MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_008380	GGC	2	6	171579	171584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249908
3503	NC_008380	TGCCGT	2	12	171596	171607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249908
3504	NC_008380	AAG	2	6	171663	171668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249908
3505	NC_008380	GGTC	2	8	171710	171717	0 %	25 %	50 %	25 %	116249908
3506	NC_008380	CAA	2	6	171833	171838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249908
3507	NC_008380	CTG	2	6	171843	171848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249908
3508	NC_008380	AAG	2	6	171855	171860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249908
3509	NC_008380	GC	3	6	171911	171916	0 %	0 %	50 %	50 %	116249908
3510	NC_008380	CGC	2	6	171977	171982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249908
3511	NC_008380	CGT	2	6	172113	172118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249909
3512	NC_008380	TCG	2	6	172127	172132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249909
3513	NC_008380	GGC	2	6	172134	172139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249909
3514	NC_008380	GGA	2	6	172200	172205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249909
3515	NC_008380	GAG	2	6	172245	172250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249909
3516	NC_008380	CGC	2	6	172257	172262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249909
3517	NC_008380	GCA	4	12	172277	172288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249909
3518	NC_008380	TC	3	6	172341	172346	0 %	50 %	0 %	50 %	116249909
3519	NC_008380	GCC	2	6	172372	172377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249909
3520	NC_008380	CGA	2	6	172403	172408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249909
3521	NC_008380	GCCG	2	8	172458	172465	0 %	0 %	50 %	50 %	116249909
3522	NC_008380	TGC	2	6	172529	172534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249909
3523	NC_008380	CAT	2	6	172593	172598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249909
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3526	NC_008380	CGA	2	6	172664	172669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249909
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3531	NC_008380	ATG	2	6	172996	173001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249909
3532	NC_008380	CGA	2	6	173556	173561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249910
3533	NC_008380	GGC	2	6	173592	173597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249910
3534	NC_008380	CGG	2	6	173667	173672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249910
3535	NC_008380	CGG	2	6	173690	173695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249910
3536	NC_008380	CGG	2	6	173709	173714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249910
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3543	NC_008380	CGC	2	6	174219	174224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249910
3544	NC_008380	GATCAG	2	12	174288	174299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116249910
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3552	NC_008380	GC	3	6	174708	174713	0 %	0 %	50 %	50 %	116249911
3553	NC_008380	CAG	2	6	174722	174727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249911
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3555	NC_008380	GAT	2	6	174794	174799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249911
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3557	NC_008380	TGC	2	6	175012	175017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249911
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3560	NC_008380	CGA	2	6	175305	175310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249912
3561	NC_008380	CGCGC	2	10	175311	175320	0 %	0 %	40 %	60 %	116249912
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3565	NC_008380	GC	3	6	175480	175485	0 %	0 %	50 %	50 %	116249912
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3568	NC_008380	CGGC	2	8	175647	175654	0 %	0 %	50 %	50 %	116249912
3569	NC_008380	GCATCG	2	12	175670	175681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249912
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3573	NC_008380	TGC	2	6	175907	175912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249912
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3580	NC_008380	TCA	3	9	176141	176149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249912
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3602	NC_008380	CGG	2	6	177131	177136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249914
3603	NC_008380	TGGCGA	2	12	177195	177206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249914
3604	NC_008380	GGC	2	6	177208	177213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249914
3605	NC_008380	GTC	3	9	177289	177297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249914
3606	NC_008380	GGC	2	6	177385	177390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249914
3607	NC_008380	CTG	2	6	177400	177405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249914
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3609	NC_008380	GCA	2	6	177426	177431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249914
3610	NC_008380	CG	3	6	177449	177454	0 %	0 %	50 %	50 %	116249914
3611	NC_008380	TTC	2	6	177457	177462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249914
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3613	NC_008380	CG	3	6	177594	177599	0 %	0 %	50 %	50 %	116249915
3614	NC_008380	GCC	2	6	177624	177629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249915
3615	NC_008380	CGCGG	2	10	177654	177663	0 %	0 %	60 %	40 %	116249915
3616	NC_008380	TCG	2	6	177670	177675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249915
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3619	NC_008380	AGC	2	6	177766	177771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249915
3620	NC_008380	CGC	2	6	177906	177911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249915
3621	NC_008380	GTC	2	6	177915	177920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249915
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3980	NC_008380	GGA	2	6	194934	194939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249927
3981	NC_008380	AGC	2	6	194987	194992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249927
3982	NC_008380	CGG	2	6	195027	195032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249927
3983	NC_008380	GCC	3	9	195088	195096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249927
3984	NC_008380	TCG	2	6	195119	195124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249927
3985	NC_008380	CGA	2	6	195227	195232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249927
3986	NC_008380	GTC	3	9	195246	195254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249927
3987	NC_008380	CCG	2	6	195347	195352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249927
3988	NC_008380	CCATG	2	10	195438	195447	20 %	20 %	20 %	40 %	116249927
3989	NC_008380	GCC	2	6	195500	195505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249927
3990	NC_008380	CAT	2	6	195528	195533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249927
3991	NC_008380	TCGA	2	8	195571	195578	25 %	25 %	25 %	25 %	116249927
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3993	NC_008380	GC	3	6	195664	195669	0 %	0 %	50 %	50 %	116249927
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3995	NC_008380	ATCC	2	8	195734	195741	25 %	25 %	0 %	50 %	116249927
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3997	NC_008380	TTG	2	6	195839	195844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249927
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3999	NC_008380	TCGAGG	2	12	195902	195913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249927
4000	NC_008380	CCA	2	6	195965	195970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249927

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