MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008378	GCC	2	6	144008	144013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248816
3002	NC_008378	AG	3	6	144019	144024	50 %	0 %	50 %	0 %	116248816
3003	NC_008378	CCG	3	9	144035	144043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248816
3004	NC_008378	CAG	2	6	144076	144081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248816
3005	NC_008378	ATTGTC	2	12	144107	144118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116248816
3006	NC_008378	GAG	2	6	144233	144238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248817
3007	NC_008378	TCCA	2	8	144242	144249	25 %	25 %	0 %	50 %	116248817
3008	NC_008378	TCC	2	6	144318	144323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248817
3009	NC_008378	GCC	2	6	144334	144339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248817
3010	NC_008378	CGAG	2	8	144382	144389	25 %	0 %	50 %	25 %	116248817
3011	NC_008378	TGCGG	2	10	144410	144419	0 %	20 %	60 %	20 %	116248817
3012	NC_008378	CGA	2	6	144493	144498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248817
3013	NC_008378	AAT	2	6	144517	144522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248817
3014	NC_008378	GAG	2	6	144561	144566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248817
3015	NC_008378	CCA	2	6	144571	144576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248817
3016	NC_008378	CGG	2	6	144610	144615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248817
3017	NC_008378	GTC	3	9	144671	144679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248817
3018	NC_008378	CCGC	2	8	144822	144829	0 %	0 %	25 %	75 %	116248817
3019	NC_008378	CGG	2	6	144847	144852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248817
3020	NC_008378	CGA	2	6	145046	145051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248818
3021	NC_008378	GGC	2	6	145059	145064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248818
3022	NC_008378	GAAAC	2	10	145076	145085	60 %	0 %	20 %	20 %	116248818
3023	NC_008378	GGC	2	6	145089	145094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248818
3024	NC_008378	CGG	2	6	145133	145138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248818
3025	NC_008378	CGC	2	6	145220	145225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248818
3026	NC_008378	GAT	2	6	145263	145268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248818
3027	NC_008378	CGC	2	6	145269	145274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248818
3028	NC_008378	GCC	2	6	145305	145310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248818
3029	NC_008378	TGA	3	9	145337	145345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248818
3030	NC_008378	CGG	2	6	145355	145360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248818
3031	NC_008378	TCA	2	6	145388	145393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248818
3032	NC_008378	TGG	2	6	145465	145470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248818
3033	NC_008378	CCG	2	6	145588	145593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248818
3034	NC_008378	TCG	2	6	145606	145611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248818
3035	NC_008378	CG	3	6	145689	145694	0 %	0 %	50 %	50 %	116248818
3036	NC_008378	CCT	3	9	145747	145755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248819
3037	NC_008378	GCG	2	6	145775	145780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248819
3038	NC_008378	CAT	2	6	145790	145795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248819
3039	NC_008378	AGC	2	6	145815	145820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3040	NC_008378	TCG	2	6	145834	145839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3041	NC_008378	GC	3	6	146033	146038	0 %	0 %	50 %	50 %	116248819
3042	NC_008378	ACG	2	6	146059	146064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3043	NC_008378	CCT	2	6	146065	146070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248819
3044	NC_008378	GCA	2	6	146143	146148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3045	NC_008378	CCA	2	6	146162	146167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248819
3046	NC_008378	CGA	2	6	146194	146199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3047	NC_008378	CGA	2	6	146215	146220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248819
3048	NC_008378	CAT	2	6	146234	146239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248819
3049	NC_008378	AGA	2	6	146257	146262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248819
3050	NC_008378	ATC	2	6	146331	146336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248819
3051	NC_008378	TCA	2	6	146338	146343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248819
3052	NC_008378	AGCG	2	8	146355	146362	25 %	0 %	50 %	25 %	116248819
3053	NC_008378	GCG	2	6	146386	146391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248819
3054	NC_008378	CGG	2	6	146402	146407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248819
3055	NC_008378	GAT	2	6	146450	146455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248819
3056	NC_008378	CAC	2	6	146507	146512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248819
3057	NC_008378	GCC	2	6	146573	146578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248819
3058	NC_008378	TCCT	2	8	146596	146603	0 %	50 %	0 %	50 %	116248820
3059	NC_008378	CGA	2	6	146609	146614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3060	NC_008378	TGC	2	6	146625	146630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3061	NC_008378	ACG	2	6	146659	146664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3062	NC_008378	CGA	2	6	146666	146671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3063	NC_008378	CGG	2	6	146672	146677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248820
3064	NC_008378	GAT	2	6	146712	146717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248820
3065	NC_008378	GAG	2	6	146724	146729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248820
3066	NC_008378	ACC	2	6	146806	146811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248820
3067	NC_008378	GAT	2	6	146835	146840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248820
3068	NC_008378	CAT	2	6	146913	146918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248820
3069	NC_008378	GAT	2	6	146967	146972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248820
3070	NC_008378	CAG	2	6	146991	146996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3071	NC_008378	TGA	2	6	147014	147019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248820
3072	NC_008378	CCT	2	6	147053	147058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248820
3073	NC_008378	GCC	2	6	147071	147076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248820
3074	NC_008378	GCC	2	6	147181	147186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248820
3075	NC_008378	CGA	2	6	147194	147199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3076	NC_008378	CGT	2	6	147237	147242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3077	NC_008378	GTG	2	6	147268	147273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248820
3078	NC_008378	AAG	2	6	147274	147279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248820
3079	NC_008378	GTC	2	6	147322	147327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3080	NC_008378	ATC	3	9	147349	147357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248820
3081	NC_008378	AGC	2	6	147379	147384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248820
3082	NC_008378	GGT	2	6	147450	147455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248820
3083	NC_008378	TGT	2	6	147468	147473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248820
3084	NC_008378	TCAG	2	8	147488	147495	25 %	25 %	25 %	25 %	116248820
3085	NC_008378	CAGG	2	8	147588	147595	25 %	0 %	50 %	25 %	116248821
3086	NC_008378	CGAG	2	8	147646	147653	25 %	0 %	50 %	25 %	116248821
3087	NC_008378	AAG	2	6	147654	147659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248821
3088	NC_008378	TCG	2	6	147684	147689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3089	NC_008378	CGA	2	6	147691	147696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3090	NC_008378	GTC	2	6	147788	147793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3091	NC_008378	CCGCCA	2	12	147895	147906	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116248821
3092	NC_008378	GCC	2	6	147942	147947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248821
3093	NC_008378	AGCACC	2	12	147969	147980	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116248821
3094	NC_008378	CTCGCT	2	12	148001	148012	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116248821
3095	NC_008378	CGC	2	6	148036	148041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248821
3096	NC_008378	TCG	2	6	148113	148118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3097	NC_008378	CCG	2	6	148179	148184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248821
3098	NC_008378	CGC	2	6	148198	148203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248821
3099	NC_008378	GCG	2	6	148384	148389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248821
3100	NC_008378	AAC	2	6	148418	148423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248821
3101	NC_008378	GCT	2	6	148438	148443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3102	NC_008378	GCA	2	6	148462	148467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3103	NC_008378	CGT	2	6	148469	148474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248821
3104	NC_008378	T	6	6	148799	148804	0 %	100 %	0 %	0 %	116248822
3105	NC_008378	GA	3	6	148882	148887	50 %	0 %	50 %	0 %	116248822
3106	NC_008378	T	6	6	148913	148918	0 %	100 %	0 %	0 %	116248822
3107	NC_008378	A	6	6	149025	149030	100 %	0 %	0 %	0 %	116248822
3108	NC_008378	ATTT	2	8	149083	149090	25 %	75 %	0 %	0 %	116248822
3109	NC_008378	ACA	2	6	149242	149247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248823
3110	NC_008378	TCG	2	6	149248	149253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248823
3111	NC_008378	CTG	2	6	149280	149285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248823
3112	NC_008378	CG	4	8	149317	149324	0 %	0 %	50 %	50 %	116248823
3113	NC_008378	GC	3	6	149333	149338	0 %	0 %	50 %	50 %	116248823
3114	NC_008378	CGA	2	6	149474	149479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248823
3115	NC_008378	GC	3	6	149505	149510	0 %	0 %	50 %	50 %	116248823
3116	NC_008378	ACA	2	6	149515	149520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248823
3117	NC_008378	GTC	2	6	149547	149552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248823
3118	NC_008378	CAT	2	6	149567	149572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248823
3119	NC_008378	GGT	2	6	149612	149617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248823
3120	NC_008378	GAA	2	6	149660	149665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248823
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3232	NC_008378	TCG	2	6	154309	154314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248827
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3238	NC_008378	ATCG	2	8	154840	154847	25 %	25 %	25 %	25 %	116248828
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3350	NC_008378	CGCTGG	2	12	160568	160579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248833
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3467	NC_008378	GAC	2	6	166399	166404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248837
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3471	NC_008378	GGCG	2	8	166495	166502	0 %	0 %	75 %	25 %	116248837
3472	NC_008378	AGA	2	6	166541	166546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248837
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3474	NC_008378	GCG	2	6	166640	166645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248837
3475	NC_008378	GAAC	2	8	166690	166697	50 %	0 %	25 %	25 %	116248837
3476	NC_008378	CGT	2	6	166743	166748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248837
3477	NC_008378	CGAAGC	2	12	166749	166760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248837
3478	NC_008378	ATG	2	6	166763	166768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248837
3479	NC_008378	GTC	2	6	166847	166852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248837
3480	NC_008378	CGG	2	6	166978	166983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248837
3481	NC_008378	CCA	2	6	166996	167001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248837
3482	NC_008378	CCT	2	6	167053	167058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248837
3483	NC_008378	AAG	2	6	167089	167094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248837
3484	NC_008378	TGCC	2	8	167117	167124	0 %	25 %	25 %	50 %	116248837
3485	NC_008378	GCGA	2	8	167156	167163	25 %	0 %	50 %	25 %	116248837
3486	NC_008378	GCG	2	6	167518	167523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3487	NC_008378	GGCGAC	2	12	167557	167568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116248838
3488	NC_008378	GCG	2	6	167607	167612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3489	NC_008378	CGA	2	6	167616	167621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248838
3490	NC_008378	CCA	2	6	167627	167632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248838
3491	NC_008378	GCC	2	6	167780	167785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248838
3492	NC_008378	CGG	2	6	167814	167819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3493	NC_008378	CAG	2	6	167833	167838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248838
3494	NC_008378	GCC	3	9	167902	167910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248838
3495	NC_008378	GCCG	2	8	167917	167924	0 %	0 %	50 %	50 %	116248838
3496	NC_008378	CGA	2	6	168018	168023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248838
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3498	NC_008378	GGC	2	6	168069	168074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3499	NC_008378	CGG	2	6	168112	168117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248838
3500	NC_008378	CTT	2	6	168121	168126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248838

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