MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008380	GCT	2	6	102893	102898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249845
2003	NC_008380	CG	3	6	102907	102912	0 %	0 %	50 %	50 %	116249845
2004	NC_008380	TCG	2	6	102949	102954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249845
2005	NC_008380	CGG	2	6	102956	102961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249845
2006	NC_008380	GCCGGC	2	12	103053	103064	0 %	0 %	50 %	50 %	116249845
2007	NC_008380	CGG	3	9	103067	103075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249845
2008	NC_008380	CGG	2	6	103154	103159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249846
2009	NC_008380	GGA	2	6	103180	103185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249846
2010	NC_008380	AGC	2	6	103216	103221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249846
2011	NC_008380	TGCC	2	8	103238	103245	0 %	25 %	25 %	50 %	116249846
2012	NC_008380	CGC	2	6	103290	103295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249846
2013	NC_008380	GACCTG	2	12	103333	103344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249846
2014	NC_008380	CGG	3	9	103351	103359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249846
2015	NC_008380	TCT	2	6	103365	103370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249846
2016	NC_008380	CGGC	2	8	103375	103382	0 %	0 %	50 %	50 %	116249846
2017	NC_008380	TCG	2	6	103386	103391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249846
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2020	NC_008380	GCG	2	6	103552	103557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249846
2021	NC_008380	TGA	2	6	103609	103614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249846
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2024	NC_008380	TGA	2	6	103725	103730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249847
2025	NC_008380	A	8	8	103730	103737	100 %	0 %	0 %	0 %	116249847
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2041	NC_008380	CGA	2	6	104356	104361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249847
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2045	NC_008380	TCG	2	6	104469	104474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249847
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2052	NC_008380	CGC	2	6	104999	105004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249848
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2121	NC_008380	GCC	2	6	108821	108826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249850
2122	NC_008380	CTC	2	6	108915	108920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249850
2123	NC_008380	CGC	2	6	109062	109067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249850
2124	NC_008380	CCG	2	6	109090	109095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249850
2125	NC_008380	AGCC	2	8	109185	109192	25 %	0 %	25 %	50 %	116249850
2126	NC_008380	CGCA	2	8	109221	109228	25 %	0 %	25 %	50 %	116249851
2127	NC_008380	GGC	2	6	109263	109268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249851
2128	NC_008380	CTG	2	6	109278	109283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249851
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2130	NC_008380	CTG	2	6	109329	109334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249851
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2132	NC_008380	GCG	2	6	109428	109433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249851
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2134	NC_008380	GGC	2	6	109535	109540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249851
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2136	NC_008380	CCG	2	6	109646	109651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249851
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2139	NC_008380	TCCGA	2	10	109734	109743	20 %	20 %	20 %	40 %	116249851
2140	NC_008380	GCC	2	6	109752	109757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249851
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2143	NC_008380	CGA	2	6	109793	109798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249851
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2154	NC_008380	GC	3	6	110426	110431	0 %	0 %	50 %	50 %	116249852
2155	NC_008380	GTC	2	6	110482	110487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249852
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2161	NC_008380	GTT	2	6	110707	110712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249852
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2165	NC_008380	TAG	2	6	110852	110857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249852
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2211	NC_008380	AGCG	2	8	112784	112791	25 %	0 %	50 %	25 %	116249854
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2224	NC_008380	GGC	4	12	113344	113355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249854
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2230	NC_008380	CGG	2	6	113534	113539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249854
2231	NC_008380	CG	3	6	113547	113552	0 %	0 %	50 %	50 %	116249854
2232	NC_008380	GCCGAG	2	12	113608	113619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249854
2233	NC_008380	ATCG	2	8	113659	113666	25 %	25 %	25 %	25 %	116249854
2234	NC_008380	CGA	2	6	113706	113711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249854
2235	NC_008380	GCG	2	6	113717	113722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249854
2236	NC_008380	TCG	2	6	113826	113831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249854
2237	NC_008380	CGA	2	6	113958	113963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249855
2238	NC_008380	GTC	2	6	114175	114180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249855
2239	NC_008380	GCG	2	6	114181	114186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249855
2240	NC_008380	AGG	2	6	114201	114206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249855
2241	NC_008380	CGC	2	6	114225	114230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249855
2242	NC_008380	TCG	2	6	114293	114298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249855
2243	NC_008380	GCG	2	6	114301	114306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249855
2244	NC_008380	GAT	2	6	114397	114402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249855
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2246	NC_008380	AGG	2	6	114432	114437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249855
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2254	NC_008380	CGT	2	6	114718	114723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249855
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2354	NC_008380	TTC	2	6	119074	119079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249859
2355	NC_008380	CTG	2	6	119086	119091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249859
2356	NC_008380	ACG	2	6	119107	119112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249859
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2361	NC_008380	CTG	2	6	119331	119336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249860
2362	NC_008380	CGA	2	6	119339	119344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249860
2363	NC_008380	CGAT	2	8	119347	119354	25 %	25 %	25 %	25 %	116249860
2364	NC_008380	ATC	2	6	119355	119360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249860
2365	NC_008380	CATC	2	8	119381	119388	25 %	25 %	0 %	50 %	116249860
2366	NC_008380	GGT	2	6	119396	119401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249860
2367	NC_008380	GCA	2	6	119403	119408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249860
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2369	NC_008380	GTC	2	6	119427	119432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249860
2370	NC_008380	GCC	2	6	119460	119465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249860
2371	NC_008380	CAT	2	6	119474	119479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249860
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2375	NC_008380	TCGAGG	2	12	119782	119793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249860
2376	NC_008380	CTG	2	6	119811	119816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249860
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2385	NC_008380	GC	3	6	120109	120114	0 %	0 %	50 %	50 %	116249860
2386	NC_008380	GCG	2	6	120151	120156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249860
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2388	NC_008380	GC	3	6	120206	120211	0 %	0 %	50 %	50 %	116249860
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2390	NC_008380	CGAT	2	8	120332	120339	25 %	25 %	25 %	25 %	116249861
2391	NC_008380	TCG	2	6	120350	120355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249861
2392	NC_008380	TCG	2	6	120359	120364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249861
2393	NC_008380	CTG	2	6	120391	120396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249861
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2400	NC_008380	CGG	2	6	120663	120668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249861
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2402	NC_008380	CGA	2	6	120729	120734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249861
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2471	NC_008380	TGGCC	2	10	123714	123723	0 %	20 %	40 %	40 %	116249863
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2478	NC_008380	CGCA	2	8	124180	124187	25 %	0 %	25 %	50 %	116249863
2479	NC_008380	CGG	2	6	124194	124199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249863
2480	NC_008380	ATGC	2	8	124202	124209	25 %	25 %	25 %	25 %	116249863
2481	NC_008380	GCC	2	6	124509	124514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249863
2482	NC_008380	AAG	2	6	124661	124666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249863
2483	NC_008380	CGCCT	2	10	124667	124676	0 %	20 %	20 %	60 %	116249863
2484	NC_008380	GGCT	2	8	124748	124755	0 %	25 %	50 %	25 %	116249863
2485	NC_008380	GCG	2	6	124761	124766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249863
2486	NC_008380	CGGCTA	2	12	124795	124806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249863
2487	NC_008380	CG	3	6	124870	124875	0 %	0 %	50 %	50 %	116249863
2488	NC_008380	CGC	2	6	124905	124910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249863
2489	NC_008380	GAC	2	6	124944	124949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249863
2490	NC_008380	GTC	2	6	125093	125098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249864
2491	NC_008380	GCC	2	6	125160	125165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249864
2492	NC_008380	AG	3	6	125188	125193	50 %	0 %	50 %	0 %	116249864
2493	NC_008380	CCG	2	6	125194	125199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249864
2494	NC_008380	GCG	2	6	125238	125243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249864
2495	NC_008380	GC	3	6	125462	125467	0 %	0 %	50 %	50 %	116249864
2496	NC_008380	GC	3	6	125522	125527	0 %	0 %	50 %	50 %	116249864
2497	NC_008380	GCAT	2	8	125532	125539	25 %	25 %	25 %	25 %	116249864
2498	NC_008380	TGC	2	6	125555	125560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249864
2499	NC_008380	GCC	2	6	125600	125605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249864
2500	NC_008380	AGC	2	6	125625	125630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249864

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