MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008380	CG	3	6	149664	149669	0 %	0 %	50 %	50 %	116249886
3002	NC_008380	CCG	2	6	149672	149677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249886
3003	NC_008380	GCGG	2	8	149820	149827	0 %	0 %	75 %	25 %	116249886
3004	NC_008380	GCC	2	6	149896	149901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249886
3005	NC_008380	GCCG	2	8	149911	149918	0 %	0 %	50 %	50 %	116249886
3006	NC_008380	AAG	2	6	149954	149959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249886
3007	NC_008380	GGCC	2	8	149964	149971	0 %	0 %	50 %	50 %	116249886
3008	NC_008380	GAC	2	6	149989	149994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249886
3009	NC_008380	ACG	2	6	150005	150010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249886
3010	NC_008380	GCGG	2	8	150078	150085	0 %	0 %	75 %	25 %	116249886
3011	NC_008380	TG	4	8	150106	150113	0 %	50 %	50 %	0 %	116249886
3012	NC_008380	GCG	2	6	150475	150480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249887
3013	NC_008380	CTT	3	9	150523	150531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249887
3014	NC_008380	AAG	2	6	150541	150546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249887
3015	NC_008380	GCG	2	6	150550	150555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249887
3016	NC_008380	CAG	2	6	150571	150576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249887
3017	NC_008380	CGG	2	6	150581	150586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249887
3018	NC_008380	CTT	2	6	150598	150603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249887
3019	NC_008380	GTT	2	6	150628	150633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249887
3020	NC_008380	CAG	2	6	150726	150731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249887
3021	NC_008380	ATC	2	6	150920	150925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249888
3022	NC_008380	GCA	2	6	150948	150953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249888
3023	NC_008380	TGGC	2	8	150962	150969	0 %	25 %	50 %	25 %	116249888
3024	NC_008380	CAT	2	6	151012	151017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249888
3025	NC_008380	TCGGCG	2	12	151164	151175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249888
3026	NC_008380	TTG	2	6	151226	151231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249888
3027	NC_008380	TCA	2	6	151233	151238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249888
3028	NC_008380	GTCG	2	8	151255	151262	0 %	25 %	50 %	25 %	116249888
3029	NC_008380	CG	3	6	151287	151292	0 %	0 %	50 %	50 %	116249888
3030	NC_008380	GAT	2	6	151330	151335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249888
3031	NC_008380	GCC	2	6	151336	151341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249888
3032	NC_008380	TCA	2	6	151410	151415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249888
3033	NC_008380	GCTG	2	8	151434	151441	0 %	25 %	50 %	25 %	116249888
3034	NC_008380	CAA	2	6	151473	151478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249888
3035	NC_008380	GAT	2	6	151485	151490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249888
3036	NC_008380	ATGA	2	8	151546	151553	50 %	25 %	25 %	0 %	116249888
3037	NC_008380	CGG	3	9	151689	151697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249888
3038	NC_008380	GGC	2	6	151791	151796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249888
3039	NC_008380	ATCGC	2	10	151811	151820	20 %	20 %	20 %	40 %	116249888
3040	NC_008380	GTC	2	6	152019	152024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3041	NC_008380	TGA	2	6	152027	152032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249889
3042	NC_008380	GGA	2	6	152046	152051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249889
3043	NC_008380	CAG	2	6	152073	152078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3044	NC_008380	GCC	2	6	152089	152094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249889
3045	NC_008380	CGA	2	6	152174	152179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3046	NC_008380	AGC	2	6	152210	152215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3047	NC_008380	GC	3	6	152285	152290	0 %	0 %	50 %	50 %	116249889
3048	NC_008380	CG	3	6	152369	152374	0 %	0 %	50 %	50 %	116249889
3049	NC_008380	GCG	2	6	152420	152425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249889
3050	NC_008380	AT	3	6	152446	152451	50 %	50 %	0 %	0 %	116249889
3051	NC_008380	CAGG	2	8	152453	152460	25 %	0 %	50 %	25 %	116249889
3052	NC_008380	CTG	2	6	152472	152477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3053	NC_008380	GTC	2	6	152523	152528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3054	NC_008380	CTC	2	6	152538	152543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249889
3055	NC_008380	GTCGC	2	10	152605	152614	0 %	20 %	40 %	40 %	116249889
3056	NC_008380	GCA	2	6	152627	152632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249889
3057	NC_008380	CGGC	2	8	152763	152770	0 %	0 %	50 %	50 %	116249889
3058	NC_008380	GCA	2	6	152859	152864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3059	NC_008380	TCG	2	6	152867	152872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3060	NC_008380	TCT	2	6	152874	152879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249890
3061	NC_008380	TCG	2	6	152900	152905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3062	NC_008380	GCCG	2	8	152955	152962	0 %	0 %	50 %	50 %	116249890
3063	NC_008380	GCG	2	6	153024	153029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249890
3064	NC_008380	CCGAGA	2	12	153075	153086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3065	NC_008380	CGT	2	6	153105	153110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3066	NC_008380	CGC	2	6	153120	153125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249890
3067	NC_008380	GCG	2	6	153146	153151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249890
3068	NC_008380	GCA	2	6	153171	153176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249890
3069	NC_008380	GAA	2	6	153194	153199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249890
3070	NC_008380	TGGTC	2	10	153202	153211	0 %	40 %	40 %	20 %	116249890
3071	NC_008380	GC	3	6	153416	153421	0 %	0 %	50 %	50 %	116249891
3072	NC_008380	ACG	3	9	153524	153532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3074	NC_008380	CGA	2	6	153579	153584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3078	NC_008380	GAT	2	6	153802	153807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249891
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3080	NC_008380	CCG	2	6	153854	153859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249891
3081	NC_008380	TCG	2	6	153890	153895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3082	NC_008380	GC	3	6	153912	153917	0 %	0 %	50 %	50 %	116249891
3083	NC_008380	TCGA	2	8	153929	153936	25 %	25 %	25 %	25 %	116249891
3084	NC_008380	TGA	2	6	153954	153959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249891
3085	NC_008380	CAT	3	9	153997	154005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249891
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3088	NC_008380	GAC	2	6	154108	154113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3089	NC_008380	CGCC	2	8	154125	154132	0 %	0 %	25 %	75 %	116249891
3090	NC_008380	GCG	2	6	154134	154139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3091	NC_008380	GCCGG	2	10	154172	154181	0 %	0 %	60 %	40 %	116249891
3092	NC_008380	CTTC	2	8	154182	154189	0 %	50 %	0 %	50 %	116249891
3093	NC_008380	GCAC	2	8	154217	154224	25 %	0 %	25 %	50 %	116249891
3094	NC_008380	CGA	2	6	154245	154250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3102	NC_008380	TCGAT	2	10	154593	154602	20 %	40 %	20 %	20 %	116249891
3103	NC_008380	GTC	2	6	154621	154626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3104	NC_008380	CGA	2	6	154632	154637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3105	NC_008380	GTCG	2	8	154651	154658	0 %	25 %	50 %	25 %	116249891
3106	NC_008380	GGC	2	6	154690	154695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
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3108	NC_008380	TGC	2	6	154760	154765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3109	NC_008380	TGGCG	2	10	154797	154806	0 %	20 %	60 %	20 %	116249891
3110	NC_008380	AGC	2	6	154817	154822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3112	NC_008380	ACG	2	6	154859	154864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3118	NC_008380	TCT	2	6	155124	155129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249891
3119	NC_008380	CGG	2	6	155153	155158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
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3121	NC_008380	GTG	2	6	155282	155287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249891
3122	NC_008380	ACG	2	6	155312	155317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3123	NC_008380	CGGAC	2	10	155324	155333	20 %	0 %	40 %	40 %	116249891
3124	NC_008380	CGC	2	6	155334	155339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249891
3125	NC_008380	GC	3	6	155338	155343	0 %	0 %	50 %	50 %	116249891
3126	NC_008380	TCT	2	6	155357	155362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249891
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3130	NC_008380	CGA	2	6	155467	155472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
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3153	NC_008380	CCTGC	2	10	156317	156326	0 %	20 %	20 %	60 %	116249892
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3155	NC_008380	TCC	2	6	156409	156414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249892
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3231	NC_008380	TCG	2	6	159433	159438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249895
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3242	NC_008380	GCT	2	6	159702	159707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249895
3243	NC_008380	GCT	3	9	159744	159752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249895
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3349	NC_008380	TCGCC	2	10	164535	164544	0 %	20 %	20 %	60 %	116249901
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3354	NC_008380	TCG	2	6	164699	164704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249901
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3356	NC_008380	CCG	2	6	164940	164945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249901
3357	NC_008380	GCT	2	6	164986	164991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249901
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3474	NC_008380	ATC	2	6	170348	170353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249906
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3479	NC_008380	GCT	2	6	170641	170646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249907
3480	NC_008380	CGAG	2	8	170680	170687	25 %	0 %	50 %	25 %	116249907
3481	NC_008380	CG	3	6	170705	170710	0 %	0 %	50 %	50 %	116249907
3482	NC_008380	ATG	2	6	170732	170737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249907
3483	NC_008380	GC	3	6	170769	170774	0 %	0 %	50 %	50 %	116249907
3484	NC_008380	GAT	2	6	170819	170824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249907
3485	NC_008380	GCG	2	6	170836	170841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249907
3486	NC_008380	TCC	2	6	170850	170855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249907
3487	NC_008380	GTC	2	6	170871	170876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249907
3488	NC_008380	CG	3	6	170921	170926	0 %	0 %	50 %	50 %	116249907
3489	NC_008380	GATC	2	8	170938	170945	25 %	25 %	25 %	25 %	116249907
3490	NC_008380	GAT	2	6	170972	170977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249907
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