MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008378	GCC	2	6	23283	23288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
502	NC_008378	GCCGA	2	10	23327	23336	20 %	0 %	40 %	40 %	116248700
503	NC_008378	CGC	2	6	23350	23355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
504	NC_008378	GGC	2	6	23356	23361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248700
505	NC_008378	CCA	2	6	23364	23369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248700
506	NC_008378	GTC	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248700
507	NC_008378	GC	3	6	23531	23536	0 %	0 %	50 %	50 %	116248700
508	NC_008378	CCG	2	6	23547	23552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
509	NC_008378	CG	3	6	23551	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	116248700
510	NC_008378	GCA	2	6	23564	23569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248700
511	NC_008378	CGC	2	6	23604	23609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
512	NC_008378	GCG	2	6	23616	23621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248700
513	NC_008378	GCGA	2	8	23636	23643	25 %	0 %	50 %	25 %	116248700
514	NC_008378	CAC	2	6	23659	23664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248700
515	NC_008378	GCG	2	6	24053	24058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
516	NC_008378	GC	3	6	24075	24080	0 %	0 %	50 %	50 %	116248701
517	NC_008378	CGG	2	6	24090	24095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
518	NC_008378	GAT	2	6	24123	24128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248701
519	NC_008378	CGGCG	2	10	24260	24269	0 %	0 %	60 %	40 %	116248701
520	NC_008378	GCG	2	6	24283	24288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
521	NC_008378	CG	3	6	24344	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	116248701
522	NC_008378	TCCT	2	8	24432	24439	0 %	50 %	0 %	50 %	116248701
523	NC_008378	GCT	2	6	24453	24458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248701
524	NC_008378	CT	3	6	24491	24496	0 %	50 %	0 %	50 %	116248701
525	NC_008378	TGGGT	2	10	24509	24518	0 %	40 %	60 %	0 %	116248701
526	NC_008378	GGC	2	6	24544	24549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
527	NC_008378	CAG	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248701
528	NC_008378	CGA	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248701
529	NC_008378	GGC	2	6	24570	24575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
530	NC_008378	CGG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
531	NC_008378	GAA	2	6	24724	24729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248701
532	NC_008378	CTG	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248701
533	NC_008378	CCG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248701
534	NC_008378	TGA	2	6	24968	24973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248702
535	NC_008378	CG	3	6	24983	24988	0 %	0 %	50 %	50 %	116248702
536	NC_008378	GGA	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248702
537	NC_008378	GAC	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
538	NC_008378	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
539	NC_008378	GATC	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	116248702
540	NC_008378	TGG	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248702
541	NC_008378	CGA	2	6	25163	25168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
542	NC_008378	GCC	2	6	25170	25175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248702
543	NC_008378	GCC	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248702
544	NC_008378	ACG	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
545	NC_008378	TTG	2	6	25312	25317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248702
546	NC_008378	GCA	2	6	25343	25348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
547	NC_008378	GAT	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248702
548	NC_008378	GCT	2	6	25514	25519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248702
549	NC_008378	GAA	2	6	25572	25577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248702
550	NC_008378	GTGC	2	8	25594	25601	0 %	25 %	50 %	25 %	116248702
551	NC_008378	CTG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248702
552	NC_008378	GGGC	2	8	26010	26017	0 %	0 %	75 %	25 %	116248703
553	NC_008378	GGCGC	2	10	26086	26095	0 %	0 %	60 %	40 %	116248703
554	NC_008378	GGT	2	6	26143	26148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248703
555	NC_008378	CCG	2	6	26156	26161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248703
556	NC_008378	GCG	2	6	26246	26251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
557	NC_008378	CGC	3	9	26295	26303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248703
558	NC_008378	GTC	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
559	NC_008378	CGG	2	6	26355	26360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
560	NC_008378	GCT	2	6	26529	26534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
561	NC_008378	GC	3	6	26565	26570	0 %	0 %	50 %	50 %	116248703
562	NC_008378	GTC	2	6	26587	26592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
563	NC_008378	TCAT	2	8	26651	26658	25 %	50 %	0 %	25 %	116248703
564	NC_008378	GGA	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248703
565	NC_008378	GGC	3	9	26685	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
566	NC_008378	CAT	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248704
567	NC_008378	CGGC	2	8	26783	26790	0 %	0 %	50 %	50 %	116248704
568	NC_008378	GGC	2	6	26824	26829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
569	NC_008378	TTG	2	6	26846	26851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248704
570	NC_008378	CGG	2	6	26865	26870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
571	NC_008378	GGCT	2	8	26874	26881	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
572	NC_008378	GGCT	2	8	26887	26894	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
573	NC_008378	TCCGT	2	10	26990	26999	0 %	40 %	20 %	40 %	116248704
574	NC_008378	ATG	4	12	27038	27049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248704
575	NC_008378	TGC	2	6	27050	27055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248704
576	NC_008378	CTG	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248704
577	NC_008378	GC	4	8	27148	27155	0 %	0 %	50 %	50 %	116248704
578	NC_008378	CGGT	2	8	27197	27204	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
579	NC_008378	CGAC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	25 %	50 %	116248704
580	NC_008378	ATC	2	6	27236	27241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248704
581	NC_008378	GGAA	2	8	27263	27270	50 %	0 %	50 %	0 %	116248704
582	NC_008378	GAT	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248704
583	NC_008378	CCG	2	6	27329	27334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248704
584	NC_008378	AG	3	6	27374	27379	50 %	0 %	50 %	0 %	116248704
585	NC_008378	CGG	2	6	27518	27523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
586	NC_008378	GCC	2	6	27526	27531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248704
587	NC_008378	ATGG	2	8	27591	27598	25 %	25 %	50 %	0 %	116248704
588	NC_008378	GGA	2	6	27977	27982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248705
589	NC_008378	ATG	2	6	28071	28076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248705
590	NC_008378	CAG	2	6	28156	28161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248705
591	NC_008378	CGG	2	6	28177	28182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248705
592	NC_008378	ACA	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248705
593	NC_008378	CAA	2	6	28375	28380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248705
594	NC_008378	CGG	2	6	28396	28401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248705
595	NC_008378	CCAGCG	2	12	28402	28413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116248705
596	NC_008378	GAC	2	6	28546	28551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248705
597	NC_008378	CAG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248705
598	NC_008378	GCGG	2	8	28734	28741	0 %	0 %	75 %	25 %	116248705
599	NC_008378	CGA	2	6	28890	28895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248705
600	NC_008378	TCGA	2	8	28913	28920	25 %	25 %	25 %	25 %	116248705
601	NC_008378	GCC	2	6	29012	29017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248705
602	NC_008378	CG	3	6	29026	29031	0 %	0 %	50 %	50 %	116248705
603	NC_008378	ATCG	2	8	29065	29072	25 %	25 %	25 %	25 %	116248705
604	NC_008378	ACG	2	6	29285	29290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248706
605	NC_008378	A	6	6	29437	29442	100 %	0 %	0 %	0 %	116248706
606	NC_008378	GGC	2	6	29612	29617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248706
607	NC_008378	GCAC	2	8	29749	29756	25 %	0 %	25 %	50 %	116248706
608	NC_008378	GAA	2	6	29810	29815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248706
609	NC_008378	CCA	2	6	29821	29826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248706
610	NC_008378	CTA	2	6	29849	29854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248706
611	NC_008378	GAGC	2	8	29937	29944	25 %	0 %	50 %	25 %	116248706
612	NC_008378	CGTGGA	2	12	29963	29974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116248706
613	NC_008378	GCA	2	6	30064	30069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248706
614	NC_008378	GAT	2	6	30246	30251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248706
615	NC_008378	TCCG	2	8	30261	30268	0 %	25 %	25 %	50 %	116248706
616	NC_008378	GC	3	6	30285	30290	0 %	0 %	50 %	50 %	116248706
617	NC_008378	GCTG	2	8	30317	30324	0 %	25 %	50 %	25 %	116248706
618	NC_008378	TGA	2	6	30342	30347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248706
619	NC_008378	GGAAC	2	10	30377	30386	40 %	0 %	40 %	20 %	116248707
620	NC_008378	CAATA	2	10	30434	30443	60 %	20 %	0 %	20 %	116248707
621	NC_008378	ATC	2	6	30476	30481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248707
622	NC_008378	GCG	2	6	30512	30517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248707
623	NC_008378	AGC	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248707
624	NC_008378	ATCC	2	8	30566	30573	25 %	25 %	0 %	50 %	116248707
625	NC_008378	CCG	2	6	30579	30584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248707
626	NC_008378	GGCC	2	8	30592	30599	0 %	0 %	50 %	50 %	116248707
627	NC_008378	CGA	2	6	30642	30647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248707
628	NC_008378	CG	3	6	30672	30677	0 %	0 %	50 %	50 %	116248707
629	NC_008378	GGC	2	6	30754	30759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248707
630	NC_008378	GTC	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248707
631	NC_008378	AGC	2	6	30927	30932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248707
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633	NC_008378	CCG	2	6	31023	31028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248707
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635	NC_008378	GGC	2	6	31135	31140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248707
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642	NC_008378	CGC	2	6	31448	31453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248708
643	NC_008378	CGG	2	6	31464	31469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248708
644	NC_008378	GCG	2	6	31483	31488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248708
645	NC_008378	ATC	2	6	31537	31542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248708
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659	NC_008378	TTG	2	6	32190	32195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248709
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680	NC_008378	GCA	2	6	32881	32886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248710
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735	NC_008378	GC	3	6	36216	36221	0 %	0 %	50 %	50 %	116248712
736	NC_008378	TTCGAC	2	12	36231	36242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116248712
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740	NC_008378	TGC	2	6	36354	36359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248713
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743	NC_008378	CTA	2	6	36430	36435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248713
744	NC_008378	ATT	2	6	36483	36488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248713
745	NC_008378	GAT	2	6	36568	36573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248713
746	NC_008378	CGT	2	6	36580	36585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248713
747	NC_008378	CTTC	2	8	36618	36625	0 %	50 %	0 %	50 %	116248713
748	NC_008378	CGGG	2	8	36649	36656	0 %	0 %	75 %	25 %	116248713
749	NC_008378	TGTTGA	2	12	36660	36671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116248713
750	NC_008378	GAC	2	6	36817	36822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248713
751	NC_008378	GATCGA	2	12	36841	36852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116248713
752	NC_008378	GGC	2	6	36856	36861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248713
753	NC_008378	TCG	2	6	36864	36869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248713
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