MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008271	GTT	2	6	242219	242224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027074
5002	NC_008271	CTC	2	6	242291	242296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027074
5003	NC_008271	TGA	2	6	242323	242328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027074
5004	NC_008271	CGA	2	6	242768	242773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027075
5005	NC_008271	GCC	2	6	242843	242848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027075
5006	NC_008271	AC	3	6	243016	243021	50 %	0 %	0 %	50 %	111027075
5007	NC_008271	GGCC	2	8	243588	243595	0 %	0 %	50 %	50 %	111027076
5008	NC_008271	CGA	2	6	243597	243602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027076
5009	NC_008271	CAC	2	6	243614	243619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027076
5010	NC_008271	GCT	2	6	243631	243636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027076
5011	NC_008271	GAA	2	6	243768	243773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027076
5012	NC_008271	CGAA	2	8	243776	243783	50 %	0 %	25 %	25 %	111027076
5013	NC_008271	ATTC	2	8	243987	243994	25 %	50 %	0 %	25 %	111027077
5014	NC_008271	ACC	2	6	244009	244014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027077
5015	NC_008271	CCG	2	6	244054	244059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027077
5016	NC_008271	TGC	2	6	244125	244130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027077
5017	NC_008271	GCGTC	2	10	244193	244202	0 %	20 %	40 %	40 %	111027077
5018	NC_008271	CCG	2	6	244228	244233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027077
5019	NC_008271	GCG	2	6	244270	244275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027077
5020	NC_008271	AGCG	2	8	244286	244293	25 %	0 %	50 %	25 %	111027077
5021	NC_008271	TCA	2	6	244318	244323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027077
5022	NC_008271	CCTG	2	8	244377	244384	0 %	25 %	25 %	50 %	111027078
5023	NC_008271	GTC	2	6	244406	244411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027078
5024	NC_008271	TCA	2	6	244436	244441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027078
5025	NC_008271	TCA	2	6	244451	244456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027078
5026	NC_008271	CGA	2	6	244472	244477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027078
5027	NC_008271	CCG	2	6	244495	244500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027078
5028	NC_008271	CGT	2	6	244582	244587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027078
5029	NC_008271	GAC	2	6	244724	244729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5030	NC_008271	CGCAG	2	10	244749	244758	20 %	0 %	40 %	40 %	111027079
5031	NC_008271	TGG	2	6	244774	244779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027079
5032	NC_008271	CTG	2	6	244821	244826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5033	NC_008271	CGA	2	6	244853	244858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5034	NC_008271	CGG	2	6	244913	244918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027079
5035	NC_008271	GGT	2	6	244922	244927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027079
5036	NC_008271	GCC	2	6	244948	244953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5037	NC_008271	CGC	2	6	244954	244959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5038	NC_008271	CGA	3	9	244964	244972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5039	NC_008271	ATG	2	6	244977	244982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027079
5040	NC_008271	CTG	2	6	244983	244988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5041	NC_008271	CGT	2	6	245000	245005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5042	NC_008271	CGA	3	9	245036	245044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5043	NC_008271	CCG	2	6	245053	245058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5044	NC_008271	TCC	2	6	245059	245064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027079
5045	NC_008271	CGA	2	6	245075	245080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
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5047	NC_008271	CGC	2	6	245123	245128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5048	NC_008271	TCCCCT	2	12	245212	245223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027079
5049	NC_008271	TCC	2	6	245226	245231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027079
5050	NC_008271	CCG	2	6	245269	245274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5051	NC_008271	CTG	2	6	245283	245288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5052	NC_008271	CGC	2	6	245289	245294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5053	NC_008271	CTT	2	6	245357	245362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027079
5054	NC_008271	GCC	2	6	245384	245389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5055	NC_008271	ACC	2	6	245419	245424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027079
5056	NC_008271	CAC	2	6	245427	245432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027079
5057	NC_008271	CCA	3	9	245446	245454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027079
5058	NC_008271	AC	3	6	245467	245472	50 %	0 %	0 %	50 %	111027079
5059	NC_008271	CCA	2	6	245473	245478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027079
5060	NC_008271	CGG	2	6	245482	245487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027079
5061	NC_008271	CCG	2	6	245503	245508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5062	NC_008271	ACG	2	6	245566	245571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5063	NC_008271	GC	3	6	245669	245674	0 %	0 %	50 %	50 %	111027079
5064	NC_008271	CGA	3	9	245681	245689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5065	NC_008271	CCG	2	6	245734	245739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027079
5066	NC_008271	CTG	2	6	245763	245768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027079
5067	NC_008271	CAC	2	6	245790	245795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027079
5068	NC_008271	CCT	2	6	245807	245812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027079
5069	NC_008271	GA	3	6	245842	245847	50 %	0 %	50 %	0 %	111027079
5070	NC_008271	TCACCG	2	12	245860	245871	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111027079
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5072	NC_008271	GC	3	6	245974	245979	0 %	0 %	50 %	50 %	111027080
5073	NC_008271	CGA	2	6	245989	245994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027080
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5089	NC_008271	CGA	2	6	246882	246887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027081
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5091	NC_008271	CGA	3	9	246906	246914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027081
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5103	NC_008271	CGCGG	2	10	247200	247209	0 %	0 %	60 %	40 %	111027081
5104	NC_008271	CAT	2	6	247218	247223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027081
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5120	NC_008271	CGG	2	6	247990	247995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027082
5121	NC_008271	CGC	2	6	248015	248020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027082
5122	NC_008271	CGC	2	6	248032	248037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027082
5123	NC_008271	CGC	2	6	248051	248056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027082
5124	NC_008271	CGC	2	6	248058	248063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027082
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5128	NC_008271	ATCG	2	8	248153	248160	25 %	25 %	25 %	25 %	111027082
5129	NC_008271	C	6	6	248237	248242	0 %	0 %	0 %	100 %	111027082
5130	NC_008271	GACC	2	8	248314	248321	25 %	0 %	25 %	50 %	111027082
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5133	NC_008271	TCG	3	9	248387	248395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
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5137	NC_008271	GT	3	6	248463	248468	0 %	50 %	50 %	0 %	111027083
5138	NC_008271	CTCG	2	8	248512	248519	0 %	25 %	25 %	50 %	111027083
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5151	NC_008271	GT	3	6	249109	249114	0 %	50 %	50 %	0 %	111027083
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5230	NC_008271	CGA	2	6	252168	252173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027086
5231	NC_008271	ACCC	2	8	252303	252310	25 %	0 %	0 %	75 %	111027086
5232	NC_008271	AAC	2	6	252317	252322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027086
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5236	NC_008271	CGGCG	2	10	252421	252430	0 %	0 %	60 %	40 %	111027086
5237	NC_008271	TCGTCT	2	12	252437	252448	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	111027086
5238	NC_008271	CCG	2	6	252449	252454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027086
5239	NC_008271	ACG	2	6	252455	252460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027086
5240	NC_008271	CGT	2	6	252480	252485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027086
5241	NC_008271	CGG	2	6	252516	252521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027086
5242	NC_008271	TCC	2	6	252536	252541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027086
5243	NC_008271	GCC	2	6	252558	252563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027086
5244	NC_008271	GACC	2	8	252627	252634	25 %	0 %	25 %	50 %	111027086
5245	NC_008271	GCT	2	6	252666	252671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027086
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5253	NC_008271	GCTG	2	8	254188	254195	0 %	25 %	50 %	25 %	111027088
5254	NC_008271	GCTGT	2	10	254230	254239	0 %	40 %	40 %	20 %	111027088
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5270	NC_008271	CCAAGA	2	12	254943	254954	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111027088
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5272	NC_008271	TGA	2	6	255087	255092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027088
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5275	NC_008271	CGA	2	6	255198	255203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027088
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5281	NC_008271	TGAC	2	8	255589	255596	25 %	25 %	25 %	25 %	111027089
5282	NC_008271	TGC	2	6	255607	255612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027089
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5300	NC_008271	TCA	2	6	256503	256508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027090
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5303	NC_008271	GTCGAC	2	12	256576	256587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111027090
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5313	NC_008271	TCG	2	6	257324	257329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027091
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5319	NC_008271	TCG	2	6	258145	258150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027092
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5350	NC_008271	TGA	2	6	259837	259842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027093
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5352	NC_008271	GTC	2	6	259938	259943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027093
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5356	NC_008271	GTC	2	6	260060	260065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027093
5357	NC_008271	GTGG	2	8	260191	260198	0 %	25 %	75 %	0 %	111027093
5358	NC_008271	TTC	2	6	260223	260228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027093
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5481	NC_008271	TCG	2	6	267735	267740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5482	NC_008271	CAG	2	6	267753	267758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5483	NC_008271	CCG	2	6	267778	267783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027103
5484	NC_008271	CA	3	6	267791	267796	50 %	0 %	0 %	50 %	111027103
5485	NC_008271	CGAT	2	8	267959	267966	25 %	25 %	25 %	25 %	111027103
5486	NC_008271	TCC	2	6	268041	268046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027103
5487	NC_008271	CGG	2	6	268088	268093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027103
5488	NC_008271	TTC	3	9	268095	268103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027103
5489	NC_008271	GTGC	2	8	268269	268276	0 %	25 %	50 %	25 %	111027103
5490	NC_008271	CGA	2	6	268333	268338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5491	NC_008271	TCG	2	6	268347	268352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5492	NC_008271	CGA	2	6	268360	268365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5493	NC_008271	GTC	2	6	268371	268376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027103
5494	NC_008271	GGGT	3	12	268389	268400	0 %	25 %	75 %	0 %	111027103
5495	NC_008271	CGG	2	6	268402	268407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027103
5496	NC_008271	GC	3	6	268410	268415	0 %	0 %	50 %	50 %	111027103
5497	NC_008271	GGT	2	6	268468	268473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027104
5498	NC_008271	CGC	2	6	268673	268678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027104
5499	NC_008271	CGC	2	6	268695	268700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027104
5500	NC_008271	GA	3	6	268708	268713	50 %	0 %	50 %	0 %	111027104

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