MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008270	ATCG	2	8	151800	151807	25 %	25 %	25 %	25 %	111026228
3002	NC_008270	CGT	2	6	151871	151876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3003	NC_008270	AGG	2	6	151916	151921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026228
3004	NC_008270	GGT	2	6	152067	152072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026228
3005	NC_008270	CGA	2	6	152117	152122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3006	NC_008270	CTC	2	6	152175	152180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026228
3007	NC_008270	CGGT	2	8	152221	152228	0 %	25 %	50 %	25 %	111026228
3008	NC_008270	CAC	2	6	152241	152246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026228
3009	NC_008270	GCT	2	6	152273	152278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3010	NC_008270	CGG	2	6	152319	152324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026228
3011	NC_008270	GCC	2	6	152385	152390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3012	NC_008270	TGA	2	6	152483	152488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026228
3013	NC_008270	GGC	2	6	152493	152498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026228
3014	NC_008270	TCC	2	6	152533	152538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026228
3015	NC_008270	TGA	2	6	152573	152578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026228
3016	NC_008270	CCG	2	6	152650	152655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3017	NC_008270	GATCC	2	10	152678	152687	20 %	20 %	20 %	40 %	111026228
3018	NC_008270	CCA	2	6	152746	152751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026228
3019	NC_008270	ATC	2	6	152776	152781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026228
3020	NC_008270	CCAG	2	8	152792	152799	25 %	0 %	25 %	50 %	111026228
3021	NC_008270	CGAT	2	8	152800	152807	25 %	25 %	25 %	25 %	111026228
3022	NC_008270	CGC	2	6	152834	152839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3023	NC_008270	GCC	2	6	152871	152876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3024	NC_008270	GGT	2	6	152883	152888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026228
3025	NC_008270	GAT	2	6	152889	152894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026228
3026	NC_008270	GCC	2	6	153000	153005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3027	NC_008270	CGA	2	6	153107	153112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3028	NC_008270	TCG	2	6	153113	153118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3029	NC_008270	CAG	2	6	153165	153170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3030	NC_008270	CTC	2	6	153204	153209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026228
3031	NC_008270	GCT	2	6	153230	153235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3032	NC_008270	ACG	2	6	153271	153276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3033	NC_008270	CGA	2	6	153296	153301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3034	NC_008270	CAC	2	6	153342	153347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026228
3035	NC_008270	CGG	2	6	153356	153361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026228
3036	NC_008270	ACCG	2	8	153379	153386	25 %	0 %	25 %	50 %	111026228
3037	NC_008270	CGGC	2	8	153425	153432	0 %	0 %	50 %	50 %	111026228
3038	NC_008270	CTG	2	6	153438	153443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3039	NC_008270	CGTT	2	8	153557	153564	0 %	50 %	25 %	25 %	111026228
3040	NC_008270	GTC	2	6	153685	153690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3041	NC_008270	GTC	2	6	153714	153719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228
3042	NC_008270	GAA	2	6	153726	153731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026228
3043	NC_008270	GCC	2	6	153747	153752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026228
3044	NC_008270	GTG	3	9	153807	153815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026229
3045	NC_008270	GCCG	2	8	153825	153832	0 %	0 %	50 %	50 %	111026229
3046	NC_008270	GC	3	6	153907	153912	0 %	0 %	50 %	50 %	111026229
3047	NC_008270	CGG	2	6	153945	153950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026229
3048	NC_008270	CGG	2	6	153957	153962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026229
3049	NC_008270	AGT	2	6	154022	154027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026229
3050	NC_008270	GAT	2	6	154068	154073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026229
3051	NC_008270	CCT	2	6	154118	154123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026229
3052	NC_008270	GAG	2	6	154280	154285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026230
3053	NC_008270	CGA	2	6	154351	154356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3054	NC_008270	GCT	2	6	154384	154389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3055	NC_008270	GT	3	6	154399	154404	0 %	50 %	50 %	0 %	111026230
3056	NC_008270	CCG	2	6	154465	154470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3057	NC_008270	TTC	2	6	154548	154553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026230
3058	NC_008270	TCC	2	6	154557	154562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026230
3059	NC_008270	ACC	2	6	154602	154607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026230
3060	NC_008270	TCC	2	6	154620	154625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026230
3061	NC_008270	CG	3	6	154695	154700	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3062	NC_008270	CGG	2	6	154732	154737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026230
3063	NC_008270	CCG	2	6	154807	154812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3064	NC_008270	GCC	2	6	154883	154888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3065	NC_008270	GTC	2	6	154902	154907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3066	NC_008270	TCG	2	6	154917	154922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3067	NC_008270	CG	3	6	154950	154955	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3068	NC_008270	TCG	2	6	154986	154991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3069	NC_008270	AGGT	2	8	155073	155080	25 %	25 %	50 %	0 %	111026230
3070	NC_008270	TGG	2	6	155122	155127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026230
3071	NC_008270	GCC	2	6	155135	155140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3072	NC_008270	GCC	2	6	155166	155171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3073	NC_008270	TC	3	6	155197	155202	0 %	50 %	0 %	50 %	111026230
3074	NC_008270	TGA	2	6	155215	155220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026230
3075	NC_008270	GCC	2	6	155228	155233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3076	NC_008270	CGC	2	6	155236	155241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3077	NC_008270	CTCA	2	8	155252	155259	25 %	25 %	0 %	50 %	111026230
3078	NC_008270	GGTG	2	8	155299	155306	0 %	25 %	75 %	0 %	111026230
3079	NC_008270	TCC	2	6	155313	155318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026230
3080	NC_008270	ACCGA	2	10	155325	155334	40 %	0 %	20 %	40 %	111026230
3081	NC_008270	GGT	3	9	155339	155347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026230
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3083	NC_008270	ATC	2	6	155361	155366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026230
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3085	NC_008270	CG	3	6	155422	155427	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3086	NC_008270	CGA	2	6	155432	155437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3087	NC_008270	CGAC	2	8	155452	155459	25 %	0 %	25 %	50 %	111026230
3088	NC_008270	CG	3	6	155467	155472	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3089	NC_008270	AGG	2	6	155473	155478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026230
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3091	NC_008270	CAG	2	6	155498	155503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3092	NC_008270	TTC	2	6	155508	155513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026230
3093	NC_008270	TCG	2	6	155563	155568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3094	NC_008270	AGGA	2	8	155574	155581	50 %	0 %	50 %	0 %	111026230
3095	NC_008270	CCG	2	6	155696	155701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
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3097	NC_008270	GC	3	6	155750	155755	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3098	NC_008270	GGT	2	6	155765	155770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026230
3099	NC_008270	TTG	2	6	155775	155780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026230
3100	NC_008270	GATCA	2	10	155852	155861	40 %	20 %	20 %	20 %	111026230
3101	NC_008270	CAC	2	6	155903	155908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026230
3102	NC_008270	GTC	2	6	155915	155920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3103	NC_008270	GCA	2	6	156007	156012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3104	NC_008270	GGTGAA	2	12	156110	156121	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	111026230
3105	NC_008270	CA	4	8	156135	156142	50 %	0 %	0 %	50 %	111026230
3106	NC_008270	CGG	2	6	156452	156457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3107	NC_008270	GCG	2	6	156479	156484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3108	NC_008270	CCG	2	6	156485	156490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3109	NC_008270	GCC	2	6	156517	156522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3110	NC_008270	GGC	2	6	156527	156532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
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3112	NC_008270	CGG	2	6	156561	156566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3113	NC_008270	ACC	2	6	156595	156600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
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3115	NC_008270	CG	4	8	156705	156712	0 %	0 %	50 %	50 %	111026231
3116	NC_008270	ACC	2	6	156718	156723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
3117	NC_008270	TCG	2	6	156842	156847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3118	NC_008270	TGC	2	6	156974	156979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3119	NC_008270	CTG	2	6	157021	157026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3120	NC_008270	GCA	2	6	157044	157049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3121	NC_008270	CAG	2	6	157094	157099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3122	NC_008270	CGG	2	6	157110	157115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3123	NC_008270	GAC	2	6	157222	157227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3124	NC_008270	TCG	2	6	157304	157309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3125	NC_008270	AGGA	2	8	157328	157335	50 %	0 %	50 %	0 %	111026231
3126	NC_008270	CG	3	6	157343	157348	0 %	0 %	50 %	50 %	111026231
3127	NC_008270	AC	3	6	157362	157367	50 %	0 %	0 %	50 %	111026231
3128	NC_008270	CAC	2	6	157377	157382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
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3130	NC_008270	GCC	2	6	157421	157426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3131	NC_008270	CGC	2	6	157454	157459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3132	NC_008270	GGC	2	6	157463	157468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3133	NC_008270	CGG	2	6	157487	157492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3134	NC_008270	GCT	2	6	157512	157517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3135	NC_008270	CGGGGA	2	12	157532	157543	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111026231
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3140	NC_008270	GCATC	2	10	157872	157881	20 %	20 %	20 %	40 %	111026231
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3142	NC_008270	ACT	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026231
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3144	NC_008270	CGA	2	6	158007	158012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3145	NC_008270	GGC	2	6	158022	158027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
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3147	NC_008270	ACGCG	2	10	158127	158136	20 %	0 %	40 %	40 %	111026231
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3150	NC_008270	TCG	2	6	158206	158211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
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3152	NC_008270	CCG	2	6	158323	158328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026232
3153	NC_008270	GCC	2	6	158366	158371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026232
3154	NC_008270	CGA	2	6	158389	158394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026232
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3158	NC_008270	GTC	4	12	158561	158572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026232
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3160	NC_008270	GTC	2	6	158642	158647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026232
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3170	NC_008270	CGC	2	6	159180	159185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026233
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3226	NC_008270	CGA	2	6	162585	162590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026237
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3228	NC_008270	AAT	2	6	162718	162723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111026237
3229	NC_008270	CGTCGC	2	12	162729	162740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111026237
3230	NC_008270	CGC	2	6	162744	162749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026237
3231	NC_008270	ATC	2	6	162790	162795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026237
3232	NC_008270	GAA	2	6	162832	162837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026237
3233	NC_008270	CG	3	6	162882	162887	0 %	0 %	50 %	50 %	111026237
3234	NC_008270	ACC	2	6	162908	162913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026237
3235	NC_008270	CGGCGA	2	12	162957	162968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111026237
3236	NC_008270	AGAT	2	8	163329	163336	50 %	25 %	25 %	0 %	111026238
3237	NC_008270	ACG	2	6	163369	163374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026238
3238	NC_008270	ACC	2	6	163401	163406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026238
3239	NC_008270	ATCT	2	8	163408	163415	25 %	50 %	0 %	25 %	111026238
3240	NC_008270	GAG	2	6	163521	163526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026238
3241	NC_008270	CGC	2	6	163550	163555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026238
3242	NC_008270	ACA	2	6	163687	163692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026238
3243	NC_008270	CGG	2	6	163713	163718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026238
3244	NC_008270	CTA	2	6	163751	163756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026238
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3246	NC_008270	TAC	2	6	163860	163865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026238
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3257	NC_008270	CTG	2	6	164412	164417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026238
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3344	NC_008270	TGC	2	6	168731	168736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026242
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3356	NC_008270	TCACG	2	10	169607	169616	20 %	20 %	20 %	40 %	111026243
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3362	NC_008270	CTG	2	6	169872	169877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026243
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3481	NC_008270	GATC	2	8	174996	175003	25 %	25 %	25 %	25 %	111026248
3482	NC_008270	GATC	2	8	175014	175021	25 %	25 %	25 %	25 %	111026248
3483	NC_008270	CGC	2	6	175071	175076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026248
3484	NC_008270	TCG	2	6	175145	175150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026248
3485	NC_008270	GTG	2	6	175198	175203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026248
3486	NC_008270	TGG	2	6	175302	175307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026249
3487	NC_008270	TTG	2	6	175359	175364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026249
3488	NC_008270	GTG	2	6	175414	175419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026249
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3490	NC_008270	CGC	2	6	175516	175521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026249
3491	NC_008270	GGC	2	6	175534	175539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026249
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3499	NC_008270	CGA	2	6	176602	176607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026250
3500	NC_008270	GCC	2	6	176647	176652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026250

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