MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 79131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008380	CCG	2	6	541	546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
2	NC_008380	AGC	2	6	619	624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
3	NC_008380	TGC	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249767
4	NC_008380	TGA	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249767
5	NC_008380	TGA	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249767
6	NC_008380	CGA	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
7	NC_008380	ACG	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
8	NC_008380	ATC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249767
9	NC_008380	CCA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249767
10	NC_008380	CGC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
11	NC_008380	GAG	2	6	1173	1178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249767
12	NC_008380	CGC	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
13	NC_008380	TCG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249768
14	NC_008380	GGA	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249768
15	NC_008380	CAG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249768
16	NC_008380	ATT	2	6	1852	1857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249768
17	NC_008380	TGC	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249768
18	NC_008380	GGA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249769
19	NC_008380	CGA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249769
20	NC_008380	TGA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249769
21	NC_008380	CGT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
22	NC_008380	CGG	2	6	2331	2336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249769
23	NC_008380	ATC	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
24	NC_008380	CGT	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
25	NC_008380	TCA	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
26	NC_008380	ACC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249769
27	NC_008380	CGT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
28	NC_008380	TCG	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
29	NC_008380	TCG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
30	NC_008380	TCA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
31	NC_008380	CGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249770
32	NC_008380	GCC	2	6	2974	2979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249770
33	NC_008380	GTC	4	12	3150	3161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249770
34	NC_008380	ACG	2	6	3266	3271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249770
35	NC_008380	CGA	3	9	3310	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249770
36	NC_008380	TCG	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249770
37	NC_008380	ATC	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
38	NC_008380	AAC	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249771
39	NC_008380	CAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
40	NC_008380	CGG	2	6	3450	3455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
41	NC_008380	TCA	2	6	3503	3508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
42	NC_008380	AGC	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249771
43	NC_008380	CTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249771
44	NC_008380	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
45	NC_008380	GAT	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249771
46	NC_008380	CGG	2	6	3882	3887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
47	NC_008380	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
48	NC_008380	GAC	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249771
49	NC_008380	GTG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249771
50	NC_008380	TGC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249771
51	NC_008380	GAG	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249771
52	NC_008380	TCG	2	6	4049	4054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249771
53	NC_008380	TTC	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249772
54	NC_008380	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249772
55	NC_008380	GCG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249772
56	NC_008380	ACC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249772
57	NC_008380	GAT	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249772
58	NC_008380	GCA	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249772
59	NC_008380	CGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249772
60	NC_008380	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249772
61	NC_008380	TGT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249772
62	NC_008380	TCC	3	9	4814	4822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249773
63	NC_008380	ACC	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249773
64	NC_008380	GGA	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249773
65	NC_008380	GCC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249773
66	NC_008380	GAC	3	9	4903	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
67	NC_008380	CGG	2	6	4951	4956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249773
68	NC_008380	GAT	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249773
69	NC_008380	AGC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
70	NC_008380	CAG	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
71	NC_008380	GCG	2	6	5089	5094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249773
72	NC_008380	GCA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
73	NC_008380	CGA	4	12	5190	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
74	NC_008380	GCA	3	9	5223	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
75	NC_008380	TCA	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249774
76	NC_008380	ATT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249774
77	NC_008380	GCC	2	6	5495	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
78	NC_008380	CGC	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
79	NC_008380	GCC	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
80	NC_008380	ACG	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249774
81	NC_008380	CGC	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
82	NC_008380	CGC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
83	NC_008380	GAT	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249774
84	NC_008380	GAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249774
85	NC_008380	GCG	2	6	5814	5819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249774
86	NC_008380	TCG	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249774
87	NC_008380	ACG	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249774
88	NC_008380	GAT	3	9	6157	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249775
89	NC_008380	CGG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249775
90	NC_008380	CGC	3	9	6276	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
91	NC_008380	CGC	2	6	6358	6363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
92	NC_008380	ACG	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249775
93	NC_008380	CCG	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
94	NC_008380	CCG	2	6	6567	6572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
95	NC_008380	TCT	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249775
96	NC_008380	TGC	2	6	6663	6668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249775
97	NC_008380	GCT	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249775
98	NC_008380	GCG	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249775
99	NC_008380	TTC	2	6	6871	6876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249775
100	NC_008380	CGC	3	9	6915	6923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
101	NC_008380	TCG	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249775
102	NC_008380	GCC	3	9	7186	7194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
103	NC_008380	GCA	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249776
104	NC_008380	GCA	2	6	7341	7346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249776
105	NC_008380	CGC	2	6	7384	7389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249776
106	NC_008380	CAT	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249776
107	NC_008380	GCA	2	6	7573	7578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249776
108	NC_008380	TCC	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249776
109	NC_008380	CAT	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249776
110	NC_008380	CGG	2	6	7752	7757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249776
111	NC_008380	CTG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249777
112	NC_008380	CAT	2	6	7942	7947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249777
113	NC_008380	TTC	2	6	7984	7989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249777
114	NC_008380	CGG	2	6	8060	8065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249777
115	NC_008380	CGA	2	6	8404	8409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249778
116	NC_008380	GTC	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249778
117	NC_008380	CGA	2	6	8458	8463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249778
118	NC_008380	TCA	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249778
119	NC_008380	CGG	2	6	8614	8619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249778
120	NC_008380	CGG	2	6	8650	8655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249778
121	NC_008380	CGT	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249778
122	NC_008380	CCG	2	6	8716	8721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249778
123	NC_008380	CTG	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249778
124	NC_008380	GAA	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249778
125	NC_008380	CGG	2	6	8977	8982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249778
126	NC_008380	AAG	2	6	9017	9022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249778
127	NC_008380	TCG	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249778
128	NC_008380	TGG	2	6	9089	9094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249778
129	NC_008380	CAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249778
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499	NC_008380	CAG	2	6	30836	30841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249795
500	NC_008380	CGG	2	6	30980	30985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249795

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