MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008380	GCC	3	9	45679	45687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1002	NC_008380	GGC	2	6	45823	45828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249809
1003	NC_008380	CTG	2	6	45853	45858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249809
1004	NC_008380	GCC	2	6	45889	45894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1005	NC_008380	GCC	2	6	46010	46015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249810
1006	NC_008380	AGG	2	6	46031	46036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249810
1007	NC_008380	GGTC	2	8	46236	46243	0 %	25 %	50 %	25 %	116249810
1008	NC_008380	GA	3	6	46244	46249	50 %	0 %	50 %	0 %	116249810
1009	NC_008380	CGG	2	6	46263	46268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249810
1010	NC_008380	CGGC	2	8	46292	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	116249810
1011	NC_008380	GCC	2	6	46443	46448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249810
1012	NC_008380	CGT	2	6	46458	46463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249810
1013	NC_008380	ATC	2	6	46484	46489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249810
1014	NC_008380	CTTT	2	8	46498	46505	0 %	75 %	0 %	25 %	116249811
1015	NC_008380	TCG	2	6	46549	46554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249811
1016	NC_008380	CGG	2	6	46558	46563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249811
1017	NC_008380	GCC	2	6	46572	46577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249811
1018	NC_008380	G	6	6	46599	46604	0 %	0 %	100 %	0 %	116249811
1019	NC_008380	TGT	2	6	47004	47009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249812
1020	NC_008380	CGA	2	6	47016	47021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249812
1021	NC_008380	CGG	2	6	47076	47081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249812
1022	NC_008380	ATC	2	6	47209	47214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249812
1023	NC_008380	CGA	2	6	47226	47231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249812
1024	NC_008380	TCT	2	6	47268	47273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249812
1025	NC_008380	CG	3	6	47280	47285	0 %	0 %	50 %	50 %	116249812
1026	NC_008380	CTT	2	6	47332	47337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249812
1027	NC_008380	ACGAT	2	10	47426	47435	40 %	20 %	20 %	20 %	116249812
1028	NC_008380	TCC	2	6	47450	47455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249812
1029	NC_008380	GGC	2	6	47500	47505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249812
1030	NC_008380	TCC	2	6	47580	47585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249813
1031	NC_008380	CGT	2	6	47669	47674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1032	NC_008380	GCC	2	6	47689	47694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1033	NC_008380	CAG	2	6	47717	47722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1034	NC_008380	GCA	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1035	NC_008380	GACC	2	8	47807	47814	25 %	0 %	25 %	50 %	116249813
1036	NC_008380	CAG	2	6	47829	47834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1037	NC_008380	CCG	2	6	47846	47851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1038	NC_008380	CAC	2	6	47879	47884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249813
1039	NC_008380	GCA	2	6	47894	47899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1040	NC_008380	CAG	2	6	47937	47942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1041	NC_008380	AGC	2	6	47968	47973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1042	NC_008380	GCC	2	6	48021	48026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1043	NC_008380	GATC	2	8	48129	48136	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
1044	NC_008380	CG	3	6	48154	48159	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1045	NC_008380	TTG	2	6	48197	48202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249814
1046	NC_008380	GAA	2	6	48259	48264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249814
1047	NC_008380	GC	3	6	48303	48308	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1048	NC_008380	CGGC	2	8	48334	48341	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1049	NC_008380	TCGTC	2	10	48369	48378	0 %	40 %	20 %	40 %	116249814
1050	NC_008380	GATC	2	8	48387	48394	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
1051	NC_008380	ATG	2	6	48478	48483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249814
1052	NC_008380	GTC	2	6	48484	48489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249814
1053	NC_008380	GAA	2	6	48565	48570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249814
1054	NC_008380	TCG	2	6	48588	48593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249814
1055	NC_008380	ACGGAA	2	12	48617	48628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116249814
1056	NC_008380	ACA	2	6	48850	48855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249815
1057	NC_008380	GGC	2	6	48874	48879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249815
1058	NC_008380	GGT	2	6	48882	48887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249815
1059	NC_008380	GGCG	2	8	48891	48898	0 %	0 %	75 %	25 %	116249815
1060	NC_008380	AAG	2	6	49033	49038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249815
1061	NC_008380	ATG	2	6	49129	49134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249815
1062	NC_008380	TCG	2	6	49136	49141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1063	NC_008380	ACG	2	6	49204	49209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1064	NC_008380	CGG	2	6	49221	49226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249815
1065	NC_008380	GCC	2	6	49243	49248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1066	NC_008380	CGC	2	6	49291	49296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1067	NC_008380	CGC	2	6	49308	49313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1068	NC_008380	CGT	2	6	49341	49346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1069	NC_008380	TGG	2	6	49454	49459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249816
1070	NC_008380	GGC	2	6	49564	49569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249816
1071	NC_008380	CGA	2	6	49576	49581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249816
1072	NC_008380	GGCA	2	8	49657	49664	25 %	0 %	50 %	25 %	116249816
1073	NC_008380	GC	3	6	49719	49724	0 %	0 %	50 %	50 %	116249816
1074	NC_008380	ACG	2	6	49811	49816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249816
1075	NC_008380	ATC	2	6	49918	49923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249817
1076	NC_008380	GC	3	6	49941	49946	0 %	0 %	50 %	50 %	116249817
1077	NC_008380	TGCGC	2	10	49956	49965	0 %	20 %	40 %	40 %	116249817
1078	NC_008380	GCC	2	6	49976	49981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1079	NC_008380	AGC	2	6	49982	49987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1080	NC_008380	GAA	2	6	50019	50024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249817
1081	NC_008380	TGA	2	6	50030	50035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249817
1082	NC_008380	CGC	2	6	50071	50076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1083	NC_008380	TCA	2	6	50102	50107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249817
1084	NC_008380	CCA	2	6	50117	50122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249817
1085	NC_008380	ATC	2	6	50164	50169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249817
1086	NC_008380	TCG	2	6	50177	50182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1087	NC_008380	GAA	2	6	50208	50213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249817
1088	NC_008380	GAG	2	6	50251	50256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249817
1089	NC_008380	CAC	2	6	50280	50285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249817
1090	NC_008380	AAG	2	6	50317	50322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249817
1091	NC_008380	GAC	2	6	50341	50346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
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1093	NC_008380	AAG	2	6	50479	50484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249817
1094	NC_008380	CGA	2	6	50526	50531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1095	NC_008380	CGG	2	6	50640	50645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249817
1096	NC_008380	CG	3	6	50663	50668	0 %	0 %	50 %	50 %	116249817
1097	NC_008380	TCG	2	6	50696	50701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1098	NC_008380	ACG	2	6	50707	50712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1099	NC_008380	TCT	2	6	50796	50801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249817
1100	NC_008380	GCC	2	6	50816	50821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1101	NC_008380	GAT	2	6	50857	50862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249817
1102	NC_008380	CCG	2	6	50865	50870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1103	NC_008380	AAGC	2	8	50888	50895	50 %	0 %	25 %	25 %	116249817
1104	NC_008380	CG	3	6	50911	50916	0 %	0 %	50 %	50 %	116249817
1105	NC_008380	CGA	2	6	50952	50957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
1106	NC_008380	CTC	2	6	50997	51002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249817
1107	NC_008380	CGAT	2	8	51101	51108	25 %	25 %	25 %	25 %	116249817
1108	NC_008380	GCC	2	6	51109	51114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1109	NC_008380	TC	3	6	51156	51161	0 %	50 %	0 %	50 %	116249817
1110	NC_008380	GCCT	2	8	51523	51530	0 %	25 %	25 %	50 %	116249818
1111	NC_008380	GCCG	2	8	51547	51554	0 %	0 %	50 %	50 %	116249818
1112	NC_008380	AGC	2	6	51570	51575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249818
1113	NC_008380	AGC	2	6	51620	51625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249818
1114	NC_008380	TGA	2	6	51678	51683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249818
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1116	NC_008380	TCG	2	6	51744	51749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249818
1117	NC_008380	AC	3	6	51754	51759	50 %	0 %	0 %	50 %	116249818
1118	NC_008380	TAT	2	6	51794	51799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249818
1119	NC_008380	CCT	2	6	51810	51815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249818
1120	NC_008380	CGCTT	2	10	51833	51842	0 %	40 %	20 %	40 %	116249818
1121	NC_008380	ATG	2	6	51843	51848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249818
1122	NC_008380	CGA	2	6	51859	51864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249818
1123	NC_008380	GCAAGA	2	12	51894	51905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116249818
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1497	NC_008380	GCCA	2	8	77685	77692	25 %	0 %	25 %	50 %	116249830
1498	NC_008380	GCC	2	6	77707	77712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249830
1499	NC_008380	TCG	2	6	77847	77852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249830
1500	NC_008380	CGG	2	6	77873	77878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249830

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