MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 7271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008379	CGGTG	2	10	227040	227049	0 %	20 %	60 %	20 %	116249656
4502	NC_008379	GC	3	6	227060	227065	0 %	0 %	50 %	50 %	116249656
4503	NC_008379	GCG	2	6	227078	227083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249656
4504	NC_008379	GTC	2	6	227161	227166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249656
4505	NC_008379	CCT	2	6	227171	227176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249656
4506	NC_008379	GGC	2	6	227177	227182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249656
4507	NC_008379	CG	3	6	227188	227193	0 %	0 %	50 %	50 %	116249656
4508	NC_008379	CTT	2	6	227217	227222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249656
4509	NC_008379	TGA	2	6	227285	227290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249656
4510	NC_008379	GCC	2	6	227311	227316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249656
4511	NC_008379	CGC	2	6	227332	227337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249656
4512	NC_008379	CGC	2	6	227371	227376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249656
4513	NC_008379	GGC	2	6	227482	227487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249657
4514	NC_008379	ATC	2	6	227491	227496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249657
4515	NC_008379	CAGGCG	2	12	227515	227526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249657
4516	NC_008379	GAA	2	6	227530	227535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249657
4517	NC_008379	CGAC	2	8	227543	227550	25 %	0 %	25 %	50 %	116249657
4518	NC_008379	GCCC	2	8	227561	227568	0 %	0 %	25 %	75 %	116249657
4519	NC_008379	TCG	2	6	227570	227575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4520	NC_008379	GCT	2	6	227640	227645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4521	NC_008379	GAAG	2	8	227688	227695	50 %	0 %	50 %	0 %	116249657
4522	NC_008379	TGCGC	2	10	227709	227718	0 %	20 %	40 %	40 %	116249657
4523	NC_008379	GAT	2	6	227805	227810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249657
4524	NC_008379	TTA	2	6	227874	227879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249657
4525	NC_008379	TCG	2	6	227936	227941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4526	NC_008379	CGC	2	6	228009	228014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249657
4527	NC_008379	CGA	2	6	228045	228050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4528	NC_008379	CGA	2	6	228054	228059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4529	NC_008379	GCTG	2	8	228084	228091	0 %	25 %	50 %	25 %	116249657
4530	NC_008379	ATT	2	6	228164	228169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249657
4531	NC_008379	CAT	2	6	228237	228242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249657
4532	NC_008379	CGC	2	6	228274	228279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249657
4533	NC_008379	GATG	2	8	228303	228310	25 %	25 %	50 %	0 %	116249657
4534	NC_008379	CGA	2	6	228429	228434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249657
4535	NC_008379	AAG	3	9	228436	228444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249657
4536	NC_008379	TCC	2	6	228533	228538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249657
4537	NC_008379	CCG	2	6	228594	228599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249657
4538	NC_008379	GACG	2	8	228649	228656	25 %	0 %	50 %	25 %	116249657
4539	NC_008379	CGG	2	6	228672	228677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249657
4540	NC_008379	TCA	2	6	229080	229085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249658
4541	NC_008379	CAC	2	6	229088	229093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249658
4542	NC_008379	CGA	3	9	229135	229143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4543	NC_008379	GTC	2	6	229148	229153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4544	NC_008379	CGC	3	9	229168	229176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249658
4545	NC_008379	GCT	2	6	229186	229191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4546	NC_008379	CGA	2	6	229198	229203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4547	NC_008379	G	6	6	229223	229228	0 %	0 %	100 %	0 %	116249658
4548	NC_008379	TGC	2	6	229229	229234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4549	NC_008379	CGC	2	6	229237	229242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249658
4550	NC_008379	CT	3	6	229321	229326	0 %	50 %	0 %	50 %	116249658
4551	NC_008379	CGA	2	6	229387	229392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4552	NC_008379	GC	3	6	229428	229433	0 %	0 %	50 %	50 %	116249658
4553	NC_008379	GGCCG	2	10	229505	229514	0 %	0 %	60 %	40 %	116249658
4554	NC_008379	CTT	2	6	229577	229582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249658
4555	NC_008379	AGA	2	6	229584	229589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249658
4556	NC_008379	GTC	2	6	229593	229598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249658
4557	NC_008379	GTT	2	6	229626	229631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249658
4558	NC_008379	GCC	2	6	229700	229705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249659
4559	NC_008379	AGG	2	6	229735	229740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249659
4560	NC_008379	GCTC	2	8	229744	229751	0 %	25 %	25 %	50 %	116249659
4561	NC_008379	GAC	2	6	229763	229768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4562	NC_008379	TTC	2	6	229778	229783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249659
4563	NC_008379	CGGC	2	8	229784	229791	0 %	0 %	50 %	50 %	116249659
4564	NC_008379	TGC	2	6	229810	229815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4565	NC_008379	GAC	2	6	229829	229834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4566	NC_008379	TCG	2	6	229872	229877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4567	NC_008379	CCGG	2	8	229904	229911	0 %	0 %	50 %	50 %	116249659
4568	NC_008379	CG	3	6	229951	229956	0 %	0 %	50 %	50 %	116249659
4569	NC_008379	CCA	2	6	229975	229980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249659
4570	NC_008379	CGA	2	6	230036	230041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4571	NC_008379	GC	3	6	230069	230074	0 %	0 %	50 %	50 %	116249659
4572	NC_008379	GCA	2	6	230086	230091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249659
4573	NC_008379	AG	3	6	230114	230119	50 %	0 %	50 %	0 %	116249659
4574	NC_008379	GGT	2	6	230171	230176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249659
4575	NC_008379	CGG	2	6	230177	230182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249659
4576	NC_008379	TTG	2	6	230196	230201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249659
4577	NC_008379	ATCG	2	8	230252	230259	25 %	25 %	25 %	25 %	116249659
4578	NC_008379	TCT	2	6	230329	230334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249659
4579	NC_008379	GCG	3	9	230337	230345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249659
4580	NC_008379	CCG	2	6	230356	230361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249659
4581	NC_008379	CG	3	6	230380	230385	0 %	0 %	50 %	50 %	116249659
4582	NC_008379	GGC	2	6	230393	230398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249659
4583	NC_008379	CCG	3	9	230415	230423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249659
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4585	NC_008379	TCG	2	6	230593	230598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249660
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4587	NC_008379	GCT	2	6	230702	230707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249660
4588	NC_008379	CGA	2	6	230818	230823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249660
4589	NC_008379	GCC	2	6	230985	230990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249660
4590	NC_008379	TCA	2	6	230992	230997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249660
4591	NC_008379	AGA	2	6	231019	231024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249660
4592	NC_008379	CAA	2	6	231035	231040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249660
4593	NC_008379	CTG	2	6	231105	231110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249660
4594	NC_008379	GGT	2	6	231150	231155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249660
4595	NC_008379	CGA	2	6	231164	231169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249660
4596	NC_008379	GCC	2	6	231284	231289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249660
4597	NC_008379	CGG	2	6	231295	231300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249660
4598	NC_008379	CTGCCC	2	12	231318	231329	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116249660
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4600	NC_008379	TCG	2	6	231391	231396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249660
4601	NC_008379	CG	3	6	231417	231422	0 %	0 %	50 %	50 %	116249660
4602	NC_008379	TCT	2	6	231452	231457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249661
4603	NC_008379	GCCGG	2	10	231477	231486	0 %	0 %	60 %	40 %	116249661
4604	NC_008379	GAC	2	6	231582	231587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249661
4605	NC_008379	AGA	2	6	231665	231670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249661
4606	NC_008379	CAT	2	6	231695	231700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249661
4607	NC_008379	GAA	3	9	231738	231746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249661
4608	NC_008379	GAT	2	6	231786	231791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249661
4609	NC_008379	CGC	3	9	231845	231853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249661
4610	NC_008379	CGG	2	6	231889	231894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249661
4611	NC_008379	ACC	2	6	231921	231926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249661
4612	NC_008379	TTC	2	6	231942	231947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249661
4613	NC_008379	TCG	2	6	232166	232171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249662
4614	NC_008379	CTG	2	6	232184	232189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249662
4615	NC_008379	CGGC	2	8	232215	232222	0 %	0 %	50 %	50 %	116249662
4616	NC_008379	CGAT	2	8	232224	232231	25 %	25 %	25 %	25 %	116249662
4617	NC_008379	TCG	2	6	232257	232262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249662
4618	NC_008379	AAC	2	6	232271	232276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249662
4619	NC_008379	GC	3	6	232354	232359	0 %	0 %	50 %	50 %	116249662
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4621	NC_008379	GAAGAC	2	12	232387	232398	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116249662
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4623	NC_008379	TCCCT	2	10	232541	232550	0 %	40 %	0 %	60 %	116249662
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4980	NC_008379	CGA	3	9	246435	246443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249677
4981	NC_008379	CGC	2	6	246463	246468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249677
4982	NC_008379	CAG	3	9	246472	246480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249677
4983	NC_008379	GAC	2	6	246490	246495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249677
4984	NC_008379	GCCG	2	8	246531	246538	0 %	0 %	50 %	50 %	116249677
4985	NC_008379	CCA	2	6	246564	246569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249677
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4987	NC_008379	ATC	2	6	246722	246727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249677
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4989	NC_008379	GCAT	2	8	246794	246801	25 %	25 %	25 %	25 %	116249677
4990	NC_008379	GCC	2	6	246814	246819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249677
4991	NC_008379	ACCAGC	2	12	246851	246862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116249677
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4993	NC_008379	CGGT	2	8	246923	246930	0 %	25 %	50 %	25 %	116249677
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