MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008381	AGG	2	6	278241	278246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254714
4502	NC_008381	AGC	2	6	278249	278254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4503	NC_008381	CGCC	2	8	278266	278273	0 %	0 %	25 %	75 %	116254714
4504	NC_008381	TTG	2	6	278274	278279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254714
4505	NC_008381	GGC	2	6	278285	278290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254714
4506	NC_008381	CGA	2	6	278302	278307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4507	NC_008381	TCT	2	6	278322	278327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254714
4508	NC_008381	GGCG	2	8	278372	278379	0 %	0 %	75 %	25 %	116254714
4509	NC_008381	GGT	2	6	278509	278514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254714
4510	NC_008381	GCA	2	6	278530	278535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4511	NC_008381	CGGCG	2	10	278584	278593	0 %	0 %	60 %	40 %	116254714
4512	NC_008381	CGA	2	6	278638	278643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4513	NC_008381	GGC	2	6	278717	278722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254714
4514	NC_008381	TGG	2	6	278744	278749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254714
4515	NC_008381	GCC	2	6	278798	278803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254714
4516	NC_008381	CGA	2	6	278815	278820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4517	NC_008381	ACG	2	6	278946	278951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254714
4518	NC_008381	CGC	2	6	278952	278957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254714
4519	NC_008381	GCC	2	6	278960	278965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254714
4520	NC_008381	GAT	2	6	278989	278994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254714
4521	NC_008381	CCG	2	6	279045	279050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254714
4522	NC_008381	GCTG	2	8	279060	279067	0 %	25 %	50 %	25 %	116254714
4523	NC_008381	CGG	3	9	279075	279083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254714
4524	NC_008381	CCGA	2	8	279086	279093	25 %	0 %	25 %	50 %	116254714
4525	NC_008381	AGG	2	6	279483	279488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254715
4526	NC_008381	AGC	2	6	279544	279549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254715
4527	NC_008381	T	6	6	279614	279619	0 %	100 %	0 %	0 %	116254715
4528	NC_008381	CGA	2	6	279649	279654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254715
4529	NC_008381	TCA	2	6	279711	279716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254715
4530	NC_008381	GGC	2	6	279727	279732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254715
4531	NC_008381	AGGC	2	8	279797	279804	25 %	0 %	50 %	25 %	116254715
4532	NC_008381	GC	3	6	279839	279844	0 %	0 %	50 %	50 %	116254715
4533	NC_008381	TCC	2	6	279845	279850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254715
4534	NC_008381	TCAA	2	8	279855	279862	50 %	25 %	0 %	25 %	116254715
4535	NC_008381	ATC	2	6	279890	279895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254715
4536	NC_008381	TC	3	6	279907	279912	0 %	50 %	0 %	50 %	116254715
4537	NC_008381	GTT	2	6	279916	279921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254715
4538	NC_008381	GA	3	6	280033	280038	50 %	0 %	50 %	0 %	116254715
4539	NC_008381	ACA	2	6	280091	280096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254715
4540	NC_008381	GCC	2	6	280124	280129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254715
4541	NC_008381	GC	3	6	280138	280143	0 %	0 %	50 %	50 %	116254715
4542	NC_008381	ACC	2	6	280187	280192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254715
4543	NC_008381	ACG	2	6	280365	280370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4544	NC_008381	ATC	2	6	280409	280414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254716
4545	NC_008381	CAT	2	6	280483	280488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254716
4546	NC_008381	GGC	2	6	280594	280599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254716
4547	NC_008381	CGGC	2	8	280603	280610	0 %	0 %	50 %	50 %	116254716
4548	NC_008381	CGA	2	6	280636	280641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4549	NC_008381	TGC	2	6	280642	280647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4550	NC_008381	CTC	2	6	280667	280672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254716
4551	NC_008381	CG	3	6	280694	280699	0 %	0 %	50 %	50 %	116254716
4552	NC_008381	CG	3	6	280714	280719	0 %	0 %	50 %	50 %	116254716
4553	NC_008381	TCA	2	6	280735	280740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254716
4554	NC_008381	GCC	2	6	280748	280753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254716
4555	NC_008381	GTT	2	6	280786	280791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254716
4556	NC_008381	TCG	2	6	280812	280817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4557	NC_008381	GAC	2	6	280862	280867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4558	NC_008381	GC	3	6	280893	280898	0 %	0 %	50 %	50 %	116254716
4559	NC_008381	AT	3	6	280902	280907	50 %	50 %	0 %	0 %	116254716
4560	NC_008381	GTT	2	6	280955	280960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254716
4561	NC_008381	GAT	3	9	280961	280969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254716
4562	NC_008381	ATG	2	6	281082	281087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254716
4563	NC_008381	GGC	2	6	281138	281143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254716
4564	NC_008381	GAT	2	6	281230	281235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254716
4565	NC_008381	TAG	2	6	281253	281258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254716
4566	NC_008381	CGA	2	6	281293	281298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4567	NC_008381	GTCG	2	8	281345	281352	0 %	25 %	50 %	25 %	116254716
4568	NC_008381	GTC	2	6	281391	281396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4569	NC_008381	CAC	2	6	281399	281404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254716
4570	NC_008381	CG	3	6	281426	281431	0 %	0 %	50 %	50 %	116254716
4571	NC_008381	CGT	2	6	281497	281502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254716
4572	NC_008381	TTC	2	6	281507	281512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254716
4573	NC_008381	GAAC	2	8	281587	281594	50 %	0 %	25 %	25 %	116254716
4574	NC_008381	CTT	2	6	281600	281605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254716
4575	NC_008381	CTC	2	6	281606	281611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254716
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4578	NC_008381	AGC	2	6	281814	281819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254717
4579	NC_008381	TCC	2	6	281832	281837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254717
4580	NC_008381	GGT	2	6	281864	281869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254717
4581	NC_008381	CAG	2	6	281882	281887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254717
4582	NC_008381	TCG	2	6	281904	281909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254717
4583	NC_008381	CGG	2	6	281947	281952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254717
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4585	NC_008381	GCCG	2	8	282056	282063	0 %	0 %	50 %	50 %	116254717
4586	NC_008381	GCC	2	6	282108	282113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254717
4587	NC_008381	GCC	2	6	282146	282151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254717
4588	NC_008381	GAT	2	6	282173	282178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254717
4589	NC_008381	GCG	2	6	282188	282193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254717
4590	NC_008381	TGA	2	6	282286	282291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254717
4591	NC_008381	CAC	2	6	282293	282298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254717
4592	NC_008381	GCG	2	6	282330	282335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254717
4593	NC_008381	GAT	2	6	282359	282364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254717
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4599	NC_008381	CG	3	6	282562	282567	0 %	0 %	50 %	50 %	116254717
4600	NC_008381	TCGC	2	8	282594	282601	0 %	25 %	25 %	50 %	116254717
4601	NC_008381	AAT	2	6	282608	282613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254717
4602	NC_008381	CG	3	6	282658	282663	0 %	0 %	50 %	50 %	116254717
4603	NC_008381	GCG	2	6	282687	282692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254717
4604	NC_008381	GGC	2	6	282736	282741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254717
4605	NC_008381	GAG	2	6	283034	283039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254718
4606	NC_008381	CGG	2	6	283080	283085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254718
4607	NC_008381	ACTC	2	8	283117	283124	25 %	25 %	0 %	50 %	116254718
4608	NC_008381	TCGG	2	8	283133	283140	0 %	25 %	50 %	25 %	116254718
4609	NC_008381	GGC	2	6	283148	283153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254718
4610	NC_008381	TG	3	6	283366	283371	0 %	50 %	50 %	0 %	116254718
4611	NC_008381	GA	3	6	283440	283445	50 %	0 %	50 %	0 %	116254718
4612	NC_008381	CGA	2	6	283468	283473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254718
4613	NC_008381	TGA	2	6	283515	283520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254718
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4617	NC_008381	TGATG	2	10	283837	283846	20 %	40 %	40 %	0 %	116254718
4618	NC_008381	ATC	2	6	283862	283867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254718
4619	NC_008381	GCG	2	6	283881	283886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254718
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4621	NC_008381	GGC	2	6	283958	283963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254718
4622	NC_008381	CGGC	2	8	283982	283989	0 %	0 %	50 %	50 %	116254718
4623	NC_008381	CTG	2	6	284003	284008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254718
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4741	NC_008381	GGCG	2	8	288994	289001	0 %	0 %	75 %	25 %	116254722
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4855	NC_008381	CA	3	6	293712	293717	50 %	0 %	0 %	50 %	116254726
4856	NC_008381	TGG	2	6	293749	293754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254726
4857	NC_008381	CGGC	2	8	293762	293769	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
4858	NC_008381	CG	3	6	293803	293808	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
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4861	NC_008381	GAT	2	6	294028	294033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254727
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4981	NC_008381	GCT	2	6	299514	299519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254729
4982	NC_008381	CGA	2	6	299548	299553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254729
4983	NC_008381	GAC	2	6	299554	299559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254729
4984	NC_008381	CGT	2	6	299595	299600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254729
4985	NC_008381	GTC	2	6	299615	299620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254729
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