MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 7271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008379	CCA	2	6	156785	156790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249601
3002	NC_008379	TTCC	2	8	156905	156912	0 %	50 %	0 %	50 %	116249601
3003	NC_008379	CG	3	6	156985	156990	0 %	0 %	50 %	50 %	116249601
3004	NC_008379	AGC	2	6	157005	157010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249601
3005	NC_008379	GTC	2	6	157035	157040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249601
3006	NC_008379	GCA	2	6	157072	157077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249601
3007	NC_008379	GAT	2	6	157190	157195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249601
3008	NC_008379	ATG	2	6	157207	157212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249601
3009	NC_008379	TGT	2	6	157261	157266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249602
3010	NC_008379	TCTG	2	8	157334	157341	0 %	50 %	25 %	25 %	116249602
3011	NC_008379	GGC	2	6	157363	157368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249602
3012	NC_008379	GAT	2	6	157403	157408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249602
3013	NC_008379	TGC	2	6	157419	157424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3014	NC_008379	ATG	2	6	157496	157501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249602
3015	NC_008379	TCG	2	6	157518	157523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3016	NC_008379	CGA	2	6	157539	157544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3017	NC_008379	GGA	2	6	157546	157551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249602
3018	NC_008379	TAT	3	9	157676	157684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249602
3019	NC_008379	ATG	2	6	157719	157724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249602
3020	NC_008379	TC	3	6	157756	157761	0 %	50 %	0 %	50 %	116249602
3021	NC_008379	CTT	2	6	157861	157866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249602
3022	NC_008379	AAGC	2	8	157870	157877	50 %	0 %	25 %	25 %	116249602
3023	NC_008379	CA	3	6	157884	157889	50 %	0 %	0 %	50 %	116249602
3024	NC_008379	TGGC	2	8	157901	157908	0 %	25 %	50 %	25 %	116249602
3025	NC_008379	CGG	2	6	157936	157941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249602
3026	NC_008379	CAA	2	6	157945	157950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249602
3027	NC_008379	GTC	2	6	157955	157960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3028	NC_008379	ACG	2	6	157962	157967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3029	NC_008379	A	6	6	157983	157988	100 %	0 %	0 %	0 %	116249602
3030	NC_008379	GAT	2	6	158056	158061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249602
3031	NC_008379	GCG	2	6	158076	158081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249602
3032	NC_008379	TCG	2	6	158139	158144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3033	NC_008379	ACGG	2	8	158174	158181	25 %	0 %	50 %	25 %	116249602
3034	NC_008379	CGT	2	6	158197	158202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3035	NC_008379	AGC	2	6	158215	158220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249602
3036	NC_008379	CAT	2	6	158248	158253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249602
3037	NC_008379	ATCA	3	12	158312	158323	50 %	25 %	0 %	25 %	116249603
3038	NC_008379	CGC	2	6	158337	158342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249603
3039	NC_008379	CCTCG	2	10	158355	158364	0 %	20 %	20 %	60 %	116249603
3040	NC_008379	CGA	2	6	158382	158387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3041	NC_008379	GCG	2	6	158485	158490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249603
3042	NC_008379	TCG	2	6	158534	158539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3043	NC_008379	TCG	2	6	158582	158587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3044	NC_008379	GCT	2	6	158810	158815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3045	NC_008379	GCG	2	6	158849	158854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249603
3046	NC_008379	G	6	6	158856	158861	0 %	0 %	100 %	0 %	116249603
3047	NC_008379	GAT	2	6	158881	158886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249603
3048	NC_008379	TGC	2	6	158906	158911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3049	NC_008379	CTG	2	6	158944	158949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3050	NC_008379	CGCA	2	8	159037	159044	25 %	0 %	25 %	50 %	116249603
3051	NC_008379	GC	3	6	159046	159051	0 %	0 %	50 %	50 %	116249603
3052	NC_008379	CTC	2	6	159057	159062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249603
3053	NC_008379	GCT	2	6	159063	159068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3054	NC_008379	GAC	2	6	159087	159092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3055	NC_008379	AGC	2	6	159102	159107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249603
3056	NC_008379	AAG	2	6	159141	159146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249603
3057	NC_008379	TCCG	2	8	159192	159199	0 %	25 %	25 %	50 %	116249603
3058	NC_008379	ATCCC	2	10	159209	159218	20 %	20 %	0 %	60 %	116249603
3059	NC_008379	GGT	2	6	159348	159353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249603
3060	NC_008379	CGC	2	6	159354	159359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249603
3061	NC_008379	GC	3	6	159493	159498	0 %	0 %	50 %	50 %	116249604
3062	NC_008379	GTC	2	6	159542	159547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249604
3063	NC_008379	AC	3	6	159549	159554	50 %	0 %	0 %	50 %	116249604
3064	NC_008379	CG	3	6	159583	159588	0 %	0 %	50 %	50 %	116249604
3065	NC_008379	GCGG	2	8	159614	159621	0 %	0 %	75 %	25 %	116249604
3066	NC_008379	TG	3	6	159713	159718	0 %	50 %	50 %	0 %	116249604
3067	NC_008379	ACGC	2	8	159759	159766	25 %	0 %	25 %	50 %	116249604
3068	NC_008379	GAAC	2	8	159912	159919	50 %	0 %	25 %	25 %	116249604
3069	NC_008379	CAA	2	6	159921	159926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249604
3070	NC_008379	TTC	2	6	159927	159932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249604
3071	NC_008379	TCG	2	6	159960	159965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249604
3072	NC_008379	GTT	2	6	159980	159985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249604
3073	NC_008379	AT	3	6	160068	160073	50 %	50 %	0 %	0 %	116249604
3074	NC_008379	GGA	2	6	160079	160084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249604
3075	NC_008379	CGG	2	6	160116	160121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249605
3076	NC_008379	TCG	2	6	160154	160159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3077	NC_008379	CG	3	6	160172	160177	0 %	0 %	50 %	50 %	116249605
3078	NC_008379	ATC	2	6	160183	160188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249605
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3080	NC_008379	CAT	2	6	160254	160259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249605
3081	NC_008379	GTT	2	6	160284	160289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249605
3082	NC_008379	GGC	2	6	160329	160334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249605
3083	NC_008379	AGGC	2	8	160424	160431	25 %	0 %	50 %	25 %	116249605
3084	NC_008379	GTC	2	6	160441	160446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3085	NC_008379	ACC	2	6	160492	160497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249605
3086	NC_008379	CAT	2	6	160504	160509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249605
3087	NC_008379	TAA	2	6	160515	160520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249605
3088	NC_008379	GCT	2	6	160560	160565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3089	NC_008379	TGGA	2	8	160675	160682	25 %	25 %	50 %	0 %	116249605
3090	NC_008379	TCG	2	6	160742	160747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3091	NC_008379	CCT	2	6	160839	160844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249605
3092	NC_008379	AGC	2	6	160864	160869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3093	NC_008379	GCA	2	6	160893	160898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3094	NC_008379	CG	3	6	160909	160914	0 %	0 %	50 %	50 %	116249605
3095	NC_008379	CGT	2	6	160930	160935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249605
3096	NC_008379	TGG	2	6	161020	161025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249605
3097	NC_008379	AGG	2	6	161046	161051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249605
3098	NC_008379	GAG	3	9	161109	161117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249606
3099	NC_008379	CCG	2	6	161129	161134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249606
3100	NC_008379	TGA	2	6	161288	161293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249606
3101	NC_008379	GTCA	2	8	161304	161311	25 %	25 %	25 %	25 %	116249606
3102	NC_008379	ACA	2	6	161389	161394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249606
3103	NC_008379	TCA	2	6	161453	161458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249606
3104	NC_008379	GCG	2	6	161532	161537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249606
3105	NC_008379	A	6	6	161578	161583	100 %	0 %	0 %	0 %	116249606
3106	NC_008379	GTC	2	6	161634	161639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249606
3107	NC_008379	TGG	2	6	161651	161656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249606
3108	NC_008379	GAC	2	6	161663	161668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249606
3109	NC_008379	GCATG	2	10	161711	161720	20 %	20 %	40 %	20 %	116249606
3110	NC_008379	CCGT	2	8	161734	161741	0 %	25 %	25 %	50 %	116249606
3111	NC_008379	ATG	2	6	161773	161778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249606
3112	NC_008379	GACC	2	8	161801	161808	25 %	0 %	25 %	50 %	116249606
3113	NC_008379	GGC	2	6	161813	161818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249606
3114	NC_008379	GCG	2	6	161837	161842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249606
3115	NC_008379	CGG	2	6	161868	161873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249606
3116	NC_008379	GCA	2	6	161947	161952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249606
3117	NC_008379	TG	3	6	161967	161972	0 %	50 %	50 %	0 %	116249606
3118	NC_008379	GCT	2	6	162014	162019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249606
3119	NC_008379	TGA	2	6	162049	162054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249606
3120	NC_008379	CATC	2	8	162056	162063	25 %	25 %	0 %	50 %	116249606
3121	NC_008379	GAAGC	2	10	162113	162122	40 %	0 %	40 %	20 %	116249606
3122	NC_008379	GCAGC	2	10	162126	162135	20 %	0 %	40 %	40 %	116249606
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3483	NC_008379	CAA	3	9	179762	179770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249614
3484	NC_008379	CAT	3	9	179795	179803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249614
3485	NC_008379	GCC	2	6	179910	179915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249614
3486	NC_008379	CG	3	6	180057	180062	0 %	0 %	50 %	50 %	116249615
3487	NC_008379	TCA	2	6	180063	180068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249615
3488	NC_008379	GCA	2	6	180096	180101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249615
3489	NC_008379	GCT	2	6	180141	180146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249615
3490	NC_008379	GGT	2	6	180261	180266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249615
3491	NC_008379	GA	3	6	180298	180303	50 %	0 %	50 %	0 %	116249615
3492	NC_008379	TGA	2	6	180341	180346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249615
3493	NC_008379	CTG	2	6	180394	180399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249615
3494	NC_008379	ATC	2	6	180463	180468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249615
3495	NC_008379	AGC	2	6	180470	180475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249615
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3499	NC_008379	ACG	2	6	180532	180537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249615
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