MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008381	GCG	2	6	60807	60812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254517
1002	NC_008381	CATA	2	8	60970	60977	50 %	25 %	0 %	25 %	116254517
1003	NC_008381	CGA	2	6	61018	61023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254517
1004	NC_008381	TTC	2	6	61059	61064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254517
1005	NC_008381	ATG	2	6	61068	61073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254517
1006	NC_008381	GCC	2	6	61102	61107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254518
1007	NC_008381	TTTC	2	8	61244	61251	0 %	75 %	0 %	25 %	116254518
1008	NC_008381	GCG	2	6	61324	61329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254518
1009	NC_008381	GAAGG	2	10	61668	61677	40 %	0 %	60 %	0 %	116254518
1010	NC_008381	CCA	2	6	61688	61693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254518
1011	NC_008381	GCA	2	6	61752	61757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254518
1012	NC_008381	ATCAC	2	10	61771	61780	40 %	20 %	0 %	40 %	116254518
1013	NC_008381	TGC	2	6	61828	61833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254518
1014	NC_008381	CGA	2	6	61844	61849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254518
1015	NC_008381	GC	3	6	61872	61877	0 %	0 %	50 %	50 %	116254518
1016	NC_008381	CGC	2	6	61979	61984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254518
1017	NC_008381	AGG	2	6	62053	62058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254518
1018	NC_008381	GAG	2	6	62115	62120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254518
1019	NC_008381	GACGCC	2	12	62181	62192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116254518
1020	NC_008381	TGA	2	6	62234	62239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254518
1021	NC_008381	TGT	2	6	62285	62290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254518
1022	NC_008381	GTTT	2	8	62336	62343	0 %	75 %	25 %	0 %	116254519
1023	NC_008381	AC	3	6	62354	62359	50 %	0 %	0 %	50 %	116254519
1024	NC_008381	TAT	2	6	62365	62370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254519
1025	NC_008381	CAC	2	6	62384	62389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254519
1026	NC_008381	GACAT	2	10	62416	62425	40 %	20 %	20 %	20 %	116254519
1027	NC_008381	TCT	2	6	62460	62465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254519
1028	NC_008381	GCTGA	2	10	62485	62494	20 %	20 %	40 %	20 %	116254519
1029	NC_008381	GTC	2	6	62515	62520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254519
1030	NC_008381	CAG	2	6	62528	62533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254519
1031	NC_008381	CGG	2	6	62545	62550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254519
1032	NC_008381	GGA	2	6	62664	62669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254519
1033	NC_008381	TGA	2	6	62753	62758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254519
1034	NC_008381	ACC	2	6	62780	62785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254519
1035	NC_008381	TGC	2	6	62852	62857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254519
1036	NC_008381	AAG	2	6	62866	62871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254519
1037	NC_008381	ATT	2	6	62893	62898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254519
1038	NC_008381	TGCGAT	2	12	62968	62979	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116254520
1039	NC_008381	GAA	2	6	63024	63029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254520
1040	NC_008381	ATC	2	6	63095	63100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254520
1041	NC_008381	CGA	2	6	63102	63107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254520
1042	NC_008381	CTG	2	6	63108	63113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254520
1043	NC_008381	ATGA	2	8	63155	63162	50 %	25 %	25 %	0 %	116254520
1044	NC_008381	CGA	2	6	63186	63191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254520
1045	NC_008381	GCA	2	6	63192	63197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254520
1046	NC_008381	GAA	2	6	63198	63203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254520
1047	NC_008381	CTGG	2	8	63297	63304	0 %	25 %	50 %	25 %	116254521
1048	NC_008381	TTC	2	6	63321	63326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254521
1049	NC_008381	CGT	2	6	63336	63341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254521
1050	NC_008381	CAA	2	6	63377	63382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254521
1051	NC_008381	CTT	2	6	63485	63490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254521
1052	NC_008381	TCGA	2	8	63577	63584	25 %	25 %	25 %	25 %	116254521
1053	NC_008381	TCG	2	6	63646	63651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254521
1054	NC_008381	GTG	3	9	65467	65475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254522
1055	NC_008381	TGC	2	6	65483	65488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254522
1056	NC_008381	G	6	6	65531	65536	0 %	0 %	100 %	0 %	116254522
1057	NC_008381	CGGC	2	8	65541	65548	0 %	0 %	50 %	50 %	116254522
1058	NC_008381	TGC	2	6	65616	65621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254522
1059	NC_008381	CTT	2	6	65631	65636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254522
1060	NC_008381	TCT	2	6	65640	65645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254522
1061	NC_008381	AAC	2	6	65674	65679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254522
1062	NC_008381	ATGG	3	12	65759	65770	25 %	25 %	50 %	0 %	116254522
1063	NC_008381	CTT	2	6	65773	65778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254522
1064	NC_008381	CCAG	2	8	65780	65787	25 %	0 %	25 %	50 %	116254522
1065	NC_008381	CTT	2	6	65803	65808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254522
1066	NC_008381	TGC	2	6	65882	65887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254522
1067	NC_008381	TGC	2	6	65897	65902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254522
1068	NC_008381	ATCA	2	8	65917	65924	50 %	25 %	0 %	25 %	116254522
1069	NC_008381	GCC	2	6	65928	65933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254522
1070	NC_008381	GCG	2	6	65947	65952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254522
1071	NC_008381	C	7	7	65970	65976	0 %	0 %	0 %	100 %	116254522
1072	NC_008381	ACCA	2	8	66075	66082	50 %	0 %	0 %	50 %	116254522
1073	NC_008381	CGG	3	9	66087	66095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254522
1074	NC_008381	GGC	2	6	66157	66162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254522
1075	NC_008381	CTC	2	6	66179	66184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254522
1076	NC_008381	TTC	2	6	66201	66206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254522
1077	NC_008381	ACG	2	6	66240	66245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254522
1078	NC_008381	GA	3	6	66250	66255	50 %	0 %	50 %	0 %	116254522
1079	NC_008381	CTTG	2	8	66279	66286	0 %	50 %	25 %	25 %	116254522
1080	NC_008381	GCC	2	6	66307	66312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254522
1081	NC_008381	TCA	2	6	66329	66334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254522
1082	NC_008381	GCC	2	6	66366	66371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254522
1083	NC_008381	TCA	2	6	66421	66426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254523
1084	NC_008381	TCC	2	6	66550	66555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254523
1085	NC_008381	GTC	2	6	66675	66680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254523
1086	NC_008381	TCG	2	6	66685	66690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254523
1087	NC_008381	CG	4	8	66743	66750	0 %	0 %	50 %	50 %	116254523
1088	NC_008381	TTCT	2	8	66777	66784	0 %	75 %	0 %	25 %	116254523
1089	NC_008381	GCT	2	6	66812	66817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254523
1090	NC_008381	TTC	2	6	66828	66833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254523
1091	NC_008381	TCA	2	6	66838	66843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254523
1092	NC_008381	TGC	2	6	66950	66955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254523
1093	NC_008381	GCTTTC	2	12	66981	66992	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116254523
1094	NC_008381	GC	3	6	67400	67405	0 %	0 %	50 %	50 %	116254524
1095	NC_008381	TTCC	2	8	67420	67427	0 %	50 %	0 %	50 %	116254524
1096	NC_008381	CGC	2	6	67511	67516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254524
1097	NC_008381	GCC	2	6	67548	67553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254524
1098	NC_008381	ATGA	2	8	67665	67672	50 %	25 %	25 %	0 %	116254524
1099	NC_008381	GCA	2	6	67688	67693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254524
1100	NC_008381	CTG	2	6	67760	67765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254524
1101	NC_008381	TCAG	2	8	67795	67802	25 %	25 %	25 %	25 %	116254525
1102	NC_008381	TTG	2	6	67890	67895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254525
1103	NC_008381	TG	3	6	67894	67899	0 %	50 %	50 %	0 %	116254525
1104	NC_008381	GT	3	6	67959	67964	0 %	50 %	50 %	0 %	116254525
1105	NC_008381	CTT	2	6	68027	68032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254525
1106	NC_008381	CCG	2	6	68087	68092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254525
1107	NC_008381	GGC	2	6	68143	68148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254525
1108	NC_008381	GC	3	6	68147	68152	0 %	0 %	50 %	50 %	116254525
1109	NC_008381	GCTC	2	8	68185	68192	0 %	25 %	25 %	50 %	116254525
1110	NC_008381	GCC	2	6	68237	68242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254525
1111	NC_008381	AGT	2	6	68244	68249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254525
1112	NC_008381	CCAT	2	8	68321	68328	25 %	25 %	0 %	50 %	116254525
1113	NC_008381	CCG	2	6	68329	68334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254525
1114	NC_008381	CTT	2	6	68431	68436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254525
1115	NC_008381	ATC	2	6	68439	68444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254525
1116	NC_008381	CG	3	6	68454	68459	0 %	0 %	50 %	50 %	116254525
1117	NC_008381	GGC	2	6	68615	68620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254526
1118	NC_008381	GCC	2	6	68692	68697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254526
1119	NC_008381	TGC	2	6	68700	68705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254526
1120	NC_008381	GGC	2	6	68706	68711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254526
1121	NC_008381	GC	3	6	68718	68723	0 %	0 %	50 %	50 %	116254526
1122	NC_008381	CCA	2	6	68780	68785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254526
1123	NC_008381	CG	3	6	68815	68820	0 %	0 %	50 %	50 %	116254526
1124	NC_008381	GAT	2	6	68832	68837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254526
1125	NC_008381	TCG	2	6	68848	68853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254526
1126	NC_008381	GCGA	2	8	68875	68882	25 %	0 %	50 %	25 %	116254526
1127	NC_008381	GGC	2	6	68949	68954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254526
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1134	NC_008381	GGC	2	6	69399	69404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254526
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1144	NC_008381	GTC	2	6	70386	70391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254527
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1146	NC_008381	CAAT	2	8	70411	70418	50 %	25 %	0 %	25 %	116254527
1147	NC_008381	GAT	2	6	70440	70445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254527
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1151	NC_008381	CTG	2	6	70753	70758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254527
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1241	NC_008381	CCGAG	2	10	77191	77200	20 %	0 %	40 %	40 %	116254535
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1249	NC_008381	CGC	2	6	77682	77687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254535
1250	NC_008381	AAGGA	2	10	77721	77730	60 %	0 %	40 %	0 %	116254535
1251	NC_008381	CG	3	6	77745	77750	0 %	0 %	50 %	50 %	116254535
1252	NC_008381	AAGCCG	2	12	77787	77798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254535
1253	NC_008381	GCACC	2	10	77919	77928	20 %	0 %	20 %	60 %	116254535
1254	NC_008381	GGC	2	6	77967	77972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254535
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1272	NC_008381	TAC	2	6	79813	79818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254537
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1275	NC_008381	CGAT	2	8	79946	79953	25 %	25 %	25 %	25 %	116254537
1276	NC_008381	A	6	6	80544	80549	100 %	0 %	0 %	0 %	116254538
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1372	NC_008381	GCC	2	6	86898	86903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254544
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1497	NC_008381	GCC	2	6	101093	101098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254552
1498	NC_008381	AAG	2	6	101166	101171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254552
1499	NC_008381	GGCGCT	2	12	101201	101212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254552
1500	NC_008381	ACGG	2	8	101241	101248	25 %	0 %	50 %	25 %	116254552

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