MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008378	CGG	2	6	240094	240099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248900
5002	NC_008378	GCG	2	6	240100	240105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248900
5003	NC_008378	CCT	2	6	240185	240190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248900
5004	NC_008378	TAT	2	6	240191	240196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248900
5005	NC_008378	TC	3	6	240354	240359	0 %	50 %	0 %	50 %	116248900
5006	NC_008378	CTT	2	6	240381	240386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248900
5007	NC_008378	GCC	2	6	240394	240399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248900
5008	NC_008378	CGT	2	6	240452	240457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248900
5009	NC_008378	TCT	2	6	240491	240496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248900
5010	NC_008378	T	6	6	240633	240638	0 %	100 %	0 %	0 %	116248900
5011	NC_008378	TGG	2	6	240655	240660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248900
5012	NC_008378	ACC	2	6	240768	240773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248900
5013	NC_008378	CAT	2	6	240776	240781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248900
5014	NC_008378	CCT	2	6	240788	240793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248900
5015	NC_008378	CCG	2	6	240802	240807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248900
5016	NC_008378	CGC	2	6	240911	240916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248900
5017	NC_008378	TGT	2	6	241117	241122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248900
5018	NC_008378	GATTT	2	10	241133	241142	20 %	60 %	20 %	0 %	116248900
5019	NC_008378	GCG	2	6	241301	241306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248901
5020	NC_008378	CGCTG	2	10	241313	241322	0 %	20 %	40 %	40 %	116248901
5021	NC_008378	AGG	2	6	241361	241366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248901
5022	NC_008378	TGC	2	6	241369	241374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5023	NC_008378	AC	3	6	241471	241476	50 %	0 %	0 %	50 %	116248901
5024	NC_008378	CGA	2	6	241528	241533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5025	NC_008378	GCC	2	6	241571	241576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248901
5026	NC_008378	CAT	2	6	241583	241588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248901
5027	NC_008378	CG	3	6	241612	241617	0 %	0 %	50 %	50 %	116248901
5028	NC_008378	ATC	2	6	241619	241624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248901
5029	NC_008378	GCG	2	6	241638	241643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248901
5030	NC_008378	GTG	3	9	241704	241712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248901
5031	NC_008378	GGATC	2	10	241735	241744	20 %	20 %	40 %	20 %	116248901
5032	NC_008378	GCC	2	6	241764	241769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248901
5033	NC_008378	CAG	2	6	241784	241789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5034	NC_008378	GCC	2	6	241799	241804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248901
5035	NC_008378	CGC	2	6	241823	241828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248901
5036	NC_008378	CGGT	2	8	241863	241870	0 %	25 %	50 %	25 %	116248901
5037	NC_008378	TGG	2	6	241905	241910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248901
5038	NC_008378	CGG	2	6	241924	241929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248901
5039	NC_008378	GAC	2	6	241931	241936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5040	NC_008378	CAG	2	6	241982	241987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5041	NC_008378	CAAA	2	8	242016	242023	75 %	0 %	0 %	25 %	116248901
5042	NC_008378	GAC	2	6	242042	242047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5043	NC_008378	CCA	2	6	242149	242154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248901
5044	NC_008378	ACG	2	6	242157	242162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
5045	NC_008378	TCG	2	6	242369	242374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5046	NC_008378	TCG	2	6	242378	242383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5047	NC_008378	GAT	2	6	242448	242453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248902
5048	NC_008378	TCG	2	6	242500	242505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5049	NC_008378	CGG	2	6	242543	242548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248902
5050	NC_008378	TGC	2	6	242629	242634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5051	NC_008378	CAT	2	6	242751	242756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248902
5052	NC_008378	GAT	2	6	242802	242807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248902
5053	NC_008378	CGAT	2	8	242818	242825	25 %	25 %	25 %	25 %	116248902
5054	NC_008378	TGC	3	9	242844	242852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5055	NC_008378	ACG	2	6	242926	242931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5056	NC_008378	AAC	2	6	242962	242967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248902
5057	NC_008378	CGAT	2	8	242986	242993	25 %	25 %	25 %	25 %	116248902
5058	NC_008378	G	6	6	243032	243037	0 %	0 %	100 %	0 %	116248902
5059	NC_008378	GC	3	6	243040	243045	0 %	0 %	50 %	50 %	116248902
5060	NC_008378	GTC	2	6	243064	243069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5061	NC_008378	TTG	2	6	243100	243105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248902
5062	NC_008378	GGC	2	6	243162	243167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248902
5063	NC_008378	C	6	6	243224	243229	0 %	0 %	0 %	100 %	116248902
5064	NC_008378	TCG	2	6	243322	243327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5065	NC_008378	TCA	2	6	243365	243370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248902
5066	NC_008378	GAA	2	6	243377	243382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248902
5067	NC_008378	GCC	2	6	243450	243455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248902
5068	NC_008378	GCC	2	6	243465	243470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248902
5069	NC_008378	CTT	2	6	243486	243491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248902
5070	NC_008378	TTG	2	6	243496	243501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248902
5071	NC_008378	GTC	3	9	243588	243596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5072	NC_008378	GCC	2	6	243633	243638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248902
5073	NC_008378	CCA	2	6	243656	243661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248902
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5075	NC_008378	CGA	2	6	243725	243730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248902
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5080	NC_008378	CAT	2	6	244064	244069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248903
5081	NC_008378	TCG	2	6	244080	244085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248903
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5084	NC_008378	ACGC	2	8	244136	244143	25 %	0 %	25 %	50 %	116248903
5085	NC_008378	ATA	2	6	244202	244207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248903
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5090	NC_008378	GCC	2	6	244365	244370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
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5092	NC_008378	GCT	2	6	244484	244489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5093	NC_008378	TGG	2	6	244538	244543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248904
5094	NC_008378	CG	3	6	244564	244569	0 %	0 %	50 %	50 %	116248904
5095	NC_008378	GCA	2	6	244607	244612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248904
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5099	NC_008378	CG	3	6	244646	244651	0 %	0 %	50 %	50 %	116248904
5100	NC_008378	GCGG	2	8	244719	244726	0 %	0 %	75 %	25 %	116248904
5101	NC_008378	ACC	2	6	244732	244737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248904
5102	NC_008378	ACC	2	6	244741	244746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248904
5103	NC_008378	GCC	2	6	244779	244784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5104	NC_008378	CAG	2	6	244893	244898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5105	NC_008378	GCC	2	6	245084	245089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5106	NC_008378	CCTT	2	8	245152	245159	0 %	50 %	0 %	50 %	116248905
5107	NC_008378	GCA	2	6	245170	245175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
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5109	NC_008378	TCG	2	6	245215	245220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5110	NC_008378	ACG	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5111	NC_008378	GCA	2	6	245394	245399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5112	NC_008378	CGT	2	6	245443	245448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
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5118	NC_008378	CCG	2	6	245745	245750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
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5120	NC_008378	GAT	2	6	245894	245899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248905
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5152	NC_008378	GCC	2	6	247539	247544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248907
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5235	NC_008378	TCG	2	6	251325	251330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248910
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5239	NC_008378	TCC	2	6	251512	251517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248910
5240	NC_008378	ATA	2	6	251519	251524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248910
5241	NC_008378	GGCCGA	2	12	251578	251589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116248910
5242	NC_008378	CTT	2	6	251600	251605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248910
5243	NC_008378	GTC	2	6	251619	251624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5244	NC_008378	CAT	2	6	251630	251635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248910
5245	NC_008378	GCC	2	6	251697	251702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248910
5246	NC_008378	CGT	2	6	251731	251736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5247	NC_008378	GGC	2	6	251825	251830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248910
5248	NC_008378	TCG	2	6	251865	251870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5249	NC_008378	TTG	2	6	251918	251923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248910
5250	NC_008378	AG	3	6	251926	251931	50 %	0 %	50 %	0 %	116248910
5251	NC_008378	TCC	2	6	251982	251987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248910
5252	NC_008378	CGA	2	6	252022	252027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5253	NC_008378	TCCT	2	8	252055	252062	0 %	50 %	0 %	50 %	116248911
5254	NC_008378	GGCG	2	8	252069	252076	0 %	0 %	75 %	25 %	116248911
5255	NC_008378	GGATCG	2	12	252101	252112	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116248911
5256	NC_008378	AAG	2	6	252124	252129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248911
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5258	NC_008378	ACC	2	6	252236	252241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248911
5259	NC_008378	TCG	2	6	252350	252355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248911
5260	NC_008378	GAT	2	6	252358	252363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248911
5261	NC_008378	GCGCTG	2	12	252403	252414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248911
5262	NC_008378	GCC	2	6	252415	252420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248911
5263	NC_008378	CT	3	6	252489	252494	0 %	50 %	0 %	50 %	116248911
5264	NC_008378	GGGTC	2	10	252585	252594	0 %	20 %	60 %	20 %	116248911
5265	NC_008378	CCT	2	6	252684	252689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248911
5266	NC_008378	ATC	2	6	252694	252699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248911
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5269	NC_008378	AGC	2	6	252845	252850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248911
5270	NC_008378	GCG	2	6	252899	252904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248911
5271	NC_008378	CTT	2	6	252913	252918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248911
5272	NC_008378	CGA	2	6	252969	252974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248911
5273	NC_008378	ACG	2	6	252995	253000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248911
5274	NC_008378	ACG	2	6	253019	253024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248911
5275	NC_008378	CTG	2	6	253066	253071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248911
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5281	NC_008378	CCG	2	6	253296	253301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248911
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5323	NC_008378	GAA	2	6	255110	255115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248913
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5331	NC_008378	GGTC	2	8	255406	255413	0 %	25 %	50 %	25 %	116248913
5332	NC_008378	GAA	2	6	255437	255442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248913
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5335	NC_008378	ATC	2	6	255667	255672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248914
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5343	NC_008378	TGGC	2	8	256059	256066	0 %	25 %	50 %	25 %	116248914
5344	NC_008378	AGC	2	6	256098	256103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248914
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5346	NC_008378	CGAGAA	2	12	256219	256230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116248914
5347	NC_008378	CGA	2	6	256288	256293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248914
5348	NC_008378	CGCA	2	8	256325	256332	25 %	0 %	25 %	50 %	116248914
5349	NC_008378	GAC	2	6	256394	256399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248914
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5351	NC_008378	ATC	2	6	256431	256436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248914
5352	NC_008378	A	6	6	256491	256496	100 %	0 %	0 %	0 %	116248914
5353	NC_008378	GCG	2	6	256497	256502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248914
5354	NC_008378	CCA	2	6	256504	256509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248914
5355	NC_008378	TGG	2	6	256974	256979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248915
5356	NC_008378	ATG	2	6	256986	256991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248915
5357	NC_008378	GAG	2	6	257000	257005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248915
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5480	NC_008378	CG	3	6	263674	263679	0 %	0 %	50 %	50 %	116248922
5481	NC_008378	CGC	2	6	263732	263737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248922
5482	NC_008378	GACGAT	2	12	263741	263752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116248922
5483	NC_008378	CAT	2	6	263762	263767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248922
5484	NC_008378	CGA	2	6	263794	263799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248922
5485	NC_008378	CTG	2	6	263950	263955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248922
5486	NC_008378	GCC	2	6	263968	263973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248922
5487	NC_008378	TGAT	2	8	263985	263992	25 %	50 %	25 %	0 %	116248922
5488	NC_008378	GCG	2	6	263997	264002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248922
5489	NC_008378	CGA	2	6	264028	264033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248922
5490	NC_008378	AAC	2	6	264041	264046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248922
5491	NC_008378	GTC	2	6	264069	264074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248922
5492	NC_008378	CGA	2	6	264118	264123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248922
5493	NC_008378	TTC	2	6	264175	264180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248922
5494	NC_008378	AGA	2	6	264190	264195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248922
5495	NC_008378	GGC	3	9	264328	264336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248923
5496	NC_008378	CGC	2	6	264405	264410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248923
5497	NC_008378	GGC	2	6	264431	264436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248923
5498	NC_008378	CGC	2	6	264489	264494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248923
5499	NC_008378	CGC	2	6	264613	264618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248923
5500	NC_008378	TTG	2	6	264623	264628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248923

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