MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008381	CAA	2	6	166894	166899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254608
2502	NC_008381	CCA	2	6	166905	166910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254608
2503	NC_008381	GCA	2	6	166947	166952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254608
2504	NC_008381	GGT	2	6	166984	166989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254608
2505	NC_008381	GCC	2	6	166990	166995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254608
2506	NC_008381	GGC	2	6	167018	167023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254609
2507	NC_008381	CGC	2	6	167049	167054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254609
2508	NC_008381	AC	3	6	167076	167081	50 %	0 %	0 %	50 %	116254609
2509	NC_008381	GGGC	2	8	167150	167157	0 %	0 %	75 %	25 %	116254609
2510	NC_008381	GCG	2	6	167181	167186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254609
2511	NC_008381	TGC	2	6	167261	167266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254609
2512	NC_008381	GCA	2	6	167321	167326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254609
2513	NC_008381	CGC	2	6	167330	167335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254609
2514	NC_008381	TGC	2	6	167408	167413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254609
2515	NC_008381	GCG	2	6	167515	167520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254609
2516	NC_008381	TGCC	2	8	167549	167556	0 %	25 %	25 %	50 %	116254609
2517	NC_008381	CTT	2	6	167564	167569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254609
2518	NC_008381	CGG	2	6	167601	167606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254609
2519	NC_008381	GCG	2	6	167717	167722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254609
2520	NC_008381	GGT	2	6	167732	167737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254609
2521	NC_008381	GCC	2	6	167747	167752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254609
2522	NC_008381	GGCA	2	8	167883	167890	25 %	0 %	50 %	25 %	116254609
2523	NC_008381	CCG	2	6	167924	167929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254609
2524	NC_008381	GCTT	2	8	167980	167987	0 %	50 %	25 %	25 %	116254609
2525	NC_008381	CGC	2	6	168043	168048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254609
2526	NC_008381	GAA	2	6	168063	168068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254609
2527	NC_008381	CCA	2	6	168081	168086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254609
2528	NC_008381	TGT	2	6	168108	168113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254609
2529	NC_008381	ATC	2	6	168129	168134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254609
2530	NC_008381	GAT	2	6	168612	168617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254610
2531	NC_008381	GGAC	2	8	168648	168655	25 %	0 %	50 %	25 %	116254610
2532	NC_008381	TAC	2	6	168786	168791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254610
2533	NC_008381	TGA	2	6	168862	168867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254610
2534	NC_008381	G	6	6	168924	168929	0 %	0 %	100 %	0 %	116254610
2535	NC_008381	TCG	2	6	169065	169070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254611
2536	NC_008381	ATG	2	6	169110	169115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254611
2537	NC_008381	CGT	2	6	169156	169161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254611
2538	NC_008381	CCG	2	6	169166	169171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254611
2539	NC_008381	CTT	2	6	169240	169245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254611
2540	NC_008381	CAA	2	6	169246	169251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254611
2541	NC_008381	GCT	2	6	169291	169296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254611
2542	NC_008381	CGC	2	6	169324	169329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254611
2543	NC_008381	AGCGC	2	10	169931	169940	20 %	0 %	40 %	40 %	116254612
2544	NC_008381	GAA	2	6	169972	169977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254612
2545	NC_008381	TCT	2	6	170040	170045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254612
2546	NC_008381	AATCA	2	10	170087	170096	60 %	20 %	0 %	20 %	116254612
2547	NC_008381	T	6	6	170165	170170	0 %	100 %	0 %	0 %	116254612
2548	NC_008381	GGA	2	6	170182	170187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254612
2549	NC_008381	ACT	2	6	170213	170218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254612
2550	NC_008381	TCA	2	6	170283	170288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254612
2551	NC_008381	AAC	2	6	170309	170314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254612
2552	NC_008381	GCG	2	6	170417	170422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254612
2553	NC_008381	TGT	2	6	170621	170626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254613
2554	NC_008381	CA	3	6	170652	170657	50 %	0 %	0 %	50 %	116254613
2555	NC_008381	CGGTG	2	10	170702	170711	0 %	20 %	60 %	20 %	116254613
2556	NC_008381	GATG	2	8	170845	170852	25 %	25 %	50 %	0 %	116254613
2557	NC_008381	CGG	2	6	170909	170914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254613
2558	NC_008381	ACG	2	6	171026	171031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254613
2559	NC_008381	AAT	2	6	171048	171053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254613
2560	NC_008381	TGT	2	6	171062	171067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254613
2561	NC_008381	ACG	2	6	171120	171125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254613
2562	NC_008381	CGG	2	6	171127	171132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254613
2563	NC_008381	GCA	2	6	171140	171145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254613
2564	NC_008381	GCC	2	6	171153	171158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254613
2565	NC_008381	GCAC	2	8	171204	171211	25 %	0 %	25 %	50 %	116254613
2566	NC_008381	GCT	2	6	171391	171396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254614
2567	NC_008381	GAG	2	6	171436	171441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254614
2568	NC_008381	CGT	2	6	171483	171488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254614
2569	NC_008381	CCGGT	2	10	171509	171518	0 %	20 %	40 %	40 %	116254614
2570	NC_008381	G	7	7	171787	171793	0 %	0 %	100 %	0 %	116254614
2571	NC_008381	ATC	2	6	172060	172065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254615
2572	NC_008381	GAT	2	6	172188	172193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254615
2573	NC_008381	CAT	2	6	172244	172249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254615
2574	NC_008381	GCC	2	6	172285	172290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254615
2575	NC_008381	GC	3	6	172301	172306	0 %	0 %	50 %	50 %	116254615
2576	NC_008381	GT	3	6	172375	172380	0 %	50 %	50 %	0 %	116254615
2577	NC_008381	TCAA	2	8	172399	172406	50 %	25 %	0 %	25 %	116254615
2578	NC_008381	ACG	2	6	172434	172439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254615
2579	NC_008381	CAAA	2	8	172480	172487	75 %	0 %	0 %	25 %	116254615
2580	NC_008381	ACC	2	6	172562	172567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254615
2581	NC_008381	GCTG	2	8	172707	172714	0 %	25 %	50 %	25 %	116254615
2582	NC_008381	TTC	2	6	172758	172763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254615
2583	NC_008381	GTT	2	6	173354	173359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254616
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2585	NC_008381	CGC	2	6	173416	173421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254616
2586	NC_008381	AGCC	2	8	173557	173564	25 %	0 %	25 %	50 %	116254616
2587	NC_008381	GTT	2	6	173624	173629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254616
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2589	NC_008381	TTG	2	6	173721	173726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254616
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2591	NC_008381	CGC	2	6	173857	173862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254616
2592	NC_008381	AACG	2	8	173930	173937	50 %	0 %	25 %	25 %	116254616
2593	NC_008381	CGT	2	6	174400	174405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254617
2594	NC_008381	CTG	2	6	174431	174436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254617
2595	NC_008381	TTC	2	6	174457	174462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254617
2596	NC_008381	CCG	2	6	174492	174497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254617
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2598	NC_008381	GCC	2	6	174753	174758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254617
2599	NC_008381	CGTGC	2	10	174810	174819	0 %	20 %	40 %	40 %	116254617
2600	NC_008381	GGC	2	6	175014	175019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254618
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2602	NC_008381	GAT	2	6	175053	175058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254618
2603	NC_008381	GGT	2	6	175155	175160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254618
2604	NC_008381	CCT	2	6	175183	175188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254618
2605	NC_008381	GCG	2	6	175231	175236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254618
2606	NC_008381	GGC	2	6	175311	175316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254618
2607	NC_008381	GAC	2	6	175317	175322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254618
2608	NC_008381	AAC	2	6	175364	175369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254618
2609	NC_008381	CGC	2	6	175427	175432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254618
2610	NC_008381	GGT	2	6	175440	175445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254618
2611	NC_008381	TCA	2	6	175471	175476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254618
2612	NC_008381	GC	3	6	175537	175542	0 %	0 %	50 %	50 %	116254618
2613	NC_008381	CGT	2	6	175553	175558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254618
2614	NC_008381	CTGCCG	2	12	175585	175596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116254618
2615	NC_008381	CAT	2	6	175631	175636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254618
2616	NC_008381	A	6	6	175651	175656	100 %	0 %	0 %	0 %	116254618
2617	NC_008381	CGG	2	6	175777	175782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254618
2618	NC_008381	GAT	2	6	177063	177068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254619
2619	NC_008381	CGGA	2	8	177070	177077	25 %	0 %	50 %	25 %	116254619
2620	NC_008381	ATTCC	2	10	177127	177136	20 %	40 %	0 %	40 %	116254619
2621	NC_008381	GAA	2	6	177161	177166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254619
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2736	NC_008381	GCCTT	2	10	185797	185806	0 %	40 %	20 %	40 %	116254626
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2744	NC_008381	CGG	2	6	185997	186002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254626
2745	NC_008381	GTC	2	6	186137	186142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254626
2746	NC_008381	TGC	2	6	186202	186207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254626
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2748	NC_008381	GCT	2	6	186213	186218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254626
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2864	NC_008381	GCA	2	6	192959	192964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254635
2865	NC_008381	GATCTC	2	12	192992	193003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254635
2866	NC_008381	CGC	2	6	193039	193044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254635
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2984	NC_008381	CGG	2	6	201276	201281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254642
2985	NC_008381	TGA	2	6	201307	201312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254642
2986	NC_008381	CG	3	6	201376	201381	0 %	0 %	50 %	50 %	116254642
2987	NC_008381	C	6	6	201512	201517	0 %	0 %	0 %	100 %	116254642
2988	NC_008381	CGGT	2	8	201594	201601	0 %	25 %	50 %	25 %	116254642
2989	NC_008381	ATG	2	6	201753	201758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254642
2990	NC_008381	TCG	2	6	201853	201858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254642
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2997	NC_008381	CAGC	2	8	203171	203178	25 %	0 %	25 %	50 %	116254643
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