MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008270	G	6	6	26619	26624	0 %	0 %	100 %	0 %	111026094
502	NC_008270	TCG	2	6	26707	26712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
503	NC_008270	GCA	2	6	26760	26765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
504	NC_008270	GTT	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026094
505	NC_008270	CCT	2	6	26903	26908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026094
506	NC_008270	CGCCCA	2	12	26927	26938	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026094
507	NC_008270	CGCC	2	8	26966	26973	0 %	0 %	25 %	75 %	111026094
508	NC_008270	CGC	2	6	26981	26986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
509	NC_008270	CAT	2	6	27035	27040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026094
510	NC_008270	AGC	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
511	NC_008270	CCGACC	2	12	27181	27192	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026094
512	NC_008270	GTT	2	6	27200	27205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026094
513	NC_008270	TCG	2	6	27208	27213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
514	NC_008270	CAC	2	6	27222	27227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
515	NC_008270	CGA	2	6	27239	27244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
516	NC_008270	TCG	2	6	27256	27261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
517	NC_008270	TGC	2	6	27271	27276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
518	NC_008270	GCC	2	6	27294	27299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
519	NC_008270	GC	3	6	27401	27406	0 %	0 %	50 %	50 %	111026094
520	NC_008270	GAC	2	6	27432	27437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
521	NC_008270	ACCGC	2	10	27503	27512	20 %	0 %	20 %	60 %	111026094
522	NC_008270	GTCG	2	8	27549	27556	0 %	25 %	50 %	25 %	111026094
523	NC_008270	GCT	2	6	27566	27571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
524	NC_008270	ACA	2	6	27619	27624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026094
525	NC_008270	CCGCGG	2	12	27642	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
526	NC_008270	TCC	2	6	27656	27661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026095
527	NC_008270	GGT	2	6	27673	27678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
528	NC_008270	CCGCG	2	10	27712	27721	0 %	0 %	40 %	60 %	111026095
529	NC_008270	CTG	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
530	NC_008270	GCTG	2	8	27810	27817	0 %	25 %	50 %	25 %	111026095
531	NC_008270	TGG	2	6	27827	27832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
532	NC_008270	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
533	NC_008270	TGA	2	6	27885	27890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
534	NC_008270	CGG	4	12	27922	27933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
535	NC_008270	TTC	2	6	27944	27949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026095
536	NC_008270	GCG	2	6	28032	28037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
537	NC_008270	GAT	2	6	28045	28050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
538	NC_008270	CAT	2	6	28060	28065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
539	NC_008270	TCA	2	6	28116	28121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
540	NC_008270	GC	3	6	28168	28173	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
541	NC_008270	ATC	2	6	28262	28267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
542	NC_008270	CTC	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026095
543	NC_008270	CGCGGC	2	12	28318	28329	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
544	NC_008270	TC	3	6	28339	28344	0 %	50 %	0 %	50 %	111026095
545	NC_008270	GAC	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026095
546	NC_008270	GGT	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
547	NC_008270	ATCGA	2	10	28475	28484	40 %	20 %	20 %	20 %	111026095
548	NC_008270	TCG	2	6	28488	28493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
549	NC_008270	CCAA	2	8	28507	28514	50 %	0 %	0 %	50 %	111026095
550	NC_008270	AAC	2	6	28556	28561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026095
551	NC_008270	CGC	2	6	28585	28590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026095
552	NC_008270	CGT	2	6	28639	28644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
553	NC_008270	GGA	2	6	28744	28749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026095
554	NC_008270	CTC	2	6	28829	28834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026095
555	NC_008270	GCCG	2	8	28856	28863	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
556	NC_008270	ATC	2	6	28868	28873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
557	NC_008270	GTC	2	6	28919	28924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
558	NC_008270	TGC	2	6	28989	28994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
559	NC_008270	GAT	2	6	28996	29001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
560	NC_008270	GTC	2	6	29036	29041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
561	NC_008270	TTC	2	6	29087	29092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026095
562	NC_008270	CCG	2	6	29128	29133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026095
563	NC_008270	CAA	2	6	29172	29177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026095
564	NC_008270	CGC	2	6	29197	29202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026095
565	NC_008270	ACCG	2	8	29203	29210	25 %	0 %	25 %	50 %	111026095
566	NC_008270	CAC	2	6	29230	29235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026095
567	NC_008270	GC	3	6	29237	29242	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
568	NC_008270	GCC	2	6	29258	29263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026095
569	NC_008270	GAA	2	6	29323	29328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026095
570	NC_008270	GCA	2	6	29384	29389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026095
571	NC_008270	CGG	2	6	29392	29397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
572	NC_008270	TCCTC	2	10	29427	29436	0 %	40 %	0 %	60 %	111026095
573	NC_008270	AGCG	2	8	29445	29452	25 %	0 %	50 %	25 %	111026095
574	NC_008270	CGGT	2	8	29511	29518	0 %	25 %	50 %	25 %	111026095
575	NC_008270	CCG	2	6	29538	29543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026095
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577	NC_008270	CGG	2	6	29589	29594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
578	NC_008270	ACG	2	6	29681	29686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026095
579	NC_008270	CAC	3	9	29722	29730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026095
580	NC_008270	CCAG	2	8	29780	29787	25 %	0 %	25 %	50 %	111026095
581	NC_008270	GCT	2	6	29842	29847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
582	NC_008270	CGCAG	2	10	29854	29863	20 %	0 %	40 %	40 %	111026095
583	NC_008270	TGA	2	6	29915	29920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
584	NC_008270	CTC	2	6	29923	29928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026096
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586	NC_008270	AC	3	6	29951	29956	50 %	0 %	0 %	50 %	111026096
587	NC_008270	GTG	3	9	29976	29984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026096
588	NC_008270	GCT	2	6	29985	29990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026096
589	NC_008270	TCA	2	6	30017	30022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026096
590	NC_008270	CGA	2	6	30050	30055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026096
591	NC_008270	CGG	3	9	30096	30104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026096
592	NC_008270	GAGG	2	8	30190	30197	25 %	0 %	75 %	0 %	111026096
593	NC_008270	ACG	2	6	30203	30208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026096
594	NC_008270	GCA	2	6	30220	30225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026096
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596	NC_008270	CGC	2	6	30270	30275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026096
597	NC_008270	CGC	2	6	30282	30287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026096
598	NC_008270	TCG	2	6	30335	30340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026096
599	NC_008270	GCG	2	6	30494	30499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026096
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605	NC_008270	CGG	2	6	30668	30673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026096
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607	NC_008270	CGG	2	6	30696	30701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026096
608	NC_008270	ACC	2	6	30731	30736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026096
609	NC_008270	CG	3	6	30745	30750	0 %	0 %	50 %	50 %	111026096
610	NC_008270	CAT	2	6	30756	30761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026096
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613	NC_008270	ACC	2	6	31018	31023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026096
614	NC_008270	GCA	2	6	31073	31078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026096
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616	NC_008270	GCT	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026096
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626	NC_008270	GCCG	2	8	31524	31531	0 %	0 %	50 %	50 %	111026096
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753	NC_008270	CGA	2	6	40222	40227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026103
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998	NC_008270	GCC	3	9	51536	51544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026116
999	NC_008270	TCG	2	6	51558	51563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026116
1000	NC_008270	CGA	2	6	51833	51838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026117

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