MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008270	CAC	2	6	125116	125121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
2502	NC_008270	TGC	2	6	125129	125134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2503	NC_008270	CGA	2	6	125148	125153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2504	NC_008270	CGA	2	6	125196	125201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2505	NC_008270	GAA	2	6	125217	125222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026203
2506	NC_008270	CCGACG	2	12	125249	125260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111026203
2507	NC_008270	GGC	2	6	125305	125310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026203
2508	NC_008270	TCT	2	6	125324	125329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026203
2509	NC_008270	CCT	2	6	125348	125353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026203
2510	NC_008270	GAC	2	6	125434	125439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2511	NC_008270	CAC	2	6	125557	125562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
2512	NC_008270	GGTC	2	8	125577	125584	0 %	25 %	50 %	25 %	111026203
2513	NC_008270	ACC	2	6	125603	125608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
2514	NC_008270	TGA	2	6	125609	125614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026203
2515	NC_008270	GCA	2	6	125664	125669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2516	NC_008270	ACG	2	6	125708	125713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2517	NC_008270	GGCT	2	8	125746	125753	0 %	25 %	50 %	25 %	111026203
2518	NC_008270	CCCGC	2	10	125774	125783	0 %	0 %	20 %	80 %	111026203
2519	NC_008270	CCAGC	2	10	125785	125794	20 %	0 %	20 %	60 %	111026203
2520	NC_008270	CTAC	2	8	125802	125809	25 %	25 %	0 %	50 %	111026203
2521	NC_008270	AAG	2	6	125889	125894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026203
2522	NC_008270	ATC	2	6	126028	126033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026204
2523	NC_008270	GGC	2	6	126152	126157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026204
2524	NC_008270	CAT	2	6	126252	126257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026204
2525	NC_008270	TGA	2	6	126296	126301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026204
2526	NC_008270	GCC	2	6	126441	126446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026204
2527	NC_008270	TCT	2	6	126459	126464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026204
2528	NC_008270	GGA	2	6	126549	126554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026204
2529	NC_008270	ACC	2	6	126657	126662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026204
2530	NC_008270	ATG	2	6	126686	126691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026204
2531	NC_008270	ATCGT	2	10	126716	126725	20 %	40 %	20 %	20 %	111026204
2532	NC_008270	CG	3	6	126856	126861	0 %	0 %	50 %	50 %	111026204
2533	NC_008270	CAG	2	6	127043	127048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026205
2534	NC_008270	GGC	2	6	127130	127135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026205
2535	NC_008270	GAC	2	6	127170	127175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026205
2536	NC_008270	TTC	2	6	127179	127184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026205
2537	NC_008270	AGG	2	6	127209	127214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026205
2538	NC_008270	TCGC	2	8	127259	127266	0 %	25 %	25 %	50 %	111026205
2539	NC_008270	TCG	2	6	127315	127320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026205
2540	NC_008270	CTG	2	6	127324	127329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026205
2541	NC_008270	CG	3	6	127343	127348	0 %	0 %	50 %	50 %	111026205
2542	NC_008270	GCG	2	6	127413	127418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026205
2543	NC_008270	GTG	2	6	127431	127436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026205
2544	NC_008270	GCGG	2	8	127438	127445	0 %	0 %	75 %	25 %	111026205
2545	NC_008270	CGGTG	2	10	127481	127490	0 %	20 %	60 %	20 %	111026205
2546	NC_008270	GAG	2	6	127512	127517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026205
2547	NC_008270	CTGG	2	8	127565	127572	0 %	25 %	50 %	25 %	111026205
2548	NC_008270	GA	3	6	127612	127617	50 %	0 %	50 %	0 %	111026205
2549	NC_008270	GCTCG	2	10	127691	127700	0 %	20 %	40 %	40 %	111026205
2550	NC_008270	TTTCG	2	10	127707	127716	0 %	60 %	20 %	20 %	111026205
2551	NC_008270	AAG	2	6	127757	127762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026206
2552	NC_008270	CGCA	2	8	127778	127785	25 %	0 %	25 %	50 %	111026206
2553	NC_008270	GCT	2	6	127855	127860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2554	NC_008270	CGG	2	6	127944	127949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026206
2555	NC_008270	GC	3	6	128001	128006	0 %	0 %	50 %	50 %	111026206
2556	NC_008270	CCT	2	6	128011	128016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026206
2557	NC_008270	GCA	2	6	128045	128050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2558	NC_008270	GC	3	6	128059	128064	0 %	0 %	50 %	50 %	111026206
2559	NC_008270	G	6	6	128080	128085	0 %	0 %	100 %	0 %	111026206
2560	NC_008270	GTGG	2	8	128096	128103	0 %	25 %	75 %	0 %	111026206
2561	NC_008270	CGA	2	6	128152	128157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2562	NC_008270	GTC	2	6	128171	128176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2563	NC_008270	CGC	2	6	128266	128271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026206
2564	NC_008270	TCG	2	6	128424	128429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2565	NC_008270	CTG	2	6	128450	128455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026206
2566	NC_008270	CG	3	6	128479	128484	0 %	0 %	50 %	50 %	111026206
2567	NC_008270	TGG	2	6	128676	128681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026207
2568	NC_008270	CGC	2	6	128740	128745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026207
2569	NC_008270	GAT	2	6	128879	128884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026207
2570	NC_008270	GC	4	8	128908	128915	0 %	0 %	50 %	50 %	111026207
2571	NC_008270	GCA	2	6	128941	128946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026207
2572	NC_008270	GCA	2	6	128992	128997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026207
2573	NC_008270	CTT	2	6	129025	129030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026207
2574	NC_008270	GA	3	6	129045	129050	50 %	0 %	50 %	0 %	111026207
2575	NC_008270	GAA	2	6	129124	129129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026208
2576	NC_008270	GTT	2	6	129144	129149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026208
2577	NC_008270	CGG	2	6	129197	129202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026208
2578	NC_008270	GCG	2	6	129203	129208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026208
2579	NC_008270	CGC	2	6	129264	129269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026208
2580	NC_008270	TTG	2	6	129308	129313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026208
2581	NC_008270	CGATC	2	10	129321	129330	20 %	20 %	20 %	40 %	111026208
2582	NC_008270	AGG	2	6	129341	129346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026208
2583	NC_008270	CGGG	2	8	129368	129375	0 %	0 %	75 %	25 %	111026208
2584	NC_008270	TCGGCG	2	12	129386	129397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026208
2585	NC_008270	GAG	2	6	129412	129417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026208
2586	NC_008270	CCGAC	2	10	129434	129443	20 %	0 %	20 %	60 %	111026208
2587	NC_008270	CCCG	2	8	129579	129586	0 %	0 %	25 %	75 %	111026208
2588	NC_008270	GGT	2	6	129624	129629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026208
2589	NC_008270	GGA	2	6	129686	129691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026208
2590	NC_008270	CCA	2	6	129713	129718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026208
2591	NC_008270	ACCGGT	2	12	129732	129743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111026208
2592	NC_008270	CGG	2	6	129836	129841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026208
2593	NC_008270	GGCA	2	8	129879	129886	25 %	0 %	50 %	25 %	111026208
2594	NC_008270	TGA	2	6	129894	129899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026208
2595	NC_008270	CGT	2	6	130037	130042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026209
2596	NC_008270	GA	3	6	130103	130108	50 %	0 %	50 %	0 %	111026209
2597	NC_008270	CGTC	2	8	130154	130161	0 %	25 %	25 %	50 %	111026209
2598	NC_008270	CA	3	6	130181	130186	50 %	0 %	0 %	50 %	111026209
2599	NC_008270	ATC	2	6	130196	130201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026209
2600	NC_008270	CCGA	2	8	130233	130240	25 %	0 %	25 %	50 %	111026210
2601	NC_008270	ACC	2	6	130286	130291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026210
2602	NC_008270	TCC	2	6	130318	130323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026210
2603	NC_008270	CGG	2	6	130388	130393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026210
2604	NC_008270	GTC	2	6	130521	130526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026210
2605	NC_008270	TGA	2	6	130539	130544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026210
2606	NC_008270	TCGG	2	8	130596	130603	0 %	25 %	50 %	25 %	111026210
2607	NC_008270	TCG	2	6	130645	130650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026210
2608	NC_008270	GGT	2	6	130691	130696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026210
2609	NC_008270	TCT	2	6	130724	130729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026210
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2611	NC_008270	TTG	2	6	131111	131116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026211
2612	NC_008270	GAC	2	6	131154	131159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026211
2613	NC_008270	GTTT	2	8	131251	131258	0 %	75 %	25 %	0 %	111026211
2614	NC_008270	GGT	2	6	131303	131308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026211
2615	NC_008270	GAT	2	6	131391	131396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026211
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2618	NC_008270	CCT	2	6	131690	131695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026211
2619	NC_008270	ACT	2	6	131783	131788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026211
2620	NC_008270	ACA	2	6	131789	131794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026211
2621	NC_008270	GTCG	2	8	131850	131857	0 %	25 %	50 %	25 %	111026211
2622	NC_008270	GCTC	2	8	131864	131871	0 %	25 %	25 %	50 %	111026211
2623	NC_008270	TTTCT	2	10	131882	131891	0 %	80 %	0 %	20 %	111026211
2624	NC_008270	GGT	2	6	132034	132039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026211
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2627	NC_008270	CGA	2	6	132101	132106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026211
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2631	NC_008270	CG	3	6	132305	132310	0 %	0 %	50 %	50 %	111026211
2632	NC_008270	ACG	2	6	132381	132386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026212
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2638	NC_008270	TCA	2	6	132681	132686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026212
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2737	NC_008270	GCT	2	6	137981	137986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026216
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2740	NC_008270	CA	3	6	138098	138103	50 %	0 %	0 %	50 %	111026216
2741	NC_008270	GCGAC	2	10	138149	138158	20 %	0 %	40 %	40 %	111026216
2742	NC_008270	ACC	2	6	138226	138231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026216
2743	NC_008270	GCAC	2	8	138302	138309	25 %	0 %	25 %	50 %	111026216
2744	NC_008270	ATCG	2	8	138365	138372	25 %	25 %	25 %	25 %	111026216
2745	NC_008270	GGC	2	6	138443	138448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026216
2746	NC_008270	CG	3	6	138462	138467	0 %	0 %	50 %	50 %	111026216
2747	NC_008270	CCGG	2	8	138544	138551	0 %	0 %	50 %	50 %	111026216
2748	NC_008270	GCA	2	6	138575	138580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026216
2749	NC_008270	GCA	2	6	138587	138592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026216
2750	NC_008270	GTC	2	6	138613	138618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026216
2751	NC_008270	GCT	2	6	138630	138635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026216
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2766	NC_008270	GATCG	2	10	139206	139215	20 %	20 %	40 %	20 %	111026216
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2775	NC_008270	GGGC	2	8	139513	139520	0 %	0 %	75 %	25 %	111026216
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2831	NC_008270	TCCGA	2	10	141823	141832	20 %	20 %	20 %	40 %	111026217
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2852	NC_008270	TGG	2	6	143068	143073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026219
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2856	NC_008270	GCT	2	6	143262	143267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026219
2857	NC_008270	CGG	2	6	143410	143415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026219
2858	NC_008270	CAC	3	9	143429	143437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026219
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2861	NC_008270	GCTTGC	2	12	143521	143532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026219
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2864	NC_008270	TGGA	2	8	143631	143638	25 %	25 %	50 %	0 %	111026219
2865	NC_008270	GTC	3	9	143690	143698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026219
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2983	NC_008270	ATC	2	6	151073	151078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026227
2984	NC_008270	CGT	2	6	151113	151118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026227
2985	NC_008270	TGAA	2	8	151121	151128	50 %	25 %	25 %	0 %	111026227
2986	NC_008270	ATG	2	6	151178	151183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026227
2987	NC_008270	GTG	2	6	151195	151200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026227
2988	NC_008270	GGT	2	6	151273	151278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026227
2989	NC_008270	GCC	2	6	151304	151309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026227
2990	NC_008270	CA	3	6	151320	151325	50 %	0 %	0 %	50 %	111026227
2991	NC_008270	TCG	2	6	151337	151342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026227
2992	NC_008270	GTG	2	6	151430	151435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026227
2993	NC_008270	GTG	2	6	151481	151486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026227
2994	NC_008270	CTCCTG	2	12	151510	151521	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	111026227
2995	NC_008270	GCG	2	6	151530	151535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026227
2996	NC_008270	ATG	2	6	151589	151594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026227
2997	NC_008270	CGG	2	6	151632	151637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026228
2998	NC_008270	ACTGG	2	10	151641	151650	20 %	20 %	40 %	20 %	111026228
2999	NC_008270	AGGT	2	8	151714	151721	25 %	25 %	50 %	0 %	111026228
3000	NC_008270	CGT	2	6	151784	151789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026228

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