MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008270	CGA	2	6	231421	231426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026305
4502	NC_008270	CGC	2	6	231430	231435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026305
4503	NC_008270	GCGG	2	8	231446	231453	0 %	0 %	75 %	25 %	111026305
4504	NC_008270	GATC	2	8	231536	231543	25 %	25 %	25 %	25 %	111026305
4505	NC_008270	GCCG	2	8	231868	231875	0 %	0 %	50 %	50 %	111026306
4506	NC_008270	TGTCGG	2	12	231878	231889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111026306
4507	NC_008270	CGC	2	6	231890	231895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026306
4508	NC_008270	GAC	2	6	231915	231920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026306
4509	NC_008270	GTCG	2	8	231962	231969	0 %	25 %	50 %	25 %	111026306
4510	NC_008270	AGC	2	6	232009	232014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026306
4511	NC_008270	GC	3	6	232031	232036	0 %	0 %	50 %	50 %	111026306
4512	NC_008270	GGT	2	6	232037	232042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026306
4513	NC_008270	GC	3	6	232045	232050	0 %	0 %	50 %	50 %	111026306
4514	NC_008270	GTCG	2	8	232078	232085	0 %	25 %	50 %	25 %	111026306
4515	NC_008270	GGT	2	6	232131	232136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026306
4516	NC_008270	GCG	2	6	232212	232217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026306
4517	NC_008270	CGG	2	6	232426	232431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026307
4518	NC_008270	GGCT	2	8	232462	232469	0 %	25 %	50 %	25 %	111026307
4519	NC_008270	CG	3	6	233221	233226	0 %	0 %	50 %	50 %	111026308
4520	NC_008270	GGT	2	6	233247	233252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026308
4521	NC_008270	GGAA	2	8	233255	233262	50 %	0 %	50 %	0 %	111026308
4522	NC_008270	CG	3	6	233287	233292	0 %	0 %	50 %	50 %	111026308
4523	NC_008270	TGG	3	9	233306	233314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026308
4524	NC_008270	GGC	2	6	233346	233351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026308
4525	NC_008270	GCGG	2	8	233352	233359	0 %	0 %	75 %	25 %	111026308
4526	NC_008270	CGC	2	6	233371	233376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026308
4527	NC_008270	GGC	2	6	233451	233456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026308
4528	NC_008270	GCG	3	9	233484	233492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026308
4529	NC_008270	GTG	3	9	233504	233512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026308
4530	NC_008270	GGACCG	2	12	233552	233563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111026308
4531	NC_008270	CG	3	6	233562	233567	0 %	0 %	50 %	50 %	111026308
4532	NC_008270	TGC	2	6	233570	233575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026308
4533	NC_008270	CG	3	6	233656	233661	0 %	0 %	50 %	50 %	111026308
4534	NC_008270	GTGCA	2	10	233701	233710	20 %	20 %	40 %	20 %	111026308
4535	NC_008270	CGG	2	6	234609	234614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026309
4536	NC_008270	ACG	2	6	234644	234649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026309
4537	NC_008270	GGGT	2	8	234749	234756	0 %	25 %	75 %	0 %	111026309
4538	NC_008270	TGC	2	6	234761	234766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026309
4539	NC_008270	GGT	2	6	234991	234996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026309
4540	NC_008270	TCGG	2	8	235024	235031	0 %	25 %	50 %	25 %	111026309
4541	NC_008270	TGCG	2	8	235032	235039	0 %	25 %	50 %	25 %	111026309
4542	NC_008270	GAC	2	6	235230	235235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026310
4543	NC_008270	GGC	2	6	235342	235347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026310
4544	NC_008270	TCCA	2	8	235370	235377	25 %	25 %	0 %	50 %	111026310
4545	NC_008270	CA	3	6	235393	235398	50 %	0 %	0 %	50 %	111026310
4546	NC_008270	AG	3	6	235418	235423	50 %	0 %	50 %	0 %	111026310
4547	NC_008270	GGT	2	6	235484	235489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026310
4548	NC_008270	CGT	3	9	235546	235554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026310
4549	NC_008270	GTG	2	6	235719	235724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026310
4550	NC_008270	CGGC	2	8	235812	235819	0 %	0 %	50 %	50 %	111026310
4551	NC_008270	GGC	2	6	235826	235831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026310
4552	NC_008270	ATGGG	2	10	235853	235862	20 %	20 %	60 %	0 %	111026310
4553	NC_008270	CGG	2	6	235873	235878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026310
4554	NC_008270	AAC	2	6	235883	235888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026310
4555	NC_008270	CGG	2	6	235936	235941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026310
4556	NC_008270	GCG	2	6	235959	235964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026310
4557	NC_008270	GTG	2	6	235986	235991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026310
4558	NC_008270	CGCGGT	2	12	236127	236138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026311
4559	NC_008270	CGGG	2	8	236187	236194	0 %	0 %	75 %	25 %	111026311
4560	NC_008270	GCG	2	6	236195	236200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4561	NC_008270	CCGT	2	8	236225	236232	0 %	25 %	25 %	50 %	111026311
4562	NC_008270	GAT	2	6	236260	236265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026311
4563	NC_008270	GGGC	2	8	236283	236290	0 %	0 %	75 %	25 %	111026311
4564	NC_008270	GCGCG	2	10	236305	236314	0 %	0 %	60 %	40 %	111026311
4565	NC_008270	CCG	2	6	236364	236369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026311
4566	NC_008270	GTCG	2	8	236402	236409	0 %	25 %	50 %	25 %	111026311
4567	NC_008270	CGGGT	2	10	236415	236424	0 %	20 %	60 %	20 %	111026311
4568	NC_008270	TGGG	2	8	236436	236443	0 %	25 %	75 %	0 %	111026311
4569	NC_008270	GTC	2	6	236469	236474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026311
4570	NC_008270	CGG	2	6	236562	236567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4571	NC_008270	GGT	2	6	236580	236585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026311
4572	NC_008270	GGT	2	6	236621	236626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026311
4573	NC_008270	CGA	2	6	236689	236694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026311
4574	NC_008270	GCG	3	9	236721	236729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4575	NC_008270	CGT	2	6	236731	236736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026311
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4577	NC_008270	GGT	3	9	236797	236805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026311
4578	NC_008270	TCG	2	6	236817	236822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026311
4579	NC_008270	CGG	3	9	236830	236838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4580	NC_008270	GAA	2	6	236984	236989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026311
4581	NC_008270	GAG	2	6	237014	237019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026311
4582	NC_008270	CGCA	2	8	237061	237068	25 %	0 %	25 %	50 %	111026311
4583	NC_008270	GCG	2	6	237086	237091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4584	NC_008270	CGG	2	6	237127	237132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
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4586	NC_008270	GAGC	2	8	237199	237206	25 %	0 %	50 %	25 %	111026311
4587	NC_008270	GCC	2	6	237222	237227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026311
4588	NC_008270	GCC	3	9	237267	237275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026311
4589	NC_008270	TGGGTG	2	12	237282	237293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026311
4590	NC_008270	GCG	2	6	237306	237311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4591	NC_008270	GCC	2	6	237320	237325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026311
4592	NC_008270	CGG	2	6	237348	237353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
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4594	NC_008270	GTC	2	6	237412	237417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026311
4595	NC_008270	GGT	2	6	237442	237447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026311
4596	NC_008270	GCG	2	6	237507	237512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026311
4597	NC_008270	GGCCAG	3	18	237517	237534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111026311
4598	NC_008270	GGGC	2	8	237535	237542	0 %	0 %	75 %	25 %	111026311
4599	NC_008270	GAC	2	6	237578	237583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026311
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4601	NC_008270	GCACCC	2	12	238363	238374	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026312
4602	NC_008270	CGCGG	2	10	238408	238417	0 %	0 %	60 %	40 %	111026312
4603	NC_008270	GCGCA	2	10	238499	238508	20 %	0 %	40 %	40 %	111026312
4604	NC_008270	CAC	2	6	238601	238606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026312
4605	NC_008270	CGA	3	9	238609	238617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026312
4606	NC_008270	GCC	2	6	238635	238640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026312
4607	NC_008270	GTG	2	6	238682	238687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026312
4608	NC_008270	GCT	2	6	238710	238715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026312
4609	NC_008270	CGG	2	6	238730	238735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026312
4610	NC_008270	TGG	2	6	238750	238755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026312
4611	NC_008270	CGA	2	6	238767	238772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026312
4612	NC_008270	GC	3	6	238891	238896	0 %	0 %	50 %	50 %	111026312
4613	NC_008270	CCG	2	6	238912	238917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026312
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4617	NC_008270	GCG	2	6	239848	239853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026313
4618	NC_008270	CGT	2	6	239868	239873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026313
4619	NC_008270	GGAG	2	8	239889	239896	25 %	0 %	75 %	0 %	111026313
4620	NC_008270	TCG	2	6	239901	239906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026313
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4622	NC_008270	TCG	2	6	239933	239938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026313
4623	NC_008270	TCG	2	6	239942	239947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026313
4624	NC_008270	GTT	2	6	240016	240021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026313
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4626	NC_008270	CGCA	2	8	240034	240041	25 %	0 %	25 %	50 %	111026313
4627	NC_008270	CGGG	2	8	240085	240092	0 %	0 %	75 %	25 %	111026313
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4656	NC_008270	GCC	2	6	241624	241629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026315
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4730	NC_008270	CTGG	2	8	245214	245221	0 %	25 %	50 %	25 %	111026320
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4740	NC_008270	CCGTA	2	10	245692	245701	20 %	20 %	20 %	40 %	111026321
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4745	NC_008270	GAT	2	6	245789	245794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026321
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4747	NC_008270	CGTT	2	8	245811	245818	0 %	50 %	25 %	25 %	111026321
4748	NC_008270	GTC	2	6	245841	245846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
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4866	NC_008270	TAC	2	6	251624	251629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026329
4867	NC_008270	CGGTT	2	10	251659	251668	0 %	40 %	40 %	20 %	111026329
4868	NC_008270	GCG	2	6	251671	251676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026329
4869	NC_008270	TCG	2	6	251691	251696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026329
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4874	NC_008270	C	6	6	251881	251886	0 %	0 %	0 %	100 %	111026330
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4884	NC_008270	TCA	2	6	252247	252252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026330
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4985	NC_008270	CTA	2	6	256065	256070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026333
4986	NC_008270	GCG	2	6	256072	256077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026333
4987	NC_008270	GGC	2	6	256098	256103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026333
4988	NC_008270	CGC	2	6	256137	256142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026333
4989	NC_008270	TGG	2	6	256245	256250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026333
4990	NC_008270	ATG	2	6	256285	256290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026333
4991	NC_008270	GCT	2	6	256315	256320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026333
4992	NC_008270	GCGA	2	8	256328	256335	25 %	0 %	50 %	25 %	111026333
4993	NC_008270	GT	3	6	256340	256345	0 %	50 %	50 %	0 %	111026333
4994	NC_008270	CGC	2	6	256394	256399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026333
4995	NC_008270	CTCGAT	2	12	256408	256419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111026333
4996	NC_008270	GCC	2	6	256489	256494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026334
4997	NC_008270	TTC	2	6	256574	256579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026334
4998	NC_008270	CGG	2	6	256588	256593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026334
4999	NC_008270	CGA	2	6	256652	256657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026334
5000	NC_008270	ACC	2	6	256658	256663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026334

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