MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_008380	ATC	2	6	5048976	5048981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254459
105002	NC_008380	AGCTG	2	10	5049022	5049031	20 %	20 %	40 %	20 %	116254459
105003	NC_008380	CGT	2	6	5049040	5049045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254459
105004	NC_008380	GAT	2	6	5049054	5049059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254459
105005	NC_008380	CAA	2	6	5049089	5049094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254459
105006	NC_008380	GAA	2	6	5049156	5049161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254459
105007	NC_008380	TCAT	2	8	5049313	5049320	25 %	50 %	0 %	25 %	116254459
105008	NC_008380	CTG	2	6	5049548	5049553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105009	NC_008380	CCG	2	6	5049623	5049628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254460
105010	NC_008380	AGC	2	6	5049648	5049653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105011	NC_008380	GCC	2	6	5049714	5049719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254460
105012	NC_008380	CAG	2	6	5049734	5049739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105013	NC_008380	AGA	2	6	5049762	5049767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254460
105014	NC_008380	CTG	2	6	5049833	5049838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105015	NC_008380	AAG	2	6	5049860	5049865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254460
105016	NC_008380	AGG	2	6	5049955	5049960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254460
105017	NC_008380	CGAT	2	8	5049978	5049985	25 %	25 %	25 %	25 %	116254460
105018	NC_008380	CGA	2	6	5050024	5050029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105019	NC_008380	AGC	2	6	5050049	5050054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105020	NC_008380	GTC	2	6	5050083	5050088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254460
105021	NC_008380	GCCA	2	8	5050139	5050146	25 %	0 %	25 %	50 %	116254460
105022	NC_008380	AAG	2	6	5050303	5050308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254461
105023	NC_008380	GC	4	8	5050378	5050385	0 %	0 %	50 %	50 %	116254461
105024	NC_008380	TAA	2	6	5050559	5050564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254461
105025	NC_008380	GCC	2	6	5050575	5050580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254461
105026	NC_008380	GCT	2	6	5050635	5050640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254461
105027	NC_008380	TCG	2	6	5050666	5050671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254461
105028	NC_008380	CCA	2	6	5050685	5050690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254461
105029	NC_008380	GATT	2	8	5050691	5050698	25 %	50 %	25 %	0 %	116254461
105030	NC_008380	AGC	2	6	5050855	5050860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254462
105031	NC_008380	GA	3	6	5050954	5050959	50 %	0 %	50 %	0 %	116254462
105032	NC_008380	CTC	2	6	5051001	5051006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254462
105033	NC_008380	TCGA	2	8	5051040	5051047	25 %	25 %	25 %	25 %	116254462
105034	NC_008380	GCG	2	6	5051137	5051142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254462
105035	NC_008380	CG	3	6	5051214	5051219	0 %	0 %	50 %	50 %	116254462
105036	NC_008380	CGC	2	6	5051299	5051304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
105037	NC_008380	CG	3	6	5051308	5051313	0 %	0 %	50 %	50 %	116254462
105038	NC_008380	GCG	2	6	5051342	5051347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254462
105039	NC_008380	CGTGA	2	10	5051434	5051443	20 %	20 %	40 %	20 %	116254462
105040	NC_008380	TCG	2	6	5051446	5051451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254462
105041	NC_008380	GCT	2	6	5051505	5051510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254462
105042	NC_008380	GGT	2	6	5051568	5051573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254462
105043	NC_008380	TGA	2	6	5051717	5051722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
105044	NC_008380	CCG	2	6	5051738	5051743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
105045	NC_008380	AGG	2	6	5051747	5051752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254462
105046	NC_008380	AAGA	2	8	5051802	5051809	75 %	0 %	25 %	0 %	116254462
105047	NC_008380	TCGA	2	8	5051851	5051858	25 %	25 %	25 %	25 %	116254462
105048	NC_008380	ATG	2	6	5051914	5051919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
105049	NC_008380	ATG	2	6	5051929	5051934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
105050	NC_008380	GTC	2	6	5051950	5051955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254462
105051	NC_008380	CTC	2	6	5052021	5052026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254462
105052	NC_008380	CGGG	2	8	5052079	5052086	0 %	0 %	75 %	25 %	116254462
105053	NC_008380	CAATC	2	10	5052141	5052150	40 %	20 %	0 %	40 %	116254462
105054	NC_008380	ACC	2	6	5052235	5052240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254462
105055	NC_008380	ATC	2	6	5052261	5052266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254462
105056	NC_008380	GAT	2	6	5052327	5052332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
105057	NC_008380	CGC	2	6	5052357	5052362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
105058	NC_008380	TCT	2	6	5052428	5052433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254462
105059	NC_008380	TGAAT	2	10	5052446	5052455	40 %	40 %	20 %	0 %	116254462
105060	NC_008380	GCGAC	2	10	5052469	5052478	20 %	0 %	40 %	40 %	116254462
105061	NC_008380	CCAT	2	8	5052487	5052494	25 %	25 %	0 %	50 %	116254462
105062	NC_008380	GC	3	6	5052609	5052614	0 %	0 %	50 %	50 %	116254462
105063	NC_008380	GCC	2	6	5052645	5052650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
105064	NC_008380	ATCACA	2	12	5052655	5052666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116254462
105065	NC_008380	CCG	2	6	5052842	5052847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
105066	NC_008380	GCT	2	6	5052857	5052862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
105067	NC_008380	GCT	2	6	5052913	5052918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
105068	NC_008380	TC	3	6	5052987	5052992	0 %	50 %	0 %	50 %	116254463
105069	NC_008380	CCG	2	6	5053011	5053016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
105070	NC_008380	CTT	2	6	5053092	5053097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254463
105071	NC_008380	GTC	2	6	5053134	5053139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
105072	NC_008380	CG	5	10	5053202	5053211	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
105073	NC_008380	GGT	2	6	5053320	5053325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254463
105074	NC_008380	ACC	2	6	5053414	5053419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254463
105075	NC_008380	GAT	2	6	5053434	5053439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254463
105076	NC_008380	GCCG	2	8	5053443	5053450	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
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105079	NC_008380	GC	3	6	5053571	5053576	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
105080	NC_008380	CGG	2	6	5053735	5053740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254463
105081	NC_008380	A	6	6	5053875	5053880	100 %	0 %	0 %	0 %	116254463
105082	NC_008380	ATCG	2	8	5053896	5053903	25 %	25 %	25 %	25 %	116254463
105083	NC_008380	GCC	2	6	5053948	5053953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
105084	NC_008380	CGA	2	6	5053964	5053969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254463
105085	NC_008380	AT	3	6	5054052	5054057	50 %	50 %	0 %	0 %	116254463
105086	NC_008380	ATCGA	2	10	5054191	5054200	40 %	20 %	20 %	20 %	116254464
105087	NC_008380	TTC	2	6	5054215	5054220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254464
105088	NC_008380	TCT	2	6	5054300	5054305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254464
105089	NC_008380	TTC	2	6	5054436	5054441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254464
105090	NC_008380	GAT	2	6	5054490	5054495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254464
105091	NC_008380	GCC	2	6	5054505	5054510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254464
105092	NC_008380	CGCGC	2	10	5054524	5054533	0 %	0 %	40 %	60 %	116254464
105093	NC_008380	GAA	2	6	5054535	5054540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254464
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105095	NC_008380	TCG	2	6	5054737	5054742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105096	NC_008380	GAG	2	6	5054749	5054754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254464
105097	NC_008380	CGC	2	6	5054762	5054767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254464
105098	NC_008380	CTT	2	6	5054792	5054797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254464
105099	NC_008380	CAG	2	6	5054814	5054819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105100	NC_008380	GAT	2	6	5054840	5054845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254464
105101	NC_008380	GCA	2	6	5054873	5054878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105102	NC_008380	GGT	2	6	5054899	5054904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254464
105103	NC_008380	CGA	2	6	5054906	5054911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105104	NC_008380	GCG	2	6	5054936	5054941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254464
105105	NC_008380	CCA	2	6	5054942	5054947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254464
105106	NC_008380	TGG	2	6	5054975	5054980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254464
105107	NC_008380	GCG	2	6	5055023	5055028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254464
105108	NC_008380	TCG	2	6	5055070	5055075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105109	NC_008380	AGC	2	6	5055097	5055102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105110	NC_008380	CCTT	2	8	5055118	5055125	0 %	50 %	0 %	50 %	116254464
105111	NC_008380	CGG	2	6	5055175	5055180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254464
105112	NC_008380	GCA	2	6	5055263	5055268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105113	NC_008380	CGA	2	6	5055272	5055277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105114	NC_008380	GAT	2	6	5055288	5055293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254464
105115	NC_008380	CTGG	2	8	5055303	5055310	0 %	25 %	50 %	25 %	116254464
105116	NC_008380	CAG	2	6	5055393	5055398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254464
105117	NC_008380	CAC	2	6	5055656	5055661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254465
105118	NC_008380	ATC	2	6	5055681	5055686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254465
105119	NC_008380	GC	3	6	5055722	5055727	0 %	0 %	50 %	50 %	116254465
105120	NC_008380	GCG	2	6	5055731	5055736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254465
105121	NC_008380	GAA	2	6	5055773	5055778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254465
105122	NC_008380	CAG	2	6	5055794	5055799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254465
105123	NC_008380	ACG	2	6	5055801	5055806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254465
105124	NC_008380	CAGC	2	8	5055824	5055831	25 %	0 %	25 %	50 %	116254465
105125	NC_008380	CAT	2	6	5055887	5055892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254465
105126	NC_008380	ATG	2	6	5055903	5055908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254465
105127	NC_008380	AGC	2	6	5055915	5055920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254465
105128	NC_008380	CAGCC	2	10	5056007	5056016	20 %	0 %	20 %	60 %	116254465
105129	NC_008380	GAT	2	6	5056034	5056039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254465
105130	NC_008380	AAG	2	6	5056110	5056115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254465

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