207289	207294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254646
3058	NC_008381	CCGAT	2	10	207344	207353	20 %	20 %	20 %	40 %	116254646
3059	NC_008381	GAT	3	9	207360	207368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254646
3060	NC_008381	GAT	2	6	207411	207416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254646
3061	NC_008381	TGGG	2	8	207493	207500	0 %	25 %	75 %	0 %	116254646
3062	NC_008381	TAT	2	6	207523	207528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254646
3063	NC_008381	CGC	2	6	207621	207626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254646
3064	NC_008381	CAG	2	6	207649	207654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3065	NC_008381	CTA	2	6	207732	207737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254646
3066	NC_008381	TGC	2	6	207740	207745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3067	NC_008381	GC	3	6	207744	207749	0 %	0 %	50 %	50 %	116254646
3068	NC_008381	GGT	2	6	207775	207780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254646
3069	NC_008381	GCC	2	6	207818	207823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254646
3070	NC_008381	CGA	2	6	207828	207833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254646
3071	NC_008381	GAA	2	6	207926	207931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254647
3072	NC_008381	CTT	2	6	207939	207944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254647
3073	NC_008381	GCT	2	6	207956	207961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3074	NC_008381	CGT	2	6	207962	207967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3075	NC_008381	CGG	2	6	207974	207979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254647
3076	NC_008381	TCG	2	6	207982	207987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3077	NC_008381	CGC	2	6	208051	208056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254647
3078	NC_008381	GCT	2	6	208093	208098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3079	NC_008381	GAT	2	6	208115	208120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254647
3080	NC_008381	CGA	2	6	208133	208138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3081	NC_008381	CTCG	2	8	208160	208167	0 %	25 %	25 %	50 %	116254647
3082	NC_008381	ATC	2	6	208186	208191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254647
3083	NC_008381	ACG	2	6	208405	208410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3084	NC_008381	ACG	2	6	208467	208472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3085	NC_008381	GCT	2	6	208475	208480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3086	NC_008381	CTG	2	6	208525	208530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3087	NC_008381	ACG	2	6	208600	208605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254647
3088	NC_008381	CCT	2	6	208678	208683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254648
3089	NC_008381	GGC	2	6	208690	208695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254648
3090	NC_008381	TTC	2	6	208697	208702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254648
3091	NC_008381	CGT	2	6	208708	208713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254648
3092	NC_008381	GCA	2	6	208734	208739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254648
3093	NC_008381	GAAG	2	8	208774	208781	50 %	0 %	50 %	0 %	116254648
3094	NC_008381	CGA	2	6	208805	208810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3095	NC_008381	GCG	2	6	208816	208821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254649
3096	NC_008381	CAA	2	6	208862	208867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254649
3097	NC_008381	TGG	2	6	208881	208886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254649
3098	NC_008381	GAT	2	6	208952	208957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254649
3099	NC_008381	GCA	2	6	209006	209011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3100	NC_008381	GAC	2	6	209039	209044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3101	NC_008381	TGATC	2	10	209051	209060	20 %	40 %	20 %	20 %	116254649
3102	NC_008381	GCC	2	6	209061	209066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254649
3103	NC_008381	CGATTC	2	12	209084	209095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254649
3104	NC_008381	CGG	2	6	209120	209125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254649
3105	NC_008381	GCG	2	6	209176	209181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254649
3106	NC_008381	ACG	3	9	209203	209211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3107	NC_008381	CGA	2	6	209248	209253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3108	NC_008381	GCC	2	6	209306	209311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254649
3109	NC_008381	TCG	2	6	209422	209427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3110	NC_008381	GAC	2	6	209451	209456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3111	NC_008381	GC	3	6	209479	209484	0 %	0 %	50 %	50 %	116254649
3112	NC_008381	ATC	2	6	209532	209537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254649
3113	NC_008381	TGCC	2	8	209569	209576	0 %	25 %	25 %	50 %	116254649
3114	NC_008381	ACG	2	6	209598	209603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254649
3115	NC_008381	GGC	2	6	209637	209642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254649
3116	NC_008381	GAG	2	6	209650	209655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254649
3117	NC_008381	CT	3	6	210107	210112	0 %	50 %	0 %	50 %	116254650
3118	NC_008381	GGA	2	6	210122	210127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254650
3119	NC_008381	CTA	2	6	210201	210206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254650
3120	NC_008381	CTT	3	9	210285	210293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254650
3121	NC_008381	TTC	2	6	210295	210300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254650
3122	NC_008381	TAT	2	6	210325	210330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254650
3123	NC_008381	TCG	3	9	210443	210451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
3124	NC_008381	CG	3	6	210477	210482	0 %	0 %	50 %	50 %	116254650
3125	NC_008381	GTC	2	6	210532	210537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
3126	NC_008381	GCT	2	6	210552	210557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
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3131	NC_008381	CGA	2	6	210765	210770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254650
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3133	NC_008381	GTC	2	6	210781	210786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
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3152	NC_008381	ACG	2	6	211873	211878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254651
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3202	NC_008381	CGC	2	6	214215	214220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254652
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3222	NC_008381	CG	3	6	215124	215129	0 %	0 %	50 %	50 %	116254654
3223	NC_008381	GCG	2	6	215133	215138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254654
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3227	NC_008381	CGTT	2	8	215615	215622	0 %	50 %	25 %	25 %	116254656
3228	NC_008381	GGT	2	6	215667	215672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254656
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3231	NC_008381	AATT	2	8	215728	215735	50 %	50 %	0 %	0 %	116254656
3232	NC_008381	CTT	2	6	215850	215855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254656
3233	NC_008381	TCG	2	6	215897	215902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254656
3234	NC_008381	CT	3	6	215930	215935	0 %	50 %	0 %	50 %	116254656
3235	NC_008381	CAA	2	6	215985	215990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254656
3236	NC_008381	GCT	2	6	216071	216076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254656
3237	NC_008381	CAAGAT	2	12	216111	216122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116254656
3238	NC_008381	TCG	2	6	216184	216189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254656
3239	NC_008381	GTTTT	2	10	216731	216740	0 %	80 %	20 %	0 %	116254657
3240	NC_008381	T	6	6	216737	216742	0 %	100 %	0 %	0 %	116254657
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3358	NC_008381	ATG	2	6	222495	222500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254662
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3362	NC_008381	GCTC	2	8	222952	222959	0 %	25 %	25 %	50 %	116254663
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3364	NC_008381	GCC	2	6	223111	223116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
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3480	NC_008381	ATC	2	6	230849	230854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254668
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3482	NC_008381	AAG	2	6	230944	230949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254668
3483	NC_008381	CGC	2	6	231002	231007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254668
3484	NC_008381	CGG	2	6	231026	231031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254668
3485	NC_008381	CGA	2	6	231042	231047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254668
3486	NC_008381	ATC	2	6	231049	231054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254668
3487	NC_008381	GCC	2	6	231073	231078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254668
3488	NC_008381	CGA	2	6	231120	231125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254668
3489	NC_008381	GCG	2	6	231238	231243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254668
3490	NC_008381	CAT	2	6	231308	231313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254669
3491	NC_008381	CGC	2	6	231356	231361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254669
3492	NC_008381	CGA	2	6	231368	231373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3493	NC_008381	ATC	2	6	231375	231380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254669
3494	NC_008381	TCC	2	6	231462	231467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254669
3495	NC_008381	TCG	2	6	231508	231513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3496	NC_008381	GCG	2	6	231526	231531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254669
3497	NC_008381	GAG	2	6	231582	231587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254669
3498	NC_008381	CAG	2	6	231608	231613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254669
3499	NC_008381	CATG	2	8	231626	231633	25 %	25 %	25 %	25 %	116254669
3500	NC_008381	CGC	3	9	231668	231676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254669

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