MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008380	GCC	2	6	260461	260466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
5502	NC_008380	CCG	2	6	260488	260493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
5503	NC_008380	GGA	2	6	260550	260555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249992
5504	NC_008380	GGT	2	6	260577	260582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249992
5505	NC_008380	GCG	2	6	260620	260625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
5506	NC_008380	GC	4	8	260788	260795	0 %	0 %	50 %	50 %	116249992
5507	NC_008380	GTAGAG	2	12	260808	260819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116249992
5508	NC_008380	GGC	2	6	260841	260846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
5509	NC_008380	CATGG	2	10	260943	260952	20 %	20 %	40 %	20 %	116249992
5510	NC_008380	CTCGC	2	10	260989	260998	0 %	20 %	20 %	60 %	116249993
5511	NC_008380	GCCA	2	8	261082	261089	25 %	0 %	25 %	50 %	116249993
5512	NC_008380	CGG	2	6	261147	261152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
5513	NC_008380	GAT	2	6	261228	261233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
5514	NC_008380	TGA	2	6	261239	261244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
5515	NC_008380	GCA	2	6	261251	261256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
5516	NC_008380	GC	4	8	261295	261302	0 %	0 %	50 %	50 %	116249993
5517	NC_008380	GGC	2	6	261451	261456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
5518	NC_008380	CAG	2	6	261486	261491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
5519	NC_008380	CCG	2	6	261550	261555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249993
5520	NC_008380	GCG	2	6	261662	261667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
5521	NC_008380	GAT	2	6	261681	261686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
5522	NC_008380	CGG	2	6	261699	261704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
5523	NC_008380	CAG	2	6	261726	261731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
5524	NC_008380	CAG	2	6	261744	261749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
5525	NC_008380	GAT	2	6	261753	261758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
5526	NC_008380	GCC	2	6	261853	261858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
5527	NC_008380	GATC	2	8	261872	261879	25 %	25 %	25 %	25 %	116249994
5528	NC_008380	GA	3	6	261889	261894	50 %	0 %	50 %	0 %	116249994
5529	NC_008380	CGA	2	6	261896	261901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5530	NC_008380	TCA	2	6	261908	261913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249994
5531	NC_008380	GAA	2	6	261930	261935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249994
5532	NC_008380	GAT	2	6	261957	261962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249994
5533	NC_008380	CCA	2	6	262025	262030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249994
5534	NC_008380	CGA	2	6	262043	262048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5535	NC_008380	ATC	2	6	262069	262074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249994
5536	NC_008380	CCG	2	6	262187	262192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
5537	NC_008380	GC	3	6	262194	262199	0 %	0 %	50 %	50 %	116249994
5538	NC_008380	CGCC	2	8	262214	262221	0 %	0 %	25 %	75 %	116249994
5539	NC_008380	CGG	2	6	262241	262246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249994
5540	NC_008380	CCG	2	6	262300	262305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
5541	NC_008380	TCG	2	6	262325	262330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5542	NC_008380	GAT	2	6	262338	262343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249994
5543	NC_008380	CAG	2	6	262347	262352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5544	NC_008380	AGGC	2	8	262364	262371	25 %	0 %	50 %	25 %	116249994
5545	NC_008380	CCG	2	6	262420	262425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
5546	NC_008380	GGC	2	6	262434	262439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249994
5547	NC_008380	CGA	2	6	262520	262525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5548	NC_008380	GCA	3	9	262607	262615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5549	NC_008380	CAG	2	6	262731	262736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5550	NC_008380	GAC	3	9	262740	262748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5551	NC_008380	CGA	2	6	262766	262771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
5552	NC_008380	GCG	2	6	262773	262778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249994
5553	NC_008380	GAG	2	6	262782	262787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249994
5554	NC_008380	CT	3	6	262903	262908	0 %	50 %	0 %	50 %	116249995
5555	NC_008380	TCT	2	6	263045	263050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249995
5556	NC_008380	GCG	2	6	263077	263082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249995
5557	NC_008380	CTT	2	6	263103	263108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249995
5558	NC_008380	ATA	2	6	263145	263150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249995
5559	NC_008380	CG	3	6	263156	263161	0 %	0 %	50 %	50 %	116249995
5560	NC_008380	GATGTC	2	12	263166	263177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116249995
5561	NC_008380	ATG	2	6	263227	263232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249995
5562	NC_008380	TCGG	2	8	263257	263264	0 %	25 %	50 %	25 %	116249995
5563	NC_008380	GCG	2	6	263342	263347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249995
5564	NC_008380	GTGAAG	2	12	263356	263367	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116249995
5565	NC_008380	GCAA	2	8	263389	263396	50 %	0 %	25 %	25 %	116249995
5566	NC_008380	CGCCTT	2	12	263397	263408	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116249995
5567	NC_008380	CGT	2	6	263414	263419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249995
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5569	NC_008380	CAT	2	6	263535	263540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249995
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5578	NC_008380	CGGT	2	8	263948	263955	0 %	25 %	50 %	25 %	116249995
5579	NC_008380	GA	3	6	263959	263964	50 %	0 %	50 %	0 %	116249995
5580	NC_008380	GCA	2	6	263966	263971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249995
5581	NC_008380	ATCG	2	8	263994	264001	25 %	25 %	25 %	25 %	116249995
5582	NC_008380	CCGCG	2	10	264044	264053	0 %	0 %	40 %	60 %	116249995
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5595	NC_008380	CTTC	2	8	264875	264882	0 %	50 %	0 %	50 %	116249996
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5599	NC_008380	CG	3	6	265120	265125	0 %	0 %	50 %	50 %	116249996
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5603	NC_008380	AGC	2	6	265318	265323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249996
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5605	NC_008380	CGA	2	6	265364	265369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249996
5606	NC_008380	GCG	2	6	265370	265375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249996
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5620	NC_008380	CGC	2	6	266027	266032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249997
5621	NC_008380	GCT	2	6	266048	266053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249997
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5981	NC_008380	TTG	2	6	282599	282604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116250010
5982	NC_008380	TCG	2	6	282653	282658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250010
5983	NC_008380	GTA	2	6	282742	282747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250010
5984	NC_008380	ACC	2	6	282782	282787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250010
5985	NC_008380	TGC	2	6	282788	282793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250010
5986	NC_008380	CCGT	2	8	282797	282804	0 %	25 %	25 %	50 %	116250010
5987	NC_008380	GCG	2	6	282970	282975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250011
5988	NC_008380	TGA	2	6	282986	282991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250011
5989	NC_008380	ATC	2	6	283098	283103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250011
5990	NC_008380	CG	3	6	283244	283249	0 %	0 %	50 %	50 %	116250011
5991	NC_008380	GC	3	6	283252	283257	0 %	0 %	50 %	50 %	116250011
5992	NC_008380	CGGCT	2	10	283278	283287	0 %	20 %	40 %	40 %	116250011
5993	NC_008380	ATGC	2	8	283293	283300	25 %	25 %	25 %	25 %	116250011
5994	NC_008380	GTC	2	6	283413	283418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250011
5995	NC_008380	GCGT	2	8	283422	283429	0 %	25 %	50 %	25 %	116250011
5996	NC_008380	CGGCA	2	10	283496	283505	20 %	0 %	40 %	40 %	116250012
5997	NC_008380	CTG	2	6	283536	283541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250012
5998	NC_008380	TCT	2	6	283612	283617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250012
5999	NC_008380	CGA	2	6	283681	283686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250012
6000	NC_008380	CGC	2	6	283711	283716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250012

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