MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008378	GGCC	2	8	48337	48344	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1002	NC_008378	ACG	2	6	48348	48353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1003	NC_008378	AAG	2	6	48446	48451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248724
1004	NC_008378	GC	3	6	48513	48518	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1005	NC_008378	GCG	2	6	48522	48527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248724
1006	NC_008378	GAG	2	6	48533	48538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248724
1007	NC_008378	CG	3	6	48564	48569	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1008	NC_008378	TCG	2	6	48579	48584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1009	NC_008378	TGC	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1010	NC_008378	CGT	2	6	48712	48717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1011	NC_008378	GAA	2	6	48796	48801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248724
1012	NC_008378	ATC	2	6	48830	48835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248724
1013	NC_008378	GGC	2	6	48859	48864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248724
1014	NC_008378	CGA	2	6	48870	48875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1015	NC_008378	CTGCG	2	10	48889	48898	0 %	20 %	40 %	40 %	116248724
1016	NC_008378	GCC	2	6	49203	49208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248725
1017	NC_008378	CTT	2	6	49216	49221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248725
1018	NC_008378	TTC	2	6	49256	49261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248725
1019	NC_008378	TGC	2	6	49305	49310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1020	NC_008378	CGC	2	6	49332	49337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248725
1021	NC_008378	GGCG	2	8	49342	49349	0 %	0 %	75 %	25 %	116248725
1022	NC_008378	GCG	2	6	49382	49387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248725
1023	NC_008378	GTG	2	6	49391	49396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248725
1024	NC_008378	TGC	2	6	49509	49514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1025	NC_008378	CAA	2	6	49525	49530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248725
1026	NC_008378	CGT	2	6	49558	49563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1027	NC_008378	GGT	2	6	49603	49608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248725
1028	NC_008378	CGA	2	6	49644	49649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1029	NC_008378	CGA	2	6	49689	49694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1030	NC_008378	GCTG	2	8	49698	49705	0 %	25 %	50 %	25 %	116248725
1031	NC_008378	GCG	2	6	49708	49713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248725
1032	NC_008378	GAT	2	6	49850	49855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248726
1033	NC_008378	ACG	2	6	49880	49885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248726
1034	NC_008378	CACG	2	8	49906	49913	25 %	0 %	25 %	50 %	116248726
1035	NC_008378	TCT	2	6	49972	49977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248726
1036	NC_008378	TGC	2	6	49981	49986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248726
1037	NC_008378	CCG	2	6	50059	50064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248726
1038	NC_008378	CG	3	6	50095	50100	0 %	0 %	50 %	50 %	116248726
1039	NC_008378	GGC	2	6	50111	50116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248726
1040	NC_008378	CCA	2	6	50122	50127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248726
1041	NC_008378	GAT	2	6	50183	50188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248726
1042	NC_008378	ATT	2	6	50203	50208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248726
1043	NC_008378	CGC	2	6	50230	50235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248726
1044	NC_008378	TCT	2	6	50332	50337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248726
1045	NC_008378	TCA	2	6	50344	50349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248726
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1047	NC_008378	GGAT	2	8	50398	50405	25 %	25 %	50 %	0 %	116248726
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1050	NC_008378	GGA	2	6	50461	50466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248727
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1052	NC_008378	CGT	2	6	50628	50633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248727
1053	NC_008378	GGC	2	6	50734	50739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1054	NC_008378	GCC	2	6	50747	50752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248727
1055	NC_008378	CGT	2	6	50767	50772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248727
1056	NC_008378	CGG	2	6	50781	50786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1057	NC_008378	CCG	2	6	50787	50792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248727
1058	NC_008378	GCCG	2	8	50859	50866	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
1059	NC_008378	ATT	2	6	50874	50879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248727
1060	NC_008378	CG	3	6	50977	50982	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
1061	NC_008378	CGG	2	6	51027	51032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1062	NC_008378	GCA	2	6	51038	51043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248727
1063	NC_008378	GTC	2	6	51083	51088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248727
1064	NC_008378	GCG	2	6	51129	51134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1065	NC_008378	TGA	2	6	51165	51170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248727
1066	NC_008378	GGA	2	6	51224	51229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248728
1067	NC_008378	GCG	2	6	51240	51245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1068	NC_008378	GCCG	2	8	51255	51262	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1069	NC_008378	CAT	2	6	51339	51344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248728
1070	NC_008378	GAC	2	6	51347	51352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1071	NC_008378	GCGCG	2	10	51368	51377	0 %	0 %	60 %	40 %	116248728
1072	NC_008378	GCCG	2	8	51401	51408	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1073	NC_008378	CG	3	6	51415	51420	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1074	NC_008378	CGT	2	6	51422	51427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
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1083	NC_008378	CGGC	2	8	51757	51764	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1084	NC_008378	CGA	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1085	NC_008378	GAG	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248728
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1087	NC_008378	GCG	2	6	51907	51912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1088	NC_008378	CGA	2	6	51962	51967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1089	NC_008378	CTG	2	6	51975	51980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1090	NC_008378	ATGCCT	2	12	52012	52023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116248728
1091	NC_008378	TCG	2	6	52036	52041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
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1093	NC_008378	TCG	2	6	52105	52110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
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1096	NC_008378	GGC	2	6	52169	52174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1097	NC_008378	GCG	2	6	52180	52185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1098	NC_008378	GA	3	6	52188	52193	50 %	0 %	50 %	0 %	116248728
1099	NC_008378	GAT	2	6	52204	52209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248729
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1102	NC_008378	ATG	2	6	52463	52468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248729
1103	NC_008378	TGC	2	6	52470	52475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248729
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1105	NC_008378	GC	3	6	52685	52690	0 %	0 %	50 %	50 %	116248729
1106	NC_008378	TGC	2	6	52693	52698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248729
1107	NC_008378	CAC	3	9	52801	52809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248729
1108	NC_008378	ATC	2	6	52826	52831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248729
1109	NC_008378	GCC	2	6	52910	52915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248729
1110	NC_008378	CGG	2	6	52920	52925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248729
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1112	NC_008378	CCGG	2	8	53046	53053	0 %	0 %	50 %	50 %	116248729
1113	NC_008378	CG	3	6	53262	53267	0 %	0 %	50 %	50 %	116248730
1114	NC_008378	CTG	2	6	53311	53316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
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1119	NC_008378	GCG	2	6	53626	53631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248730
1120	NC_008378	TCG	2	6	53660	53665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
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1122	NC_008378	TCG	2	6	53744	53749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
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1124	NC_008378	GCT	2	6	53880	53885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
1125	NC_008378	CCGCA	2	10	53906	53915	20 %	0 %	20 %	60 %	116248730
1126	NC_008378	GAC	2	6	53926	53931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248730
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1129	NC_008378	GCT	2	6	53975	53980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
1130	NC_008378	ATC	2	6	53990	53995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248730
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1133	NC_008378	CCG	2	6	54205	54210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248730
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1164	NC_008378	GGC	2	6	55812	55817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248732
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1239	NC_008378	TGGA	2	8	59624	59631	25 %	25 %	50 %	0 %	116248735
1240	NC_008378	CCG	2	6	59642	59647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248735
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1244	NC_008378	CTC	2	6	59811	59816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248736
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1248	NC_008378	AGC	2	6	59905	59910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248736
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1367	NC_008378	GGCCG	2	10	65866	65875	0 %	0 %	60 %	40 %	116248741
1368	NC_008378	CGA	2	6	65876	65881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248741
1369	NC_008378	CGC	2	6	65942	65947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248741
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1494	NC_008378	GC	3	6	71784	71789	0 %	0 %	50 %	50 %	116248745
1495	NC_008378	CGG	2	6	71834	71839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248745
1496	NC_008378	TGGCGA	2	12	71884	71895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116248745
1497	NC_008378	GCC	3	9	71921	71929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248745
1498	NC_008378	AAGGC	2	10	71931	71940	40 %	0 %	40 %	20 %	116248745
1499	NC_008378	CGG	2	6	71947	71952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248745
1500	NC_008378	CG	4	8	72001	72008	0 %	0 %	50 %	50 %	116248745

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