MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008381	GAA	2	6	300431	300436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254730
5002	NC_008381	CGT	2	6	300445	300450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254730
5003	NC_008381	ACGG	2	8	300458	300465	25 %	0 %	50 %	25 %	116254730
5004	NC_008381	GC	3	6	300466	300471	0 %	0 %	50 %	50 %	116254730
5005	NC_008381	GCG	3	9	300479	300487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254730
5006	NC_008381	CAT	2	6	300520	300525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254730
5007	NC_008381	CGA	2	6	300649	300654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254730
5008	NC_008381	GCG	2	6	300689	300694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254730
5009	NC_008381	GC	3	6	300700	300705	0 %	0 %	50 %	50 %	116254730
5010	NC_008381	TCC	2	6	300708	300713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254730
5011	NC_008381	CGG	2	6	300729	300734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254730
5012	NC_008381	CGAC	2	8	300744	300751	25 %	0 %	25 %	50 %	116254730
5013	NC_008381	GCA	2	6	300786	300791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254730
5014	NC_008381	GCG	2	6	300807	300812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254730
5015	NC_008381	CAG	2	6	300958	300963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254730
5016	NC_008381	GAGG	2	8	300985	300992	25 %	0 %	75 %	0 %	116254730
5017	NC_008381	TTC	2	6	301075	301080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254731
5018	NC_008381	ACG	2	6	301081	301086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254731
5019	NC_008381	GGC	2	6	301101	301106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254731
5020	NC_008381	ATC	2	6	301120	301125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254731
5021	NC_008381	GC	3	6	301159	301164	0 %	0 %	50 %	50 %	116254731
5022	NC_008381	GGA	2	6	301170	301175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254731
5023	NC_008381	GCG	2	6	301179	301184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254731
5024	NC_008381	GCC	2	6	301237	301242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254731
5025	NC_008381	AGG	2	6	301355	301360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254731
5026	NC_008381	CGT	2	6	301500	301505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254731
5027	NC_008381	GC	3	6	301526	301531	0 %	0 %	50 %	50 %	116254731
5028	NC_008381	GGCC	2	8	301572	301579	0 %	0 %	50 %	50 %	116254731
5029	NC_008381	GCC	2	6	301624	301629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254731
5030	NC_008381	GCA	2	6	301653	301658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254731
5031	NC_008381	GTT	2	6	301662	301667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254731
5032	NC_008381	ATG	2	6	301670	301675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254731
5033	NC_008381	TCC	2	6	301727	301732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254731
5034	NC_008381	CGC	2	6	301752	301757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254731
5035	NC_008381	GCCG	2	8	301847	301854	0 %	0 %	50 %	50 %	116254731
5036	NC_008381	CGT	2	6	302013	302018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254731
5037	NC_008381	CAGG	2	8	302217	302224	25 %	0 %	50 %	25 %	116254731
5038	NC_008381	GT	3	6	302246	302251	0 %	50 %	50 %	0 %	116254731
5039	NC_008381	GAT	2	6	302639	302644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254732
5040	NC_008381	GCC	2	6	302691	302696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254732
5041	NC_008381	CCG	2	6	302722	302727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254732
5042	NC_008381	GGT	2	6	302732	302737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254732
5043	NC_008381	CAG	2	6	302892	302897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254732
5044	NC_008381	CAT	2	6	302924	302929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254732
5045	NC_008381	CTGAT	2	10	302965	302974	20 %	40 %	20 %	20 %	116254732
5046	NC_008381	GTTG	2	8	303020	303027	0 %	50 %	50 %	0 %	116254732
5047	NC_008381	CGT	2	6	303059	303064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254732
5048	NC_008381	CAT	2	6	303596	303601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254733
5049	NC_008381	CGC	2	6	303612	303617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254733
5050	NC_008381	GAGCAA	2	12	303711	303722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116254733
5051	NC_008381	TGG	2	6	303731	303736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254733
5052	NC_008381	GTG	2	6	303744	303749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254733
5053	NC_008381	TGG	2	6	303782	303787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254733
5054	NC_008381	TGCCGG	2	12	303864	303875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254733
5055	NC_008381	CA	3	6	303905	303910	50 %	0 %	0 %	50 %	116254733
5056	NC_008381	GGC	2	6	303967	303972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5057	NC_008381	GCT	2	6	303990	303995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5058	NC_008381	CTT	2	6	303999	304004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254733
5059	NC_008381	GCC	2	6	304051	304056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254733
5060	NC_008381	CGA	2	6	304068	304073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5061	NC_008381	TAT	2	6	304126	304131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254733
5062	NC_008381	CAG	2	6	304132	304137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5063	NC_008381	CGT	2	6	304233	304238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5064	NC_008381	CGA	2	6	304262	304267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5065	NC_008381	CAC	2	6	304312	304317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254733
5066	NC_008381	TGC	2	6	304325	304330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5067	NC_008381	CGG	2	6	304340	304345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5068	NC_008381	TGA	2	6	304352	304357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254733
5069	NC_008381	GGC	3	9	304470	304478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5070	NC_008381	TGC	2	6	304494	304499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5071	NC_008381	ATC	2	6	304560	304565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254733
5072	NC_008381	GCG	2	6	304574	304579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5073	NC_008381	CGG	2	6	304632	304637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5074	NC_008381	GAA	2	6	304723	304728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254733
5075	NC_008381	CGG	2	6	304745	304750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254733
5076	NC_008381	CGC	2	6	304753	304758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254733
5077	NC_008381	TCG	2	6	304849	304854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254733
5078	NC_008381	AGG	2	6	304922	304927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254733
5079	NC_008381	CGTC	2	8	305121	305128	0 %	25 %	25 %	50 %	116254734
5080	NC_008381	GGC	2	6	305156	305161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254734
5081	NC_008381	GGC	3	9	305165	305173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254734
5082	NC_008381	TGAT	2	8	305220	305227	25 %	50 %	25 %	0 %	116254734
5083	NC_008381	GGAT	2	8	305244	305251	25 %	25 %	50 %	0 %	116254734
5084	NC_008381	CAT	2	6	305255	305260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254734
5085	NC_008381	CGG	3	9	305353	305361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254734
5086	NC_008381	GAGC	2	8	305381	305388	25 %	0 %	50 %	25 %	116254734
5087	NC_008381	GGC	2	6	305403	305408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254734
5088	NC_008381	GC	3	6	305429	305434	0 %	0 %	50 %	50 %	116254734
5089	NC_008381	GGCA	2	8	305453	305460	25 %	0 %	50 %	25 %	116254734
5090	NC_008381	AG	3	6	305580	305585	50 %	0 %	50 %	0 %	116254734
5091	NC_008381	GCA	2	6	305626	305631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254734
5092	NC_008381	GGCGA	2	10	305685	305694	20 %	0 %	60 %	20 %	116254734
5093	NC_008381	ATG	2	6	305732	305737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254734
5094	NC_008381	CG	3	6	305761	305766	0 %	0 %	50 %	50 %	116254734
5095	NC_008381	CCGG	2	8	305854	305861	0 %	0 %	50 %	50 %	116254734
5096	NC_008381	AGC	2	6	305877	305882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254734
5097	NC_008381	CGC	2	6	305946	305951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254735
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5099	NC_008381	GTG	2	6	306119	306124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254735
5100	NC_008381	CCGA	2	8	306128	306135	25 %	0 %	25 %	50 %	116254735
5101	NC_008381	GAC	2	6	306172	306177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254735
5102	NC_008381	GCCG	2	8	306196	306203	0 %	0 %	50 %	50 %	116254735
5103	NC_008381	CGT	2	6	306247	306252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254735
5104	NC_008381	CAG	2	6	306256	306261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254735
5105	NC_008381	GCG	2	6	306283	306288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254735
5106	NC_008381	TCG	2	6	306323	306328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254735
5107	NC_008381	GCCA	2	8	306337	306344	25 %	0 %	25 %	50 %	116254735
5108	NC_008381	CCT	3	9	306350	306358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254736
5109	NC_008381	GAC	2	6	306369	306374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254736
5110	NC_008381	CGA	2	6	306422	306427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254736
5111	NC_008381	CAG	2	6	306480	306485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254736
5112	NC_008381	TCGC	2	8	306595	306602	0 %	25 %	25 %	50 %	116254736
5113	NC_008381	CGC	2	6	306816	306821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254736
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5115	NC_008381	GGC	2	6	306984	306989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254736
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5119	NC_008381	CGC	2	6	307241	307246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254736
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5121	NC_008381	CCT	2	6	307487	307492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254736
5122	NC_008381	GTC	2	6	307626	307631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254736
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5229	NC_008381	TCG	3	9	311648	311656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254740
5230	NC_008381	TCG	2	6	311675	311680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254740
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5232	NC_008381	ATG	2	6	311740	311745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254740
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5234	NC_008381	CGATT	2	10	311797	311806	20 %	40 %	20 %	20 %	116254740
5235	NC_008381	CCAT	2	8	311859	311866	25 %	25 %	0 %	50 %	116254741
5236	NC_008381	GCTCG	2	10	311890	311899	0 %	20 %	40 %	40 %	116254741
5237	NC_008381	CAG	3	9	311947	311955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254741
5238	NC_008381	GTC	2	6	311980	311985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254741
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5240	NC_008381	TCG	2	6	312011	312016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254741
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5242	NC_008381	CGG	2	6	312057	312062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254741
5243	NC_008381	CGG	3	9	312120	312128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254741
5244	NC_008381	GTAGCG	2	12	312142	312153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254741
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5248	NC_008381	AGCCG	2	10	312243	312252	20 %	0 %	40 %	40 %	116254741
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5252	NC_008381	CCAG	2	8	312366	312373	25 %	0 %	25 %	50 %	116254741
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5344	NC_008381	GGCTG	2	10	315859	315868	0 %	20 %	60 %	20 %	116254744
5345	NC_008381	CCTG	2	8	315870	315877	0 %	25 %	25 %	50 %	116254744
5346	NC_008381	GATCCA	2	12	315940	315951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116254744
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5349	NC_008381	CAT	2	6	316296	316301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254745
5350	NC_008381	CGA	2	6	316356	316361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254745
5351	NC_008381	ATG	2	6	316387	316392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254745
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5353	NC_008381	GCA	2	6	316458	316463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254745
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5355	NC_008381	GGCC	2	8	316542	316549	0 %	0 %	50 %	50 %	116254745
5356	NC_008381	CGA	2	6	316560	316565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254745
5357	NC_008381	GAT	2	6	316581	316586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254745
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5359	NC_008381	TCC	2	6	316648	316653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254745
5360	NC_008381	CTT	2	6	316665	316670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254745
5361	NC_008381	GCC	3	9	316756	316764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254745
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5363	NC_008381	CAA	2	6	316857	316862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254745
5364	NC_008381	GGC	2	6	317001	317006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254745
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5367	NC_008381	CGA	2	6	317082	317087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254745
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5400	NC_008381	CGC	2	6	318499	318504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254747
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5478	NC_008381	GACA	2	8	323212	323219	50 %	0 %	25 %	25 %	116254749
5479	NC_008381	CGA	2	6	323239	323244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254749
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5481	NC_008381	CGA	2	6	323314	323319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254749
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