MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008269	TCG	2	6	199788	199793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984
4002	NC_008269	CAT	2	6	199828	199833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024984
4003	NC_008269	CCG	2	6	199840	199845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024984
4004	NC_008269	GAC	2	6	199880	199885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024984
4005	NC_008269	GTCG	2	8	200148	200155	0 %	25 %	50 %	25 %	111024985
4006	NC_008269	CAC	3	9	200175	200183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024985
4007	NC_008269	CAGCGA	2	12	200196	200207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4008	NC_008269	TCT	2	6	200213	200218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024985
4009	NC_008269	CAAC	2	8	200220	200227	50 %	0 %	0 %	50 %	111024985
4010	NC_008269	CGTCGA	2	12	200271	200282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4011	NC_008269	GAC	2	6	200335	200340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4012	NC_008269	CGC	2	6	200358	200363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4013	NC_008269	CAGCCC	2	12	200399	200410	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111024985
4014	NC_008269	GCC	2	6	200431	200436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4015	NC_008269	CCG	2	6	200489	200494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4016	NC_008269	GTC	3	9	200536	200544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4017	NC_008269	GAC	2	6	200545	200550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4018	NC_008269	CCG	2	6	200563	200568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4019	NC_008269	CAGCC	2	10	200594	200603	20 %	0 %	20 %	60 %	111024985
4020	NC_008269	GCA	2	6	200669	200674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4021	NC_008269	GCG	2	6	200720	200725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024985
4022	NC_008269	CGGC	2	8	200763	200770	0 %	0 %	50 %	50 %	111024985
4023	NC_008269	CGG	2	6	200781	200786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024985
4024	NC_008269	TCGACC	2	12	200798	200809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111024985
4025	NC_008269	ACG	2	6	200831	200836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4026	NC_008269	CGA	2	6	200913	200918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4027	NC_008269	CGG	2	6	200937	200942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024985
4028	NC_008269	ACG	2	6	201011	201016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024985
4029	NC_008269	CCG	3	9	201032	201040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4030	NC_008269	ACCC	2	8	201059	201066	25 %	0 %	0 %	75 %	111024985
4031	NC_008269	CCT	2	6	201132	201137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024985
4032	NC_008269	AACG	2	8	201142	201149	50 %	0 %	25 %	25 %	111024985
4033	NC_008269	CCG	2	6	201239	201244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024985
4034	NC_008269	CGC	2	6	201287	201292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024986
4035	NC_008269	CGGA	2	8	201293	201300	25 %	0 %	50 %	25 %	111024986
4036	NC_008269	CAC	2	6	201307	201312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024986
4037	NC_008269	ACCGC	2	10	201317	201326	20 %	0 %	20 %	60 %	111024986
4038	NC_008269	GA	3	6	201390	201395	50 %	0 %	50 %	0 %	111024986
4039	NC_008269	TGC	2	6	201431	201436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024986
4040	NC_008269	TGG	2	6	201463	201468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024986
4041	NC_008269	CCCG	2	8	201515	201522	0 %	0 %	25 %	75 %	111024986
4042	NC_008269	GGA	2	6	201538	201543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024986
4043	NC_008269	GTC	2	6	201596	201601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024986
4044	NC_008269	AGC	2	6	201631	201636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024986
4045	NC_008269	CA	3	6	201637	201642	50 %	0 %	0 %	50 %	111024986
4046	NC_008269	CTC	2	6	201692	201697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024986
4047	NC_008269	CG	3	6	201707	201712	0 %	0 %	50 %	50 %	111024986
4048	NC_008269	CGGGT	2	10	201871	201880	0 %	20 %	60 %	20 %	111024986
4049	NC_008269	CTT	3	9	202069	202077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024987
4050	NC_008269	AATGAT	2	12	202093	202104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111024987
4051	NC_008269	GAT	3	9	202114	202122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024987
4052	NC_008269	CTG	2	6	202123	202128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4053	NC_008269	TTG	2	6	202160	202165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024987
4054	NC_008269	CCGAT	2	10	202194	202203	20 %	20 %	20 %	40 %	111024987
4055	NC_008269	GCC	2	6	202216	202221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024987
4056	NC_008269	AAC	2	6	202243	202248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024987
4057	NC_008269	GGC	2	6	202249	202254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024987
4058	NC_008269	GGC	2	6	202305	202310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024987
4059	NC_008269	CGA	2	6	202338	202343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4060	NC_008269	TGC	2	6	202402	202407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4061	NC_008269	TCC	2	6	202417	202422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024987
4062	NC_008269	GGC	2	6	202423	202428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024987
4063	NC_008269	TCA	2	6	202458	202463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024987
4064	NC_008269	AGG	2	6	202502	202507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024987
4065	NC_008269	AGGA	2	8	202637	202644	50 %	0 %	50 %	0 %	111024987
4066	NC_008269	CGA	2	6	202662	202667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4067	NC_008269	CGA	2	6	202741	202746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4068	NC_008269	GAC	2	6	202762	202767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4069	NC_008269	GA	3	6	202796	202801	50 %	0 %	50 %	0 %	111024987
4070	NC_008269	GCG	3	9	202811	202819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024987
4071	NC_008269	GAT	2	6	202852	202857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024987
4072	NC_008269	CAG	2	6	202894	202899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4073	NC_008269	GAC	2	6	202942	202947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4074	NC_008269	TGC	2	6	202996	203001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024987
4075	NC_008269	TCGG	2	8	203007	203014	0 %	25 %	50 %	25 %	111024987
4076	NC_008269	CTC	2	6	203056	203061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024987
4077	NC_008269	GGT	2	6	203083	203088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024987
4078	NC_008269	TGG	2	6	203094	203099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024987
4079	NC_008269	TCG	2	6	203144	203149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024988
4080	NC_008269	CGA	2	6	203211	203216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024988
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4082	NC_008269	GAT	2	6	203251	203256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024988
4083	NC_008269	ATG	2	6	203294	203299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024988
4084	NC_008269	TGG	2	6	203328	203333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024988
4085	NC_008269	TCG	2	6	203336	203341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024988
4086	NC_008269	GGT	2	6	203357	203362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024988
4087	NC_008269	GCCGAG	2	12	203374	203385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111024988
4088	NC_008269	GAC	2	6	203398	203403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024988
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4090	NC_008269	GGT	2	6	203452	203457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024988
4091	NC_008269	GTC	3	9	203506	203514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024988
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4093	NC_008269	CGA	2	6	203766	203771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024988
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4096	NC_008269	GAT	2	6	203980	203985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024988
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4101	NC_008269	TCA	2	6	204477	204482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024988
4102	NC_008269	GCC	2	6	204505	204510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024988
4103	NC_008269	CTG	2	6	204654	204659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4104	NC_008269	GA	3	6	204729	204734	50 %	0 %	50 %	0 %	111024989
4105	NC_008269	CGA	2	6	204743	204748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4106	NC_008269	GCTTC	2	10	204788	204797	0 %	40 %	20 %	40 %	111024989
4107	NC_008269	GCG	2	6	204823	204828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024989
4108	NC_008269	CGA	2	6	204839	204844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4109	NC_008269	GTT	2	6	204873	204878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024989
4110	NC_008269	CGT	2	6	204891	204896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4111	NC_008269	GAA	2	6	204960	204965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024989
4112	NC_008269	CAC	2	6	204967	204972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024989
4113	NC_008269	CCG	2	6	204976	204981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024989
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4117	NC_008269	GTG	2	6	205149	205154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024989
4118	NC_008269	GTCG	2	8	205230	205237	0 %	25 %	50 %	25 %	111024989
4119	NC_008269	CGA	2	6	205238	205243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4120	NC_008269	CGG	2	6	205316	205321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024989
4121	NC_008269	GGCG	2	8	205332	205339	0 %	0 %	75 %	25 %	111024989
4122	NC_008269	AGGGA	2	10	205357	205366	40 %	0 %	60 %	0 %	111024989
4123	NC_008269	GAT	2	6	205374	205379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024989
4124	NC_008269	CGA	2	6	205454	205459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4125	NC_008269	GCT	2	6	205546	205551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024989
4126	NC_008269	TCGA	2	8	205597	205604	25 %	25 %	25 %	25 %	111024989
4127	NC_008269	CGT	2	6	205679	205684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024989
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4134	NC_008269	CG	3	6	205842	205847	0 %	0 %	50 %	50 %	111024989
4135	NC_008269	TGC	2	6	205853	205858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024989
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4140	NC_008269	TCG	2	6	206324	206329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024990
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4142	NC_008269	TCG	2	6	206387	206392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024990
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4151	NC_008269	TCGA	2	8	206671	206678	25 %	25 %	25 %	25 %	111024990
4152	NC_008269	TCG	2	6	206684	206689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024990
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4227	NC_008269	ATCCAG	2	12	211195	211206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111024994
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4235	NC_008269	CGGG	2	8	211465	211472	0 %	0 %	75 %	25 %	111024994
4236	NC_008269	TCC	2	6	211477	211482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024994
4237	NC_008269	AAC	2	6	211519	211524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024994
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4239	NC_008269	CAG	2	6	211581	211586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024994
4240	NC_008269	CGT	2	6	211619	211624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024994
4241	NC_008269	GGC	2	6	211635	211640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024994
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4355	NC_008269	GCT	2	6	216690	216695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024999
4356	NC_008269	CCGA	2	8	216726	216733	25 %	0 %	25 %	50 %	111024999
4357	NC_008269	CAA	2	6	216739	216744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024999
4358	NC_008269	ATC	2	6	217207	217212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025000
4359	NC_008269	CGA	2	6	217251	217256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025000
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4361	NC_008269	CGC	2	6	217314	217319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025000
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4384	NC_008269	CCGGGC	2	12	218596	218607	0 %	0 %	50 %	50 %	111025002
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4394	NC_008269	GTGACC	2	12	218967	218978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025002
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4444	NC_008269	TCG	2	6	220657	220662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025004
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4465	NC_008269	CTG	2	6	222095	222100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025006
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4469	NC_008269	TCAT	2	8	222171	222178	25 %	50 %	0 %	25 %	111025006
4470	NC_008269	CGA	2	6	222196	222201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025006
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4475	NC_008269	CGCC	2	8	222400	222407	0 %	0 %	25 %	75 %	111025006
4476	NC_008269	GTCGA	2	10	222411	222420	20 %	20 %	40 %	20 %	111025006
4477	NC_008269	CGA	2	6	222439	222444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025006
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4479	NC_008269	CCGC	2	8	222565	222572	0 %	0 %	25 %	75 %	111025007
4480	NC_008269	CA	3	6	222573	222578	50 %	0 %	0 %	50 %	111025007
4481	NC_008269	GGT	2	6	222579	222584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025007
4482	NC_008269	CCG	2	6	222619	222624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025007
4483	NC_008269	ACG	2	6	222627	222632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025007
4484	NC_008269	GC	3	6	222685	222690	0 %	0 %	50 %	50 %	111025007
4485	NC_008269	GGCC	2	8	222722	222729	0 %	0 %	50 %	50 %	111025007
4486	NC_008269	ACG	2	6	222742	222747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025007
4487	NC_008269	TCA	2	6	222782	222787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025007
4488	NC_008269	CCA	2	6	222821	222826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025007
4489	NC_008269	GCCA	2	8	222984	222991	25 %	0 %	25 %	50 %	111025008
4490	NC_008269	CCCCA	2	10	223001	223010	20 %	0 %	0 %	80 %	111025008
4491	NC_008269	TCA	2	6	223024	223029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025008
4492	NC_008269	AC	4	8	223059	223066	50 %	0 %	0 %	50 %	111025008
4493	NC_008269	GCT	2	6	223102	223107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025008
4494	NC_008269	GAC	2	6	223116	223121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025008
4495	NC_008269	ACC	2	6	223145	223150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025008
4496	NC_008269	GCC	2	6	223191	223196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025008
4497	NC_008269	ACC	2	6	223203	223208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025008
4498	NC_008269	CGA	3	9	223318	223326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025009
4499	NC_008269	CGCAG	2	10	223395	223404	20 %	0 %	40 %	40 %	111025009
4500	NC_008269	GCC	2	6	223443	223448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025009

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