MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008378	GCG	2	6	168146	168151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3502	NC_008378	AT	3	6	168224	168229	50 %	50 %	0 %	0 %	116248838
3503	NC_008378	CAT	2	6	168277	168282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248838
3504	NC_008378	GCG	2	6	168298	168303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3505	NC_008378	CGG	2	6	168321	168326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3506	NC_008378	CCGA	2	8	168338	168345	25 %	0 %	25 %	50 %	116248838
3507	NC_008378	AGA	2	6	168348	168353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248838
3508	NC_008378	GGC	2	6	168367	168372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3509	NC_008378	AGC	2	6	168389	168394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248838
3510	NC_008378	TCA	2	6	168447	168452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248838
3511	NC_008378	AGC	3	9	168458	168466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248838
3512	NC_008378	TTCG	2	8	168471	168478	0 %	50 %	25 %	25 %	116248838
3513	NC_008378	GC	3	6	168507	168512	0 %	0 %	50 %	50 %	116248838
3514	NC_008378	GCGA	2	8	168554	168561	25 %	0 %	50 %	25 %	116248838
3515	NC_008378	GGT	2	6	168619	168624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248838
3516	NC_008378	CCG	2	6	168892	168897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248839
3517	NC_008378	CGG	2	6	168903	168908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248839
3518	NC_008378	CTG	2	6	168975	168980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248839
3519	NC_008378	TC	4	8	169028	169035	0 %	50 %	0 %	50 %	116248839
3520	NC_008378	GCG	2	6	169040	169045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248839
3521	NC_008378	ACAGA	2	10	169068	169077	60 %	0 %	20 %	20 %	116248839
3522	NC_008378	TGGC	2	8	169081	169088	0 %	25 %	50 %	25 %	116248839
3523	NC_008378	CG	3	6	169105	169110	0 %	0 %	50 %	50 %	116248839
3524	NC_008378	CCT	2	6	169154	169159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248839
3525	NC_008378	GACG	2	8	169217	169224	25 %	0 %	50 %	25 %	116248839
3526	NC_008378	CAT	2	6	169226	169231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248839
3527	NC_008378	GC	3	6	169299	169304	0 %	0 %	50 %	50 %	116248839
3528	NC_008378	TTG	2	6	169330	169335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248839
3529	NC_008378	CG	3	6	169689	169694	0 %	0 %	50 %	50 %	116248839
3530	NC_008378	TCT	2	6	169910	169915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248840
3531	NC_008378	ACC	2	6	169924	169929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248840
3532	NC_008378	AAT	2	6	169944	169949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248840
3533	NC_008378	GCC	2	6	169969	169974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248840
3534	NC_008378	AAC	2	6	170005	170010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248840
3535	NC_008378	TTC	2	6	170038	170043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248840
3536	NC_008378	GCC	2	6	170097	170102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248840
3537	NC_008378	GCA	2	6	170126	170131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248840
3538	NC_008378	CCG	2	6	170136	170141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248840
3539	NC_008378	CGGC	2	8	170155	170162	0 %	0 %	50 %	50 %	116248840
3540	NC_008378	GCC	2	6	170176	170181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248840
3541	NC_008378	TGA	2	6	170225	170230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248840
3542	NC_008378	GAG	2	6	170262	170267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248840
3543	NC_008378	CAG	2	6	170316	170321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248840
3544	NC_008378	CGC	2	6	170418	170423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248840
3545	NC_008378	ATG	2	6	170434	170439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248840
3546	NC_008378	GTT	2	6	170505	170510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248840
3547	NC_008378	GAA	2	6	170511	170516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248840
3548	NC_008378	GCG	2	6	170546	170551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248840
3549	NC_008378	ACG	2	6	170579	170584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248840
3550	NC_008378	CGA	3	9	170588	170596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248840
3551	NC_008378	GCC	2	6	170695	170700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248841
3552	NC_008378	ACC	2	6	170709	170714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248841
3553	NC_008378	ACA	2	6	170734	170739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248841
3554	NC_008378	CAGCGC	2	12	170741	170752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116248841
3555	NC_008378	ACC	2	6	170793	170798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248841
3556	NC_008378	GCC	2	6	170825	170830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248841
3557	NC_008378	CAGCGG	2	12	171077	171088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116248841
3558	NC_008378	CAGC	3	12	171105	171116	25 %	0 %	25 %	50 %	116248841
3559	NC_008378	GTG	2	6	171190	171195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248841
3560	NC_008378	GTG	2	6	171288	171293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248841
3561	NC_008378	AGA	2	6	171334	171339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248841
3562	NC_008378	GAA	2	6	171347	171352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248841
3563	NC_008378	GGT	2	6	171368	171373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248841
3564	NC_008378	TGCCC	2	10	171394	171403	0 %	20 %	20 %	60 %	116248841
3565	NC_008378	TCA	2	6	171418	171423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248841
3566	NC_008378	GAT	2	6	171425	171430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248841
3567	NC_008378	GCA	2	6	171442	171447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248841
3568	NC_008378	AAG	2	6	171453	171458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248841
3569	NC_008378	CGG	2	6	171472	171477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248841
3570	NC_008378	CAG	2	6	171488	171493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248841
3571	NC_008378	T	6	6	171506	171511	0 %	100 %	0 %	0 %	116248841
3572	NC_008378	CCT	2	6	171576	171581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248842
3573	NC_008378	GAC	2	6	171622	171627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3574	NC_008378	CGA	2	6	171657	171662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3575	NC_008378	AAT	2	6	171672	171677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248842
3576	NC_008378	GGA	2	6	171715	171720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248842
3577	NC_008378	GCA	2	6	171726	171731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3578	NC_008378	TCG	2	6	171773	171778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3579	NC_008378	GTC	2	6	171784	171789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3580	NC_008378	CGA	2	6	171876	171881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3581	NC_008378	CAC	3	9	171961	171969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248842
3582	NC_008378	TCG	2	6	172103	172108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3583	NC_008378	AGC	2	6	172109	172114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3584	NC_008378	GCT	3	9	172158	172166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3585	NC_008378	GCC	2	6	172168	172173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248842
3586	NC_008378	ATC	2	6	172433	172438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248842
3587	NC_008378	GTC	3	9	172445	172453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3588	NC_008378	AGC	2	6	172475	172480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248842
3589	NC_008378	GAA	2	6	172845	172850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248843
3590	NC_008378	TCA	3	9	172856	172864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248843
3591	NC_008378	CAG	2	6	172884	172889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248843
3592	NC_008378	GAACAT	2	12	172956	172967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116248843
3593	NC_008378	CTT	2	6	172970	172975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248843
3594	NC_008378	CGA	3	9	173045	173053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248843
3595	NC_008378	CAT	2	6	173141	173146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248843
3596	NC_008378	CAG	2	6	173175	173180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248843
3597	NC_008378	GCCGAT	2	12	173301	173312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116248843
3598	NC_008378	TCT	2	6	173348	173353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248843
3599	NC_008378	GAA	2	6	173409	173414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248843
3600	NC_008378	CCTT	2	8	173416	173423	0 %	50 %	0 %	50 %	116248843
3601	NC_008378	TCA	2	6	173453	173458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248843
3602	NC_008378	GGC	2	6	173470	173475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248843
3603	NC_008378	CGG	2	6	173486	173491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248843
3604	NC_008378	CGG	2	6	173666	173671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248843
3605	NC_008378	GCC	2	6	173702	173707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248843
3606	NC_008378	CAT	2	6	173718	173723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248843
3607	NC_008378	CGG	2	6	173763	173768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248843
3608	NC_008378	TCA	2	6	173808	173813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248844
3609	NC_008378	AT	3	6	173848	173853	50 %	50 %	0 %	0 %	116248844
3610	NC_008378	CGC	2	6	173882	173887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248844
3611	NC_008378	GGC	2	6	173899	173904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248844
3612	NC_008378	GAA	2	6	173940	173945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248844
3613	NC_008378	GGC	2	6	173957	173962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248844
3614	NC_008378	GC	3	6	173961	173966	0 %	0 %	50 %	50 %	116248844
3615	NC_008378	CGG	2	6	173985	173990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248844
3616	NC_008378	TCG	2	6	174022	174027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248844
3617	NC_008378	TGA	2	6	174059	174064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248844
3618	NC_008378	TCGA	2	8	174076	174083	25 %	25 %	25 %	25 %	116248844
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3620	NC_008378	TGA	2	6	174233	174238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248844
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