MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008380	GAT	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249968
5002	NC_008380	CGG	2	6	238012	238017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249969
5003	NC_008380	TCT	2	6	238031	238036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249969
5004	NC_008380	GAT	2	6	238056	238061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249969
5005	NC_008380	TCG	2	6	238147	238152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5006	NC_008380	CGT	2	6	238202	238207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5007	NC_008380	CGC	2	6	238244	238249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249969
5008	NC_008380	GCT	2	6	238313	238318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5009	NC_008380	GC	3	6	238361	238366	0 %	0 %	50 %	50 %	116249969
5010	NC_008380	CTG	2	6	238386	238391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5011	NC_008380	TCA	2	6	238396	238401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5012	NC_008380	TCA	2	6	238477	238482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5013	NC_008380	GCC	2	6	238524	238529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249969
5014	NC_008380	CAT	2	6	238532	238537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5015	NC_008380	GCCG	2	8	238580	238587	0 %	0 %	50 %	50 %	116249969
5016	NC_008380	TGC	2	6	238610	238615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5017	NC_008380	CAT	2	6	238640	238645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5018	NC_008380	CGA	2	6	238700	238705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5019	NC_008380	CTGT	2	8	238710	238717	0 %	50 %	25 %	25 %	116249969
5020	NC_008380	GCG	2	6	238746	238751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249969
5021	NC_008380	ATC	2	6	238780	238785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249970
5022	NC_008380	CGA	2	6	238803	238808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249970
5023	NC_008380	CGC	2	6	238815	238820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5024	NC_008380	CGG	2	6	239016	239021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5025	NC_008380	CGC	3	9	239058	239066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5026	NC_008380	GAT	2	6	239085	239090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249970
5027	NC_008380	CGG	2	6	239115	239120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5028	NC_008380	AGG	2	6	239195	239200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249970
5029	NC_008380	CAT	2	6	239211	239216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249970
5030	NC_008380	CCG	2	6	239240	239245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5031	NC_008380	ATTCC	2	10	239288	239297	20 %	40 %	0 %	40 %	116249970
5032	NC_008380	TCA	2	6	239300	239305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249970
5033	NC_008380	GAA	2	6	239322	239327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249970
5034	NC_008380	TGG	2	6	239387	239392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249970
5035	NC_008380	CGT	2	6	239577	239582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249970
5036	NC_008380	CGC	2	6	239592	239597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5037	NC_008380	CGC	2	6	239622	239627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5038	NC_008380	TGA	2	6	239634	239639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249970
5039	NC_008380	GGC	2	6	239679	239684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5040	NC_008380	CG	3	6	239694	239699	0 %	0 %	50 %	50 %	116249970
5041	NC_008380	CGG	2	6	239715	239720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5042	NC_008380	GCC	2	6	239788	239793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5043	NC_008380	GGCT	2	8	239800	239807	0 %	25 %	50 %	25 %	116249970
5044	NC_008380	GCC	2	6	239809	239814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5045	NC_008380	GC	3	6	239821	239826	0 %	0 %	50 %	50 %	116249970
5046	NC_008380	CGG	3	9	239853	239861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5047	NC_008380	CGG	2	6	239873	239878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5048	NC_008380	GATC	2	8	239883	239890	25 %	25 %	25 %	25 %	116249970
5049	NC_008380	GCC	2	6	239965	239970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5050	NC_008380	GAC	2	6	239971	239976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249970
5051	NC_008380	CGG	2	6	239981	239986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5052	NC_008380	AG	3	6	239987	239992	50 %	0 %	50 %	0 %	116249970
5053	NC_008380	GAG	2	6	240028	240033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249970
5054	NC_008380	AGG	2	6	240117	240122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249971
5055	NC_008380	CGT	3	9	240154	240162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249971
5056	NC_008380	CACG	2	8	240198	240205	25 %	0 %	25 %	50 %	116249971
5057	NC_008380	GCC	2	6	240211	240216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249971
5058	NC_008380	CGG	2	6	240317	240322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249971
5059	NC_008380	TGC	2	6	240447	240452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249971
5060	NC_008380	GCT	2	6	240477	240482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249971
5061	NC_008380	GA	3	6	240509	240514	50 %	0 %	50 %	0 %	116249971
5062	NC_008380	GCT	2	6	240525	240530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249971
5063	NC_008380	GAA	2	6	240544	240549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249971
5064	NC_008380	TG	3	6	240560	240565	0 %	50 %	50 %	0 %	116249971
5065	NC_008380	ATG	2	6	240820	240825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249972
5066	NC_008380	TCGA	2	8	240850	240857	25 %	25 %	25 %	25 %	116249972
5067	NC_008380	GCGCG	2	10	240884	240893	0 %	0 %	60 %	40 %	116249972
5068	NC_008380	GCAG	2	8	240923	240930	25 %	0 %	50 %	25 %	116249972
5069	NC_008380	CGC	2	6	240975	240980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249972
5070	NC_008380	CGA	3	9	241013	241021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
5071	NC_008380	TCC	2	6	241042	241047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249972
5072	NC_008380	CG	4	8	241115	241122	0 %	0 %	50 %	50 %	116249972
5073	NC_008380	AGC	2	6	241150	241155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
5074	NC_008380	GC	3	6	241165	241170	0 %	0 %	50 %	50 %	116249972
5075	NC_008380	CGAAG	2	10	241176	241185	40 %	0 %	40 %	20 %	116249972
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5077	NC_008380	AGCAG	2	10	241280	241289	40 %	0 %	40 %	20 %	116249972
5078	NC_008380	GCA	2	6	241304	241309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
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5080	NC_008380	TGC	2	6	241363	241368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249972
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5084	NC_008380	GCCGAA	2	12	241640	241651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249973
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5087	NC_008380	ATGG	2	8	241952	241959	25 %	25 %	50 %	0 %	116249973
5088	NC_008380	GCA	2	6	242088	242093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249973
5089	NC_008380	AT	3	6	242197	242202	50 %	50 %	0 %	0 %	116249973
5090	NC_008380	TCG	2	6	242286	242291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249973
5091	NC_008380	TCC	2	6	242319	242324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249973
5092	NC_008380	GCAGT	2	10	242483	242492	20 %	20 %	40 %	20 %	116249973
5093	NC_008380	CTT	2	6	242498	242503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249973
5094	NC_008380	CCGG	2	8	242540	242547	0 %	0 %	50 %	50 %	116249974
5095	NC_008380	CG	3	6	242655	242660	0 %	0 %	50 %	50 %	116249974
5096	NC_008380	CGG	2	6	242700	242705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249974
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5099	NC_008380	CGA	2	6	242829	242834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249974
5100	NC_008380	CATC	2	8	242889	242896	25 %	25 %	0 %	50 %	116249974
5101	NC_008380	TGA	2	6	242919	242924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249974
5102	NC_008380	AGC	2	6	243008	243013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249974
5103	NC_008380	CGG	2	6	243022	243027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249974
5104	NC_008380	AGC	2	6	243128	243133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249974
5105	NC_008380	CGA	2	6	243214	243219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249974
5106	NC_008380	GAT	2	6	243271	243276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249974
5107	NC_008380	GGC	2	6	243463	243468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249974
5108	NC_008380	CG	3	6	243533	243538	0 %	0 %	50 %	50 %	116249974
5109	NC_008380	GGGAA	2	10	243568	243577	40 %	0 %	60 %	0 %	116249974
5110	NC_008380	CTG	2	6	243606	243611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249974
5111	NC_008380	TCG	2	6	243659	243664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249974
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5114	NC_008380	AAAAG	2	10	243716	243725	80 %	0 %	20 %	0 %	116249974
5115	NC_008380	CAG	2	6	243896	243901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249975
5116	NC_008380	CGC	2	6	243903	243908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249975
5117	NC_008380	TGATCG	2	12	243954	243965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116249975
5118	NC_008380	ACCGT	2	10	244106	244115	20 %	20 %	20 %	40 %	116249975
5119	NC_008380	TCAGCG	2	12	244179	244190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249975
5120	NC_008380	GC	3	6	244245	244250	0 %	0 %	50 %	50 %	116249975
5121	NC_008380	TGC	2	6	244265	244270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249975
5122	NC_008380	GCG	2	6	244298	244303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249975
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5139	NC_008380	GC	3	6	245074	245079	0 %	0 %	50 %	50 %	116249976
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5230	NC_008380	GGC	2	6	249001	249006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
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5234	NC_008380	CCGG	2	8	249138	249145	0 %	0 %	50 %	50 %	116249981
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5241	NC_008380	CGG	2	6	249440	249445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249982
5242	NC_008380	GAC	2	6	249453	249458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249982
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5244	NC_008380	ATC	2	6	249477	249482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249982
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5255	NC_008380	ACT	2	6	249847	249852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249982
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5302	NC_008380	GGA	2	6	251638	251643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249984
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