MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008378	CCAT	2	8	634882	634889	25 %	25 %	0 %	50 %	116249249
13002	NC_008378	CGG	2	6	634962	634967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249249
13003	NC_008378	CGT	2	6	635013	635018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
13004	NC_008378	CG	3	6	635026	635031	0 %	0 %	50 %	50 %	116249249
13005	NC_008378	CGC	2	6	635079	635084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249249
13006	NC_008378	GGTC	2	8	635148	635155	0 %	25 %	50 %	25 %	116249249
13007	NC_008378	TGC	2	6	635305	635310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
13008	NC_008378	CG	3	6	635323	635328	0 %	0 %	50 %	50 %	116249249
13009	NC_008378	CCG	2	6	635355	635360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249249
13010	NC_008378	CGG	2	6	635493	635498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249249
13011	NC_008378	CGG	2	6	635535	635540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249249
13012	NC_008378	GTC	2	6	635587	635592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
13013	NC_008378	GTC	2	6	635684	635689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
13014	NC_008378	ACATGC	2	12	635697	635708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116249249
13015	NC_008378	ACG	2	6	636176	636181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13016	NC_008378	CG	4	8	636191	636198	0 %	0 %	50 %	50 %	116249250
13017	NC_008378	CTG	2	6	636199	636204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13018	NC_008378	GCT	2	6	636221	636226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13019	NC_008378	GCC	2	6	636265	636270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249250
13020	NC_008378	GC	3	6	636285	636290	0 %	0 %	50 %	50 %	116249250
13021	NC_008378	TCA	2	6	636317	636322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249250
13022	NC_008378	GGT	2	6	636381	636386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249250
13023	NC_008378	GAG	2	6	636400	636405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249250
13024	NC_008378	GTG	2	6	636421	636426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249250
13025	NC_008378	TGCCCA	2	12	636447	636458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116249250
13026	NC_008378	TTC	2	6	636511	636516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249250
13027	NC_008378	GCC	2	6	636523	636528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249250
13028	NC_008378	GAG	2	6	636601	636606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249250
13029	NC_008378	GCC	2	6	636682	636687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249250
13030	NC_008378	ATC	2	6	636715	636720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249250
13031	NC_008378	ACG	2	6	636743	636748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13032	NC_008378	TCG	2	6	636767	636772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13033	NC_008378	AGC	2	6	636845	636850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13034	NC_008378	ACG	2	6	636899	636904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249250
13035	NC_008378	TGG	2	6	637035	637040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249251
13036	NC_008378	GAC	2	6	637094	637099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249251
13037	NC_008378	GAC	2	6	637131	637136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249251
13038	NC_008378	TCG	2	6	637141	637146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249251
13039	NC_008378	ATCG	2	8	637236	637243	25 %	25 %	25 %	25 %	116249251
13040	NC_008378	CCG	2	6	637249	637254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249251
13041	NC_008378	CGG	2	6	637303	637308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249251
13042	NC_008378	CG	3	6	637337	637342	0 %	0 %	50 %	50 %	116249251
13043	NC_008378	GCT	2	6	637430	637435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249251
13044	NC_008378	GGT	2	6	637533	637538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249251
13045	NC_008378	CG	3	6	637597	637602	0 %	0 %	50 %	50 %	116249251
13046	NC_008378	GCGG	2	8	637604	637611	0 %	0 %	75 %	25 %	116249251
13047	NC_008378	GAG	2	6	637728	637733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249251
13048	NC_008378	GC	3	6	637772	637777	0 %	0 %	50 %	50 %	116249251
13049	NC_008378	GCC	2	6	637854	637859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249251
13050	NC_008378	GCG	2	6	637888	637893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249251
13051	NC_008378	TCGC	2	8	637920	637927	0 %	25 %	25 %	50 %	116249251
13052	NC_008378	CGC	2	6	637951	637956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249251
13053	NC_008378	GC	3	6	637969	637974	0 %	0 %	50 %	50 %	116249251
13054	NC_008378	CTT	2	6	637979	637984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249251
13055	NC_008378	CGC	2	6	638003	638008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249251
13056	NC_008378	TCA	2	6	638023	638028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249251
13057	NC_008378	GAT	2	6	638054	638059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249251
13058	NC_008378	GGCCT	2	10	638119	638128	0 %	20 %	40 %	40 %	116249251
13059	NC_008378	ATCA	2	8	638139	638146	50 %	25 %	0 %	25 %	116249251
13060	NC_008378	GAAA	2	8	638185	638192	75 %	0 %	25 %	0 %	116249252
13061	NC_008378	CTC	2	6	638198	638203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249252
13062	NC_008378	TCG	2	6	638340	638345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249252
13063	NC_008378	ATCT	2	8	638366	638373	25 %	50 %	0 %	25 %	116249252
13064	NC_008378	GAC	2	6	638374	638379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249252
13065	NC_008378	ATCCT	2	10	638436	638445	20 %	40 %	0 %	40 %	116249252
13066	NC_008378	GGA	2	6	638518	638523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249252
13067	NC_008378	GCC	2	6	638573	638578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249252
13068	NC_008378	GC	3	6	638591	638596	0 %	0 %	50 %	50 %	116249252
13069	NC_008378	CCA	2	6	638631	638636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249252
13070	NC_008378	CGC	2	6	638713	638718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249252
13071	NC_008378	GCT	2	6	638764	638769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249252
13072	NC_008378	TGA	2	6	638799	638804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249252
13073	NC_008378	GGT	2	6	638849	638854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249252
13074	NC_008378	CA	3	6	638914	638919	50 %	0 %	0 %	50 %	116249253
13075	NC_008378	CGCGG	2	10	639014	639023	0 %	0 %	60 %	40 %	116249253
13076	NC_008378	TCG	3	9	639027	639035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249253
13077	NC_008378	CG	3	6	639038	639043	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
13078	NC_008378	CTT	2	6	639058	639063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249253
13079	NC_008378	GCG	2	6	639131	639136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
13080	NC_008378	CG	3	6	639236	639241	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
13081	NC_008378	GCG	2	6	639272	639277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
13082	NC_008378	GCCG	2	8	639311	639318	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
13083	NC_008378	CAT	2	6	639328	639333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249253
13084	NC_008378	GGT	2	6	639394	639399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249253
13085	NC_008378	GCGT	2	8	639435	639442	0 %	25 %	50 %	25 %	116249253
13086	NC_008378	CTG	2	6	639490	639495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249253
13087	NC_008378	GAC	2	6	639511	639516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249253
13088	NC_008378	CG	3	6	639579	639584	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
13089	NC_008378	CGA	2	6	639595	639600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249253
13090	NC_008378	GCG	2	6	639602	639607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
13091	NC_008378	CGG	2	6	639637	639642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
13092	NC_008378	GCCGCT	2	12	639670	639681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249253
13093	NC_008378	CGC	2	6	639720	639725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249253
13094	NC_008378	AG	3	6	639745	639750	50 %	0 %	50 %	0 %	116249253
13095	NC_008378	ATG	2	6	639752	639757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249253
13096	NC_008378	GCG	2	6	639773	639778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
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13098	NC_008378	CCG	2	6	639850	639855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249253
13099	NC_008378	CGT	2	6	640130	640135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249254
13100	NC_008378	GC	3	6	640154	640159	0 %	0 %	50 %	50 %	116249254
13101	NC_008378	CGC	2	6	640274	640279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249254
13102	NC_008378	CGG	2	6	640308	640313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249254
13103	NC_008378	CG	5	10	640323	640332	0 %	0 %	50 %	50 %	116249254
13104	NC_008378	GCG	2	6	640367	640372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249254
13105	NC_008378	GTGA	2	8	640446	640453	25 %	25 %	50 %	0 %	116249254
13106	NC_008378	AAGG	2	8	640458	640465	50 %	0 %	50 %	0 %	116249254
13107	NC_008378	AAG	2	6	640555	640560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249254
13108	NC_008378	CGAT	2	8	640589	640596	25 %	25 %	25 %	25 %	116249254
13109	NC_008378	CGG	2	6	640711	640716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249254
13110	NC_008378	CGG	2	6	640808	640813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249254
13111	NC_008378	CGT	3	9	640893	640901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249254
13112	NC_008378	GAA	2	6	640932	640937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249254
13113	NC_008378	CGA	2	6	641045	641050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249255
13114	NC_008378	GAA	2	6	641066	641071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249255
13115	NC_008378	GTGC	2	8	641139	641146	0 %	25 %	50 %	25 %	116249255
13116	NC_008378	ATC	2	6	641151	641156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249255
13117	NC_008378	TGG	2	6	641157	641162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249255
13118	NC_008378	GAT	2	6	641204	641209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249255
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13120	NC_008378	CGG	2	6	641332	641337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249255
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13354	NC_008378	TGGAGG	2	12	652230	652241	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116249266
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13358	NC_008378	TCG	2	6	652395	652400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249266
13359	NC_008378	TCG	2	6	652412	652417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249266
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13477	NC_008378	GCC	2	6	657259	657264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249270
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