MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008271	CGG	2	6	268727	268732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027104
5502	NC_008271	GCC	2	6	268743	268748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027104
5503	NC_008271	GTC	2	6	268758	268763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5504	NC_008271	GCG	2	6	268798	268803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027104
5505	NC_008271	GCT	2	6	268814	268819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5506	NC_008271	GC	3	6	268828	268833	0 %	0 %	50 %	50 %	111027104
5507	NC_008271	GTC	2	6	268842	268847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5508	NC_008271	CGA	2	6	268856	268861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5509	NC_008271	TCGA	2	8	268872	268879	25 %	25 %	25 %	25 %	111027104
5510	NC_008271	TGA	2	6	269018	269023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027104
5511	NC_008271	CGT	2	6	269024	269029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5512	NC_008271	GTC	2	6	269106	269111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5513	NC_008271	CGC	2	6	269148	269153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027104
5514	NC_008271	TCG	2	6	269167	269172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5515	NC_008271	GAT	2	6	269205	269210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027104
5516	NC_008271	CAG	2	6	269213	269218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5517	NC_008271	TTCG	2	8	269262	269269	0 %	50 %	25 %	25 %	111027104
5518	NC_008271	TCG	2	6	269331	269336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5519	NC_008271	ATC	2	6	269379	269384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027104
5520	NC_008271	GCC	2	6	269451	269456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027104
5521	NC_008271	GA	3	6	269495	269500	50 %	0 %	50 %	0 %	111027104
5522	NC_008271	CGT	3	9	269501	269509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027104
5523	NC_008271	TGA	2	6	269516	269521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027104
5524	NC_008271	CGTCGG	2	12	269537	269548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111027104
5525	NC_008271	CGG	2	6	269567	269572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027104
5526	NC_008271	GCC	2	6	269782	269787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027105
5527	NC_008271	GGA	2	6	269801	269806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027105
5528	NC_008271	CTC	2	6	269827	269832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027105
5529	NC_008271	GCTCG	2	10	269835	269844	0 %	20 %	40 %	40 %	111027105
5530	NC_008271	GCC	2	6	269884	269889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027105
5531	NC_008271	ATC	2	6	269899	269904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027105
5532	NC_008271	GGA	2	6	269940	269945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027105
5533	NC_008271	CGG	2	6	269948	269953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027105
5534	NC_008271	GACC	2	8	269994	270001	25 %	0 %	25 %	50 %	111027105
5535	NC_008271	GAC	2	6	270033	270038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
5536	NC_008271	AGA	2	6	270083	270088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027105
5537	NC_008271	TCGA	2	8	270137	270144	25 %	25 %	25 %	25 %	111027105
5538	NC_008271	CGAC	2	8	270153	270160	25 %	0 %	25 %	50 %	111027105
5539	NC_008271	TAC	2	6	270289	270294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027105
5540	NC_008271	GACGG	2	10	270295	270304	20 %	0 %	60 %	20 %	111027105
5541	NC_008271	CGA	3	9	270333	270341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
5542	NC_008271	CAG	2	6	270376	270381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
5543	NC_008271	ATCG	2	8	270408	270415	25 %	25 %	25 %	25 %	111027105
5544	NC_008271	CGA	3	9	270425	270433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
5545	NC_008271	ACT	2	6	270491	270496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027105
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5547	NC_008271	CG	3	6	270503	270508	0 %	0 %	50 %	50 %	111027105
5548	NC_008271	TG	3	6	270510	270515	0 %	50 %	50 %	0 %	111027105
5549	NC_008271	GGA	2	6	270549	270554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027105
5550	NC_008271	TGGC	2	8	270568	270575	0 %	25 %	50 %	25 %	111027105
5551	NC_008271	CGGT	2	8	270577	270584	0 %	25 %	50 %	25 %	111027105
5552	NC_008271	GAC	2	6	270586	270591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
5553	NC_008271	CGA	3	9	270630	270638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027105
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5555	NC_008271	GCCC	2	8	270708	270715	0 %	0 %	25 %	75 %	111027105
5556	NC_008271	TGG	2	6	270740	270745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027105
5557	NC_008271	CG	3	6	270762	270767	0 %	0 %	50 %	50 %	111027105
5558	NC_008271	CGC	2	6	270778	270783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027105
5559	NC_008271	GTC	2	6	271063	271068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027106
5560	NC_008271	TGG	2	6	271083	271088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027106
5561	NC_008271	TCG	2	6	271110	271115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027106
5562	NC_008271	CAG	2	6	271140	271145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027106
5563	NC_008271	TGT	2	6	271149	271154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027106
5564	NC_008271	GAG	2	6	271246	271251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027106
5565	NC_008271	ACT	2	6	271345	271350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027106
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5568	NC_008271	GAC	2	6	271441	271446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027106
5569	NC_008271	TGC	2	6	271468	271473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027106
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5572	NC_008271	TGC	3	9	271592	271600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027107
5573	NC_008271	CTG	3	9	271704	271712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027107
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5584	NC_008271	CGA	2	6	272045	272050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027107
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5605	NC_008271	TGCCG	2	10	273182	273191	0 %	20 %	40 %	40 %	111027108
5606	NC_008271	TTG	2	6	273202	273207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027108
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5609	NC_008271	GC	3	6	273308	273313	0 %	0 %	50 %	50 %	111027108
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5862	NC_008271	TGGTC	2	10	283530	283539	0 %	40 %	40 %	20 %	111027114
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5981	NC_008271	TCGA	2	8	288560	288567	25 %	25 %	25 %	25 %	111027118
5982	NC_008271	GC	3	6	288590	288595	0 %	0 %	50 %	50 %	111027118
5983	NC_008271	GA	3	6	288608	288613	50 %	0 %	50 %	0 %	111027118
5984	NC_008271	CGG	2	6	288802	288807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027118
5985	NC_008271	GGT	2	6	288956	288961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027119
5986	NC_008271	CGG	2	6	288992	288997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027119
5987	NC_008271	CCG	2	6	289026	289031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027119
5988	NC_008271	CCG	2	6	289040	289045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027119
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5990	NC_008271	TCC	2	6	289095	289100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027119
5991	NC_008271	GCC	2	6	289119	289124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027119
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5999	NC_008271	CG	3	6	289335	289340	0 %	0 %	50 %	50 %	111027119
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