MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008271	GTC	2	6	201651	201656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4002	NC_008271	GAC	2	6	201660	201665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4003	NC_008271	CGT	2	6	201677	201682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4004	NC_008271	GTC	2	6	201702	201707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4005	NC_008271	GCGCA	2	10	201861	201870	20 %	0 %	40 %	40 %	111027028
4006	NC_008271	TCG	2	6	201931	201936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4007	NC_008271	TCG	2	6	201953	201958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
4008	NC_008271	CCG	2	6	202003	202008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
4009	NC_008271	GCC	2	6	202021	202026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
4010	NC_008271	GCG	2	6	202039	202044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
4011	NC_008271	GGGC	2	8	202066	202073	0 %	0 %	75 %	25 %	111027028
4012	NC_008271	CGG	2	6	202082	202087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
4013	NC_008271	G	6	6	202119	202124	0 %	0 %	100 %	0 %	111027028
4014	NC_008271	GGC	2	6	202143	202148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
4015	NC_008271	GCG	2	6	202171	202176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
4016	NC_008271	GC	3	6	202192	202197	0 %	0 %	50 %	50 %	111027028
4017	NC_008271	CTC	2	6	202382	202387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027029
4018	NC_008271	TCG	2	6	202416	202421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027029
4019	NC_008271	GTGTCG	2	12	202449	202460	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111027029
4020	NC_008271	GGA	2	6	202464	202469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027029
4021	NC_008271	CGA	3	9	202510	202518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027029
4022	NC_008271	GCC	2	6	202562	202567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027029
4023	NC_008271	GTT	2	6	202592	202597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027029
4024	NC_008271	CAT	2	6	202604	202609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027029
4025	NC_008271	CGA	2	6	202737	202742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4026	NC_008271	ACA	2	6	202755	202760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027030
4027	NC_008271	CGC	2	6	202761	202766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027030
4028	NC_008271	CGC	2	6	202780	202785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027030
4029	NC_008271	CGA	3	9	202807	202815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4030	NC_008271	GTC	2	6	202832	202837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4031	NC_008271	GTCGCC	2	12	202868	202879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111027030
4032	NC_008271	CTCGCC	2	12	202898	202909	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111027030
4033	NC_008271	GTG	2	6	202928	202933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027030
4034	NC_008271	CCGC	2	8	203022	203029	0 %	0 %	25 %	75 %	111027030
4035	NC_008271	CAT	2	6	203047	203052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027030
4036	NC_008271	GTCG	2	8	203059	203066	0 %	25 %	50 %	25 %	111027030
4037	NC_008271	CGA	2	6	203071	203076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4038	NC_008271	TGG	2	6	203109	203114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027030
4039	NC_008271	GAG	2	6	203189	203194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027030
4040	NC_008271	AGC	2	6	203256	203261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4041	NC_008271	GTC	2	6	203305	203310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4042	NC_008271	CCGG	2	8	203311	203318	0 %	0 %	50 %	50 %	111027030
4043	NC_008271	CGA	2	6	203428	203433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4044	NC_008271	CGC	2	6	203437	203442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027030
4045	NC_008271	CAC	2	6	203455	203460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027030
4046	NC_008271	TGC	2	6	203576	203581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4047	NC_008271	GCTGGT	2	12	203592	203603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111027031
4048	NC_008271	GCC	2	6	203611	203616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4049	NC_008271	CTG	2	6	203619	203624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4050	NC_008271	GGT	2	6	203625	203630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027031
4051	NC_008271	C	6	6	203646	203651	0 %	0 %	0 %	100 %	111027031
4052	NC_008271	CGA	2	6	203697	203702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4053	NC_008271	TGG	2	6	203786	203791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027031
4054	NC_008271	CGGT	2	8	203821	203828	0 %	25 %	50 %	25 %	111027031
4055	NC_008271	TCC	2	6	203839	203844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027031
4056	NC_008271	GCG	2	6	203845	203850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027031
4057	NC_008271	GTCAC	2	10	203884	203893	20 %	20 %	20 %	40 %	111027031
4058	NC_008271	GCC	2	6	203944	203949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4059	NC_008271	ACC	2	6	203968	203973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027031
4060	NC_008271	CGC	2	6	203974	203979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4061	NC_008271	GAT	2	6	204130	204135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027031
4062	NC_008271	AG	3	6	204159	204164	50 %	0 %	50 %	0 %	111027031
4063	NC_008271	TCGA	2	8	204172	204179	25 %	25 %	25 %	25 %	111027031
4064	NC_008271	GCA	2	6	204199	204204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4065	NC_008271	ACC	2	6	204214	204219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027031
4066	NC_008271	CGC	2	6	204225	204230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4067	NC_008271	TGC	2	6	204276	204281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4068	NC_008271	CGG	3	9	204366	204374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027031
4069	NC_008271	CCG	2	6	204389	204394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4070	NC_008271	GCT	2	6	204408	204413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4071	NC_008271	CGC	2	6	204447	204452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027031
4072	NC_008271	CGG	2	6	204516	204521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027031
4073	NC_008271	TCG	2	6	204554	204559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027031
4074	NC_008271	CGG	2	6	204567	204572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027031
4075	NC_008271	CCGC	2	8	204581	204588	0 %	0 %	25 %	75 %	111027031
4076	NC_008271	GGAC	2	8	204655	204662	25 %	0 %	50 %	25 %	111027032
4077	NC_008271	CGGA	2	8	204716	204723	25 %	0 %	50 %	25 %	111027032
4078	NC_008271	GGT	2	6	204741	204746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027032
4079	NC_008271	CAT	2	6	204835	204840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027032
4080	NC_008271	GGCG	2	8	204864	204871	0 %	0 %	75 %	25 %	111027032
4081	NC_008271	GCCGA	2	10	204915	204924	20 %	0 %	40 %	40 %	111027032
4082	NC_008271	GTCCTC	2	12	204929	204940	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	111027032
4083	NC_008271	GC	3	6	204975	204980	0 %	0 %	50 %	50 %	111027032
4084	NC_008271	GGTG	2	8	204994	205001	0 %	25 %	75 %	0 %	111027033
4085	NC_008271	TCG	2	6	205025	205030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027033
4086	NC_008271	TCG	2	6	205046	205051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027033
4087	NC_008271	GCT	2	6	205066	205071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027033
4088	NC_008271	CGC	2	6	205092	205097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027033
4089	NC_008271	GC	3	6	205173	205178	0 %	0 %	50 %	50 %	111027033
4090	NC_008271	GGT	2	6	205207	205212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027033
4091	NC_008271	GCG	2	6	205242	205247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027033
4092	NC_008271	GGT	2	6	205248	205253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027033
4093	NC_008271	GTG	2	6	205303	205308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027034
4094	NC_008271	CTG	2	6	205314	205319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027034
4095	NC_008271	GTGC	2	8	205336	205343	0 %	25 %	50 %	25 %	111027034
4096	NC_008271	TGG	3	9	205408	205416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027034
4097	NC_008271	ATC	2	6	205420	205425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027034
4098	NC_008271	CGG	2	6	205487	205492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027034
4099	NC_008271	CAT	2	6	205494	205499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027034
4100	NC_008271	TCA	2	6	205649	205654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027034
4101	NC_008271	CAGC	2	8	205698	205705	25 %	0 %	25 %	50 %	111027034
4102	NC_008271	ATC	2	6	205834	205839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027034
4103	NC_008271	TGC	2	6	205840	205845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027034
4104	NC_008271	ACGTC	2	10	205850	205859	20 %	20 %	20 %	40 %	111027034
4105	NC_008271	CGG	2	6	205877	205882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027034
4106	NC_008271	CTGA	2	8	205925	205932	25 %	25 %	25 %	25 %	111027034
4107	NC_008271	TGC	2	6	205946	205951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027034
4108	NC_008271	GCG	2	6	205972	205977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027034
4109	NC_008271	CGG	2	6	205982	205987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027034
4110	NC_008271	GGTCGC	2	12	206362	206373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111027035
4111	NC_008271	CGG	2	6	206380	206385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027035
4112	NC_008271	CA	3	6	206393	206398	50 %	0 %	0 %	50 %	111027035
4113	NC_008271	AGC	2	6	206418	206423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027035
4114	NC_008271	TCC	2	6	206493	206498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027035
4115	NC_008271	GGCC	2	8	206584	206591	0 %	0 %	50 %	50 %	111027035
4116	NC_008271	GTC	2	6	206821	206826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027036
4117	NC_008271	TGA	2	6	206865	206870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027036
4118	NC_008271	CAG	2	6	206887	206892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027036
4119	NC_008271	AGA	2	6	206901	206906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027036
4120	NC_008271	TCC	2	6	206918	206923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027036
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4125	NC_008271	CGT	2	6	207369	207374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027037
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4232	NC_008271	CCGT	2	8	211562	211569	0 %	25 %	25 %	50 %	111027040
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4240	NC_008271	GC	3	6	211973	211978	0 %	0 %	50 %	50 %	111027040
4241	NC_008271	GCT	2	6	212001	212006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
4242	NC_008271	CGC	2	6	212074	212079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027040
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4244	NC_008271	TGC	2	6	212177	212182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
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4246	NC_008271	CGC	2	6	212235	212240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027040
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4252	NC_008271	GCTG	2	8	212351	212358	0 %	25 %	50 %	25 %	111027040
4253	NC_008271	TCG	3	9	212399	212407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
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4261	NC_008271	ACG	2	6	212708	212713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027040
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4342	NC_008271	CTCAA	2	10	215493	215502	40 %	20 %	0 %	40 %	111027043
4343	NC_008271	CTT	2	6	215539	215544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027043
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4347	NC_008271	CCGAC	2	10	215740	215749	20 %	0 %	20 %	60 %	111027044
4348	NC_008271	GTC	2	6	215775	215780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027044
4349	NC_008271	ATGG	2	8	215790	215797	25 %	25 %	50 %	0 %	111027044
4350	NC_008271	CAC	2	6	215831	215836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027044
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4353	NC_008271	GTGGG	2	10	216208	216217	0 %	20 %	80 %	0 %	111027045
4354	NC_008271	GCG	4	12	216247	216258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027045
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4356	NC_008271	CGA	2	6	216308	216313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027045
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4358	NC_008271	GC	3	6	216376	216381	0 %	0 %	50 %	50 %	111027045
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4481	NC_008271	GCG	2	6	221216	221221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027051
4482	NC_008271	GCA	2	6	221275	221280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4483	NC_008271	CGA	2	6	221281	221286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4484	NC_008271	ATC	2	6	221291	221296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027051
4485	NC_008271	ACG	2	6	221312	221317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4486	NC_008271	GCC	2	6	221378	221383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027051
4487	NC_008271	TGTGG	2	10	221387	221396	0 %	40 %	60 %	0 %	111027051
4488	NC_008271	GAC	2	6	221398	221403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4489	NC_008271	AGC	2	6	221432	221437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4490	NC_008271	CGGG	2	8	221460	221467	0 %	0 %	75 %	25 %	111027051
4491	NC_008271	GCA	2	6	221535	221540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4492	NC_008271	GAC	2	6	221554	221559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4493	NC_008271	TCG	2	6	221564	221569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027051
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4495	NC_008271	GCA	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4496	NC_008271	CTG	2	6	221725	221730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4497	NC_008271	CGAA	2	8	221826	221833	50 %	0 %	25 %	25 %	111027051
4498	NC_008271	GCG	2	6	221867	221872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027051
4499	NC_008271	CTCGCC	2	12	221884	221895	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111027051
4500	NC_008271	CGC	2	6	221899	221904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027051

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