MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008269	TGG	2	6	172811	172816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024960
3502	NC_008269	GCGG	2	8	172856	172863	0 %	0 %	75 %	25 %	111024960
3503	NC_008269	GTG	2	6	172918	172923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024960
3504	NC_008269	C	7	7	172975	172981	0 %	0 %	0 %	100 %	111024961
3505	NC_008269	TGG	2	6	173083	173088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024961
3506	NC_008269	CGAT	2	8	173090	173097	25 %	25 %	25 %	25 %	111024961
3507	NC_008269	GTC	2	6	173100	173105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3508	NC_008269	GGCA	2	8	173123	173130	25 %	0 %	50 %	25 %	111024961
3509	NC_008269	GTC	2	6	173178	173183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3510	NC_008269	CCG	2	6	173209	173214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024961
3511	NC_008269	CCGGG	2	10	173226	173235	0 %	0 %	60 %	40 %	111024961
3512	NC_008269	CTGC	2	8	173288	173295	0 %	25 %	25 %	50 %	111024961
3513	NC_008269	GCG	2	6	173299	173304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024961
3514	NC_008269	TCG	2	6	173317	173322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3515	NC_008269	CGC	2	6	173351	173356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024961
3516	NC_008269	TCG	2	6	173398	173403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3517	NC_008269	GC	3	6	173404	173409	0 %	0 %	50 %	50 %	111024961
3518	NC_008269	GGC	2	6	173525	173530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024961
3519	NC_008269	GC	3	6	173672	173677	0 %	0 %	50 %	50 %	111024961
3520	NC_008269	TCG	2	6	173746	173751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3521	NC_008269	CTC	2	6	173787	173792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024961
3522	NC_008269	GCGCA	2	10	173798	173807	20 %	0 %	40 %	40 %	111024961
3523	NC_008269	TCG	2	6	173923	173928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024961
3524	NC_008269	GCC	2	6	173931	173936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024961
3525	NC_008269	CGG	2	6	174051	174056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024962
3526	NC_008269	CAG	2	6	174242	174247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024962
3527	NC_008269	CGTC	2	8	174296	174303	0 %	25 %	25 %	50 %	111024962
3528	NC_008269	GGT	2	6	174316	174321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024962
3529	NC_008269	GTGC	2	8	174344	174351	0 %	25 %	50 %	25 %	111024962
3530	NC_008269	CGA	2	6	174388	174393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024962
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3532	NC_008269	CCG	2	6	174425	174430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024962
3533	NC_008269	ACG	2	6	174438	174443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024962
3534	NC_008269	TCG	2	6	174460	174465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024962
3535	NC_008269	CGG	2	6	174499	174504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024962
3536	NC_008269	TCG	2	6	174588	174593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024962
3537	NC_008269	ATC	2	6	174626	174631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024962
3538	NC_008269	ACC	2	6	174636	174641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024962
3539	NC_008269	GTG	2	6	174648	174653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024962
3540	NC_008269	CTAC	2	8	174703	174710	25 %	25 %	0 %	50 %	111024962
3541	NC_008269	GGA	2	6	174781	174786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024962
3542	NC_008269	ATGC	2	8	174861	174868	25 %	25 %	25 %	25 %	111024962
3543	NC_008269	CGG	2	6	174888	174893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024962
3544	NC_008269	CG	3	6	175062	175067	0 %	0 %	50 %	50 %	111024963
3545	NC_008269	TG	3	6	175131	175136	0 %	50 %	50 %	0 %	111024963
3546	NC_008269	GGT	2	6	175138	175143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024963
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3548	NC_008269	TCT	2	6	175239	175244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024963
3549	NC_008269	CCG	2	6	175245	175250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024963
3550	NC_008269	CGC	2	6	175287	175292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024963
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3552	NC_008269	GAT	2	6	175318	175323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024963
3553	NC_008269	GGC	3	9	175360	175368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024963
3554	NC_008269	TCA	2	6	175407	175412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024963
3555	NC_008269	GCC	2	6	175430	175435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024963
3556	NC_008269	TCG	2	6	175530	175535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
3557	NC_008269	CGGT	2	8	175580	175587	0 %	25 %	50 %	25 %	111024963
3558	NC_008269	TCG	3	9	175590	175598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
3559	NC_008269	GCT	2	6	175612	175617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
3560	NC_008269	TGC	2	6	175632	175637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
3561	NC_008269	ACTC	2	8	175650	175657	25 %	25 %	0 %	50 %	111024963
3562	NC_008269	GCACT	2	10	175782	175791	20 %	20 %	20 %	40 %	111024963
3563	NC_008269	GAG	2	6	175792	175797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024963
3564	NC_008269	CTG	3	9	175829	175837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
3565	NC_008269	TCA	2	6	175851	175856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024963
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3569	NC_008269	CGC	2	6	175969	175974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024963
3570	NC_008269	GTC	2	6	176039	176044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024963
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3585	NC_008269	CGA	2	6	177133	177138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024964
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3587	NC_008269	TGC	2	6	177166	177171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024964
3588	NC_008269	GGC	2	6	177187	177192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024964
3589	NC_008269	GGT	2	6	177199	177204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024964
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3591	NC_008269	TGG	2	6	177287	177292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024964
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3594	NC_008269	ACC	2	6	177402	177407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024964
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3598	NC_008269	CTGA	2	8	177739	177746	25 %	25 %	25 %	25 %	111024965
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3601	NC_008269	ACC	2	6	178005	178010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024966
3602	NC_008269	GGT	2	6	178017	178022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024966
3603	NC_008269	GCC	2	6	178039	178044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024966
3604	NC_008269	TCT	2	6	178063	178068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024966
3605	NC_008269	GGC	2	6	178093	178098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024966
3606	NC_008269	CGG	2	6	178105	178110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024966
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3608	NC_008269	CG	3	6	178158	178163	0 %	0 %	50 %	50 %	111024966
3609	NC_008269	ACG	2	6	178183	178188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024966
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3621	NC_008269	CCG	2	6	178625	178630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024966
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3741	NC_008269	CGG	2	6	186130	186135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024973
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3982	NC_008269	GTG	2	6	198863	198868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024984
3983	NC_008269	TCA	2	6	198912	198917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024984
3984	NC_008269	AGA	2	6	198954	198959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024984
3985	NC_008269	CTGG	2	8	199027	199034	0 %	25 %	50 %	25 %	111024984
3986	NC_008269	CGC	2	6	199054	199059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024984
3987	NC_008269	CCCG	2	8	199078	199085	0 %	0 %	25 %	75 %	111024984
3988	NC_008269	CGG	2	6	199168	199173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024984
3989	NC_008269	CTG	2	6	199181	199186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984
3990	NC_008269	CTGG	2	8	199237	199244	0 %	25 %	50 %	25 %	111024984
3991	NC_008269	TCA	2	6	199287	199292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024984
3992	NC_008269	CTG	3	9	199304	199312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984
3993	NC_008269	TGA	2	6	199356	199361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024984
3994	NC_008269	GACC	2	8	199473	199480	25 %	0 %	25 %	50 %	111024984
3995	NC_008269	TTC	2	6	199511	199516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024984
3996	NC_008269	CGT	2	6	199545	199550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984
3997	NC_008269	ATC	3	9	199598	199606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024984
3998	NC_008269	CTCGGC	2	12	199610	199621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111024984
3999	NC_008269	TCG	2	6	199623	199628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984
4000	NC_008269	CTG	2	6	199742	199747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024984

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