MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_008378	GAC	2	6	193028	193033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248858
4003	NC_008378	CCG	2	6	193044	193049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248858
4004	NC_008378	AAG	2	6	193050	193055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248858
4005	NC_008378	GAT	2	6	193061	193066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248858
4006	NC_008378	GGCC	2	8	193068	193075	0 %	0 %	50 %	50 %	116248858
4007	NC_008378	ATA	2	6	193088	193093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248858
4008	NC_008378	TCG	2	6	193224	193229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248858
4009	NC_008378	TGA	2	6	193282	193287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248858
4010	NC_008378	CGGT	2	8	193314	193321	0 %	25 %	50 %	25 %	116248858
4011	NC_008378	GTCG	2	8	193445	193452	0 %	25 %	50 %	25 %	116248858
4012	NC_008378	CGAC	2	8	193480	193487	25 %	0 %	25 %	50 %	116248858
4013	NC_008378	GCG	2	6	193498	193503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248858
4014	NC_008378	AT	3	6	193512	193517	50 %	50 %	0 %	0 %	116248858
4015	NC_008378	GCC	2	6	193550	193555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248858
4016	NC_008378	GGA	2	6	193590	193595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248858
4017	NC_008378	CTC	2	6	193610	193615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248858
4018	NC_008378	TGCCGC	2	12	193628	193639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116248858
4019	NC_008378	GC	3	6	193644	193649	0 %	0 %	50 %	50 %	116248858
4020	NC_008378	CGA	2	6	193738	193743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248858
4021	NC_008378	CGG	2	6	193756	193761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248858
4022	NC_008378	CAGC	2	8	193766	193773	25 %	0 %	25 %	50 %	116248858
4023	NC_008378	CCAC	2	8	193824	193831	25 %	0 %	0 %	75 %	116248858
4024	NC_008378	GAT	2	6	193850	193855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248858
4025	NC_008378	TGC	3	9	193886	193894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248858
4026	NC_008378	TCG	2	6	193939	193944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248858
4027	NC_008378	TTC	2	6	194034	194039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248859
4028	NC_008378	TTG	2	6	194047	194052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248859
4029	NC_008378	CTG	3	9	194073	194081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4030	NC_008378	CGT	2	6	194091	194096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4031	NC_008378	GCC	2	6	194127	194132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
4032	NC_008378	GC	3	6	194158	194163	0 %	0 %	50 %	50 %	116248859
4033	NC_008378	CGAT	2	8	194173	194180	25 %	25 %	25 %	25 %	116248859
4034	NC_008378	CCG	2	6	194181	194186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
4035	NC_008378	GCTC	2	8	194192	194199	0 %	25 %	25 %	50 %	116248859
4036	NC_008378	GCGCG	2	10	194248	194257	0 %	0 %	60 %	40 %	116248859
4037	NC_008378	TGC	3	9	194263	194271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4038	NC_008378	GTT	2	6	194273	194278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248859
4039	NC_008378	CGT	2	6	194288	194293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4040	NC_008378	TTGCGG	2	12	194356	194367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116248859
4041	NC_008378	CGC	2	6	194389	194394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
4042	NC_008378	GCC	2	6	194406	194411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
4043	NC_008378	CGCC	2	8	194438	194445	0 %	0 %	25 %	75 %	116248859
4044	NC_008378	ACG	2	6	194482	194487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4045	NC_008378	GCT	3	9	194495	194503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4046	NC_008378	T	7	7	194612	194618	0 %	100 %	0 %	0 %	116248859
4047	NC_008378	CGG	2	6	194654	194659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248859
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4049	NC_008378	GAC	2	6	194819	194824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4050	NC_008378	GTC	2	6	194826	194831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4051	NC_008378	GTG	2	6	194844	194849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248859
4052	NC_008378	CTG	2	6	194856	194861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4053	NC_008378	GC	3	6	194874	194879	0 %	0 %	50 %	50 %	116248859
4054	NC_008378	GCC	2	6	194931	194936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
4055	NC_008378	GTG	2	6	194940	194945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248859
4056	NC_008378	GC	3	6	194961	194966	0 %	0 %	50 %	50 %	116248859
4057	NC_008378	CGT	2	6	194993	194998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248859
4058	NC_008378	CGGCG	2	10	195012	195021	0 %	0 %	60 %	40 %	116248859
4059	NC_008378	TGG	2	6	195058	195063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248859
4060	NC_008378	CCG	2	6	195115	195120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
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4062	NC_008378	GAT	2	6	195206	195211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248859
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4064	NC_008378	GGC	2	6	195260	195265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248859
4065	NC_008378	TCGC	2	8	195273	195280	0 %	25 %	25 %	50 %	116248859
4066	NC_008378	GAAG	2	8	195305	195312	50 %	0 %	50 %	0 %	116248859
4067	NC_008378	CGC	2	6	195388	195393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248859
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4070	NC_008378	CAGAT	2	10	195466	195475	40 %	20 %	20 %	20 %	116248859
4071	NC_008378	CTGGA	2	10	195510	195519	20 %	20 %	40 %	20 %	116248859
4072	NC_008378	AGC	2	6	195520	195525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248859
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4074	NC_008378	GC	4	8	195653	195660	0 %	0 %	50 %	50 %	116248860
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4081	NC_008378	GC	3	6	196066	196071	0 %	0 %	50 %	50 %	116248860
4082	NC_008378	TGGC	2	8	196102	196109	0 %	25 %	50 %	25 %	116248860
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4088	NC_008378	TGA	2	6	196223	196228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248860
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4093	NC_008378	GCA	2	6	196490	196495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248860
4094	NC_008378	CGA	2	6	196502	196507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248860
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4098	NC_008378	TCG	2	6	196688	196693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248860
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4105	NC_008378	GCC	2	6	197279	197284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248861
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4121	NC_008378	CGG	2	6	198145	198150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248862
4122	NC_008378	ATC	2	6	198353	198358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248862
4123	NC_008378	TCG	2	6	198552	198557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248862
4124	NC_008378	CG	3	6	198566	198571	0 %	0 %	50 %	50 %	116248862
4125	NC_008378	CCTC	2	8	198615	198622	0 %	25 %	0 %	75 %	116248862
4126	NC_008378	ATC	2	6	198639	198644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248862
4127	NC_008378	TGC	2	6	198744	198749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248862
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4129	NC_008378	TGA	2	6	198813	198818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248862
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4131	NC_008378	TC	3	6	199102	199107	0 %	50 %	0 %	50 %	116248862
4132	NC_008378	AAG	2	6	199214	199219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248862
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4134	NC_008378	GGC	2	6	199298	199303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248862
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4143	NC_008378	TTC	2	6	199674	199679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248863
4144	NC_008378	CAT	2	6	199724	199729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248863
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4149	NC_008378	CAT	2	6	199931	199936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248863
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4152	NC_008378	TTC	2	6	199989	199994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248863
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4154	NC_008378	GTC	2	6	200112	200117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248863
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4232	NC_008378	CGGG	2	8	203848	203855	0 %	0 %	75 %	25 %	116248867
4233	NC_008378	CGG	3	9	203871	203879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248867
4234	NC_008378	GCTG	2	8	203919	203926	0 %	25 %	50 %	25 %	116248867
4235	NC_008378	CCGT	2	8	203949	203956	0 %	25 %	25 %	50 %	116248867
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4239	NC_008378	GTTC	2	8	204081	204088	0 %	50 %	25 %	25 %	116248867
4240	NC_008378	TCG	2	6	204146	204151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
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4363	NC_008378	CGAG	2	8	209844	209851	25 %	0 %	50 %	25 %	116248871
4364	NC_008378	CGA	2	6	209853	209858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248871
4365	NC_008378	TGA	2	6	209928	209933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248871
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4367	NC_008378	CGG	2	6	209950	209955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248871
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4384	NC_008378	GCCGC	2	10	210638	210647	0 %	0 %	40 %	60 %	116248872
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4391	NC_008378	GA	3	6	210988	210993	50 %	0 %	50 %	0 %	116248872
4392	NC_008378	GGC	2	6	211015	211020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248872
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4401	NC_008378	CGA	2	6	211491	211496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248872
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4452	NC_008378	GC	4	8	214388	214395	0 %	0 %	50 %	50 %	116248874
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4463	NC_008378	CGCC	2	8	214791	214798	0 %	0 %	25 %	75 %	116248874
4464	NC_008378	ACG	2	6	214823	214828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248874
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4471	NC_008378	TGC	2	6	215105	215110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4472	NC_008378	GCCGC	2	10	215116	215125	0 %	0 %	40 %	60 %	116248875
4473	NC_008378	ATC	2	6	215128	215133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248875
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4477	NC_008378	CGA	2	6	215334	215339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
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4479	NC_008378	GCCG	2	8	215406	215413	0 %	0 %	50 %	50 %	116248875
4480	NC_008378	CAT	2	6	215532	215537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248875
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4483	NC_008378	TCA	2	6	215666	215671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248875
4484	NC_008378	GAC	2	6	215703	215708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4485	NC_008378	GGCCG	2	10	215725	215734	0 %	0 %	60 %	40 %	116248875
4486	NC_008378	GCC	2	6	215743	215748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248875
4487	NC_008378	CTG	2	6	215770	215775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4488	NC_008378	ACG	2	6	215816	215821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4489	NC_008378	GAC	2	6	215857	215862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4490	NC_008378	CCG	2	6	215879	215884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248875
4491	NC_008378	CGA	2	6	215910	215915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4492	NC_008378	GGC	2	6	215920	215925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248875
4493	NC_008378	GCT	2	6	215931	215936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4494	NC_008378	CGG	2	6	215946	215951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248875
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4499	NC_008378	TCG	2	6	216257	216262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4500	NC_008378	CGA	2	6	216285	216290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875

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