MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008378	GCA	2	6	120203	120208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248795
2502	NC_008378	TGA	2	6	120227	120232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248795
2503	NC_008378	AGG	2	6	120265	120270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248795
2504	NC_008378	ACG	3	9	120274	120282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248795
2505	NC_008378	GAC	2	6	120327	120332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248795
2506	NC_008378	GCC	2	6	120336	120341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248795
2507	NC_008378	CGTG	2	8	120409	120416	0 %	25 %	50 %	25 %	116248796
2508	NC_008378	GCC	2	6	120432	120437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248796
2509	NC_008378	GCA	2	6	120481	120486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2510	NC_008378	ACG	2	6	120498	120503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2511	NC_008378	ACC	2	6	120515	120520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248796
2512	NC_008378	GTG	2	6	120576	120581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248796
2513	NC_008378	GCC	2	6	120605	120610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248796
2514	NC_008378	GTT	2	6	120617	120622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248796
2515	NC_008378	GCA	2	6	120625	120630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2516	NC_008378	GAC	2	6	120716	120721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2517	NC_008378	GGT	2	6	120782	120787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248796
2518	NC_008378	CG	3	6	120847	120852	0 %	0 %	50 %	50 %	116248796
2519	NC_008378	CGT	2	6	120862	120867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2520	NC_008378	GATC	2	8	120889	120896	25 %	25 %	25 %	25 %	116248796
2521	NC_008378	GAC	2	6	120914	120919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2522	NC_008378	CG	3	6	120983	120988	0 %	0 %	50 %	50 %	116248796
2523	NC_008378	CGG	2	6	120991	120996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2524	NC_008378	CCG	3	9	121003	121011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248796
2525	NC_008378	GCT	2	6	121012	121017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2526	NC_008378	ATC	2	6	121059	121064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248796
2527	NC_008378	GGC	2	6	121079	121084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2528	NC_008378	TCG	2	6	121134	121139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2529	NC_008378	GTA	2	6	121184	121189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248796
2530	NC_008378	GCT	2	6	121202	121207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2531	NC_008378	CGT	2	6	121328	121333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2532	NC_008378	GGC	2	6	121430	121435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2533	NC_008378	CAG	2	6	121436	121441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2534	NC_008378	ACC	2	6	121458	121463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248796
2535	NC_008378	GCG	2	6	121490	121495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2536	NC_008378	GAT	2	6	121504	121509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248796
2537	NC_008378	CAG	2	6	121538	121543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248796
2538	NC_008378	CCGGCG	2	12	121567	121578	0 %	0 %	50 %	50 %	116248796
2539	NC_008378	CGC	2	6	121601	121606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248796
2540	NC_008378	ATC	2	6	121625	121630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248796
2541	NC_008378	GCC	2	6	121641	121646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248796
2542	NC_008378	GCG	2	6	121676	121681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2543	NC_008378	CG	3	6	121714	121719	0 %	0 %	50 %	50 %	116248796
2544	NC_008378	GCCG	2	8	121835	121842	0 %	0 %	50 %	50 %	116248796
2545	NC_008378	GCG	2	6	121900	121905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2546	NC_008378	TCC	2	6	121974	121979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248796
2547	NC_008378	CGG	2	6	122026	122031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248796
2548	NC_008378	ATG	2	6	122070	122075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248796
2549	NC_008378	CGC	2	6	122104	122109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248797
2550	NC_008378	TCACG	2	10	122147	122156	20 %	20 %	20 %	40 %	116248797
2551	NC_008378	TGCA	2	8	122193	122200	25 %	25 %	25 %	25 %	116248797
2552	NC_008378	CGCC	2	8	122218	122225	0 %	0 %	25 %	75 %	116248797
2553	NC_008378	TCG	2	6	122230	122235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248797
2554	NC_008378	CG	3	6	122285	122290	0 %	0 %	50 %	50 %	116248797
2555	NC_008378	ACG	2	6	122350	122355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248797
2556	NC_008378	TCG	2	6	122395	122400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248797
2557	NC_008378	AAT	2	6	122414	122419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248797
2558	NC_008378	GCC	2	6	122427	122432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248797
2559	NC_008378	CTC	3	9	122547	122555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248797
2560	NC_008378	CG	3	6	122558	122563	0 %	0 %	50 %	50 %	116248797
2561	NC_008378	CGA	2	6	122633	122638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248797
2562	NC_008378	TTC	2	6	122647	122652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248797
2563	NC_008378	GCG	2	6	122777	122782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248797
2564	NC_008378	CGTC	2	8	122821	122828	0 %	25 %	25 %	50 %	116248797
2565	NC_008378	CTC	2	6	122853	122858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248797
2566	NC_008378	CG	3	6	122942	122947	0 %	0 %	50 %	50 %	116248797
2567	NC_008378	GCA	2	6	122959	122964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248797
2568	NC_008378	TCA	2	6	122969	122974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248797
2569	NC_008378	CGA	2	6	123001	123006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248798
2570	NC_008378	CG	4	8	123064	123071	0 %	0 %	50 %	50 %	116248798
2571	NC_008378	GC	4	8	123172	123179	0 %	0 %	50 %	50 %	116248798
2572	NC_008378	GAT	2	6	123194	123199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248798
2573	NC_008378	AGC	2	6	123267	123272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248798
2574	NC_008378	GAT	2	6	123275	123280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248798
2575	NC_008378	GAC	2	6	123488	123493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248798
2576	NC_008378	CTG	2	6	123499	123504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248798
2577	NC_008378	GTCCG	2	10	123575	123584	0 %	20 %	40 %	40 %	116248798
2578	NC_008378	TGA	2	6	123585	123590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248798
2579	NC_008378	GAT	2	6	123689	123694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248798
2580	NC_008378	GTC	2	6	123797	123802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248798
2581	NC_008378	TGGG	2	8	123819	123826	0 %	25 %	75 %	0 %	116248798
2582	NC_008378	GAC	2	6	123920	123925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248798
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2584	NC_008378	CGA	2	6	124103	124108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248799
2585	NC_008378	CAA	2	6	124109	124114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248799
2586	NC_008378	GGC	3	9	124124	124132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248799
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2588	NC_008378	GCA	2	6	124216	124221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248799
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2590	NC_008378	TGCGA	2	10	124371	124380	20 %	20 %	40 %	20 %	116248799
2591	NC_008378	GAC	2	6	124385	124390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248799
2592	NC_008378	CCG	2	6	124395	124400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248799
2593	NC_008378	GCG	2	6	124483	124488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248799
2594	NC_008378	CCAT	2	8	124509	124516	25 %	25 %	0 %	50 %	116248799
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2597	NC_008378	TCG	2	6	124707	124712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248799
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2599	NC_008378	CGC	2	6	124730	124735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248799
2600	NC_008378	TGC	2	6	124748	124753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248799
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2602	NC_008378	ATG	2	6	124803	124808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248799
2603	NC_008378	CTG	2	6	124828	124833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248800
2604	NC_008378	CGG	2	6	124834	124839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248800
2605	NC_008378	CT	3	6	124849	124854	0 %	50 %	0 %	50 %	116248800
2606	NC_008378	CGC	2	6	124914	124919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248800
2607	NC_008378	ATG	2	6	124931	124936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248800
2608	NC_008378	GAC	2	6	124948	124953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248800
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2610	NC_008378	CAG	2	6	124990	124995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248800
2611	NC_008378	GC	3	6	125103	125108	0 %	0 %	50 %	50 %	116248800
2612	NC_008378	CCA	2	6	125147	125152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248800
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2615	NC_008378	GCTG	2	8	125324	125331	0 %	25 %	50 %	25 %	116248800
2616	NC_008378	GGC	3	9	125348	125356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248800
2617	NC_008378	GA	3	6	125378	125383	50 %	0 %	50 %	0 %	116248800
2618	NC_008378	GCG	2	6	125467	125472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248800
2619	NC_008378	CCGC	2	8	125489	125496	0 %	0 %	25 %	75 %	116248800
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2621	NC_008378	CAGC	2	8	125641	125648	25 %	0 %	25 %	50 %	116248800
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2862	NC_008378	TGC	2	6	137677	137682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248810
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2981	NC_008378	TGG	2	6	143088	143093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248816
2982	NC_008378	AAT	2	6	143100	143105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248816
2983	NC_008378	CGA	2	6	143163	143168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248816
2984	NC_008378	CCTT	2	8	143228	143235	0 %	50 %	0 %	50 %	116248816
2985	NC_008378	CCG	2	6	143283	143288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248816
2986	NC_008378	GAC	2	6	143305	143310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248816
2987	NC_008378	AG	3	6	143358	143363	50 %	0 %	50 %	0 %	116248816
2988	NC_008378	CCTT	2	8	143375	143382	0 %	50 %	0 %	50 %	116248816
2989	NC_008378	CTT	3	9	143380	143388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248816
2990	NC_008378	TCG	2	6	143411	143416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248816
2991	NC_008378	GCG	2	6	143423	143428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248816
2992	NC_008378	TCG	2	6	143576	143581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248816
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2994	NC_008378	CGTC	2	8	143658	143665	0 %	25 %	25 %	50 %	116248816
2995	NC_008378	CGA	2	6	143676	143681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248816
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2997	NC_008378	CGC	2	6	143904	143909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248816
2998	NC_008378	GCC	2	6	143912	143917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248816
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