MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008271	GGT	2	6	127254	127259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026960
2502	NC_008271	TGC	2	6	127306	127311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026960
2503	NC_008271	CGC	2	6	127340	127345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026960
2504	NC_008271	CCG	2	6	127461	127466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026960
2505	NC_008271	GCG	2	6	127510	127515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026960
2506	NC_008271	TGA	2	6	127528	127533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026960
2507	NC_008271	TCA	2	6	127573	127578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026960
2508	NC_008271	CGG	2	6	127698	127703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026961
2509	NC_008271	CCA	2	6	127815	127820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026961
2510	NC_008271	CCA	2	6	127851	127856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026961
2511	NC_008271	CGG	2	6	127873	127878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026961
2512	NC_008271	CGCC	2	8	127887	127894	0 %	0 %	25 %	75 %	111026961
2513	NC_008271	CGC	2	6	127933	127938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026961
2514	NC_008271	GCA	2	6	128025	128030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026961
2515	NC_008271	CCAC	2	8	128078	128085	25 %	0 %	0 %	75 %	111026961
2516	NC_008271	ATG	2	6	128681	128686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026962
2517	NC_008271	GCG	2	6	128687	128692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
2518	NC_008271	TGA	2	6	128694	128699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026962
2519	NC_008271	CGC	2	6	128719	128724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
2520	NC_008271	ACC	2	6	128735	128740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
2521	NC_008271	CG	3	6	128785	128790	0 %	0 %	50 %	50 %	111026962
2522	NC_008271	GAC	2	6	128791	128796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2523	NC_008271	CGAGG	2	10	128797	128806	20 %	0 %	60 %	20 %	111026962
2524	NC_008271	CGA	2	6	128823	128828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2525	NC_008271	GCA	2	6	128829	128834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2526	NC_008271	CGC	2	6	128877	128882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
2527	NC_008271	CAGC	2	8	128910	128917	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
2528	NC_008271	ACC	2	6	128927	128932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
2529	NC_008271	GTC	2	6	128947	128952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2530	NC_008271	AAG	2	6	128987	128992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
2531	NC_008271	ACCG	2	8	129010	129017	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
2532	NC_008271	ATT	2	6	129035	129040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111026962
2533	NC_008271	GAA	2	6	129065	129070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
2534	NC_008271	AGA	2	6	129091	129096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
2535	NC_008271	GGC	2	6	129133	129138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
2536	NC_008271	ACGC	2	8	129153	129160	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
2537	NC_008271	CCA	2	6	129174	129179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
2538	NC_008271	CGG	2	6	129277	129282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
2539	NC_008271	CCAG	2	8	129284	129291	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
2540	NC_008271	CCA	2	6	129306	129311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
2541	NC_008271	GCG	2	6	129390	129395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
2542	NC_008271	CTT	2	6	129415	129420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
2543	NC_008271	CGC	2	6	129421	129426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
2544	NC_008271	CCG	2	6	129528	129533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
2545	NC_008271	G	6	6	129570	129575	0 %	0 %	100 %	0 %	111026962
2546	NC_008271	CAT	2	6	129630	129635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
2547	NC_008271	CGA	2	6	129637	129642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2548	NC_008271	CGGC	2	8	129705	129712	0 %	0 %	50 %	50 %	111026962
2549	NC_008271	CGA	2	6	129732	129737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2550	NC_008271	CTT	2	6	129739	129744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
2551	NC_008271	CAG	2	6	129836	129841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2552	NC_008271	AT	3	6	129853	129858	50 %	50 %	0 %	0 %	111026962
2553	NC_008271	GTC	2	6	129970	129975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2554	NC_008271	TTC	2	6	130013	130018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
2555	NC_008271	CT	3	6	130027	130032	0 %	50 %	0 %	50 %	111026962
2556	NC_008271	AAC	2	6	130049	130054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026962
2557	NC_008271	TGGA	2	8	130069	130076	25 %	25 %	50 %	0 %	111026962
2558	NC_008271	CTG	2	6	130095	130100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2559	NC_008271	TGG	2	6	130137	130142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026962
2560	NC_008271	GGAA	2	8	130168	130175	50 %	0 %	50 %	0 %	111026962
2561	NC_008271	ATC	2	6	130308	130313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
2562	NC_008271	TGC	2	6	130338	130343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2563	NC_008271	CTA	2	6	130432	130437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
2564	NC_008271	CGT	2	6	130537	130542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
2565	NC_008271	CAACGA	2	12	130564	130575	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111026962
2566	NC_008271	CAT	2	6	130579	130584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
2567	NC_008271	ACG	2	6	130623	130628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
2568	NC_008271	GGGTT	2	10	130640	130649	0 %	40 %	60 %	0 %	111026963
2569	NC_008271	C	6	6	130744	130749	0 %	0 %	0 %	100 %	111026963
2570	NC_008271	GCG	2	6	130829	130834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026963
2571	NC_008271	CTT	2	6	130851	130856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026963
2572	NC_008271	CGA	2	6	130857	130862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
2573	NC_008271	TCA	2	6	130931	130936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026963
2574	NC_008271	TAC	2	6	131008	131013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026963
2575	NC_008271	TTAG	2	8	131063	131070	25 %	50 %	25 %	0 %	111026963
2576	NC_008271	TCG	2	6	131078	131083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026963
2577	NC_008271	GAC	2	6	131107	131112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
2578	NC_008271	CG	3	6	131287	131292	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
2579	NC_008271	CG	4	8	131298	131305	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
2580	NC_008271	AAGCCC	2	12	131336	131347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111026964
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2582	NC_008271	ATC	2	6	131495	131500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026964
2583	NC_008271	GGT	2	6	131531	131536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026964
2584	NC_008271	CAC	2	6	131560	131565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026964
2585	NC_008271	ACC	3	9	131588	131596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026964
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2587	NC_008271	AGC	2	6	131648	131653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026964
2588	NC_008271	CCG	2	6	131669	131674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026964
2589	NC_008271	CG	3	6	131700	131705	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
2590	NC_008271	CGG	2	6	131711	131716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026964
2591	NC_008271	CTG	2	6	131718	131723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026964
2592	NC_008271	CATC	2	8	131755	131762	25 %	25 %	0 %	50 %	111026964
2593	NC_008271	GACT	2	8	131955	131962	25 %	25 %	25 %	25 %	111026965
2594	NC_008271	TCTG	2	8	131987	131994	0 %	50 %	25 %	25 %	111026965
2595	NC_008271	CGG	2	6	132018	132023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026965
2596	NC_008271	GTCC	2	8	132054	132061	0 %	25 %	25 %	50 %	111026965
2597	NC_008271	GAC	2	6	132141	132146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026965
2598	NC_008271	TCG	2	6	132166	132171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026965
2599	NC_008271	CACC	2	8	132216	132223	25 %	0 %	0 %	75 %	111026965
2600	NC_008271	GGA	2	6	132316	132321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026965
2601	NC_008271	GGA	2	6	132329	132334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026965
2602	NC_008271	GTC	2	6	132345	132350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026965
2603	NC_008271	GC	3	6	132379	132384	0 %	0 %	50 %	50 %	111026965
2604	NC_008271	GTC	2	6	132542	132547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026966
2605	NC_008271	GTAGAA	2	12	132572	132583	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	111026966
2606	NC_008271	GTC	2	6	132638	132643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026966
2607	NC_008271	TTTG	2	8	132674	132681	0 %	75 %	25 %	0 %	111026966
2608	NC_008271	CGG	2	6	132763	132768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026966
2609	NC_008271	CCTCG	2	10	132830	132839	0 %	20 %	20 %	60 %	111026966
2610	NC_008271	CAG	2	6	132966	132971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026966
2611	NC_008271	CCG	2	6	132972	132977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026966
2612	NC_008271	GCG	2	6	133021	133026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026966
2613	NC_008271	CA	3	6	133066	133071	50 %	0 %	0 %	50 %	111026966
2614	NC_008271	TGT	2	6	133194	133199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026966
2615	NC_008271	ACT	2	6	133250	133255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026966
2616	NC_008271	CTG	3	9	133267	133275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026966
2617	NC_008271	CGGCT	2	10	133387	133396	0 %	20 %	40 %	40 %	111026967
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2619	NC_008271	GGC	2	6	133533	133538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026967
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2621	NC_008271	GGT	2	6	133566	133571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026967
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2984	NC_008271	GACTT	2	10	151935	151944	20 %	40 %	20 %	20 %	111026981
2985	NC_008271	ATC	2	6	151971	151976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026981
2986	NC_008271	TGA	2	6	152080	152085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026981
2987	NC_008271	CCG	2	6	152119	152124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026981
2988	NC_008271	GGA	2	6	152472	152477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026982
2989	NC_008271	CCG	2	6	152481	152486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026982
2990	NC_008271	CGT	2	6	152490	152495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026982
2991	NC_008271	GAA	2	6	152568	152573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026982
2992	NC_008271	ACCCG	2	10	152605	152614	20 %	0 %	20 %	60 %	111026982
2993	NC_008271	CGA	2	6	152634	152639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026982
2994	NC_008271	GCT	2	6	152667	152672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026982
2995	NC_008271	CCTA	2	8	152708	152715	25 %	25 %	0 %	50 %	111026982
2996	NC_008271	CG	3	6	152717	152722	0 %	0 %	50 %	50 %	111026982
2997	NC_008271	ATG	2	6	152736	152741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026982
2998	NC_008271	GCC	2	6	152763	152768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026983
2999	NC_008271	CGC	2	6	152885	152890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026983
3000	NC_008271	CGA	2	6	152939	152944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983

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