MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008271	GGT	2	6	221962	221967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027051
4502	NC_008271	CGT	2	6	221995	222000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027051
4503	NC_008271	CG	3	6	222017	222022	0 %	0 %	50 %	50 %	111027051
4504	NC_008271	CCT	2	6	222063	222068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027051
4505	NC_008271	GTGCG	2	10	222108	222117	0 %	20 %	60 %	20 %	111027051
4506	NC_008271	ACA	2	6	222159	222164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027051
4507	NC_008271	GCTC	2	8	222172	222179	0 %	25 %	25 %	50 %	111027052
4508	NC_008271	CGG	2	6	222208	222213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4509	NC_008271	CAT	2	6	222228	222233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027052
4510	NC_008271	TCCA	2	8	222283	222290	25 %	25 %	0 %	50 %	111027052
4511	NC_008271	CCA	3	9	222323	222331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027052
4512	NC_008271	GTC	2	6	222345	222350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4513	NC_008271	CT	3	6	222359	222364	0 %	50 %	0 %	50 %	111027052
4514	NC_008271	CAG	2	6	222385	222390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4515	NC_008271	GTC	2	6	222450	222455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4516	NC_008271	GTC	2	6	222480	222485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4517	NC_008271	CCTT	2	8	222505	222512	0 %	50 %	0 %	50 %	111027052
4518	NC_008271	CGT	2	6	222539	222544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4519	NC_008271	CACC	2	8	222567	222574	25 %	0 %	0 %	75 %	111027052
4520	NC_008271	TGG	2	6	222613	222618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027052
4521	NC_008271	GTT	2	6	222852	222857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027052
4522	NC_008271	TCGA	2	8	222865	222872	25 %	25 %	25 %	25 %	111027052
4523	NC_008271	CTC	2	6	222915	222920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027052
4524	NC_008271	AGCC	2	8	222976	222983	25 %	0 %	25 %	50 %	111027052
4525	NC_008271	CTG	2	6	222991	222996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4526	NC_008271	GAC	2	6	223008	223013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4527	NC_008271	GCG	2	6	223040	223045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4528	NC_008271	TCG	2	6	223132	223137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4529	NC_008271	CGG	2	6	223211	223216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4530	NC_008271	GTA	2	6	223260	223265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027052
4531	NC_008271	TCG	2	6	223267	223272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4532	NC_008271	CCGG	2	8	223289	223296	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4533	NC_008271	TCC	2	6	223378	223383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027052
4534	NC_008271	GGCC	2	8	223423	223430	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4535	NC_008271	CGA	2	6	223601	223606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4536	NC_008271	TCG	2	6	223612	223617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4537	NC_008271	CCG	2	6	223763	223768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4538	NC_008271	ATC	2	6	223774	223779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027052
4539	NC_008271	GAT	2	6	223824	223829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027052
4540	NC_008271	GCC	2	6	223854	223859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4541	NC_008271	GAA	2	6	223893	223898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027052
4542	NC_008271	CCG	2	6	223921	223926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4543	NC_008271	CGC	2	6	223938	223943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4544	NC_008271	GC	3	6	223945	223950	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4545	NC_008271	CGG	2	6	223976	223981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4546	NC_008271	CGA	2	6	223985	223990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4547	NC_008271	CTC	2	6	224013	224018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027052
4548	NC_008271	CCT	2	6	224030	224035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027052
4549	NC_008271	CG	3	6	224079	224084	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4550	NC_008271	GTC	2	6	224100	224105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4551	NC_008271	GT	3	6	224127	224132	0 %	50 %	50 %	0 %	111027052
4552	NC_008271	GCG	2	6	224157	224162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4553	NC_008271	CAG	2	6	224214	224219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4554	NC_008271	ACG	2	6	224299	224304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4555	NC_008271	AGT	2	6	224360	224365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027052
4556	NC_008271	CAG	2	6	224391	224396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4557	NC_008271	GCC	2	6	224439	224444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4558	NC_008271	AGCCG	2	10	224456	224465	20 %	0 %	40 %	40 %	111027052
4559	NC_008271	CG	3	6	224464	224469	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4560	NC_008271	CGG	2	6	224471	224476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4561	NC_008271	TGT	2	6	224495	224500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027052
4562	NC_008271	CAG	2	6	224520	224525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4563	NC_008271	GCC	2	6	224555	224560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027052
4564	NC_008271	CGG	2	6	224584	224589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4565	NC_008271	CGA	2	6	224594	224599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4566	NC_008271	GGC	2	6	224601	224606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4567	NC_008271	GTC	2	6	224625	224630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4568	NC_008271	CGT	2	6	224636	224641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4569	NC_008271	CG	3	6	224672	224677	0 %	0 %	50 %	50 %	111027052
4570	NC_008271	TCG	2	6	224732	224737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4571	NC_008271	TGG	2	6	224867	224872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027052
4572	NC_008271	CGT	2	6	224918	224923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027052
4573	NC_008271	GTG	2	6	224931	224936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027052
4574	NC_008271	CGG	2	6	224952	224957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027052
4575	NC_008271	CGTG	2	8	224975	224982	0 %	25 %	50 %	25 %	111027052
4576	NC_008271	GCCC	2	8	225085	225092	0 %	0 %	25 %	75 %	111027053
4577	NC_008271	CAG	2	6	225133	225138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027053
4578	NC_008271	CGAGGA	2	12	225144	225155	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111027053
4579	NC_008271	GCC	2	6	225200	225205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027053
4580	NC_008271	CCAG	2	8	225228	225235	25 %	0 %	25 %	50 %	111027053
4581	NC_008271	CG	3	6	225242	225247	0 %	0 %	50 %	50 %	111027053
4582	NC_008271	CGTG	2	8	225255	225262	0 %	25 %	50 %	25 %	111027053
4583	NC_008271	ATG	2	6	225263	225268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027053
4584	NC_008271	GGC	2	6	225288	225293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
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4586	NC_008271	CAT	2	6	225325	225330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027053
4587	NC_008271	CG	3	6	225358	225363	0 %	0 %	50 %	50 %	111027053
4588	NC_008271	GAG	2	6	225415	225420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027053
4589	NC_008271	GGCGCC	2	12	225421	225432	0 %	0 %	50 %	50 %	111027053
4590	NC_008271	CAG	2	6	225466	225471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027053
4591	NC_008271	CGA	2	6	225531	225536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027053
4592	NC_008271	GCCAG	2	10	225558	225567	20 %	0 %	40 %	40 %	111027053
4593	NC_008271	GAG	2	6	225592	225597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027053
4594	NC_008271	GGC	2	6	225598	225603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
4595	NC_008271	CGC	2	6	225621	225626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027053
4596	NC_008271	GGC	2	6	225634	225639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
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4598	NC_008271	CGG	2	6	225768	225773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
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4600	NC_008271	GAG	2	6	225811	225816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027053
4601	NC_008271	GC	3	6	225840	225845	0 %	0 %	50 %	50 %	111027053
4602	NC_008271	CGG	2	6	225846	225851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
4603	NC_008271	AGGT	2	8	225869	225876	25 %	25 %	50 %	0 %	111027053
4604	NC_008271	GTG	2	6	225920	225925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027053
4605	NC_008271	GTG	2	6	225935	225940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027053
4606	NC_008271	CGG	2	6	225960	225965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027053
4607	NC_008271	AGGT	2	8	225998	226005	25 %	25 %	50 %	0 %	111027053
4608	NC_008271	AGA	2	6	226059	226064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027053
4609	NC_008271	TCG	2	6	226137	226142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027053
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4612	NC_008271	GC	3	6	226224	226229	0 %	0 %	50 %	50 %	111027053
4613	NC_008271	GTGG	2	8	226252	226259	0 %	25 %	75 %	0 %	111027053
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4616	NC_008271	TGCA	2	8	226295	226302	25 %	25 %	25 %	25 %	111027053
4617	NC_008271	CGA	2	6	226338	226343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027053
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4619	NC_008271	CACG	2	8	226387	226394	25 %	0 %	25 %	50 %	111027053
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4982	NC_008271	ACG	2	6	241608	241613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027074
4983	NC_008271	CGT	2	6	241624	241629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027074
4984	NC_008271	TGC	2	6	241640	241645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027074
4985	NC_008271	CCA	2	6	241684	241689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027074
4986	NC_008271	CGGCGC	2	12	241696	241707	0 %	0 %	50 %	50 %	111027074
4987	NC_008271	GCT	2	6	241730	241735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027074
4988	NC_008271	CGA	2	6	241744	241749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027074
4989	NC_008271	CAGC	2	8	241783	241790	25 %	0 %	25 %	50 %	111027074
4990	NC_008271	CGC	2	6	241795	241800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027074
4991	NC_008271	GGC	2	6	241889	241894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027074
4992	NC_008271	TCG	2	6	241920	241925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027074
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