MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008270	ACC	2	6	305229	305234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026381
6002	NC_008270	GCGG	2	8	305235	305242	0 %	0 %	75 %	25 %	111026381
6003	NC_008270	GCGGA	2	10	305245	305254	20 %	0 %	60 %	20 %	111026381
6004	NC_008270	GACG	2	8	305299	305306	25 %	0 %	50 %	25 %	111026381
6005	NC_008270	CAG	2	6	305339	305344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026381
6006	NC_008270	GTCA	2	8	305363	305370	25 %	25 %	25 %	25 %	111026381
6007	NC_008270	GGA	2	6	305378	305383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026381
6008	NC_008270	G	6	6	305401	305406	0 %	0 %	100 %	0 %	111026381
6009	NC_008270	TCA	3	9	305407	305415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026381
6010	NC_008270	CCG	2	6	305578	305583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026381
6011	NC_008270	TCG	2	6	305680	305685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026381
6012	NC_008270	ATC	2	6	305824	305829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026382
6013	NC_008270	CATC	2	8	305877	305884	25 %	25 %	0 %	50 %	111026382
6014	NC_008270	TC	3	6	305892	305897	0 %	50 %	0 %	50 %	111026382
6015	NC_008270	GC	3	6	305925	305930	0 %	0 %	50 %	50 %	111026382
6016	NC_008270	GTA	2	6	305944	305949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026382
6017	NC_008270	CGA	2	6	305952	305957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026382
6018	NC_008270	CAG	2	6	306085	306090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026382
6019	NC_008270	CGC	2	6	306102	306107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026382
6020	NC_008270	CGGTC	2	10	306118	306127	0 %	20 %	40 %	40 %	111026382
6021	NC_008270	ACG	3	9	306128	306136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026382
6022	NC_008270	GCGG	2	8	306145	306152	0 %	0 %	75 %	25 %	111026382
6023	NC_008270	GC	3	6	306222	306227	0 %	0 %	50 %	50 %	111026382
6024	NC_008270	CCA	2	6	306276	306281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026382
6025	NC_008270	GAAG	2	8	306369	306376	50 %	0 %	50 %	0 %	111026382
6026	NC_008270	GACG	2	8	306378	306385	25 %	0 %	50 %	25 %	111026382
6027	NC_008270	CCG	2	6	306437	306442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026382
6028	NC_008270	CAC	2	6	306462	306467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026382
6029	NC_008270	CTC	2	6	306531	306536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026382
6030	NC_008270	GCC	2	6	306586	306591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026382
6031	NC_008270	CG	3	6	306612	306617	0 %	0 %	50 %	50 %	111026382
6032	NC_008270	CGGTG	2	10	306627	306636	0 %	20 %	60 %	20 %	111026382
6033	NC_008270	GCG	2	6	306640	306645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026382
6034	NC_008270	GCT	2	6	306801	306806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026382
6035	NC_008270	GGGCG	2	10	306816	306825	0 %	0 %	80 %	20 %	111026382
6036	NC_008270	GCGAG	2	10	306929	306938	20 %	0 %	60 %	20 %	111026382
6037	NC_008270	CCA	2	6	306953	306958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026382
6038	NC_008270	TCG	2	6	306959	306964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026382
6039	NC_008270	CGCGG	2	10	307037	307046	0 %	0 %	60 %	40 %	111026383
6040	NC_008270	TCA	2	6	307053	307058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026383
6041	NC_008270	GAA	2	6	307078	307083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026383
6042	NC_008270	CGG	3	9	307116	307124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
6043	NC_008270	GGAT	2	8	307197	307204	25 %	25 %	50 %	0 %	111026383
6044	NC_008270	GCG	2	6	307221	307226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
6045	NC_008270	CGG	2	6	307321	307326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
6046	NC_008270	TGC	2	6	307335	307340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
6047	NC_008270	CG	3	6	307372	307377	0 %	0 %	50 %	50 %	111026383
6048	NC_008270	TGG	2	6	307407	307412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026383
6049	NC_008270	CTG	3	9	307430	307438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
6050	NC_008270	CGG	2	6	307442	307447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
6051	NC_008270	GCT	3	9	307471	307479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
6052	NC_008270	CTG	2	6	307497	307502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
6053	NC_008270	GC	3	6	307504	307509	0 %	0 %	50 %	50 %	111026383
6054	NC_008270	CGG	2	6	307512	307517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
6055	NC_008270	CGGCG	2	10	307546	307555	0 %	0 %	60 %	40 %	111026383
6056	NC_008270	GGA	2	6	307708	307713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026383
6057	NC_008270	AGG	2	6	307719	307724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026383
6058	NC_008270	ACC	2	6	308472	308477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
6059	NC_008270	CG	3	6	308516	308521	0 %	0 %	50 %	50 %	111026384
6060	NC_008270	CCA	2	6	308533	308538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
6061	NC_008270	GCT	2	6	308575	308580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026384
6062	NC_008270	ACCG	2	8	308597	308604	25 %	0 %	25 %	50 %	111026384
6063	NC_008270	CGCC	2	8	308662	308669	0 %	0 %	25 %	75 %	111026384
6064	NC_008270	TAC	2	6	308739	308744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026384
6065	NC_008270	CGA	2	6	308765	308770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026384
6066	NC_008270	CCG	2	6	308818	308823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026384
6067	NC_008270	CGCCGG	2	12	308943	308954	0 %	0 %	50 %	50 %	111026384
6068	NC_008270	CAC	2	6	308974	308979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
6069	NC_008270	AGC	2	6	308983	308988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026384
6070	NC_008270	GGTC	2	8	308989	308996	0 %	25 %	50 %	25 %	111026384
6071	NC_008270	TCG	2	6	309000	309005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026384
6072	NC_008270	TTC	2	6	309134	309139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026385
6073	NC_008270	ACC	2	6	309159	309164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026385
6074	NC_008270	CG	3	6	309225	309230	0 %	0 %	50 %	50 %	111026385
6075	NC_008270	ATG	2	6	309265	309270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026385
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6079	NC_008270	CCA	2	6	309419	309424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026385
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6081	NC_008270	GCT	2	6	309462	309467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026385
6082	NC_008270	TCG	2	6	310008	310013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026386
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6089	NC_008270	CG	3	6	310241	310246	0 %	0 %	50 %	50 %	111026386
6090	NC_008270	GGA	2	6	310273	310278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026386
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6102	NC_008270	CGG	2	6	310810	310815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026386
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6107	NC_008270	GAC	2	6	310981	310986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026386
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6110	NC_008270	GC	3	6	311365	311370	0 %	0 %	50 %	50 %	111026387
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6122	NC_008270	TGG	2	6	311854	311859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026387
6123	NC_008270	CGG	2	6	311918	311923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026387
6124	NC_008270	CTGG	2	8	311978	311985	0 %	25 %	50 %	25 %	111026387
6125	NC_008270	GCT	2	6	312029	312034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
6126	NC_008270	CG	3	6	312102	312107	0 %	0 %	50 %	50 %	111026387
6127	NC_008270	GGA	2	6	312112	312117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026387
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6133	NC_008270	CTG	2	6	312240	312245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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6153	NC_008270	CTG	2	6	313014	313019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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6234	NC_008270	CG	3	6	316739	316744	0 %	0 %	50 %	50 %	111026391
6235	NC_008270	TGCAA	2	10	316795	316804	40 %	20 %	20 %	20 %	111026391
6236	NC_008270	GC	3	6	316850	316855	0 %	0 %	50 %	50 %	111026391
6237	NC_008270	CAG	3	9	316881	316889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026391
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6240	NC_008270	CGA	2	6	317006	317011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026391
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6242	NC_008270	GCG	2	6	317458	317463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026392
6243	NC_008270	GGC	2	6	317469	317474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026392
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6352	NC_008270	GGTCG	2	10	324103	324112	0 %	20 %	60 %	20 %	111026399
6353	NC_008270	AG	3	6	324147	324152	50 %	0 %	50 %	0 %	111026399
6354	NC_008270	ACG	2	6	324158	324163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026399
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6363	NC_008270	CGC	2	6	324514	324519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026399
6364	NC_008270	ACC	2	6	324581	324586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026399
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6473	NC_008270	CCATG	2	10	330608	330617	20 %	20 %	20 %	40 %	111026405
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6482	NC_008270	ACC	2	6	331090	331095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026406
6483	NC_008270	ACGG	2	8	331154	331161	25 %	0 %	50 %	25 %	111026406
6484	NC_008270	TCG	2	6	331189	331194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026406
6485	NC_008270	GCC	2	6	331258	331263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026406
6486	NC_008270	AGGC	2	8	331446	331453	25 %	0 %	50 %	25 %	111026406
6487	NC_008270	CCA	2	6	331488	331493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026406
6488	NC_008270	TCG	2	6	331498	331503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026406
6489	NC_008270	GCA	2	6	331522	331527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026406
6490	NC_008270	GCT	3	9	331586	331594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026406
6491	NC_008270	TCCC	2	8	331614	331621	0 %	25 %	0 %	75 %	111026407
6492	NC_008270	CCA	2	6	331637	331642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026407
6493	NC_008270	C	6	6	331741	331746	0 %	0 %	0 %	100 %	111026407
6494	NC_008270	TCACCG	2	12	331847	331858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111026407
6495	NC_008270	CGT	2	6	331905	331910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026407
6496	NC_008270	CTG	2	6	331978	331983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026407
6497	NC_008270	CTG	2	6	332005	332010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026407
6498	NC_008270	GAG	2	6	332025	332030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026407
6499	NC_008270	CCG	2	6	332061	332066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026407
6500	NC_008270	GCTC	2	8	332084	332091	0 %	25 %	25 %	50 %	111026407

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