MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008381	TTC	2	6	352748	352753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254782
6002	NC_008381	CGA	2	6	352762	352767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254782
6003	NC_008381	TCA	2	6	352772	352777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254782
6004	NC_008381	GATG	2	8	352818	352825	25 %	25 %	50 %	0 %	116254782
6005	NC_008381	ATG	2	6	352837	352842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254782
6006	NC_008381	GGC	2	6	352926	352931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254782
6007	NC_008381	CTC	2	6	352957	352962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254782
6008	NC_008381	GGA	2	6	353004	353009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254782
6009	NC_008381	CGG	2	6	353085	353090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254782
6010	NC_008381	CGATG	2	10	353091	353100	20 %	20 %	40 %	20 %	116254782
6011	NC_008381	AT	3	6	353103	353108	50 %	50 %	0 %	0 %	116254782
6012	NC_008381	GTC	2	6	353143	353148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254782
6013	NC_008381	GATG	2	8	353204	353211	25 %	25 %	50 %	0 %	116254782
6014	NC_008381	CCTC	2	8	353212	353219	0 %	25 %	0 %	75 %	116254783
6015	NC_008381	GCT	2	6	353228	353233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6016	NC_008381	TTC	2	6	353259	353264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254783
6017	NC_008381	GCG	2	6	353355	353360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254783
6018	NC_008381	TTC	2	6	353361	353366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254783
6019	NC_008381	TTC	2	6	353385	353390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254783
6020	NC_008381	CAT	2	6	353423	353428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254783
6021	NC_008381	GCA	2	6	353463	353468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6022	NC_008381	ATC	2	6	353481	353486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254783
6023	NC_008381	ATC	2	6	353493	353498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254783
6024	NC_008381	TCG	2	6	353526	353531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6025	NC_008381	TGG	2	6	353551	353556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254783
6026	NC_008381	GCCA	2	8	353636	353643	25 %	0 %	25 %	50 %	116254783
6027	NC_008381	AGA	2	6	353791	353796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254783
6028	NC_008381	CAT	2	6	353804	353809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254783
6029	NC_008381	GGT	2	6	353867	353872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254783
6030	NC_008381	CGG	2	6	353990	353995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254783
6031	NC_008381	CGA	2	6	354040	354045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6032	NC_008381	TCG	2	6	354086	354091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6033	NC_008381	CGG	2	6	354154	354159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254783
6034	NC_008381	GCA	2	6	354162	354167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6035	NC_008381	TGC	2	6	354199	354204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254783
6036	NC_008381	AATGA	2	10	354205	354214	60 %	20 %	20 %	0 %	116254783
6037	NC_008381	T	7	7	354639	354645	0 %	100 %	0 %	0 %	116254784
6038	NC_008381	CAGC	2	8	354657	354664	25 %	0 %	25 %	50 %	116254784
6039	NC_008381	CGC	2	6	354725	354730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6040	NC_008381	GAC	2	6	354742	354747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6041	NC_008381	TCA	2	6	354762	354767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254784
6042	NC_008381	TCCG	2	8	354787	354794	0 %	25 %	25 %	50 %	116254784
6043	NC_008381	ATC	2	6	354875	354880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254784
6044	NC_008381	CCT	2	6	354942	354947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254784
6045	NC_008381	GCG	2	6	354978	354983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254784
6046	NC_008381	CGC	2	6	355017	355022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6047	NC_008381	TCC	2	6	355160	355165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254784
6048	NC_008381	AAG	2	6	355190	355195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254784
6049	NC_008381	GCC	2	6	355217	355222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6050	NC_008381	GGC	2	6	355235	355240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254784
6051	NC_008381	CGC	2	6	355270	355275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6052	NC_008381	CGG	2	6	355276	355281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254784
6053	NC_008381	TCG	2	6	355311	355316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6054	NC_008381	GCC	3	9	355318	355326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6055	NC_008381	TCT	2	6	355365	355370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254784
6056	NC_008381	AGC	2	6	355392	355397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6057	NC_008381	CCA	2	6	355428	355433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254784
6058	NC_008381	GC	3	6	355477	355482	0 %	0 %	50 %	50 %	116254784
6059	NC_008381	TGC	2	6	355507	355512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6060	NC_008381	CTG	2	6	355520	355525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6061	NC_008381	ACA	2	6	355566	355571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254784
6062	NC_008381	CGA	2	6	355620	355625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6063	NC_008381	GCC	2	6	355638	355643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6064	NC_008381	CCT	2	6	355722	355727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254784
6065	NC_008381	GCC	2	6	355850	355855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254784
6066	NC_008381	CGG	2	6	355872	355877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254784
6067	NC_008381	TCG	2	6	355892	355897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254784
6068	NC_008381	CTT	2	6	355915	355920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254784
6069	NC_008381	GCC	2	6	356085	356090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254785
6070	NC_008381	GGC	2	6	356102	356107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254785
6071	NC_008381	TCG	2	6	356153	356158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6072	NC_008381	CGT	2	6	356183	356188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6073	NC_008381	TCG	2	6	356197	356202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6074	NC_008381	CGG	2	6	356245	356250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254785
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6078	NC_008381	CGATC	2	10	356462	356471	20 %	20 %	20 %	40 %	116254785
6079	NC_008381	TGC	2	6	356479	356484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6080	NC_008381	CCG	2	6	356493	356498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254785
6081	NC_008381	TCGC	2	8	356517	356524	0 %	25 %	25 %	50 %	116254785
6082	NC_008381	TCA	2	6	356566	356571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254785
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6084	NC_008381	CCG	2	6	356599	356604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254785
6085	NC_008381	TGC	2	6	356650	356655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6086	NC_008381	TGC	2	6	356689	356694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
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6088	NC_008381	CTT	2	6	356798	356803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254785
6089	NC_008381	TCG	2	6	356823	356828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6090	NC_008381	CAT	2	6	356840	356845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254785
6091	NC_008381	TCG	2	6	356869	356874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254785
6092	NC_008381	TGG	2	6	356893	356898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254785
6093	NC_008381	TCA	2	6	356914	356919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254785
6094	NC_008381	GC	3	6	357010	357015	0 %	0 %	50 %	50 %	116254786
6095	NC_008381	ATC	2	6	357068	357073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254786
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6098	NC_008381	CGT	2	6	357193	357198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254786
6099	NC_008381	GCT	2	6	357214	357219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254786
6100	NC_008381	CGAA	2	8	357275	357282	50 %	0 %	25 %	25 %	116254786
6101	NC_008381	ACCTCG	2	12	357318	357329	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116254786
6102	NC_008381	GGC	2	6	357374	357379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254786
6103	NC_008381	CG	3	6	357404	357409	0 %	0 %	50 %	50 %	116254786
6104	NC_008381	CTG	2	6	357431	357436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254786
6105	NC_008381	CGA	2	6	357439	357444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254786
6106	NC_008381	GC	3	6	357453	357458	0 %	0 %	50 %	50 %	116254786
6107	NC_008381	TGA	2	6	357531	357536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254786
6108	NC_008381	ATG	2	6	357543	357548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254786
6109	NC_008381	TGT	2	6	357564	357569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254786
6110	NC_008381	TGA	3	9	357582	357590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254786
6111	NC_008381	CGG	2	6	357600	357605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254786
6112	NC_008381	CATCG	2	10	357650	357659	20 %	20 %	20 %	40 %	116254786
6113	NC_008381	GCC	2	6	357896	357901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254787
6114	NC_008381	CTGCGG	2	12	357906	357917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254787
6115	NC_008381	CGCA	2	8	357922	357929	25 %	0 %	25 %	50 %	116254787
6116	NC_008381	CTC	2	6	357955	357960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254787
6117	NC_008381	GC	3	6	358062	358067	0 %	0 %	50 %	50 %	116254787
6118	NC_008381	TTC	3	9	358111	358119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254787
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6120	NC_008381	TCG	2	6	358178	358183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254787
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6229	NC_008381	ATCCGT	2	12	363135	363146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254792
6230	NC_008381	TCA	3	9	363186	363194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254792
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6232	NC_008381	CAT	2	6	363325	363330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254792
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6234	NC_008381	CAT	2	6	363469	363474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254792
6235	NC_008381	ATC	2	6	363506	363511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254792
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6237	NC_008381	CAC	2	6	363601	363606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254792
6238	NC_008381	CGA	3	9	363621	363629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254792
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6481	NC_008381	ATC	2	6	375733	375738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254806
6482	NC_008381	GC	3	6	375791	375796	0 %	0 %	50 %	50 %	116254806
6483	NC_008381	GAC	2	6	376042	376047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254806
6484	NC_008381	TCG	2	6	376070	376075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254806
6485	NC_008381	TCGG	2	8	376142	376149	0 %	25 %	50 %	25 %	116254806
6486	NC_008381	CAG	2	6	376150	376155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254806
6487	NC_008381	TCAT	2	8	376166	376173	25 %	50 %	0 %	25 %	116254806
6488	NC_008381	GCG	2	6	376196	376201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254806
6489	NC_008381	TCA	2	6	376221	376226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254806
6490	NC_008381	CGG	2	6	376227	376232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254806
6491	NC_008381	CGG	2	6	376304	376309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254806
6492	NC_008381	TCG	2	6	376412	376417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254806
6493	NC_008381	GGCACG	2	12	376477	376488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116254806
6494	NC_008381	GCG	2	6	376562	376567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254806
6495	NC_008381	GTC	2	6	376570	376575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254806
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6499	NC_008381	GGC	2	6	377011	377016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254807
6500	NC_008381	CGG	2	6	377060	377065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254807

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