MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008270	GCG	2	6	98659	98664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026175
2002	NC_008270	GC	3	6	98680	98685	0 %	0 %	50 %	50 %	111026175
2003	NC_008270	AGC	2	6	98731	98736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026175
2004	NC_008270	ACCG	2	8	98745	98752	25 %	0 %	25 %	50 %	111026175
2005	NC_008270	CGGG	2	8	98773	98780	0 %	0 %	75 %	25 %	111026175
2006	NC_008270	CCG	2	6	98782	98787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026175
2007	NC_008270	GAA	2	6	98796	98801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026175
2008	NC_008270	TCC	2	6	98846	98851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026176
2009	NC_008270	CGC	2	6	98878	98883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026176
2010	NC_008270	CGT	2	6	98895	98900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026176
2011	NC_008270	GT	3	6	98991	98996	0 %	50 %	50 %	0 %	111026176
2012	NC_008270	GAGG	2	8	98998	99005	25 %	0 %	75 %	0 %	111026176
2013	NC_008270	CGA	2	6	99006	99011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026176
2014	NC_008270	GGTC	2	8	99012	99019	0 %	25 %	50 %	25 %	111026176
2015	NC_008270	CGC	2	6	99057	99062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026176
2016	NC_008270	GGT	2	6	99091	99096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026176
2017	NC_008270	TCT	2	6	99141	99146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026176
2018	NC_008270	CGA	2	6	99186	99191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026176
2019	NC_008270	CGG	2	6	99219	99224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026176
2020	NC_008270	ACC	2	6	99227	99232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026176
2021	NC_008270	ACG	2	6	99377	99382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026176
2022	NC_008270	TCG	2	6	99383	99388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026176
2023	NC_008270	TGAC	2	8	99434	99441	25 %	25 %	25 %	25 %	111026176
2024	NC_008270	GGC	2	6	99444	99449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026176
2025	NC_008270	GAA	2	6	99591	99596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026177
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2027	NC_008270	GGCT	2	8	99678	99685	0 %	25 %	50 %	25 %	111026177
2028	NC_008270	CGA	2	6	99689	99694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026177
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2030	NC_008270	GAC	2	6	99705	99710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026177
2031	NC_008270	TCG	2	6	99715	99720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026177
2032	NC_008270	TGA	2	6	99761	99766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026177
2033	NC_008270	AGC	2	6	99835	99840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026177
2034	NC_008270	CCT	2	6	99869	99874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026177
2035	NC_008270	CGT	2	6	99878	99883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026177
2036	NC_008270	ACG	2	6	100237	100242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026178
2037	NC_008270	CGC	2	6	100256	100261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026178
2038	NC_008270	TGCG	4	16	100290	100305	0 %	25 %	50 %	25 %	111026178
2039	NC_008270	CGA	3	9	100377	100385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026178
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2041	NC_008270	CCA	2	6	100583	100588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026179
2042	NC_008270	GCC	2	6	100599	100604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026179
2043	NC_008270	CGC	2	6	100628	100633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026179
2044	NC_008270	CTAA	2	8	100668	100675	50 %	25 %	0 %	25 %	111026179
2045	NC_008270	GGA	2	6	100690	100695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026179
2046	NC_008270	GGAAG	2	10	100727	100736	40 %	0 %	60 %	0 %	111026179
2047	NC_008270	GCG	2	6	100782	100787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026179
2048	NC_008270	CGG	2	6	100858	100863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026179
2049	NC_008270	TCG	2	6	100872	100877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026179
2050	NC_008270	GTC	2	6	100907	100912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026179
2051	NC_008270	TCT	2	6	100924	100929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026179
2052	NC_008270	ACA	2	6	100939	100944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026179
2053	NC_008270	G	6	6	100948	100953	0 %	0 %	100 %	0 %	111026179
2054	NC_008270	AAT	2	6	100955	100960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111026179
2055	NC_008270	CACC	2	8	100969	100976	25 %	0 %	0 %	75 %	111026179
2056	NC_008270	TTG	2	6	101019	101024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026179
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2058	NC_008270	GTATC	2	10	101197	101206	20 %	40 %	20 %	20 %	111026179
2059	NC_008270	GA	3	6	101212	101217	50 %	0 %	50 %	0 %	111026179
2060	NC_008270	TCT	2	6	101428	101433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026179
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2062	NC_008270	GCA	2	6	101469	101474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026179
2063	NC_008270	AGCT	2	8	101498	101505	25 %	25 %	25 %	25 %	111026179
2064	NC_008270	CTG	2	6	101849	101854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2065	NC_008270	CGA	2	6	101874	101879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026180
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2068	NC_008270	TCG	2	6	102068	102073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2069	NC_008270	CGCACC	2	12	102163	102174	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026180
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2071	NC_008270	TCA	2	6	102287	102292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026180
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2073	NC_008270	TG	3	6	102432	102437	0 %	50 %	50 %	0 %	111026180
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2081	NC_008270	TGC	2	6	102666	102671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2082	NC_008270	CTG	2	6	102689	102694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
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2089	NC_008270	TGC	2	6	103279	103284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026182
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2093	NC_008270	CGTC	2	8	103455	103462	0 %	25 %	25 %	50 %	111026182
2094	NC_008270	CGC	2	6	103498	103503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026182
2095	NC_008270	CG	3	6	103576	103581	0 %	0 %	50 %	50 %	111026182
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2099	NC_008270	GCAA	2	8	103873	103880	50 %	0 %	25 %	25 %	111026183
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2102	NC_008270	CGT	2	6	104099	104104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2103	NC_008270	AGG	2	6	104151	104156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026184
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2106	NC_008270	CGA	2	6	104294	104299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2107	NC_008270	GCC	2	6	104335	104340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026184
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2109	NC_008270	ACC	2	6	104361	104366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026184
2110	NC_008270	GCT	2	6	104465	104470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2111	NC_008270	GCC	2	6	104488	104493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026184
2112	NC_008270	CAG	2	6	104565	104570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2113	NC_008270	GCG	2	6	104656	104661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026184
2114	NC_008270	CCCGA	2	10	104719	104728	20 %	0 %	20 %	60 %	111026184
2115	NC_008270	GC	3	6	104906	104911	0 %	0 %	50 %	50 %	111026185
2116	NC_008270	TGCA	2	8	104924	104931	25 %	25 %	25 %	25 %	111026185
2117	NC_008270	GC	3	6	104974	104979	0 %	0 %	50 %	50 %	111026185
2118	NC_008270	CATCGT	2	12	104990	105001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111026185
2119	NC_008270	AGGTCG	2	12	105012	105023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111026185
2120	NC_008270	CAC	2	6	105032	105037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026185
2121	NC_008270	ATC	2	6	105038	105043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026185
2122	NC_008270	CGA	2	6	105088	105093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2123	NC_008270	CGA	2	6	105124	105129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2124	NC_008270	TGC	2	6	105137	105142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2125	NC_008270	AGT	2	6	105246	105251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026185
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2142	NC_008270	TCG	2	6	105953	105958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026186
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2241	NC_008270	TGC	2	6	110291	110296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2242	NC_008270	AGA	2	6	110383	110388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026190
2243	NC_008270	ACC	2	6	110398	110403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2244	NC_008270	AGC	2	6	110415	110420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2245	NC_008270	GGT	2	6	110453	110458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026190
2246	NC_008270	CAGG	2	8	110460	110467	25 %	0 %	50 %	25 %	111026190
2247	NC_008270	AGC	2	6	110553	110558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2248	NC_008270	CTGC	2	8	110563	110570	0 %	25 %	25 %	50 %	111026190
2249	NC_008270	CGT	2	6	110645	110650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2250	NC_008270	GTC	2	6	110654	110659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2251	NC_008270	GA	3	6	110683	110688	50 %	0 %	50 %	0 %	111026190
2252	NC_008270	CCGAT	2	10	110751	110760	20 %	20 %	20 %	40 %	111026190
2253	NC_008270	CG	3	6	110793	110798	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2254	NC_008270	GGC	2	6	110897	110902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2255	NC_008270	CGC	2	6	110918	110923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
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2259	NC_008270	GCG	2	6	111052	111057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
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2261	NC_008270	ACGC	2	8	111143	111150	25 %	0 %	25 %	50 %	111026190
2262	NC_008270	GGA	2	6	111154	111159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026190
2263	NC_008270	ACC	2	6	111193	111198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
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2265	NC_008270	CGG	2	6	111279	111284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2266	NC_008270	CCAA	2	8	111290	111297	50 %	0 %	0 %	50 %	111026190
2267	NC_008270	CAT	2	6	111403	111408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026190
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2270	NC_008270	CGCA	2	8	111683	111690	25 %	0 %	25 %	50 %	111026190
2271	NC_008270	CGTG	2	8	111859	111866	0 %	25 %	50 %	25 %	111026190
2272	NC_008270	CAG	2	6	111929	111934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2273	NC_008270	CTG	2	6	112028	112033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2274	NC_008270	CATC	2	8	112075	112082	25 %	25 %	0 %	50 %	111026190
2275	NC_008270	CCA	2	6	112162	112167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
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2311	NC_008270	GC	3	6	113654	113659	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2312	NC_008270	GAGCC	2	10	113684	113693	20 %	0 %	40 %	40 %	111026190
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2315	NC_008270	CGT	3	9	113807	113815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2316	NC_008270	CGT	2	6	114279	114284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026191
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2324	NC_008270	GCCA	2	8	114666	114673	25 %	0 %	25 %	50 %	111026191
2325	NC_008270	ACG	2	6	114739	114744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026191
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2332	NC_008270	TGCA	3	12	115238	115249	25 %	25 %	25 %	25 %	111026192
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2336	NC_008270	GACT	2	8	115349	115356	25 %	25 %	25 %	25 %	111026192
2337	NC_008270	T	6	6	115379	115384	0 %	100 %	0 %	0 %	111026192
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2340	NC_008270	GCT	2	6	115907	115912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026193
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2344	NC_008270	CTG	2	6	116043	116048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026193
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2346	NC_008270	GGA	2	6	116123	116128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026193
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2348	NC_008270	GGT	3	9	116168	116176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026193
2349	NC_008270	GCT	2	6	116243	116248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026193
2350	NC_008270	GGAT	2	8	116295	116302	25 %	25 %	50 %	0 %	111026193
2351	NC_008270	CGC	2	6	116347	116352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026193
2352	NC_008270	GGATC	2	10	116437	116446	20 %	20 %	40 %	20 %	111026193
2353	NC_008270	GGT	2	6	116453	116458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026193
2354	NC_008270	GAC	2	6	116685	116690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026193
2355	NC_008270	GCCG	2	8	116736	116743	0 %	0 %	50 %	50 %	111026193
2356	NC_008270	GAG	2	6	116773	116778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026193
2357	NC_008270	GTA	2	6	116785	116790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026193
2358	NC_008270	TCT	2	6	116809	116814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026193
2359	NC_008270	GTG	2	6	116844	116849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026193
2360	NC_008270	GTCG	2	8	116930	116937	0 %	25 %	50 %	25 %	111026193
2361	NC_008270	GCC	2	6	116946	116951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026193
2362	NC_008270	GAG	2	6	117107	117112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026194
2363	NC_008270	CGG	2	6	117141	117146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026194
2364	NC_008270	AAG	2	6	117155	117160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026194
2365	NC_008270	GTC	2	6	117185	117190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026194
2366	NC_008270	GCC	2	6	117261	117266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026194
2367	NC_008270	GGA	2	6	117328	117333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026194
2368	NC_008270	CGA	2	6	117352	117357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026194
2369	NC_008270	GGT	2	6	117428	117433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026194
2370	NC_008270	GGC	2	6	117476	117481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026194
2371	NC_008270	GATC	2	8	117612	117619	25 %	25 %	25 %	25 %	111026194
2372	NC_008270	AACG	2	8	117631	117638	50 %	0 %	25 %	25 %	111026194
2373	NC_008270	TCCC	2	8	117644	117651	0 %	25 %	0 %	75 %	111026194
2374	NC_008270	ATC	2	6	117770	117775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026194
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2376	NC_008270	TAC	2	6	117952	117957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026195
2377	NC_008270	GCC	2	6	118048	118053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026195
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2380	NC_008270	GC	3	6	118086	118091	0 %	0 %	50 %	50 %	111026195
2381	NC_008270	CGA	2	6	118134	118139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026195
2382	NC_008270	G	6	6	118190	118195	0 %	0 %	100 %	0 %	111026195
2383	NC_008270	TG	3	6	118205	118210	0 %	50 %	50 %	0 %	111026195
2384	NC_008270	TAC	2	6	118225	118230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026195
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2386	NC_008270	GAGGC	2	10	118283	118292	20 %	0 %	60 %	20 %	111026195
2387	NC_008270	CTA	2	6	118350	118355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026195
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2393	NC_008270	CGA	2	6	118665	118670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026195
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2397	NC_008270	CGACC	2	10	118827	118836	20 %	0 %	20 %	60 %	111026195
2398	NC_008270	CCA	2	6	118844	118849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026195
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2400	NC_008270	CGA	2	6	118902	118907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026195
2401	NC_008270	GAA	2	6	119023	119028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026195
2402	NC_008270	CGT	2	6	119046	119051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026195
2403	NC_008270	GCC	2	6	119113	119118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026195
2404	NC_008270	CCG	2	6	119148	119153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026195
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2406	NC_008270	CAA	2	6	119289	119294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026195
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2410	NC_008270	CGA	2	6	119630	119635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026196
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2445	NC_008270	CGA	2	6	121561	121566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026199
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2453	NC_008270	TCGT	2	8	121812	121819	0 %	50 %	25 %	25 %	111026199
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2464	NC_008270	TCGG	2	8	122379	122386	0 %	25 %	50 %	25 %	111026200
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2468	NC_008270	GGT	2	6	123308	123313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026201
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2472	NC_008270	CCT	2	6	123695	123700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026201
2473	NC_008270	ACT	2	6	123788	123793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026201
2474	NC_008270	ACA	2	6	123794	123799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026201
2475	NC_008270	GTCG	2	8	123855	123862	0 %	25 %	50 %	25 %	111026201
2476	NC_008270	GCTC	2	8	123869	123876	0 %	25 %	25 %	50 %	111026201
2477	NC_008270	TTTCT	2	10	123887	123896	0 %	80 %	0 %	20 %	111026201
2478	NC_008270	GGT	2	6	124039	124044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026201
2479	NC_008270	GAC	2	6	124057	124062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026201
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2481	NC_008270	CGA	2	6	124106	124111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026201
2482	NC_008270	GGC	2	6	124112	124117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026201
2483	NC_008270	GCT	2	6	124119	124124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026201
2484	NC_008270	T	6	6	124220	124225	0 %	100 %	0 %	0 %	111026201
2485	NC_008270	CG	3	6	124310	124315	0 %	0 %	50 %	50 %	111026201
2486	NC_008270	ACG	2	6	124386	124391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026202
2487	NC_008270	CGTC	2	8	124400	124407	0 %	25 %	25 %	50 %	111026202
2488	NC_008270	TCA	2	6	124416	124421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026202
2489	NC_008270	ACG	2	6	124476	124481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026202
2490	NC_008270	CTA	2	6	124588	124593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026202
2491	NC_008270	CCAC	2	8	124664	124671	25 %	0 %	0 %	75 %	111026202
2492	NC_008270	TCA	2	6	124686	124691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026202
2493	NC_008270	TGG	2	6	124794	124799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026202
2494	NC_008270	ATC	2	6	124856	124861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026202
2495	NC_008270	GCT	2	6	124879	124884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026202
2496	NC_008270	GCC	2	6	125041	125046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026203
2497	NC_008270	GTC	2	6	125065	125070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2498	NC_008270	GAC	2	6	125071	125076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2499	NC_008270	GAC	2	6	125083	125088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2500	NC_008270	ATCT	2	8	125092	125099	25 %	50 %	0 %	25 %	111026203

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